EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-03281 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr11:69377440-69378870 
Target genes
Number: 55             
NameEnsembl ID
RangrfENSMUSG00000032892
PfasENSMUSG00000020899
1500010J02RikENSMUSG00000020898
CntrobENSMUSG00000032782
Trappc1ENSMUSG00000049299
Kcnab3ENSMUSG00000018470
Gm16040ENSMUSG00000086900
A030009H04RikENSMUSG00000043419
Gm17305ENSMUSG00000091095
Chd3ENSMUSG00000018474
Lsmd1ENSMUSG00000059278
Cyb5d1ENSMUSG00000044795
Tmem88ENSMUSG00000045377
1700064E03RikENSMUSG00000085178
Kdm6bENSMUSG00000018476
6030455H03RikENSMUSG00000086591
Dnahc2ENSMUSG00000005237
Efnb3ENSMUSG00000003934
Wrap53ENSMUSG00000041346
Trp53ENSMUSG00000059552
Atp1b2ENSMUSG00000041329
ShbgENSMUSG00000005202
Sat2ENSMUSG00000069835
Gm12308ENSMUSG00000083485
Gm12309ENSMUSG00000083300
Fxr2ENSMUSG00000018765
Mir467fENSMUSG00000080573
Mpdu1ENSMUSG00000018761
Cd68ENSMUSG00000018774
SNORA67ENSMUSG00000065862
snoU6ENSMUSG00000089542
Eif4a1ENSMUSG00000059796
Senp3ENSMUSG00000005204
2010012P19RikENSMUSG00000085890
BC096441ENSMUSG00000018752
Polr2aENSMUSG00000005198
Amac1ENSMUSG00000018776
Zbtb4ENSMUSG00000018750
Chrnb1ENSMUSG00000041189
Fgf11ENSMUSG00000042826
Tmem102ENSMUSG00000089876
Nlgn2ENSMUSG00000051790
1810027O10RikENSMUSG00000070394
Plscr3ENSMUSG00000019461
Kctd11ENSMUSG00000046731
2810408A11RikENSMUSG00000018570
Neurl4ENSMUSG00000047284
Gps2ENSMUSG00000023170
Eif5aENSMUSG00000078812
Ctdnep1ENSMUSG00000018559
Rai12ENSMUSG00000018565
GabarapENSMUSG00000018567
Phf23ENSMUSG00000018572
Dvl2ENSMUSG00000020888
AcadvlENSMUSG00000018574
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr11:69378465-69378480AGAGTTCAAAGTTCT+6.13
NFYBMA0502.1chr11:69377700-69377715CAATGAACCAATCAG+7.56
Nr5a2MA0505.1chr11:69378005-69378020GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
ZNF263MA0528.1chr11:69378555-69378576GGAGCAGGGTGGGGGGGTGGG+6.69
Enhancer Sequence
GACAGGAACC TGGACAGAGA TGTGGGAATG CTGGGGTCAC CGGCAGGAGA AAAACTTGTA 60
CACCCTCCCT GGGGAGAGCT AAGGCCCAGG GGGAGACTAT CCAGGTAGGA AAGAGCACGC 120
GGGGCTCAAA GAACGCAACT CTTACCACCC TAACATTTAA CTCAGGCACT ACTGCCAGAC 180
TTGGGCCACC AAAAGGCAGC AGATTCATCA TTTTTTTAAA CACTCATATA GAAGATACAA 240
ATAATACCCT AATCCAAAGA CAATGAACCA ATCAGGGTCA TCTTAGCCTG CTTCTGCCTG 300
GCTGGAGAAG GAACCAAGGG CTTCACACTT GTGAGACAGG GACTCCACTA AGCAGGCCAC 360
ATTCTCAGCC AACACACAAA CACTTCAAAA GCAAAATGAG GGCTGTGGCC ATACCTCAGT 420
GGTACAACAC CTGCCTGGCG GGCATGAGGC CCTTGGCTCA ATCTTTTCTG ACACAAACAA 480
GCAAATACCT CTGACCTTTC TACTCAGCTG TCTCTTGCCT GTAACCCCAG CCTTTATTTG 540
AACCTGAGAC AGGAGGAACT GCTGTGAGTT CAAGGCCAGC CTGTAATACC TAAAGAATAA 600
CAGGCAGGAC TGAAAGATTT AGTGGACAAA GGCGCTTCCT GAGGATCAAG GCCGGCCAAC 660
AATGTGTTCT TTGTTCTTGT TCTGATCAAG ACAAGGTTTC TCTGTGTAGT CTTGGCTGTC 720
CTCCAACTCA CAAAGATCCG ACTGCCTCTG CCTTCTGTGT GCTAGGATTA AAAGTGTGCA 780
CCACCACTGC CTGGCAAAAA TAAATCTTAA AAAAAAAAAA AATTACAGAC CAACCTAAGC 840
TACATAGGGA AACACTGCCT CAAAAACTGG AAGACAGAAG CTGTAGCCGG GGTGGGTAGG 900
ACGCTTTCCT GACATCCACA CAACCCTGGG CTTGATCTCC AGCACCACAT AAAACAAGGC 960
ATAAGTGGCT CACGCCTGTA ATCCATTAAT CTTAGTACTC CAGAGGTAGA GAGGCAAGAG 1020
GATAAAGAGT TCAAAGTTCT TCTTAGATAT GTGGAAAAGG CCAGGGTTAC TTGAAACCCT 1080
GTCTCCAAAC AAAACAAAAA CAACAAAGAA AAACAGGAGC AGGGTGGGGG GGTGGGGGCA 1140
GGCGGGCTCA GTGGGTGAAG GCGCTTATAC AAACCTGGCG ACCTTAGTTT CATCTCACAG 1200
GGAGATGGAG AAAATGCAAG TCTGCCACAG CACACTCGCA CCAGTACCTA CACATCACAC 1260
ACACTCTAAT AAAACAACAA GAAAAAACAA AATAATTTTA AGTTTGACAG TGTGCTGGAA 1320
TGTGGCTCAA AGCCCTGGCT TTGATCCTCC TGACTACAAA AACAAAACGA AACACAGGCG 1380
ATGCCAGGAA GTGAGAGAAC ACCAGGCACG AATGTTTAAA TGCTGCTGCT 1430