EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-05224 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr12:86605990-86607100 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr12:86606631-86606642GTTTTATTGGG-6.62
POU4F1MA0790.1chr12:86605991-86606005ATGCATATTTAATG+7.03
POU4F2MA0683.1chr12:86605991-86606007ATGCATATTTAATGTT+6.49
POU4F3MA0791.1chr12:86605991-86606007ATGCATATTTAATGTT+6.37
Enhancer Sequence
GATGCATATT TAATGTTTAT CCTACTGGTG AAAGCCGAGA TTGTAGCCAG ATGGGAATCA 60
GCTTTACCGG CTCCCAACAT CTGGCTCTAA CACACTGCCA AAACAATGTC ACTTTTAACG 120
TTGCGGGAAA CCTGAGAACC CAAAGTCCTA GACCAGGCTC TGGTGCTGCT TTGTGGTGTG 180
ACCTGAGAGC CACGTTATCA TCAACTTCTT ACATCAGAAA CATAGCAAGT GGACTGATAA 240
ACGCATTATA GTAAAGTACA TTTGAAAAAT ATAGTTATGA AGGCCTAGCC TACATTTTGC 300
AAAATGTGGC CAAATCCTAT ATTCTAGGGG AAGCTCATAA AAGCGCACTA TGCTGACCTA 360
CAGATCTTAT TGGAAACTTA GGTTTTTCCA ACCTTAGGCT GGTAGCCACA AATGGAAGCA 420
GTCATGCCTC TAAAGATAAT TTCTACAAGT GTATTTGGGA AGAAAGGGAA AATAGGGTAG 480
ATAAAAACTG TGTGTCTTCT AGCCAGTAAC AGTGTACCAT TTTATTAAAA TGAAGTTCCC 540
CACTCTCTCT TACACACACA AACATCTTAG ACACATGTAA ATACATTTAC ATCTTTTATC 600
AGTCTTTACT AAATTCTTTT CTTTCCCCCG GTGTGGAAGA GGTTTTATTG GGAGAGAAGA 660
GAGGAGGAGG CAGCAGAAAG AGAAGAGGGG GAGCTACTAA ATTCTTATAT TTAAACATTG 720
TTAAACCCAG TGACTCTCCA TGAGTGACTT ATGAGTGTCA CTCGTAAATC AGTGAACCTA 780
CTGTGTTATT CCTTAACCAC AGCAGAGGTC TTAAAAACTT GCCTTCAGAA GCTGAGTGAG 840
ATGGCACATA CCTTTACTTC TACAGGCTCT AGAAGCAGGA GCTATCATGA ATTCAAGACC 900
AACCTGGCTA CAAAGAGAGT TTGAGGCCAG CCCGGACTAC ATAGCAAGAC CTTATCTCAT 960
TATTCCTTGA CCCCCCCTCC CAAAAAAATA TGAAGCACAG TCTTCCAATG CTATCTGCTG 1020
AGGTCACCTC TATGAACAAA AATTATATTG CTCTTTGGCC ACTATTCTCT TTCCCAAAAA 1080
CATTTCACAC CAATGAGTCC TGCATGCTTA 1110