EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-04622 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr12:8803420-8807230 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:8806544-8806562GGGAGGGAGGAAGTCAGG+6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:8806548-8806566GGGAGGAAGTCAGGAAGG+7.11
FOXB1MA0845.1chr12:8805146-8805157TATGTAAATAA+6.02
Foxq1MA0040.1chr12:8806312-8806323TATAAACAATA-6.32
NFIAMA0670.1chr12:8805647-8805657ACTTGGCACC-6.02
NR2C2MA0504.1chr12:8803541-8803556TGACCTTTGACCTAG-6.74
Nr2f6MA0677.1chr12:8803541-8803555TGACCTTTGACCTA-7.64
RREB1MA0073.1chr12:8805502-8805522CCCCACCCCCACCCCCACCC+6.27
RREB1MA0073.1chr12:8805503-8805523CCCACCCCCACCCCCACCCC+6.27
RXRBMA0855.1chr12:8803541-8803555TGACCTTTGACCTA-7.19
RXRGMA0856.1chr12:8803541-8803555TGACCTTTGACCTA-7.25
RxraMA0512.2chr12:8803541-8803555TGACCTTTGACCTA-7.25
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02614chr12:8782967-8832907HFSCs
Enhancer Sequence
ATGACAGAGT TCTGTGGCGG CCAGTGGGAA TCAAAAAGAC AGGGACATTT GTCCAGCATC 60
AGAGTCATTG GAGCTCACCA AGGCAGCCCT TGGACCAAAT CAGGAGGAGC AAAAGTGTAG 120
GTGACCTTTG ACCTAGAGAA GAGGTGCTCC AAGCAGAAAG CCCCACTCAG TCAGACGGAG 180
CTCCAGAGGC TTCCGGCTGT CTGGAAAGCT GATGCAGGTG CAGGACAGTC AAGGCTGCAG 240
TGCAGTGATG GCCAAGGAAA GGGGAGACCT TGCACATGGG TAGGGGAGTA CGGAGCGCCT 300
GGCTTGAGAC TTAGAGGCAG ACTATCAGGA TTTTTGAAGC ATGCTACTGG ATGATCTTGC 360
TCTCCCTTGG GAGCCTGAAG GGAACCCAAA GGCAAAGGTA AGAAGTAACC ATGCCTCTGA 420
GCTAATGGTC TTGGTGAGGA GAGGTCACAG GAGGAAAGGG CACGGTAACC CTTTCAGATG 480
AGCAATCTTG AGCCCCTAGG TTAGGCACTG ATGGTGGTTG GTCCCAGAAC AGTACCTAGC 540
AAAACAGGAA ATGCTTGCAG GCAAGCACAA TGCGGAGGTC CAGAAATCAT GACTACCTCA 600
GAAGTATCCC ACCTGTATCT GTCAAGTCAT CCGTATTACT TCTCTCCAGC TTGACTCATA 660
AGCCATGATT GGCTGCCTCA GAGGGGTGAG CTCCTGGTCC CTGGAGCTAG GAGGTGGTCC 720
TGACCCAGGG ACCTAGAGGA GTTTAGAAAA TGCTTTGGCT TCACTGACCA TAAAGCTGCA 780
GAGTTTCAGG CTCTTCCGTC TCCACCTGGC TGTGGCCAAG CCTTCTGGCT TTCTCCTTTT 840
GCCTCCCTTG TTACTTAATA CCATAGCATC CCCTACCTAC CTATCTACTC TTGGCCATGC 900
GCACTCTTAT GATGGAATTG CCCCAATCAG GCCCTCAGCT GCTCTACTCA ATGACTGCTC 960
AAGTTCAAGT TAGGAGACGC ACGTGAATGC TGCCCCATTA CTTCCTGGCC TCTTCCTTTC 1020
AGGTATCTCT TGCTACTGGA CCAAAGATGT CTGCCGCCCT GGGTGCTCTT TGAAGGCAGA 1080
TGTTTGGTGT GCAAGAGTGC TTTGGGGGTG TTCTAGCGAG GCATATTCTG TTCTAAGTCC 1140
AGCCAGTCTT AGAGATGAGT GAATAACACA AGCTACCCCC TCCACCCATC TAGAAACAGA 1200
AGACGTAACT GTTGGGAGAG CAGAGGAAGG GACTGGGGTG GTTCTAGGCT TGTTGGAGAA 1260
TGTGCCAGTT CACACAAGCA TTGGAAGACT TGTATGATAG TAATTACTAA AAGCTGACAT 1320
TCACCGTTCT GGGGCTCCAG TGAAATAAAA CCATGTGTCT GTCAAAAGAT GTGTATGGGC 1380
ATACGCCTAG CCTCTGTAGC CATCATACAC CAGACACGGA AGTAAACGTG TATCAGCGGG 1440
AGCGGAGGAC ATCAATGGTA GTATATTCAT ACAAAGGAAT GCTACTACTT GGCAGTGCTT 1500
AAGGAACTAA AGCACACACA ACACAGGCAA CTTAGTGACT GCTTGAAGCC AGAAGGAACC 1560
TAGGTTGCAC AGTTCCAGCT ATTGGAGTAT AGTTGACCAT AATAGAAACC ACTGAGCCCT 1620
CGGGCTGAGG ATATGGTATT GACTAGGCAA GGACACAAAA GAACCTTCTA GGGTGCAGGA 1680
AATATTCTTC AGTTAGTTGC AGGTGGTGAT TACAAAGGTG AAGGTCTATG TAAATAAGCC 1740
ATCAGTCACA CTTAGGTGAG TGTACTCTGG GTATGTGATT CTGCCACAGA AAAGTTACAT 1800
GAAGAAAAGC AGTTTATTAG AAAAAGGGCT TCTGAGACTC TAATTAGCTC CTTTAAGTTC 1860
CACTGTAGCC TTTTCAGTAG AAACAGGGAA GGCCACATGG TTGACGTTTT CTTCAGAATC 1920
CCAGAGGATT CTAATTTATG GATCAAGAGG CCCAGGGCAA AGCTAGCCAC AGCTGCATGC 1980
CAAGCAAGCC AGCTGTTTGT CTGGATCTGG TGGGGTCTGT GGAGTGGACT CTTTTCTCAA 2040
CTGTGGGATA GTGAGGACTC TACAGAGGGC AGCGCTGGTG ACCCCCACCC CCACCCCCAC 2100
CCCCCAGCAG CAACCTGGCC TCGCTCTTTC CCTCCTTCCT GGAACCTGCC TTCCCCAGAC 2160
GCTGTTTCCA GCACTTAAGG CTGAGAGCTA AGCCATTCCT CCACTCCAGG AAAATATTTG 2220
CTCAGGGACT TGGCACCCGC AGAAGAGGAA ATAAAAGCCA CTTTGGAGTT GAGCAGGCGG 2280
CCTGCTGCAG GCTGCTTTGT CTGCCCTTCC AGACTGCCTC GGCACTGGTT GTGTCTAGGA 2340
CAGGGAAAAC GAATGCACCT TGCAAAGGGG CCAGTGCTAG GAACGACCTG GGTGTCAGCT 2400
CTTCATTTAG TGTTCAGTCA CCAGCCAGCT CCGCCAACCA AGGTTGACAA AGCCTCCTCC 2460
ATGCCAGGCT GGGTGTTGCT CTTGGCCTTG CTTTCCAAGC TAGGATAAGG GAGTGAGAGA 2520
GGTCAGTGAG AAGCCATGAC ATCATAGGAA GAACATGGTA GCCATGAGAA AGATGCTGGG 2580
AACTAGCAGG GTGACTTTGT CCGTGGGGGC AAGCTCGAGC TCTACCCAGA GTCAGGCTGT 2640
GGAAAGAGGA TGGTGAGTGC AGGGGACAGC AAAGGCCCTG GGCCAACAAT GTCCAAGAGG 2700
CTTAGGAAGT TGATGGAATC AACTAAGTTT GAAAGCATGA GTCTAGGAAT GGGAAACTGG 2760
AGAAAGGGTA GACAGGGAAC CTCCAGAATA CCTGTGTGAG AGTGTGAGTG TCTGTGGACT 2820
TTATCGCCAG GACACAGAAG GCATGTGGTT GTTGCAAAAA CACACACACT TGAGTCTTTT 2880
TAATATAGAA AGTATAAACA ATAAAGCTGG CCCACCGTGG TGTCACAGGC CTGTCATCTC 2940
AGTTGCTCCA ATAGGTGAGA CAGAAGAACT GCACGTTTGA AGCCGGGCCG GGTGAATGAA 3000
TGAATGAATG AATAAATAAA TAAGAGGGAG GAGAGAGATC GCTCAGTGGT ACAGTGCTCG 3060
GCTAGCATGC ACCAATCAAT CCTCAGGTTT ACTCAGAGTA TGAGGGTGGG AAGAAGAAGA 3120
AAAGGGGAGG GAGGAAGTCA GGAAGGCTAG GGACAGAACT GTGCTTACCT GAATCCCACC 3180
ATCTACAGAC TTCGTGATGA CATTTTAAAA GTTAAAAATA CTTGTGGGCA TATGACTAGA 3240
AATCCAAACA GAGCGAGAAT GTGCAAACCT CAAGCAAACT CTTCGTCCCC ACCCGTGGCT 3300
CGGGCCAAAG GCAACTTCCT TTCAACGGGG CGTCAGGGTC CGTTTCCAGA ATCCTTTTCC 3360
ATGCATGTTC CTACGAGGGT GTGTCTATGC TCTTATAACT TGCACAAATG GCTGGCTCTC 3420
TACATGGGAG ATGTGAGTGG TTTCCTTTAG CATGCCAGCA CCTGCAGACA GCTCCACCCT 3480
ATTCTCATAA TGGCTATGGA GTCCACTCAG TGATGCCAAA GGGCTGAAAC TGCCCCAGCT 3540
CTTTCTCCTG GTGGATGCTG GGTGGCAGGC AGATACTGTT GTCCTTAAGT GTACTGTGCA 3600
CAGCCTCCTG AACTCCCATG AATACACGTA CTTACCGGGC CCTTCCAGCC AGGGGTCCTG 3660
GACAGACTCA CAGGGATGTT CTTCACACTC GCCTTCTTGG AACGGGGGTC AATATCTCAC 3720
ACTAGTCACT GCACCAGACT GCAACAAGAG TCTCAGACTC ACCTCCCTAG CTTAGCAAAT 3780
GGGCCTGTTT GCTGTATGTG GGGTGTGGAG 3810