EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-02031 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr10:79533500-79535040 
Target genes
Number: 52             
NameEnsembl ID
Gm16517ENSMUSG00000020308
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
Prss57ENSMUSG00000020323
PalmENSMUSG00000035863
9130017N09RikENSMUSG00000035852
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
ElaneENSMUSG00000020125
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
Apc2ENSMUSG00000020135
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Adamtsl5ENSMUSG00000043822
Plk5ENSMUSG00000035486
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Rexo1ENSMUSG00000047417
Scamp4ENSMUSG00000078441
Btbd2ENSMUSG00000003344
Mknk2ENSMUSG00000020190
Sf3a2ENSMUSG00000020211
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr10:79533559-79533571GTTTGTTTGTTT+6.32
Myod1MA0499.1chr10:79533792-79533805AGGGACAGCTGCT-7.52
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr10:79534442-79534455TCCCCTGGGGGCA+6
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr10:79534442-79534455TCCCCTGGGGGCA+6.18
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr10:79534442-79534455TCCCCTGGGGGCA-6
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02776chr10:79533407-79540086HFSCs
mSE_09645chr10:79532318-79540297MEF
Enhancer Sequence
TCACCATGTA GAAGCTGGGG ACAGAGCCTG TGTCCTCGGT AAAGGCATCA TACCCCTTAG 60
TTTGTTTGTT TTGTTTTGTC TTTTTCAGAC CAGGGTCATG TAGCCCAGGC TGGTCTTCTC 120
AAACACCCTA ACGAGCCGAG GGTGACCCTG AACTCCCTGT ACCTTCTGAG TGCTGGGATT 180
ACGGGGACAA CACCACACCT GGGCCATCTG GTGCTGAGGA CGGAGCGCAG GGCTTGGTGC 240
ATGCCAGGGA GCACTCTCCC CACTGAGCCA CAGTCCCTCT GATTGGCAGC ACAGGGACAG 300
CTGCTCAGCC TCCAGCCCTA ACCTGGAGGG CTTGCTTCAG ATGCAGCATC CTTGAGGGGG 360
GACAGGAGTC TCTGAGGCAC TTCAGGCACA GTCACTGTCA CATGTCCCTT GCTCTGCTGG 420
GCACAGGGCC AGGGGTGTTG AAAGCCAGCG GAAGCTTGGG AAGGTTACAA GTCCACACTC 480
AACCCTCCTG CCTTGTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT CTTTCTTAAA TTAACAAAAA 540
CCCAAACAGA CTGTGGAGGT TCCTGGAAGG CTGAGTCATG TTCCGGGCTG GAGCAGCACA 600
GGGTGTTGGG TTTCAGATAT GGCTGTGGCG CTTGGTCCAG GCAGCCTGGG GCCCTGGGCA 660
GGATAGGCAG TACCCTGTGG CCTTGATCTC ATAGCTCCAC ACAGTAGGGG GTGGGGGACA 720
CACAGGGACT GCCGGTCCTG CTGGCTCTGC ACCAACTGCA CTGTCAGCCC TTAACTCTGA 780
GCTGTATGGC ACCAAGGCTT CCTTCCTGAA GACTCCTGGG AGCCTCCCTA ACTTACACTC 840
TCAAAGTCTA GAAGCTTCCA TCTAGAAGAC CCTGGCAAGG CCTAGTCCAT GCCAGGAGCT 900
CCCGACAGAG TAACCATACA TACCTCCCAG ACACTGTTAG TGTCCCCTGG GGGCAAAAAT 960
AACTGCTGGC TAAGATCCCT CTAGGTCAGA GTCCTGCACA CCCGGAAGCC TCTGTGTCCC 1020
ACAGTCACCT GCCTGCTGAG TGGGTGGACA GAGAGAAGTT GACCCCAGAA GCTAGGGTCC 1080
CCTGAGAGAC ACTGCTTGCC TCAAAGTGGC GGTCAGTCAC AGTAGACCAT CCATCAGGTC 1140
CACTGAGGGT GGAGAGCCTG GGATGAGAAC TGGTGACCCA AGCTACCTTT AGAGTCAGAC 1200
ATGCTGGCAC ACACCTGTCA CCCCAGGATT CAGGGACTGA GATAGGTGGA TTGGTAGCCC 1260
AAGGGCAACC TTGGCTAAAA GAGTAAAGTT GACACCAGAC TGGGCTATGT GAGATCCTGG 1320
CTCAGAAACT AAATGAAACC AAACAAAAAT AAACTCAAAC TGCTTTCCAC TCTCTCTAGG 1380
AATCGCTGTG TTCCTAGCAG GTATACAACA GCTGGGACCC AGTATGGGGC ATGAGGGGAC 1440
ATGGGGTATG TGGAGGCCTT TAGGGCTGTG GGACTGGCCC GCCAGCCTGG GGTATAGGAC 1500
CCCTTATAAC CCAGGCCTGA ACACACTGTT GTCAATCACA 1540