EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-06021 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr13:53277470-53280050 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARAMA0729.1chr13:53279768-53279786AACTGACCTTTTCACCAC-6.36
RREB1MA0073.1chr13:53279243-53279263TGGGGGGGGGTGGTGGTGGT-6.38
RREB1MA0073.1chr13:53277490-53277510TGTGTGTGTGTGGGGTGGGG-6.68
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05652chr13:53277846-53279492E14.5_Limb
mSE_10352chr13:53277388-53281309Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TTGTTTTTCA GATGTGTGCT TGTGTGTGTG TGGGGTGGGG GTGCACATGT GTGCTTGTGC 60
ATGTGGAGGC CTGCGGTTCA CGGCAAAACC ATTCACTACC TCTCTTCCAT CTTATTCGCT 120
GAAGCAGGGT CTCTCACTCA AACCCAAAGC TCTCCACTGT CAGTTATCCC AGGTTGCTCT 180
GGGTATCGCC CATCTCCAGA GTCCAAGGCT GGATTACAAA TGGCCTCCAC ACCTACCTAG 240
CATCATCCCA TATTGTCAGC TTGACACAGC TGGGCAGAGA GAGCCTCAGC TGAGGAACGT 300
CTCTATCAGA TTTGCTCCAG GCTGTGTTTA TGGGGCGTTT TCTTGATTGC TAACTGATGT 360
TAGACCACTG TGGGTGGTAC CATCCATCCC AGAGCTTGTG GGTTTGGGCT ACATAAGAAA 420
GGCTGCTGAA CAAGAGATGG GGACAAGCCA GTAAGCAGCA TCCCTCCACA GTCCCTACTT 480
TAAGCTCCGA CTCTATTGAT GTTTCTGCTC TGATTTTCCT CCATGGTGGA ACCCATAAGA 540
TAAAACAAAC CATTTCCTGC CCAGGTTGTT TGATCATGGT ATTTTGGAGG GGTGTGTGTG 600
CACGCGTATC TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG CGCGCGCACC 660
ATATGTACCC TTGGAGGCCA GAAGAAGGTG TGCAATTCCC TGGAAATGGA GATACAGAAA 720
TTTTTAAGAC TCCATGTGAG ACTTGAGAGT CCTCTGCAAG AACTTGAATT GCTAAACCAC 780
AGCTACAGTC CTGTGCGTGG CACTTATTCC AGAAACAAAG CAGGGCATGT GGGTTCTGAA 840
GTTCCAGAAT CCTGTCCTCA CACTTCATGG TTGTCTCTCC AGCACCATCC CTGATTATTA 900
ATATGTAGTG AGTTCAAAGC CAGTGTTTCA AAACAAAATA AATAAGCCCA GGTGTCTTAG 960
ATAGCAAGCC TCTCACATAT CCTGTCACAC TCATGCGGAG AGAGAATTTG AATATCTCTC 1020
CTGGATATTC AAGGTCCAGA GGGTGGCAAG ACTCAGGGCA GTCCATCACA GAGAAACAGT 1080
TTTCTCTCGG GAGTAGGAAA GAACGCACTG CACATGCGCA ATGACAAAGT CCTCCCCTAT 1140
GCAAGACCGC ACGTTCAGAA GTCTGTAATC ACAAACACAT TGTCCGGGAA AAGAGGGAAA 1200
GGGAGAGAGA TTTCAAAGGC CCTCCCCAGG AGTGCTGCAG GAAATGGAGG GAGACAAAAT 1260
GCAAGCAAAC GCTGTTGTTC CCCACCTGAA GCAGCTGTCC TCTGACCCTG GTATATGACA 1320
CCCCAGCTTC CTTGACGAAA AACAGGACAC CAGGGGTGGG ATGCACACAG CCCTCATCAG 1380
GCATCCTTGG AGGGAGGGAG ACTAGCTCAT GTGTTTGCAA TTAGGAGGTT GCAGACATCA 1440
GGGAGGGGCT TCATGGCCCT GCCAAGCAGG GTTTTCTTCC CAGCAAAACA AGGCCCCCTT 1500
TACCCAACGC TCTGCAGCCC ACAGAATGGC AGGGCTCACA GAAATGGGAG AAGAGACAGC 1560
ACCAGGCTTC AGTTGTGTCC CCAAGTCAAA CCATACAGCT GGGACCCACT GCAGTTCTGT 1620
GTTATTTCTG CCATTGACAA CAGGATAGAT ACACAGAAGC CCTCCCTACA TGCAAAAGAG 1680
GTGTTTGGGA ATAGGGGAAG GTTAGCCCCT GAGCGATAGA ATGAAATTTC CCCCATAGGA 1740
GAGCACTATG TAAGGAGAGG TGGTTTTAGA AACTGGGGGG GGGTGGTGGT GGTAAGCAGG 1800
AATGGGGGTG TTCTTCCACC TGAATTCTAA AGATCTTGGC TGAAAGTGAG GCTTGCTGGG 1860
AGACAGTTCA AGCTTCCCAC AGAGAAAACA CTGTAAGACT CTGGGGAGCC TTAGCTTACT 1920
GGGGACCCCC TGAGTGAACC ACATGGAGCC TGGATCCATG CAAAAAGCAA GAGGAATTTA 1980
TTGTTTCAAT GCAGACCCAG ACCCAAAGGA GAGGTGGCGA CCCCCAGCAC CAGTTCAGCG 2040
AGTTTTTATC CGGTTTCCAG GGGCAGAATA GAGCATCAGC AACTAGGCAC AATGATTGGT 2100
GGGACAGTGC ACCCTTTAAA CTGATTGGTC TTTAGGGAAT AAGGTGACAA GGACTTCCCT 2160
TGTCTTAAGC TGGGTGAGGT CCATCCTGCT TAATGTGTCC CCACCTGCAG GTCTGTTCCC 2220
ACCTGGTGCT CTGAGAAATG GTAATTAGCC TCTCCCTTCC GGAGGGGCAA GTGTTTCCTG 2280
ACCTTCCCAA AGTTTCTTAA CTGACCTTTT CACCACAAAA CAGCATGTAA CAAACTTGCC 2340
TCGCCCTCCA GCTCTGAGAT GCTCGCTCCA CTGGACTTAA ATGGATAGCT GCTAGACCCA 2400
CAAGATAGAC TCTCTTCTTC ATACCTACTC TGCGGTCCCA GCTGATCTGG AACAGAGATC 2460
CACCTGCCTC TGCCTCCTGA ATGCTGGGAT TTAAGGTGAG CACCACCATG TCTAGCCAGA 2520
TTTGCAGAGT TGTTTATTTT ATTTTATTTA TTTTTAACAA GACCCTTCAT CCAGGGACCC 2580