EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-04574 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr12:3809440-3812060 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:3810950-3810962GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr12:3810954-3810966GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr12:3810958-3810970GTTTGTTTGTTT+6.32
POU4F1MA0790.1chr12:3811749-3811763AATTAATAATGCAG-6.35
POU4F2MA0683.1chr12:3811747-3811763GTAATTAATAATGCAG-6.63
POU4F3MA0791.1chr12:3811747-3811763GTAATTAATAATGCAG-6.61
ZNF263MA0528.1chr12:3810562-3810583GTCTCCTTCACCACCTCCTCC-6.06
ZNF263MA0528.1chr12:3810761-3810782TTCTCCTGTCCCCTTTCCTCC-6.15
ZNF740MA0753.2chr12:3810514-3810527CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr12:3810515-3810528CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr12:3810516-3810529CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10883chr12:3809583-3810290Olfactory_bulb
mSE_10883chr12:3811064-3812078Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
TTGGCCCAGC CTCTCCGGTG TTCGCCAGGA GCCTAACCTG AGGAAAGGTG TGTTCCCTTT 60
AGACTCAAGG TCTGCTTTCC ACAGTGGAGG AGCCCAAGAG AGGCCGCCAA TGGCCATTTG 120
TCAGGGTGTC TGCAGGCAGG ATTCCTCTGT GGGGTGGGGG TTGGATGCAG CTTGCAGGCC 180
CATTCCAACT TTGAAATTCT ATGGCTCTGA TTTTCCTGGT GGAATTTCAG ACCCAGAATA 240
GGGCTAGAGT GGTATGTTTT CCCTCCACGG TAGTGGTCAT GGAGAAGGTA GGGGCTGCCA 300
GGGGTGGGCT TTGGCAGAGA GGGGAGAGAT GACGTGTTGA TCTGTCAGGT CTGACTGCAG 360
AGGATGGAAA CCACAGCTTC CCTGAAGCCT CTCCACTTGG TGCTCTCCTG AATGTACTGT 420
GTGGAAATGT GTGTGTGGGT AACTTGCAAG GGTTGTCCCC AGTCCAAGCT GTTGTATGTC 480
CCTGGGTCCC TAAAGGTAGT TCACCATCAG TTCCATGCCC GGTCCCCCAT TCTTTCCCAC 540
AAGCCAGCAA CGGACAAGAT GGAGCTGAAG GATCCTTGTC CAGCCTCTCT GGGTGGGAGG 600
AACTGAAGGT GATCTGCCTT CTTCTGAGTG TTCCGTTCAT TCGACATTAG TGGTGCCCAT 660
GAGGAAGGCT ACTAGACAGG CTCCCTACTC TCTCCTAGGA TGCATTCTGT CCTAGCCCTT 720
CAGTTGCTGG TTAGTCCAGT GGTTATTGCC TGCATGTAGG CCTCCGTTGA GAGAGCACCT 780
GGAGAGTTCA GCTCTCCTCC ACCCCCACGC CCCCAGACCC AAGTTACTTC CCAGATTCCC 840
TCAAGATTTC CATCTCAGGG AGCTAGATAA GGCACACAGA GCCTTACCTT TCAGATGGGT 900
GGACCCTCTT CTAGGATGTT CCCATGAACA CTCCAGCCCT TAGGAAGGGA CCTAGGAGCC 960
CCTGGAGCAT TAAGAGCTGG GTTGGGGTCT TTGTGGGAGA GGCCAAGCGG GTTCTGTCCC 1020
GTTCCTTATG TGGTTGGCTC TGCCTTGCAG GGCCTGAGAA AGAAGGGCTG TTTACCCCCC 1080
CCCCCCCCCA GCACTTACTG CCGCCTCCAG GTCCTGACCT AAGTCTCCTT CACCACCTCC 1140
TCCCTGCTGT TGATTGAGCA GGTCTGGCTG GTAGAAGTCA GAGCTGCAGT GTGATCCTTG 1200
GGGGAGTTGG CTCTAGCTCC ATTTTAGAAG CCGGCAGCTT TCTCAGCAAG GCTGGGTTTC 1260
TACAGGAACT CTGCTGCTCC CGACCAGGGC TTTAATAGTA AATTAAAGGT GCCAGGCTCC 1320
TTTCTCCTGT CCCCTTTCCT CCTGTCCCCT CCTACCCTTG AGTAGGAGGG CCCTGCTCTG 1380
TAGTCAAGCT CTGTAGACTG GCCTTCAACT AATTTCTTAG CCTTTGTCTC CCAAGTGCTG 1440
GCATTATAAG GGGGTTTGTG TAAACTTTAA GGGCTTATTT AGGGTCATTT GTGGTGGGTT 1500
TTTTTTTTTT GTTTGTTTGT TTGTTTGTTT TTGAAATCAT GCTTACCCAG ACTGGTCTCA 1560
AACCTTCTTC AGCCTTCTTT AAGCTCTCTT GTATCTGGGG TGACATGCAT CTGGCTTCAT 1620
TTGTCTTGTT GATTATAGTG TTTTTCCCAA AGAAATGAGC CAATCCAGTT CCATTAACAC 1680
AAGTCTTTCA CTGAAATCTG TGTTGTGTCC GAGCTGCCTC CATTTGGCTA ATTGTGTGGG 1740
CAAGATGGGG TCCACGCTGT GTGTCTGCAT ATTTGCGCAG ACATGTATGG ACACACAGCT 1800
TGCTTTATGT GAGCCAGGTT CAGCATGTCG TGTGGTAAGC AAGGGTCCTG GAGTTAGGGG 1860
GAGGTATCTG TTGACTCAGC GTAGCTGTAG GACTTAACTG CTGGCTGCCA GGACGTATGT 1920
AAGAGCCTAG CGCCATCTTA GCCAAGGGGC AGTGGATGTG TGGGTTGCTG TCTCTGCTGT 1980
CTGCATTTGG GGTGCACCGG GCAGCGGGGG GGGGGCATTT TGAAGTTCCG AAAAACCCCA 2040
TCCTGTCTCT TTTATAAAGC CTTGGTTTTA TAAGAATGAT CCTGACAGCA CTTGGAAATC 2100
TTGGCAGAGT GCTTCCATTC TCACAAATGG CTCTGTCAAC AGGTTGTGTG AGCACCTTCA 2160
GTCCTGAGTT TGCTCCAGCT TTTTATTCTT ACCCTGCCTT GAATTTCCGT AGAATTTTCC 2220
CTCATGTTTG CTTCCGCTTG TCTGAGATTT TATTTGCTGG GCATTTCCTG TCAGCAGGGC 2280
TCAGTGCCCG CTTTGAGGAG TACCCAAGTA ATTAATAATG CAGGGTGCTG GAGAGGGAGG 2340
TCACTGCCAA TTGAGAGGTC AGAGCAGGCT TCTAGGAGGA AGGGGCAGCA CCGAGGGCCT 2400
CAGAGCCCAG GAGTAGAGTG GGGGAAGAGC ATCATGGGGG CAGCCTCGGT GTGGGAATGC 2460
TCACCCATGG TGGATGCCTG GGAGGTGGAG GGGGCCTGGG AGGTGCTGGG GTCTTGGTAA 2520
GACTCCCCAG TAGTTTGGAG AGAGGGTTCC TGCACTTAGT GACCCCTATG TGTGCCCAAG 2580
AAGTGACTAA GTCTCCCTGC TGGGAGGTGG AGGGAGAGCT 2620