EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-02025 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr10:79445680-79446650 
Target genes
Number: 57             
NameEnsembl ID
Mier2ENSMUSG00000042570
Shc2ENSMUSG00000020312
Madcam1ENSMUSG00000020310
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
GzmmENSMUSG00000054206
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
ElaneENSMUSG00000020125
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
Apc2ENSMUSG00000020135
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Rexo1ENSMUSG00000047417
Fam108aENSMUSG00000003346
Scamp4ENSMUSG00000078441
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
Btbd2ENSMUSG00000003344
Mknk2ENSMUSG00000020190
Mob3aENSMUSG00000003348
Ap3d1ENSMUSG00000020198
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:79445705-79445723GGAGGGCAGGAAGGAAGA+7
NR2C2MA0504.1chr10:79446617-79446632TGGGGTCAGGGGTCA+6.67
NR2C2MA0504.1chr10:79446631-79446646AGAGGTCAGGGGTCA+7.19
NR2C2MA0504.1chr10:79446624-79446639AGGGGTCAGAGGTCA+9.03
Nr2f6MA0677.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.03
RXRBMA0855.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.04
RXRBMA0855.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.06
RXRGMA0856.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr10:79446632-79446646GAGGTCAGGGGTCA+6
RXRGMA0856.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.01
RxraMA0512.2chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+6.98
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03404chr10:79445313-79453117Bone_Marrow
mSE_06348chr10:79445348-79451828E14.5_Liver
mSE_07798chr10:79445937-79453081Intestine
mSE_09619chr10:79446247-79454263MEF
mSE_12142chr10:79446084-79453231Spleen
Enhancer Sequence
CACCCACCCG GAGCCCTGAG GGTGTGGAGG GCAGGAAGGA AGATGGAGCA TGGGCTCATC 60
TGCAGCCAAT GAACTGGGGC CTGAGGGGAT GCCCACAGCT GTCTTGAGCT CAAGCTAGAT 120
CTACCTATGA AACCCCCGAA CGCTCAGTTC TGAGAAGCAC CAGGAGTGAG TCCCAAACTC 180
ACCAATGCCC TCCAATATCA GCATGCCAGC CACCAAGCCA TGACCCCAAC ACCAGAAGGC 240
CCAGGCAGCT CCTCAGAGAG AGCCTGGTGC CATCCCTCGA GTAGCCTTTG TGACCGAGAA 300
CCGGGATCTC CCGGGAGCAC ATGAAGAAGA CACAGCCAGG GCAGGTGCTG GCTGTAGAGG 360
TCCCTGGCCA ATCTGGCTGT GACTCTGTGG CTGACCCTAG TGAGATGACC TCACCCAAAG 420
CCACAGAAAA CCTGGCAAGA GTCTGAAAAC AGTGAAGTAA CAGAAAATTT GAGCAGTGAC 480
ACTGGGGGGT AGGGGGCTGT CCCCAGGGGG TTGGTTCAGG GTGTGCTGGA ATGGGACTGA 540
CTAGTAGAGA CTGGACTGAG AGAATCAGGG TAGAATAGAA ATGACAGGCG GGACAGGGCC 600
TCCAGCACAG GAGGTGGTCT ACAGTGGAAA GTCAGGAATG GAATGGAAAT GACCATATTG 660
TTCTCAGTGG AGGTGCAGGA CAGGATGGGA GTGACAGGTG GGAAGGTGGA CCTCGAGTCC 720
AAAATCCTAC TCCAAGAGGA CACTGGGCTC TGGTCTTGAG TGGAAAAATT TGGGGCCTAG 780
GCTCCCAAGT GGCAGACTGA GGCCAAAGGG CAGGAGGCGG GGCCTGAGAG CTGAGGAAGT 840
GAGGACCAGA GATAGCATCT GTAAGAGTGG TATCAGGGTA TCCAGGCGTC AGGAGCCAAG 900
TGGTAAAGTT GCCGGGGGTG GGCGAGCGGA TGACAGCTGG GGTCAGGGGT CAGAGGTCAG 960
GGGTCAGAGG 970