EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-04649 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr12:11228340-11229640 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr12:11228468-11228481TGCAGCTGTTGCT+6.64
MyogMA0500.1chr12:11228467-11228478CTGCAGCTGTT-6.02
Nr5a2MA0505.1chr12:11229476-11229491GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
PHOX2AMA0713.1chr12:11228617-11228628TAATCTAATTA+6.32
POU1F1MA0784.1chr12:11229565-11229579ATTATGCAAATTAG+8.12
POU2F1MA0785.1chr12:11229565-11229577ATTATGCAAATT+6.92
POU2F2MA0507.1chr12:11229566-11229579TTATGCAAATTAG-6.13
POU3F1MA0786.1chr12:11229566-11229578TTATGCAAATTA+7.22
POU3F2MA0787.1chr12:11229566-11229578TTATGCAAATTA+7.22
POU3F3MA0788.1chr12:11229565-11229578ATTATGCAAATTA+7.22
PROP1MA0715.1chr12:11228617-11228628TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr12:11228617-11228628TAATCTAATTA+6.32
Pou2f3MA0627.1chr12:11229564-11229580AATTATGCAAATTAGT+6.22
Tcf12MA0521.1chr12:11228467-11228478CTGCAGCTGTT-6.62
Enhancer Sequence
CTCTCCTACA ACACAAATAG CTCTCAGGGT TGTCCAGCCG GAGCGGGAGA GCAAGAGCTT 60
ACATTAAAAA ACAGCTGCAC AGAGATGCGA TTGAGAGGCC GTCATCACTC CAACAGTGGG 120
CTCATTACTG CAGCTGTTGC TACCTTTCAA AGCCAGACAG CTGTTGCCAG GAGATGGATT 180
CAAACAGAAC AAAGGAAATG GAGTTCGCAG TAATGACCGT GCCTGTATGT GTGTGCACGA 240
TGTTCTTCGT CCTGTAGCTC AAAGCGTTCC ACAGATCTAA TCTAATTACT TCTCGGGAAG 300
GCCATGCTTG AGGGATACAA GTCAGAAAGC CAGGCGCGGA GAGAAGCAAG GCAGTCTTTG 360
TGGAATACTT TTAAAACTAG AAAGGAAGGT TTGCGGGAGT TGCACAAACC TTCAGCCTCC 420
TGTGATGGCG TTTGCAGTGG ACACTGAGTG TCCTTGTCCT TAGCAGGGCT GGGGAGCCCC 480
CACAGTGTCT CTGCTGAGGA ACTGGGAATA GGACAGGAGA TTAGTTCTAT CTTCCCCTCC 540
TCCCGTTTCC TGGATCTAGA CCTTGTCTTC TCATGCAGGA GGCCCCGTGC CACAAGCTTC 600
TCTTGTGACA TTCTTACTTT CACCGCTTTC CTTCCTTGCT CCTTCCTTTC CTCCAGCCTA 660
GACATTCTCT TCTCCCCCGC CTTGGAAGTC ACACAGGCTA AATAGACTTT CCTGCTCTGG 720
GCCAGCCTCC CCCACTAGAC TACGTACCAG ACTGTGGACT GACAGAGGGT CCTTCTCATG 780
ATTCTGCTGT CCACCTCTGT CGCTGAACAA GATGACTACA TATACAATTC ACATTATTTC 840
TGCCTTAAAT GATCCTGCTT ACGGTGGTTT ACTCGTCAGT TATGCACCCT CGGGAATAGT 900
TTGCACTTGT TTTGATTGGT AATTTGATTT CCTAGTTTTC CTGGAGGGAA AGGTAGCTCT 960
GGAGAATGCT CTGGGTTGAA GAGGGAAGGC AACTTGCTTT AGTTCACCGC TGGTGGTCTA 1020
AGAGCTTAGG TGGTCACTGT AATCCCCTGC ATGGGCCATC AAAAGTTCCC TTTAAGAAGT 1080
ATGCAGGTAG CTGGGTGTGT TTAATCCCAG CACTTCGGAA GCAGGCAGAT TTCTGGGAGT 1140
TCAAGGCCAG CCTGGTCAAC AAAGTTAGTT CCAGAACAGC CAGGGAAATT GCACAGAGAA 1200
ACCCTGTCTC AAAAACCCCA AAAGAATTAT GCAAATTAGT TGGGCGTGGT GACATGGACT 1260
TGTGAGCTCA GTGCTGAGGA GGCAGAAGCA GAAGGATCAA 1300