EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-01239 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr1:180497620-180502760 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:180501313-180501324GAGCCATAAAA+6.14
FOXP1MA0481.2chr1:180501528-180501540AAGTAAACAGAC+6.52
FOXP2MA0593.1chr1:180501528-180501539AAGTAAACAGA+6.32
NEUROG1MA0623.2chr1:180499469-180499479GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr1:180499469-180499479GACATATGTC-6.02
RREB1MA0073.1chr1:180501247-180501267CCCCCAACCACCACAAACTG+6.09
RREB1MA0073.1chr1:180501243-180501263CCCCCCCCCAACCACCACAA+6.5
SOX10MA0442.2chr1:180497774-180497785GTCTTTGTTTT-6.14
STAT1MA0137.3chr1:180499670-180499681TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr1:180499670-180499681TTTCTGGGAAA+6.32
YY1MA0095.2chr1:180501581-180501593GCCGCCATGTTG-6.37
Enhancer Sequence
ATCCCCAGAG AATGTTAGAA TCTTTGTGTT GGGAAGTGTA CGTGAATAGT CATCAGATTC 60
TCCAGCCTCC TAATTCTGTA ATTTTTTTGT CCTTTGAGGC TGACTCCCAC TTTCCTCCAT 120
CTGCCTCTGG TTATCCTCAT TTTTTTTTTT TTTGGTCTTT GTTTTCAGAA AAGGATAAAA 180
AAGTGTTTGC ACTAAAGGAG GGACAGAGGA TGGCATTGTT ACTAGGACTG TTGCTGTTAT 240
GTTTTCTGGG CAGGGGGCAC TGACTGCCTT TTCCCAGAGA CTAAAGCTTC ATGTCTAAGA 300
AGCCATTCTT GTAACTGTTG AATTTCAGAT GTAGGCTGAT TAGGGAGTCA AGGGTTTCCC 360
CAAACGCTCT CCATCATAAT GTATAGAAAC AGGTATAATT GTAGCTTCAT GATGAGCTTC 420
AGTGCTGGGT GTTTTTCAGA AGAGCTGAAG GCTCTTGTGT GACCTGCCAG TTGTTCCTTT 480
TTCTTGTTTT GTGTAAAAGG CAAAAGGACT TTTTTCTGTC CTGGGCATCA TTAGCGACCC 540
TGAGAGGGAG AGTTTGTTTC TTTCATTCTG CTGTGTGTGA CAGAAGCCGG GGACTTTCTC 600
CTGGCCACAC AGCTGGGAGC TGAAGCTGGT GTGAGCTCTG CCTCAAGGCT CTAGCTCTCC 660
CGTGTGGGTG AGGAACCATT CAGTGTCAAC ATTGCCTCTC CCCTCTTGCT TCTGAACCAC 720
TGCAAGGTAA ACTTGCCAAT AGGCTGAGTT GGTTCCATTT TGAATTTAGC TAACAGTTAT 780
TATTGTGTGG ATCTGTGTGT GCATGAAGGG TACACGTGAG TGCACATGTG TGTCACACGT 840
GTAGAGGTCA GGGAACAATT TTGTGGAGTC AACAATTTTG AAGGAGTCTT TCCTTTCACC 900
TTTATCTAGG TTGTGGGGTT CTCTTATTGT TGTTGTTGTC TTTGTTGTAT ACTTAGGTAG 960
ACAGCCTCCT TCAGCAAGCA CCTTTACCTG CTGAGCCATC TTCCATTTTG TGTGTGTGTG 1020
TGTACGTATG TGTGTGTACG TATGTGTGTG TGTATGTGTC CTTGTGTCTG TGTGTGTCTC 1080
TGTGTCTCTG TGTGTGTATG TGTGTGTATC TCTGTGTGTG TATGTGTGTG TCTGTGTGTC 1140
TCTGTGTGTG TGTGTGCGCA TGCTGAGTGC CTTCCTGGGG TACTGGTGAT ACTCCCAGAT 1200
CCAGGAAGAT GTGGTGAGGA GTCTAAAGTC TCTGTATTTC CACATTCACC ACATTTGCTT 1260
CCTGACCTAC AGCCTGCACA ACTTCTGTGC CCTCTGCAGC TCTGCATTCA GAAAGGCTAT 1320
CAGCCACCTG GATAATTGCT CCTTTATAAC TGCAGACAAC CGGGGAGTGG ATAACGACAA 1380
TAAATGGCTT GTAATTCTAG GTCTTAGATC TTTGCTGTAA CATAAAGTCT GCTCTCCAGT 1440
TCCTTGTGTT CACAACCTGG AGAAGTCAAA GCTAACCGTT AGAGAAGTCA TTGCCCACCA 1500
TTCATGCCCT GCCCTCAGAT GGGAACAAGC TTCCCTTTTT GGGGCCTGGA GGTGGGGGTG 1560
GGGCAAGGGA GACATTTCTA ATTTTGCCAT GCTTCTGTAG GAATTTTTTT AAATGGGGGT 1620
ATGTTTTCAC CCCCAGCTAT TCCTCACCAC AGGAGTCTGA TTGTATCTGA GGAGGTGGCC 1680
CAAGCTTCAG GGTCTTTTAT TTCCTGTTGG GGTTTTAAAG TTACCCTTGT TTAGTTTGAT 1740
TCCATTTTAT AAGTCAGCCT GAATGTTGGA AGGCAGGCGG CCTGTTAGTC CATGTTATGG 1800
CTTTGGGGCA TAAGAATCAC AGGGCAGCTT TCTTTGCAAT TGCCAGGCAG ACATATGTCC 1860
TCAATTATCC CATTTGGAAG GACTAGGCTC TTTGTACCAC CCCTCCCCCA AGGTCTCCCG 1920
CTGTCATGAC CAGGATCGGA AAGATCTGGG AATATGGGGG TAGGAAAGTT AAAATGTATG 1980
TGCCAGGCCC TTTATAACAC TGGCCTCTGT CCTTACTCCT GCTTGGGTAT CCTCAGAATC 2040
AACTAAGCTG TTTCTGGGAA AAGATCACAA AATTCATCTA CCCTGGAGGA CACAGGCCAA 2100
AGGGTTAGTG GAGAGACCAT GGACATAAGA GATGGACAGA CCTAAGGTCT TTTTTCTGGT 2160
CTAGTTGTTT CAACTTGGGA AAGGTCACTT AATTATCCTG TCCAAAATCC ATCCTCTCTG 2220
TCTGTAATCT TGGGGATGGT ACCTAGGATT TAATGCACAC CTGGCAAGTG CTCTACTATT 2280
TTTATTTATT TATTTCGGGT TTTTTTTCCC TTATTTATTT TTGAGACAGG GTCTTATGTA 2340
GCCCAGGCTG GCCTCAATAG TTATGAAGCT TACACCTGCT TACACCTTAC ACCTGCTGCC 2400
TGCACCTCTT AAGTACTGGA CTTACAGGCC TGGCTTTTTA TTTTATTTTG AGACAAAGTC 2460
CCATTAAGTT GCTCAGGCTG CCCTTGAATT TGTGATCCTT CTGCCTCCGC CTCTGGAAAA 2520
CAGCTGGCGA TTTGTTAAAT TTTCTGACTC CCAATCTCTC CATTTGGAAA TGAAGTGAAG 2580
CTGTAAGGAA ACTGATTTTG GCTCCATAAG AGACTGGACA TATGGACAGT TTTTGTATAG 2640
GGGCTTCCCT GAGTGACTTC TGAGTCTCAG GCATTTAATA ACGATACCTA TTTCCCCCCT 2700
TGCCTCTTTC TGTGTGGATT TTCACCCAGA CACCTTGCCA GTCATGTTTC AAGACGAACA 2760
GCGTGGCTCT TCTTTCAGCC TGGGCTCCCA ACCCTGTAGA TTTTACCTTG GCAGATAGAT 2820
TACTGCATCT AGAGGTTGCA CGTAGGTAAT ACTATATGGA TCTCTGGAGT TACCACGGAG 2880
TCAGCATTTG TCCCTGCTTA ACTTTATATT GAGCCAAGAA GCGAATCATT TCATTCTCTC 2940
ATCATGGGGT TTTATGGTAT TGCTCTGGCT GGCCCTGGGC TTCCAGGTGT AAGGCATTCT 3000
TTTATCTCAG CTTCCATGTG GTTCATTTTG GTTTATGGTT TCACCCAAAC TTGCCTGACC 3060
TCGTTGGTTT TGGTCTTTTG TGAGGTAGCG CCAACCAGAG TGTGGGAAGA GAGACCCGAT 3120
CACCTTCTGG AATTCAGGAA ACAAAGGAAG ACAAGAGAGA GAGAGTGCCT CACTCAAGCT 3180
AGTTTCCTCC TGAAGATTTC CCCATTTCTC TATAGGCTGG GGACAAACCT CTGGAGCTTC 3240
GGGGCAGTCT GGGTCCAAAC TATGAGCATT CCTCTCCCAG CTCAGAGAGG CACATCTCCA 3300
TTGCATGGAG CAAATTGCAT CTCAGCTGAC AACTTTCCTC TAAGTTTAAA CTGGTTCAGA 3360
AGTTCTGGAA AGTCCTTGTT CAAATTCTCC TCTGAAGCTG TAAGGCAGAT TCAAATATGA 3420
GCCCTGGGAG AAAAGTCAAA AGAGCAAATC CATGCTTCTA AAATACAGAA GCAGGGGACA 3480
CACATGCTGC TTGAAGCCCC TCTACCACTG GTCTGAAGCT ATAGTGAAAT ACACCTATGT 3540
TTTAAGGTTC TGGAAAAATC CCTTTATAGC TCCATGTGAG TCTCAAAACA AATAGGTCTC 3600
TTAAAGGACT CAGGGTTTAG CCCCCCCCCC CCAACCACCA CAAACTGCAT CCTTTGTGCC 3660
ATTTCTTAAC TGCTCATTTA CGAGCCCTGA TTGGAGCCAT AAAAGAGCAT CTGTGTGTTT 3720
TCAGCATCCT TGTGCTACCT CCCAGCAACG CCTCCTTCAC GCACTGCAGT TTGTGCACAC 3780
CAGGGTACCA GATACTATTA AAAGCACCAT TACTATGTTT TATTGTTGTT GGTAGGTGCA 3840
GTTTCTTCCC AGCGTTTGCT GGAATAACTT CTGGAATTTG TGGTAGCATC ATCATTAAGG 3900
TGTGTGGAAA GTAAACAGAC TCTTGTTCTT CAGGAAAATT TGACCAGGGT AGAGAAATGC 3960
CGCCGCCATG TTGGCTCTTC TCATGAGAAT CCAGGAAAAC TCCAGGAAAT GCACACTGAC 4020
AATCAAAACT TGTAGTACTG ATGACCATAG GGATGCGGTG AGGGTGACAT TTCCACAGTA 4080
ATGACGGAGT TGTCACATTC CCCTGAGAGA GCAAAACAGC TTGGTGAGTG CCACCATGTC 4140
TCCCCGGGAC TCCCCTCTGA GATTGGTTCA GAGCAGACAA CAGCAAATCC TTCCCAGGGA 4200
AGTTGTTCTG CTTGGTGAAT TTTGCTGTGT TCAGAGACCA GGCAAGGCAC CCTGACTTTT 4260
CCTCTGTGGA TTCATGCCGT AGGGACCCTC ACATCAGCTC ATATGTGGTG CTTTAAAATA 4320
CACCCCAAGT CCCAATAAAG GCTGAAAGCA TAACTCAGAC AAAAGTCTTA CACTCCTGTA 4380
GGAAACAATG AGGCAGCTGG TTAGAGATCA GAAATGGGAC TTGATGCTTG GAGCCCTCCT 4440
GGTGCCTGCT CCCAGAATGG CACTCATTTC CATCTCCCCG GTCCATCATC TTTCTTCAAA 4500
GGACGATGTG TTTGTGTGAG GTGTCCCTGA GCTGATTTTC CCGGAGGTCT GGAAAGGGAG 4560
CGGGACTCCA CAATTGATGA AGTCAAGTCA TGTGTCTGCT CCATGCTGTG ATTCGTTTCT 4620
CGACTTTGAA AGAACAACCG CAGGCTTCAG AGTAGCCCGA GGCACATTTG TACAAAGCCA 4680
CGTGGGCAGT TTTTGGTCTG GAGCACCAAC CTCAATGGCT GCTTTGAGGC ATACAGTGCA 4740
ATGCTGTTGG AGGAGACCAG GGGAGCACTA CTGCACACAG TAGCCCGGTG TGGCCCTCAC 4800
GTCACTGTGA GCTGCAGATG TGTGCCTCAG GTCAGGCTGC AGATTCCCAC GAACCCTCCA 4860
ACCGACCTCA GGGTTCTTTA TGCTTTGCCC TTTAAGAAAA TCAAATATGT GTTTAAATAA 4920
AGACTTTTAA AGACTAAAGA ACTCAGAGAC TGTGGCAACT CCTTAGCAGG TTTCTTTCCC 4980
CTCCTGTTAA ATTCCTCACA GCCACTTTGA TGTGGCTGAT GTGGCTAACA ATTGCCACTG 5040
GACGGATTCT AAGAGACTGG TTTCAAAGCT GACTGACAGA TTAAGTAGCA GCTACCACAA 5100
CAGAAAGTGG TTGTCTGAGT AAACTTTAGC TGTTTTCCCA 5140