EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-02115 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr10:80875900-80878980 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
Btbd2ENSMUSG00000003344
Mknk2ENSMUSG00000020190
SgtaENSMUSG00000004937
Thop1ENSMUSG00000004929
Map2k2ENSMUSG00000035027
Zbtb7aENSMUSG00000035011
Pias4ENSMUSG00000004934
Eef2ENSMUSG00000034994
Dapk3ENSMUSG00000034974
Zfr2ENSMUSG00000034949
MatkENSMUSG00000004933
Mrpl54ENSMUSG00000034932
Apba3ENSMUSG00000004931
Tjp3ENSMUSG00000034917
Pip5k1cENSMUSG00000034902
Gm16315ENSMUSG00000090230
2510012J08RikENSMUSG00000034889
Tbxa2rENSMUSG00000034881
Hmg20bENSMUSG00000020232
Mfsd12ENSMUSG00000034854
4930404N11RikENSMUSG00000020234
Fzr1ENSMUSG00000020235
DohhENSMUSG00000078440
2210404O07RikENSMUSG00000078439
Gm16104ENSMUSG00000085327
NficENSMUSG00000055053
Celf5ENSMUSG00000034818
NclnENSMUSG00000020238
S1pr4ENSMUSG00000044199
Gna11ENSMUSG00000034781
AesENSMUSG00000054452
Tle2ENSMUSG00000034771
Tle6ENSMUSG00000034758
Sirt6ENSMUSG00000034748
Ankrd24ENSMUSG00000054708
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HSF1MA0486.2chr10:80878060-80878073GAACCTTCTAGAA-6.74
HSF2MA0770.1chr10:80878060-80878073GAACCTTCTAGAA-7.12
HSF4MA0771.1chr10:80878060-80878073GAACCTTCTAGAA-7.04
KLF4MA0039.3chr10:80877622-80877633GGAGGGTGTGG-6.32
Klf1MA0493.1chr10:80877624-80877635AGGGTGTGGCC-6.32
SP2MA0516.2chr10:80876723-80876740TTAAGCCCCTCCCCCAC+6.15
SP2MA0516.2chr10:80878412-80878429CAAAGTCCCACCCACTT+6.59
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03027chr10:80864616-80896783TACs
mSE_03371chr10:80868336-80878939Bone_Marrow
mSE_03693chr10:80873113-80881085Cerebellum
mSE_04072chr10:80873013-80879646Cortex
mSE_06631chr10:80869871-80881189Heart
mSE_07454chr10:80872992-80879728Intestine
mSE_07969chr10:80869855-80881415Kidney
mSE_08356chr10:80870055-80886111Liver
mSE_08986chr10:80869946-80881109Lung
mSE_10904chr10:80873527-80878649Olfactory_bulb
mSE_12261chr10:80876049-80878227Spleen
mSE_12608chr10:80873260-80877639Testis
Enhancer Sequence
CAAGCCCGGA GCTCGGCCTC TCCCCCATGG TCTGCCAGGT GTGTCCTGGG TTCAAGTGTG 60
AATCCTCCTT TTCCTCTGGC TTCCGGGCAG GTAAGCACCA AGTTGGTACC AGCTGTATGC 120
TGGTCCTGTG GCACTCGCGT GTCTCTTCTA ATGTACAGAT GGGGAAACTG AGGAAGGGCA 180
GGGTTGGCTA AGGCTCACCC CACTCCCACC CAGTCCCCCT CCACAGCAGC CACCATGGGG 240
CGCCTGTGAG CACTGAGTGG GTCCCTCCTT CCCAGTCCAG GCCCTCCCCT TCCAGACCCC 300
TGCTGTGCTC TTTCCTCCTC CTTTCCATCA TAGCTCTTGA GTGAAATAGG CATGAGGTGG 360
GTTATCGGGG ACAGTGATGA GCCTGAAACC CCCTCACATG GAGGTTAGTG GCCACCCACA 420
GGGGTCCACC TTGCCTTGAG CTCCCCCAGG CTGGCCTTTG CCGGGAACCA GGATTTGAAC 480
TCTGGTCTCA GTGCTTGTAC GCAGTCACCT CCACACCCTG ATCGCAGTCT CTGCCTCCCA 540
CGTGCTCCAC CCTCATTAGG CTTTTCTCTG TCACTCTTGG CTGGGTCAGC AGGGCTGGGA 600
GCAGCGCCTT GCACACAGTA GGTGCTTAAT AGTTGCTCGC TGCACACTGG CTTGGCTGGC 660
CTCAGTCCAT CCCCAACCCC TTCATATATC ACAACCCGCT GCCCCTCCAT AGGCTGACTG 720
GTGAGGTTGT CGCCCCTTAC AGATTGGGAT GTCTGACCTT GTCATTGGAG GGGGTAGACT 780
GCTGGAGGAG GGCTAGGGGG TGCAGTCCCG GGACGCGGCC CCTTTAAGCC CCTCCCCCAC 840
GCGGCCGGCG GCTCCTTATG TAATTGGGCC GTTGTCCTTG CATAACCCAG TTACATAAGG 900
AAGCCTGGAA CGGGCGGCTC CATCCGGCGG GGACCAGTAC GAACACTGCA GGCCCCCCGG 960
CACCCCAGCC CGGTCAGCAG CTGCCACAGC TGGTGTTCAC CCCTCCCACT GGCTCCCACC 1020
AAGGGACCCC ATTGACTCTC ACCTGCTTCC TGCCCTCCCC CTGACTCCTG CCATCGGTTC 1080
CCACCTGGGT AGGCCCTGCT TTCCCCACCC CCCCCCAAAT TCTTGCAATC TCTGCAGCAT 1140
CCAGGAAAAG TGACCAGTTT CAAACCTAGC ACAGAATCTA GGTCCTTTCC CATTACTCAG 1200
AACGGGAAAC TGAGTCCCAG AGAGAGGGAG CTCACAGCCC GAGGCTGCAC AGTGCTGACC 1260
TGACCACAGT ACGGGGAGGA CCCTTCAGGG CACAATGTCG CTCCTGAACA CACTCCCTCC 1320
TGTGCACTCT GCTGCACCTG TCTTAGGGCC TATTATGCAG TAGGCACTCA ATAAATGCAA 1380
CCCTTGTGGC CATATACCTA GTGATGTTTG TTTTAGGCCT TGGCTCTTCA TTCCAAAGAG 1440
GAGGCCGTTT TAATATTTCA TCTAGTTCTC TGTGAAAAAG GGGCAAGGCT GCTTCCTACA 1500
GGGTAAACTG AGACAAAAAA GGAAGGGAAG CCTCAGCCTG CCTGTGCAAC CAGAAACAGC 1560
AGGGGCCCTA TTACTGCACA GAACCTGGCA CCACTTTCCT CTACCCCAGG AAGCCCATGT 1620
GTCTGGGGTT GGGAGTGGGT CCATTGAGCC TCTGGGCTTC TGTCCTGAGG CTGGCCCTTT 1680
AAGGCTGTCT GAGACTTGAG TCTGTCCCAG AGTGACCCCA GGGGAGGGTG TGGCCTGGAA 1740
CAAGGGGCCC ATTCAGTTCT GGGTGGGTGG GGGATGGGGT GGGACAGGCC CAGGCCTGAA 1800
GGACTGGTGG GTGTGTGTTA GGGGACTGAC AGACACCTGG AGTCAGACAT GAAGGAGCCC 1860
CACCTGCCTC TGTGCACCCC TTCTTCTGAC CCCAAGCCCC AAACTTACTC CTTGAATCAG 1920
TTGACTTTCC CTGCTCCCCA CAGTTAAGTC CTTTAGGCCC AAGGGGTGAA GGGCTTCCCA 1980
AACACTGCAG GTCTCGGGCA TGGGTTCGAA TTCTGATGAG CTTCTCTGGG CCCAACCTCA 2040
GCTCTCAGGG CTCAGTGACA TAAATGTGTC ATATCAGGCA GTGTAGACAC TCAGCAGCAC 2100
GGGAAGGTGA CCTCCTGCCT CAGGCCTTCC TTCAGCAGAG GCATAACAGA ACCTGTCCTA 2160
GAACCTTCTA GAACCTGGGG CTCACAAGTT CCCAGCCCCA CGATGGGCTT CTGGAAAGCT 2220
TCTCCCCAGT TCTCCCTCTG CTTAGAAAGC TGAGGCAGGG GGACTGATGT GAGTCCCTAC 2280
GACCTGAGAC CTTGTCCCAA AAACCCAGTA GGGTCTTGAG GCAGGAGGAT GAGGAGTCTG 2340
AGGCATCCTC AGCTAAGCAG CATGTTTGAG TCTAGCCTGG GCCACATTAA GGCCCCGTCT 2400
TGTAACCCAA ACAAGGCCAG ATGAAAGGGC ATTGGTTCGT TCTCTGGGCC TCAGATTCCC 2460
TGACTGGTCA GGATACCCCA TGCCTCCAAG AGTCCTGTCC ATCATCCCAC AGCAAAGTCC 2520
CACCCACTTG TGACTTCAGG CCCACGCAGC GGGAAGGGCA GTAGGGCTGT CGTCTGAGGG 2580
AACGGAGATG TCCTGAGCTG CTCCCAGCCA GTCCCAGGCG TAGAGCCAGG GCACCAACTG 2640
TGGTGCACAC AGGTGCAGGG GGATATCATC CACTGCTGAG CCCCAGAACA TGAGCGCCCT 2700
AGGGTGACCC CATCTCCCGC ACTCTGAACA CACTCGTTGC TATAGGAATG ATGGTATTTG 2760
ATACCTTTCT GGAGCTATGC AGCCTGCAGG GTGGAGCTAC AAGCTCCCGT GCCCTAGCCC 2820
TTACTAGTCC CATTCAAACT TCGCCCCCTC CCCACGCCCC TCAAAGGCCT GGACCCTGGC 2880
ACAGCCTAAA GTAAGCAAGC CACTTGCCCA GGACCACGGT GTTACCAAGT GGCACTATGG 2940
ATGCCCACCT ATCTCTGCAG CCACTAAAGA CACCACCAGA CCTTTCCTGC TGAGGAAACA 3000
GGCTCAAGGA TTGTTGAGGA GAAGATGGGC CCTCGCTCCC TTCTGGGGAC TGCGGGGTCT 3060
GAGAATCTAG AAGGAAGTGG 3080