EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-07725 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr15:25702300-25705770 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr15:25702921-25702933GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702925-25702937GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702929-25702941GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702933-25702945GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702937-25702949GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25703328-25703340AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25703332-25703344AAACAAACAAAC-6.32
LHX6MA0658.1chr15:25703873-25703883ACTAATTAGC+6.02
Nr5a2MA0505.1chr15:25703027-25703042GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RFX1MA0509.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.31
RFX1MA0509.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.31
RFX2MA0600.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.19
RFX2MA0600.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.23
RFX3MA0798.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.06
RFX3MA0798.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.34
RFX4MA0799.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.25
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00789chr15:25691500-25704859Myotubes
mSE_04513chr15:25702984-25705660E14.5_Brain
mSE_09963chr15:25702945-25705541MEF
mSE_10057chr15:25701025-25704620Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TTACGTGTAT ATATTAATGC CCCTGACCAA GGCTGAGGGC AACGCTAATT GTTATGAACA 60
GTTAGAAGGC AGTTTGACCA TGTGAGCATT TTGCCAAGCA ACTGTAGTAG CTCCACCTGC 120
CCACCTCCCA GGACCCTTGG TGGCCCCAGC CTTGGACTCT GACATTCCTA CATCAGGCAC 180
GAATTCCTGC TGAAGAACAG GCCTCAGAGC AGAAAGTGGT TAGTTACCCC CATAACTATA 240
ATGACACTAA TGCATCAGCA GGTACACTTT GACTAGGTCC CTTCCTGTCT TTCTCTGTGT 300
ATGTTAAATA CAGTATAATA TTAGCCTTTA TATGGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 360
GTGTGTGTGT GTGTATGTAT CTGTAGGCCA GAAAGCTAAC TTCAGGTAAC TTCTACTGCT 420
TGCCAGTTTT TTGGTTTTTT TCCATTTAGA TTATTTATCC ACCTTTGAAA GGAACATATT 480
CATGGGTGGG GTCAGTTCCC TTCTATGTGT CCCTGGGGTA AAATTCTGGT GGAAACACTT 540
TTACCTACAG AGCCAATTCA GTGACCTACC AGATTATTTT TAGTCAAGGC CTCCCACTGA 600
ACCTGAAACC CTCTGGGTTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT GGGGTGTGGC 660
AGGGGTGTTT CCAATCATTG TTTCTCTGTG TAGCCCTGGC TGTCCTAGAA CTCACTCTGT 720
AGACCAGGCT GGCCTTGAAC TCAGAAATCC ACCTGCCTCT GCCTCCCAAA TGCTAGGAGC 780
CCGGCTGGAG CTCTGTTTGG GCTAGACTGG TGGGCCTAGT GAGGTCCTAA GATCTGCCTG 840
TCTCTGCTGC CCAGTACCAG GGTCACAGAA GTGCCACTGT GAGCAGCTTC CATTTAGATC 900
ATCTCCGCAG CCCTGATCAG TAGTGATTTT TTGACACGGC TGACAGACAA CCTGCCAAAC 960
TTCAGAAACC TGGGGGACAA AATGCAGTTT CTACTGCAGT GAACCTTCCT TGAGTATGAA 1020
TCAGCAAAAA ACAAACAAAC AAACAAAAAA ATAAAAAACA AAACCTTTGC ACATAGTAGG 1080
TGTTTAATAG CTATTCACAA TGCTATCTAG CTGGGGCTGT AATTGCCTGG GGTTGGGACT 1140
GTTCCTTCCA AAAATCCAGT CTATTTGTTC TCATAAAAAC CTAGCTCTTA GTGCTCTGCA 1200
GGCAGTCTTT GTTGGGGTGC AGCCCTGCCT TGGAGAACTG GTAACCCATG AGGACTAGCA 1260
AGCATTAGGC TGGCTTTGAA AAGCAAAATG CTCCTTGTCC AGCCTCCAGC TGTGACAGCT 1320
TTGAAAGTTA AATTCACCAG AAAAGGAAGT TGCCACTGAA AACCGAAGCG CCAATGGAGA 1380
GCGGGGGTTG TCCCCTCGTG ACCACCGGAG GCGGGTTGCC CAGGGCGACA ATCGCCTATA 1440
GATCCCCCTT TTCCCGGTTA AATTACTGGG AAGGGGCAGG AACACAATGG CACTGGGAGT 1500
CTGCAAAAAG CTACAGCTCC CAGCGTCCCT CACTCCCTTC CCAGAGCTGT ATCAACTCCT 1560
AGAACCACAC CACACTAATT AGCCCGGAGT GGAAGGGGTT GTCATGGTGA CCGGGTACTT 1620
TTTAAAGCAC AGGAATGGTG TTCATTATTG TTCCAAGTCT TTAGCTGTGG GGAAAAGGTC 1680
AGGGTAGCAG TTGTTTTCCC GTATGAAGTT TGGCCAGAGA GCCTAACAGA AGGTGGAATG 1740
TCCTTTGGAG ACGCCGGAAG ATGGTGAGTG TTGATCGGGC GTGGAGGGGT GGCCCTCGGA 1800
GTCATATCTT TCAGAATGTT TTAATAACTT GGGTGCCAGG CTAAGGAATT ATACGGAGGA 1860
AGGAGAAGGC GGCAGGGCCA GAATGTGGGT CGGGCACAGC CACAGCTGGA GGGAAGGGGG 1920
GTTAAGAATT CTCCCTCCAA ACCTCACATC ATTAAACCAG TTAAAAGTTT CTCTGCTTCC 1980
AAGGAAGTGT AACCAAATTG AAACAGTCTG GCACTTTCTT TGAAATTCAC TTTGTAAATA 2040
AACTCAGTGC TGGTCCTTGT AGATCATTAC CACTCAGATT TTATTTTCCA GTCTATAAAG 2100
CCCAAAGTGC CAGGGACACA CGCATTTAGA GCAGCCACTT AGCATGCTGT AAGCCAGAAG 2160
TTAAAGTGTG TCAGGACTGA CTTGGTTTCA TAGCCTTATG CTTTCTTCCT TTTCTAAGGA 2220
GTTCAGACGC ATAGACTAAA AATCCAAGCA AGCCACTGGT CTCTGGCTGC TTGCCGTAAA 2280
TTGCCGGCTA CACTTGGTTA GAATACAGCT AAGTAAAGAC AACGTGACCA CTGTGTTTGT 2340
ATAAGACATT TTTGGGAGAC GTCTGCCTGC CAGAGACAGG GCAGCTGTTC CATCAGGGTG 2400
TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG CGCGCGCGCG CGCGCACGCA GCGCTCTGTC TTAATTTTAG 2460
TTTTTAAAAC TGTAGAATAC CCTAGCTTTA AGCCTACTTT GGTGTTCATG GCTCATTGTG 2520
TGTTTTTTTA AGGGTCAGGG AGTAAGCCAC TGTGTTTTTT GGACTTTCCA ACAGTATGGC 2580
TCCGTCTTTC GGTCCTTTTA TTAGACTTCT ATAGAATAAC AGCATACAAG TTAATTAAGG 2640
GGACTAGGAG CCTGGAGTAG AAGAGCGACT TGTCATCCAA AAAGCTGCAA GTGGGAAATG 2700
ACCCACTCTG CTTTCCCCTG GCAGACGATG GTTCAGCAGC AGTGCCAGCT GGCAGCTGCA 2760
GAGCTGAGCT GGGAGCACAG ACTGCAGAGG AGGCAGCTTG GCCCGACTCC TCCCTCAGGC 2820
CTGTGTGTCC TTGGGCTCAC TTCTGGTGGG ACTCCCAATA AGTGGGGTAT AAGGCTGGAA 2880
CAAACTAGGA GTCGTCTTGT CTCTTTTACC CTCTGGCATT TCTAGCCCCC CTCCCTCATT 2940
CCTGTGTGTG TGTTTGTGTG TGTGTGCGCT TGTGTGTGCT TGCAAGTCCA TGTAATGTGT 3000
GCTCCTCAGT GAATACTGTA TTGTTTAACT CAGGAACACC TCTATATCCT AAGTTAAATA 3060
AACAGGTGTG TGCCTGATAC TTTAGACTTT TGAAAAAGGT GATCACAGAG ATGAGAGTGA 3120
ACAGCAGTGT CTTTGTGACA CGGACACTTT GTGACATGTG TGAACGTGGA CACTGATGTT 3180
TTAGGAATTT TTGGTACCTT TCAAGACACA ATAATGGTGA AACTATGATA TATGCTAAAG 3240
TATCTACTGA AATTAAATTG GCAAAAGATC TGAAGCAGTA AGCAGGCTGG TGGGCATCAC 3300
AGTGTCGTTC TGGAGCTGGG GGAACCAGTG ACTTGACTCC ACAGATGTAC ACTGGCCAGT 3360
GTATATTTTG TGTAGGCTCT AAATTACTAT GTATGCGCAT GGGCTTCCTA GAAGCCCGGC 3420
AAGGGCGGCC TTGTGAGCAC TGTGTCCTCT AACTCTATCC CACCTCACGG 3470