EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-02010 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr10:79302770-79304620 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
Mier2ENSMUSG00000042570
Shc2ENSMUSG00000020312
Madcam1ENSMUSG00000020310
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
GzmmENSMUSG00000054206
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
ElaneENSMUSG00000020125
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Rps15ENSMUSG00000063457
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Mbd3ENSMUSG00000035478
Scamp4ENSMUSG00000078441
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr10:79302979-79302989GCACGTGACC-6.02
CDX2MA0465.1chr10:79304076-79304087TTTTATGGCCT-6.02
ESR1MA0112.3chr10:79303976-79303993GAGGTCACCACGACCCC+6.19
ESR2MA0258.2chr10:79303977-79303992AGGTCACCACGACCC+6.28
Foxq1MA0040.1chr10:79303879-79303890AATAAACAATG-6.02
SP2MA0516.2chr10:79303735-79303752AAGTGGGAGGGACTTTG-6.34
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04504chr10:79303153-79304081E14.5_Brain
mSE_04845chr10:79302976-79304654E14.5_Heart
mSE_05508chr10:79302762-79304677E14.5_Limb
mSE_07352chr10:79302988-79304675Intestine
mSE_08114chr10:79302803-79304677Kidney
mSE_09089chr10:79302817-79304681Lung
mSE_09812chr10:79302961-79304656MEF
mSE_10291chr10:79302623-79304692Embryonic_stem_cells
mSE_11035chr10:79302942-79304508Olfactory_bulb
mSE_11888chr10:79303090-79304641Placenta
mSE_12235chr10:79303866-79304386Spleen
Enhancer Sequence
CAGAAATCTG CCTGCCTCTG CCTCCCAAAT GCTAGGACTA AAGGCGTGGG CCACCACCAC 60
CCGGCACATC TCTCTATCTT TTGAGTCAAG CTTCCACTGT GTCGCCCAGT AGGGCCTCAA 120
ATTCCTGATG CTCCCGCCTG GCTATGGCTT GGCTACCAGG AGTGACCCAC TGGGTTCCAT 180
CTCCTGCACC ACACAAACAG AACTTGGTGG CACGTGACCA TCATCTCAGC AATCAGGAAA 240
TAGAGGCAGA AGGACCAGGT CATCTTCAGC TACATGTCCA GTTTGAGCTA GCCTTGGCTA 300
CATGAGACCA TGTTCAAAAA GGCAAAAATC AATGCAGGCA GCAGGCACCC TGCATAGCCC 360
TTCCTTGCCC TGTAGTCCTT CAAGCTTGGC AATGTCTAAG GAGCCACTAG GGCATCACCA 420
GAGACAGATG GGAGATCACA TCTAAACCTC CAAACTCAGA AAATTGGGCC AAAGACATCC 480
CTAGCAGGTT TTTCCAGCCC TCAGAGGCAG TAACGTGCAC CTGAATTGCT TGAACTTGCT 540
GGAATTTCTT CCATGGTACA GCAAGCAGAC TCATGGCTGT GTGGGACGTA GACAGGAGGA 600
GTGTAAAGGG GGACAGGGAT GTTGAGGGAT ATGCTAGTGT TTGGATACTG GGTTCCAGCC 660
CAGCCTGTAG GTGGCAGGAA CCCCTTCTTC CTACCTTGAT GCTCTCTGGT GGTATAGCCC 720
CTGCCTAGAA CCCACACAGC GAAGGGCTGG AGGTGTGACC ACAAGGATCC TAAGGACCCT 780
CCCTGCCTAG AATCCTCCAG TTAGAGCCCT GTGTGTGCTC AGGGGTGGAG CCCTGCCTAG 840
AACCCCGCAG TGAGAGGCTG GGAGCAGACT CAGTCCTTAG CTCGACTCTA GCCAAGTACG 900
CAGCTCGGGG TTTATGATAA TATATGGAAG AGTGGAAGAA AATCACCCGC TGTGGAAGTC 960
TGAGGAAGTG GGAGGGACTT TGCCGCGGAA TGTCTGTGCC CACGCCTGGG CTGTAGTGGT 1020
AGTCTAACTC CTCACACCCC ATCCCCCAGG CTCCTTCCAA GTCCAGACAG AGAAAGGAAT 1080
TCCTGGCTGA GTCTAATTTA AAACAAACAA ATAAACAATG TTTGCAGGGA GGAGAATGAG 1140
AGGAATGCGG GCGGGGCTCT TCCCTGCGGG AGAACCGGAG AACTGGGGCC TCGGACTGCA 1200
AGAACAGAGG TCACCACGAC CCCAGCAAAC TCCCACCCCA TCTCTGCAAA GAGCTGGAAA 1260
GCACTGTTAA GCCCACCCCG ACCGGCCTTC CAGGGTTATT CTGTTGTTTT ATGGCCTTTT 1320
TGCTCCGCTG GCTGCAAATT GGGGGAGGGG AGAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAACACGGG 1380
AGGCGGGGTA ACGACAGATT CCGGATCCCT GGTCCCGGAA ACCTTTGTTT CTTAAGGCTG 1440
GGCAGCTGCT CCTCAGAGAC AGTTAGGGCT CTGGACTTGG AGCACCGGTC AGTGTTTTTA 1500
CTTCAAGGAA AGCTCTAACC TAGAGCAAGA GCCCAAAATT TCTCAGGTAG TTTGAAAAAC 1560
AGTGAGGTGG TTTTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTCT 1620
TTCTGAGGTG GTTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1680
TGTGTTTCTT TCTTAGTACT TGGTAAGCTG AAGCAGGAGG ATTGCGGCAA TTTTAATGAC 1740
AACTGGGCTA CATGAGACCT TGATTGTCTC CAAACATTGT TGGTGCCCAC CTGTCATGCC 1800
AGCATTCAGG AGGTGGAGGC AGGCGGATCA AATGCAAAAG ACTATCCTGG 1850