EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-02068 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr10:80135640-80138560 
Target genes
Number: 51             
NameEnsembl ID
Med16ENSMUSG00000013833
Wdr18ENSMUSG00000035754
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
CirbpENSMUSG00000045193
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Rps15ENSMUSG00000063457
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Plk5ENSMUSG00000035486
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Atp8b3ENSMUSG00000003341
Rexo1ENSMUSG00000047417
Klf16ENSMUSG00000035397
Fam108aENSMUSG00000003346
Adat3ENSMUSG00000035370
Scamp4ENSMUSG00000078441
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
Btbd2ENSMUSG00000003344
Mknk2ENSMUSG00000020190
Mob3aENSMUSG00000003348
Izumo4ENSMUSG00000055862
Ap3d1ENSMUSG00000020198
Dot1lENSMUSG00000061589
Gm17151ENSMUSG00000075558
Sf3a2ENSMUSG00000020211
Plekhj1ENSMUSG00000035278
Jsrp1ENSMUSG00000020216
Oaz1ENSMUSG00000035242
Lingo3ENSMUSG00000051067
Lsm7ENSMUSG00000035215
3110056O03RikENSMUSG00000035206
Timm13ENSMUSG00000020219
Lmnb2ENSMUSG00000062075
Gadd45bENSMUSG00000015312
Gm3828ENSMUSG00000083808
SgtaENSMUSG00000004937
Thop1ENSMUSG00000004929
Map2k2ENSMUSG00000035027
Pias4ENSMUSG00000004934
Dapk3ENSMUSG00000034974
Mrpl54ENSMUSG00000034932
Apba3ENSMUSG00000004931
Pip5k1cENSMUSG00000034902
2510012J08RikENSMUSG00000034889
Hmg20bENSMUSG00000020232
DohhENSMUSG00000078440
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03323chr10:80136055-80143583Bone_Marrow
mSE_03893chr10:80133825-80143304Cerebellum
mSE_04266chr10:80136697-80139045Cortex
mSE_06220chr10:80137040-80143478E14.5_Liver
mSE_06681chr10:80133656-80139155Heart
mSE_08019chr10:80130869-80139008Kidney
mSE_08416chr10:80133697-80139001Liver
mSE_08985chr10:80136225-80139139Lung
mSE_11923chr10:80136579-80145462Spleen
Enhancer Sequence
GGGCTATGCC CAGTCCATAA CCTGCAATGT CTAAAGGTCC TTCTCTGGGC AGCCAGGGTT 60
CAAATTCATA CTTATAGTTC AAGTAAGACA CCAAAGGACC TAGCTGCCAG ATATGTGGAA 120
GACCTTAAGA CTGCTCAGGA GAGGTGGGAG CTAAAGGCCA GAGAAACCTG GTTTGAACAG 180
GAGCATGCTG AAACAAAACA CGTCCTCATG ATGGCTGCTG CTGGCACCTC GGTGTAGTGC 240
GCAAGCTGGG AGACTGAGGC AAACTCTAGC TTTAGAGGGA ATAACCTACC CAGAGAACAA 300
GGCATGGGCT GCAGGTGGGT GTGGGGAACG TGGTTTAAAT CACCCCTTTC TTAATATCCA 360
CAGTGGGAGG GGCTGACAAG AGGGTTATCT GGGAGAAAAG TCTCTCGACA GAACCCTAGG 420
GAGACCCCAA GGGGCTACAG CAGAAGGGGC CAGATACCTG GAGACCAGCA GCACACAGCC 480
AGAGAGCAAC ATTGGTACAC CTTATAAGCT GTTCTGCTCC CAGAACAGAG AATCGCCACT 540
AGGAGACTGG CACAAAAGGG GCACACTAGC AGGTCATGGG GAACAGGGCA CACAACCCCA 600
GTGCTCTGAT AAAACTCGCT GCCTGCAAGG CCCGGGCATC AACCTGCACC ACACAAGGTG 660
GGGGATTGGT GAGCTACAGA AGGGGAGGTA AACCAGGTTT GAGACCAAAG GCTAGCCAGG 720
GCACCTGCTC CATGACCACA GCCTGGTGAC CTTCCTCTAA GTATACTGTC ATGAGAGACA 780
GGGAAGGGCT GTCCCCAGCT CTGGGAACCT TACAAGGGTG ACAGGGGTCC AGTAGAACCT 840
CTGACATTAT AGTCACTGTC CCCCTAGCTG AAGACTGGGA CACATGGGAC AGCCAGAACC 900
TAGCACAGGG ATTGGCTGGC TGGAGCACAC CTTTCAGGGA GATCCCCAAG CGCTAGCTTA 960
CAGTCTTCCA GCTTGCACAT TAAAGACAGG AAAACAGGGC TGGGCTCTAG CTGAGTTCAT 1020
AGAGCACCTG TCTGGCAGGC ATGAGGCCCC AGACTCCATC ACCAGTACCT CTTAAAACTC 1080
CAGAAAGAAA ACCAGAAACC CAGGTAATAA AGCAGGCGGC CTGGCGGGTG TGTGTGCTAT 1140
CTGACTAGCT GCAGACTGAG GCTACCTGAG CAGCAGTAGC CTGGCTTCCA GAAGCAGCCT 1200
CATAGGGTGG GGTCCCAGGA GGGAGTTGAG GTACCAGTCC CTGGCCACCT ACAAGGCTGC 1260
CTAACAGCCA GCTCCCCACA GTCCCAGCTC AGTGCAGAGC CCCACAGTGG CCACGCAGAG 1320
GGCAGCTTGC AGTCCCAAGT GCTGTGTGGG CAGTCCAGTC TGGTCCAGCC AGCCTCCCCT 1380
GGGTCTGGCT GAGGGCCTTG AGTCAGCAGG CCTGGCAGGA GGCGGCTCGA ACCATCTAGA 1440
AAGCCAGGGT TTGCTTTGGC AGCCTTGCTG ACCCTCTAGG CTCAAGCAAA GCCCCAGGAG 1500
GGCAAAAAAA AAAAACCCAC TGTAGGTGAC ATTCTTGGGT CCATCTCTCG TTCCTGCTCA 1560
GCCCCAAATC AAGCTGGCCA AGGATAACAG GCATTTGAGG CAGGGGTGGG GCAGTTGGCC 1620
AGGGGCACTG GCTGGACAGG CCTGGGAATT CTTCCCTATC TGCATGCCCC TCCCACAGGG 1680
GTGCAGGCAC ACACATACAC ACTCTTGCCT TCTCTACAGG GCAACAGGTC CCTGCCCCAG 1740
GAAGCCATTA CATAATCCAG CCTTCTGGGT GGGGTGGGCA GGCTGACATC ACTGCGTCCT 1800
TTAGGCCAGG CCCCAAGTAG GGGGCTCTGC CTAGCACCCT GCCCACCTTC ACCACCCCCA 1860
GATATACTCA TCTAAGGTAA GACTCAATCA GCCACCATTA ATAACACTAC AGAAACTTCC 1920
TGTTCTGATA AGAAATAACA CTTTGGGCCT GGGGTGTCTT GAGGGAAGGT CTCCACAGGC 1980
CACCACCAAG TGTGGAGGTT GCAGTGGGGC AAAGCATACC CATGTGCCAA AGGGTTTCCC 2040
CAACAAGGCT TCATCCCCTC TGATCCCAAC CAACCGCACA GGCCAGCTTG AGACTACAGT 2100
GGACAGATAC AGGGTTTCCC TGGAACTATA TACACAGAAG TAGGGGAGAC GGGGCTGAGA 2160
GACTGCAAGG AACATCCAGC CACTGACCAC AAGCCAACCT AGGGGAGCTC ACAAAAGAGA 2220
GAGCTAGGAC CTGCTGACGT GCTTTCATCC AGAACAAGGC CAACCTGGGG GACACAGAAA 2280
GTGTGGGATC ACATACAGAA AGTGGGTGGG GAGCACAAGA CTGAGATCAG GCTGATGGCG 2340
AGGGACATAG AGCCACCAAT CAGTGGTGGG AGTGGGTCCT GAAAGAAAGA GCTACTAGGC 2400
AGCCGGGGAC AGGTTGTAGC CTGCAACAAG CACACACTGC AGGAAACAAA TGTAAAGTCC 2460
ATCAGAGACC ACATACAGAG GTAGGAAAGC CCGGGCTGAG AAACTGCTAG GGACACAGCC 2520
ACAGATCACA GGGGAGCCTG GGGCAGTTCA TGAAGAGTTA GTAGGCAGCT AGAAGCAAGG 2580
CTGCAGCTTA CTGACTCTCC CAACCAGCAC AAGACAGGCC TGGAAGTTGC AAGGAACAGA 2640
AACACTCGAT TTGCCTAGGA TCACACACAG AAACAGACGA CTGTGATCGG GCTAACTGCA 2700
AGGGACACAG AGCCACCAAT CACAAGCCTG GGGGTGGGGG TTGAGGGTCC TAGAAGAGAG 2760
AGCTACTAGG AGGATGGGGA CAGGGCTGCG GCCTGCTGAC CCCCACCACC TCCAGCACAA 2820
AAGTCCAATG CAAGCACCCC TCCCAAGCCC TGCACCAGCC TCCCGAGTAG GCTCTGCTTA 2880
TCCGTCGCAC CCGTCACTGC AATGGGACCC CCGGACAGGA 2920