EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-03720 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr11:88319440-88322100 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr11:88319960-88319970TCTAATTAAA+6.02
Foxd3MA0041.1chr11:88321091-88321103AAACAAACAAAC-6.32
RREB1MA0073.1chr11:88321922-88321942TGGGGTGGGGTGGGTGTGGG-6.38
RREB1MA0073.1chr11:88321923-88321943GGGGTGGGGTGGGTGTGGGG-6.8
Enhancer Sequence
GGGGAGAAAC GACCAAGGAT TTGTCCTCTG ACTTCCACAA GCACACAGTA GCACTCCACC 60
CAACAAATAC ATCATGGGTT CCCTGTGCCA GACCAGGACA CCCCAAACTC CTCCATCTAT 120
GGGAAGGAAG ACATATTGCG GGAAGACATT AGAACCTAAC TACCAAATCT GGCCCTTCCG 180
CCTTCCACTC TGGGGCCAAA GCAAGGGGAC ATCGCCCAGT GGCCACCGAC TGCGCAGGCC 240
TGGTGTGGCC ACGTGCCACA CAGCGAAAAG CACAGCTTTC ATATACATAT CCCGGCAGTT 300
CCTGGGAGCA AATTGAGATC GCAAGGCCGT CAGCAGCCTG GGCGCTCATC ATCTTGACAG 360
ATACTTAGCT ATTCATTTAA AAACAAGGGC GAGAACAAGC GTCAGCTGTA TTTTTTAATT 420
ACTCCTGGAT AGAGCTGGGA CTGCTCTGGC ATAATTGGGG TACTGAGGGT TCCCCCTCCC 480
TTTGAAAGCC TTGTTGCAGC AAGAAAAATA CCGTGTTTAT TCTAATTAAA ACCAACCCTT 540
CTTTTAAATC ATCTTAGCAA TGGCAAGGCA AAGGGTGACA TCTCCTTTGG CGCGTTCCTC 600
CTTAGGAGGA ACTTCAGTGG GACCAGCTCT GCCATGGGCA TGTCCCTGGG CATAACTCTT 660
CCTCTTCAAC TATCAGTTCT CTCATTTAGG AATCGGGAAA CGTGAAGAGA ATTGCATGTG 720
TCCTCTCTGG CTCTAATGTA ATCTGAGACC ACTGCTCCCA CGATCCATCA CTCAGGCCCA 780
GTGGGGTGTA CTGTGTCTCT AGGACTCGCT CCCTGGTCCA CAGGATGAGT TCAGAGCACC 840
TGGTGCTCAA AGCCATCAAC AGCCTCTATG CTGACACCAG GGCTGTGCTG GCATTGCCAG 900
TGAGGACAGT GCTGTGGCTC CCAGCCACTC ACCAGTCCAG GGAGCACATC TGGTGGCCTT 960
GTTAAATACA CAGCCCCAGG CTTCCTTGAG AGCAGGACTC AAGAGAGGTC CAGGAATTCT 1020
CATTCTGGGC CCCATTATCT CTAACCAGAC ATTCAGAAAA ACTCAGGGCT AGTTAAAGCA 1080
CAGCCTTGGA ACACAGACTC TAGTCTCAAA GCCTGTCTTC TTGATTTCTT GGGCATATGA 1140
CCTTGTGTGA GGCACTGCCT GTAAGTTCTC TCTATAGGAG CACAGAAGGA AGGCATGTAA 1200
ATCTGTGTCT GCTTCCCACC ACATGGCAGT GGCCAGGCAA GGGCTATTCC CTTCCATGGC 1260
TTTCTTTTAG TTTGGACTTT TATGAGACAG GGTCTCATGC TGCACCCCAG GCTGGTCTGG 1320
AACTCATTAT GCAAACTGGT CTCCCATCTC AGCCTCTCCT TGGCTTTGAA GGAGGAGCAA 1380
TTTGAAAATC TTTTTAAAAC GCCCCAATGT GACAGCTGCT CAGAAGATAA ATTTGACAGG 1440
GGGAAAAAAA AGCTACATTA AAAAGGGTCC AGGAGCTGGA GAGATGGGTC CCAGTTAAGA 1500
GCGCTGACTG CTCTTCCAGA GGATCTGGGT TGAATTCCCA GCAGCCACAT GGCAGCTCAG 1560
AACTGTCCGT AACTATAAGA TCTGACACCA TCACTGACAT ACATGCAGGC AAAACACCAG 1620
TGCACATTAA AAAAACAATA ACAACAACAA CAAACAAACA AACAAAAAAG GAACACTTCC 1680
AACCATGTTT CTTGGAGTTA AGAGTCAGGG TGGAAGCTGA AATCAGCCAC CAACAAAGTA 1740
AGTTCAAAAT GTGAGCCAGG CAGGGAGAGG ACAGAATGAT GACCTTAAAC ACTAGCAAAC 1800
AGTGTTATAC TGAAATTTCC TGGGTGTCCC ACCCCACCCC ACTCGACTTT GGGCTATCCT 1860
GTTCATAGGC AAGGGCTATC CTGTTCATAG GCAAGGGCTA TCCTGGTTCA TAGGCAAGGG 1920
CTATCCTGTT CATAGGCAAG GGCTATCCTG TTCATTCATA GGCAAGGGCT ATCCTGGTTC 1980
ATAGACAAGC CTGCAGGAGA GTTACAGCTT CCCAGCCTGA TGGCGAATGG GCTGGTGCTG 2040
GCAGGAGGGA GGCAGCTGCC TAGTACTCCT GACTTCGAGG CTGTCATGCT TTGTCCTCAT 2100
GGAGCAGCTG GGGAATCGGG TCACCTGAGT GCTTCCATTT GCAGCTAGAC ACCTGGGCTG 2160
GCCACTGCCA GGCTCTCTGA CCAAACAGCT GACAGAGCAC ATTAGCTCAC CTTCTCTGCT 2220
TGTCAGAACA TTTACGTTCT GAAAGGTGGT GGCCATGGCG CTGGGCAGAG AAAATGCAGT 2280
TGTCATATCA GCCTGTTCAT CAGCCTCACG GAAGGTGTGA CAAGCCGGGA GAGCAGGGAA 2340
CCTAAGTGGA GGGAGAAGAG ATCTGGGCTG CTGGTGGGAC ACAGAGTCAC GCTAAACATG 2400
AGGCAAGAAC ACAGTAGCCC CGGAGGCATC ACACAGCCAC AGATGGTTCT GCTGGCTCTG 2460
TAGAGCAGGC AGCCTGCAAG GGTGGGGTGG GGTGGGTGTG GGGGGCAGTC TGGGTATCCA 2520
GCAGGTGAGT GACAGGCCAG GTCTCCCTGC ACTTCTGCTC CAGTTAACTA CCTGTATTAT 2580
GCTAAAACGA CACAAAGGAC AATAATTAAG CCCAGATCTC TGTGGATCAT TCGCTGTGAT 2640
AATTCCACCT TTGTAATTCA 2660