EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-04626 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr12:8861030-8864660 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HSF4MA0771.1chr12:8864429-8864442GAACTTTCCAGAA-6.07
JUNMA0488.1chr12:8861314-8861327ATGACATCATTAT-6.98
JUND(var.2)MA0492.1chr12:8861313-8861328GATGACATCATTATG-6.5
MYBMA0100.3chr12:8862031-8862041GACAGTTGGT-6.02
NR2C2MA0504.1chr12:8862852-8862867ACAGGTCAGAGGTCA+7.58
Nr2f6MA0677.1chr12:8862853-8862867CAGGTCAGAGGTCA+6.67
RXRBMA0855.1chr12:8862853-8862867CAGGTCAGAGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr12:8862853-8862867CAGGTCAGAGGTCA+6.38
RxraMA0512.2chr12:8862853-8862867CAGGTCAGAGGTCA+6.27
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03030chr12:8860763-8888406TACs
mSE_05967chr12:8862270-8863413E14.5_Limb
Enhancer Sequence
GCTGAGGTGA TCTCCAGACC TCCTGCTGTC CTAGTGCCTT GGTGTCCCAG GGGCAAACCT 60
GGGATTTCTG GGACTCTGCC CCTGGAGATG AAAGGACCCC TGAAATCTCA ACTGAGTTCC 120
AAGGGACTCT ATCCTCTGAC CTACAGGAGC TTCTGCCCCA CTTGGAGTCT CAGTTTCCCT 180
CACTGTAGGT GGCCCCGGAT ATTCCACCCC CACAGATCTT TCCTGGCCAA GGACAGTGTA 240
TCAGAGGAAA GAGAGGGTTT GCTGAGGAGT GGGTGGGAGC AGAGATGACA TCATTATGGT 300
GAGCTGGGTT GGGGTGTGAG TCACACATGA CAAGAGGGCA AGGGAAGGCT TGACTAGGAA 360
GTCATGTGGT CAAACTTTGG GCCAGAAGGC TGGGGCTGGC ATGCTTGAGG GTTCAGTGGG 420
GGACAAACTC TCCCATAGTG CCATTTAAAT CGGGTCCCAG GGGGTAGGAG TGCAGCTGTA 480
GAAAACTGTA GTCCCTTATT GAGAACGGTC ACACTGGAGT GATGGCTGCT GGGCCCTGGC 540
CCAGTGCCCG TGGATATGTG ACTGATGGGA GATCTTTATG CAACCAAGTC TTGATACAAA 600
ATCCCTACTT CACAAGGCCT GCCCAGCCTC ACCCCCACTG TCTCCTTGGC TCTAGTTTCA 660
GTGGCGAGGC TGCCTTTTAC GTATGCCTCT AGCTTCTGCT TGCCTCTGAG CACATCCTAT 720
CTGGAAACCA GTAGTTGTTG GCTTTTGTAG CCCAGGTTAG CTCATCTATG GATACCCAGT 780
GGGAACCTCC AAGAAGGAAA CCATTCATTG TCATCAGAGT TGAGGGTCTG GTGTTCCTTC 840
CTACGCTGCC TCTGATTGTC ACTCCTTTGT CTTCAGTGGC TTTTCCTGGG ATCCGTTGGT 900
CACTCTTTGA GATATGTGCC TCACAGCAAG GCTCACCACC TAGATGGAGA CTCATGATGC 960
AGCAGCACAG CTCTAAAACT CTGTCACCCG GGCACTGGGC GGACAGTTGG TAGGCTTTGC 1020
TTGTATTCTG GTTCACAGCT GGCTGTATAC TCCTCCTCCT GTCGCTCTTC TTTAGAGGCT 1080
CCCTCAGCTG TCAATTGGCA GCTGTTATCT CTCTCTCTCT CTCCCTCTCT CTCTCTCTCT 1140
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTGTGT GTGTGTGTGT ATACACCTTA 1200
GGGGGGTTGC TGTTTGTTTG TTGTTTTTGG TGTGTGTGTG TGTTTGAGAC AGGATCTTTT 1260
ATTGCCCACG AACTCGTGGG GGTAGACTAG ACTGACTGGC CAGCAAGCCC TGCGGATCCC 1320
CAGCTGTACT TGCACAGCAC TGAGGTGACA AGAGTCAGCA CTGAGGTGAC AAGAGTCACA 1380
TCATAATGCT TGACCTTTTC TCTGTCTTTC TTTTTTTTGG GCAGGTTTGG GTTTGGGGGA 1440
TCCAATTCAG GTACTACCAA CTAGGCTGTC TCCCCGATTC TAGCAGCTAT TACTCTTGAG 1500
TCCCACTGAC TCCCTGACAC AGACTCACAC TTACCAATGT ATCTATTATT GTCTTTAAAA 1560
CCTTCAAGGT GGGTAGACTG GCATCCAAAT GCCTCACATC CCCTTGGTAT GTGCCCAAAG 1620
GGTCAGAGCT CCAGGGAGAC ATTTGTCAGT GGTACAAGCA TCTATGGCCC TTAGGGTATG 1680
GATGCAGGGG GCTCTCAGCC TAGCTCAGCT GCAATCGGAG GGAGGCAAGA TCTCCTCAAA 1740
GCAGGGGCGG TGGTCAGGTG GGGGCTTGCT TGAGAGGTTA TATGAGGTAC AGGAAATATC 1800
TGGAATCTAT GGGAATGAGA ATACAGGTCA GAGGTCACCT CAAATTAAAA TGGAAAAAGT 1860
CCCCTGTGTG AGGGCAATCA AAGGAGGTGA GGACATGTGC TCTTCTGGGA GCCAGATGTT 1920
AGTGGTTAAA ATTCCTGTGG GGCCAGCAGT AGGCCCAGGA GCAGCCCTGA GAGCCCCTCG 1980
AGGTGGGAGC TTTGAGAACA GAAGGGGCTC CTTAAGCCCT CCAAGGCCCT GACCCAGGTT 2040
TACTGAGCAT ACAGGACCTT GGCCCACCAA GTAGGGCCCT GGTGGGGTTT GGGGGGAGAG 2100
ATGGGCAGCC TGAGTCTCAA GGTCCCCAGG AACCTCTCAG TCAGACTGCC CCTGAGTGAA 2160
ACAGGATCTC TCAGTGCCTG CTCCAGCCAG CCAGGACAGC TCATTAGCTG CAGGGCCAGG 2220
TTCTCCAGAT TTATAGCTGG AGCCCTCACA TCTGAGAGCC AAGGTCTTTT GATGTGAGCT 2280
CAGGTTAGGG CAGGGGATTC AGCAAGGTTG ATGCTGAGTG CGACTTTGTC TCAGCCATCA 2340
GCCCCGAGCC CCGAGCCCCC AGCCCCACCC TCAGCTCCAG CCTCCCAAGC CATGGAGGGG 2400
AAGGAAGACT AAGCCCTGCT GGAGCTCATC TAGGTTCTGG GGCTTCCTGG ACAAGAGCTG 2460
CAGGAGAGTT AGTGGCCCCT CCCTCCCACC CCTGGACCTG GCCCAGGTCC AGACCCCATG 2520
AGGATAGCTC CAGCAGAAAG GCAACGCACA CATAACTGGA CAAAACCTGA CAGAATGATA 2580
GGGTATGCTT TGAAGGCTCC AACTTGGTAC ATACATTGGC TGAGTGGTTT GTTACGCTTG 2640
TCTTGCTTGC TGGCTGAAGA AGGGGAGAAG CAGTATATGT CTGCTTGTGT GTGTGTGTGT 2700
GTGTGTGTGT GTGTGTTCAT GTGTGTGTGT ATTCATGTAT ATGTGTATAT TCATGTATGT 2760
GTGTCTTCAT GTGTGTCTTC ATGTATGTGT GTATTCATGT ATATGTGTGT GTTCATATGT 2820
GTATGTGTTT GTGCATGTGC ACCTGTGGAG TGGCATATTC AGAGAGTAGG ACAGGAGAGA 2880
AAGGACAGTC AGAGGCAGTT GAGCAGAGAG ACCAGGGGGA CAAGAGGGAG AGAGTGAGCC 2940
AGCAACAGAG GTGAGAAAGA CCCAGACACC CTGGTTCTTG ATCCTGAGCC CTGCAGTGTC 3000
TGATTCTAGC TGCCCCAGGC CAGGTCTTTC AGGTCTGTGG CTCAGCAAAG TACCTAGGTC 3060
TTGAACTGTC CAAACTGCTC TCCCCTGCGC AGCAGAAGTA ACTAGTATTT AGGAGTAAAT 3120
ATTAATTCTA AAACACAGAC AAAGTATTCC AGTCCTGTCC CCGGGTCACT GGAGTTCCAG 3180
GGAGAGGATA GAGGGAAGAG AGAAAGAGGC AGCGCTGACA GATCAGGTCT TCCCCACTCT 3240
CTGTAGCAGA GCCAACGCTG CAGAGCGAGA ACCACTGGAG GGCGTTAGCC GTTAGAGGCA 3300
GGGAGGGCAG AAGGGCAGGG AGCGATAGAG TCTGCAGCAG TAGATGCTGG AAGGACAAGG 3360
CTGGGGGGAA AGAGGTCAGT CTTGCCTGAA TAACCTGCAG AACTTTCCAG AAGTAAAAGG 3420
AAGGGAGTAG TTCCTTGGTA CTGTATGCCA AGCCAAAGAC CCAAGCTTGG CTGAGTCTGT 3480
ACCCTCCCCC CTCCCCCCAT GCTGGGCCGA AAGAAGGAAA CAAACAAAAC AGTGGTGTGA 3540
CTAAGGGAAC ACTTTCTGAT AGTTCTAAAA GATGGAGCTT TCTTCAGGTA GATCCTGGAG 3600
TGAGGCCCTC AGATGTGGGT AGGGGCATGG 3630