EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-00710 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr1:120800060-120803450 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hnf4aMA0114.3chr1:120801605-120801621TGTGAACTCTGACCCC-6.01
Myod1MA0499.1chr1:120800386-120800399AGGGGCAGCTGCT-6.18
NR2C2MA0504.1chr1:120801607-120801622TGAACTCTGACCCCG-7.03
POU2F2MA0507.1chr1:120801914-120801927CTCATTTGCATGT+6.54
RXRBMA0855.1chr1:120801607-120801621TGAACTCTGACCCC-6.22
RXRGMA0856.1chr1:120801607-120801621TGAACTCTGACCCC-6.42
RxraMA0512.2chr1:120801607-120801621TGAACTCTGACCCC-6.2
ZNF740MA0753.2chr1:120800233-120800246CCACCCCCCCCCC+6.44
ZNF740MA0753.2chr1:120800236-120800249CCCCCCCCCCCAC+6.92
Enhancer Sequence
AAGACAGTTC CAGGGCAGTC AAGCTTAGGC AGTGAAGGAG ACCATCAAAA GCAAAGCCGG 60
TGAAGAATGT ATTCCAACGA GGGAGCCATG TTCTAGCCCC AGCAAGCAGC AGAACCTGGC 120
GGATCGGACA CGTGGTTTGG GCTTTAGAGT TGAGGATAGA AGAGTTCTGA AGTCCACCCC 180
CCCCCCCACC CTCTTGGATG AGGAAAGCCA CTGAGGTCAG GCATGTGACA GGGGTGTCCC 240
TGCATAGAGG CCTAGAGAGA CCATCGTGTG AAGCTGTGAA GGTGAAGCCT AGCTTGCCTT 300
GGAGACCCTG AGATGGTGGA GATGTCAGGG GCAGCTGCTG AGGAGAGCTG CTCAGAGGGA 360
ATGGAACCAG CCCAAGAAAA AGAAGTGTGC TGCAGTCAGC AAAGCTGAAA GGAATTGGGG 420
TCTGAAAATC ACCATGACAT CAGACATGGA GATGCAGTCT GGAGTTTGTC CAGATGGAGT 480
TTGGTCTTGC TTTGGTCCAG TGTTTCCTCA CTTGGCTCCC TTTCCTGCCT CTTAGAATGG 540
CAATGCATGT GCCATTGTAT GTCGGAAGTA TGTGATCTGC TTTTTCATTG TGATTGTACA 600
GTGGGTTACA ATTAGGAGAC TGCATGGGTC TGTGAAGAGA CTTCACGCTT TTAAACACTG 660
TTGAGACTGT GATAGACTAC GGGGACTTTT GAAGTTGGAC TAAGTAAATG CATTTTGCAT 720
TATGATATGG CTATAAGCCT ATGGGGGCCA GGGAGGGGAA GCAACCATTT GTTTTGTGGT 780
TAAATCTGCA TCACAGTCCT CAAGTGCCAC GCACATTTTC TGTGTATAAA ATGTTTCCAT 840
TTTCATCATT TTTTTAAAAA AGCCAAGTGG TGGTGCTGCA CGCCTTTAAT CCCGGCATTC 900
AGGAGGCAGA GCCAGGTGGA TCTCTGACTT TGAGTGGCCT ATAGGGGCCA GAGTTTGAAT 960
GAAAATGGCC CCCATAGGCC CATAGGGAGA GGTCTTGTAG GAGGAACTTT GTCACTGGGG 1020
ATGGGCTTTG AGGTTTCGGA AGCTCACACC AGGCCCAGTA TCACTCTCTC TTCCTGCTGC 1080
CTGCCATCTG GGTGTAGAAC TCTCAGCTAC CTCTCCAGCA CCATATCTGC CTGCATATTA 1140
CCATATTCCC TGCTGTGATG ATAATGGACT AAACTCCTGA ACTGTAAGCC AGCCCTAATT 1200
AAATGGTTTC CTGTAAGCTC TTGTCTGTCT CCCACGAAGC TCCCTCTTTT TAAAACCTTA 1260
ATTTAAACCC CGTTAGCAGT CTAGCCCTAG ATTCTACTGT GACCTGACCT CAGGGAACAT 1320
CTCTCTACCA TTAATTTCTT GAGCCTTACT TCCCTCCCTG CCTCAACATA ATCAATCTAT 1380
TTACTACAGT CTTAAAATGA ACAATGTAGC AAGGGCCCCA ACACACTTAC AAGCTCTGCT 1440
GGCCCTCCTC CATCCATCAA GGCAACACAA CTCATTTCTC CTCGGAGATG AAACAAGCCC 1500
AGTGCAGAGG GACAAAGAAG CACTTCCTTT GAAACTCGGG CACGATGTGA ACTCTGACCC 1560
CGAGACTGCA ACAGGAACCA GATGCCCAAG CTTGGAGGTG AGAGCATTCT GCCATGGCAG 1620
CTCATGGCCT GGAAGGGACT GGCCAAGGCA GCATCTGAGC GGGCAGCATG GACTTTCCAG 1680
GGGCTCTGGC TCATGTCAAA GATTAGCACC ATCTGGAATT TAATCGCAGT CCTGACCGCA 1740
ACAGGGAGAG AATCAGCCCT ACGAGCATGC CAGACTCCAA GACCCCCTAT TTTTTACCCC 1800
TTCACGAGGA TGTCTCAAAC ACCCTAGCAT GGGCTCCCTG GAAATACCAG CTGCCTCATT 1860
TGCATGTCTC CAATGGACTT TGATATTAAC TGTTGTTCCT TTAGCACTCT AAGCCAGTTA 1920
AGTGGCCATA GGGGTGCTGA TGAACGTCAG CAGCCAGCTC TCTTGTAGGA AGAGGGATGT 1980
GGAAACCCAG GCTTGTCTGC TCATTACCAG GGTCTAAGTG TTGGCACAGT AGCAGGTTTC 2040
AAGTCATCAA GAGAGGCCAC TGGCTTTGGA GACAGAAAAG CGCACTCCTG AGAGCAGCTA 2100
AGAGTCAGCT CGGCTGCGAA GCAGCGGCTT TCTGGCAACA CTTGTGCTCT CTTGAACAAG 2160
GACCCATTCT TTCCTTTGCA AACAGAGTAC TTGAAAATTC ATTTAGACAA TTTCTGCCTA 2220
AAAATTTAAC TTTTCAGATG AGCATATCCA ATGCACATAT GAAAAAAAAA ACACCATAGA 2280
GCACACTGTT AGAAATGAAT TGGCAAGTAC AGGCAGAGAT GGCCCTAGCA AACATGAGGA 2340
TTGGAGCTTG ATCCCCAAAA CATGTGCAAA AGGCTAAGCA TGGTGTGTTT GTAATCCCGC 2400
TGGAAGACGG ACACAGGCAG GCTCCTAAAG CTCATCGGCC AGTCAGCTTA ACATATGTGG 2460
TAAGCTCCAG GCCACTGAGA CCCTGTCTCA ACAGAACAGG TGAGACTGTA CCCCAAACTC 2520
TTCTTTACCC TCTACACACA CACACACACA CACACACACA CACTTCTCAT GGGTTATGAA 2580
GGAGTGAAAA GTTAACACTT ACATACAGTA AGAGCTTTTA TTTATTTGTG TGTGTGTGTG 2640
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTATTTGAG AAAGGGTTTC TCAGTGTGGC CCTGGTTGTA 2700
CTGAAACTTG ATCTGTAGAC CAGGCTGGTC TTGAACTCAC AAGAGATCTG CCCACCTCTG 2760
TCTCCTGAGT GGTGGGATTA AAGTGGTGCA CCACGCCTGC CTGGCTAGAA CTTTTAATCC 2820
TAGTTAGGAA ATTAGAACTA ACTAATGAAA TAACTGGATA CAACCCCAAA GTTCTGCCAA 2880
GGGCAAGTGA TTAGGTGACG TTTAGACCAA TCCTTTAAGA ATTCTACGTG AATAATGTCC 2940
CAGGGGCTCC AACAGCTTCT TTTGGCATCA GAACTCACTG CACATATGTG GCTGGTGCTC 3000
ATGCAAACAA GCAGGTCCAT GTATATACAC GATACAAAAA ATAAATAGAT TCCCAAAAGA 3060
GGATGAACTG CCAATGCCGT GATACTGAAA CACTGAGCAA CTTCTGTCTT GTCCCCTGTC 3120
CCTGTATGTA CACTTGCCCT TTTGTCTCCA CCTTTCAAGG GGCAGCACAG AGCTGCAGCT 3180
TCGGACCCTG GGCGTCTAGC CTCAGATCGT GAGCATGCTG CACATTTGCA TGCATGTGTG 3240
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTTATAT GCATATGTGT 3300
GTACAGGTGT GTGTATGCAT ATGTAGGCTG GAAGTCTTCA ACTGGTGTCC TTGTCAATCA 3360
CACACAATCA GATCTCTCAC TGAACCTGAA 3390