EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-00222 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr1:54962280-54965010 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr1:54964275-54964285ATCACGTGAC+6.02
EBF1MA0154.3chr1:54963508-54963522TGTCCCTGGGGATT-6.04
Lhx3MA0135.1chr1:54964817-54964830CATTAATTAATTA-6.46
POU6F1MA0628.1chr1:54964818-54964828ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:54964818-54964828ATTAATTAAT-6.02
SREBF2(var.2)MA0828.1chr1:54964275-54964285ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr1:54964275-54964285ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr1:54964275-54964285ATCACGTGAC+6.02
USF2MA0526.2chr1:54964273-54964289TCATCACGTGACCCCT-6.03
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_12304chr1:54963404-54964608Spleen
Enhancer Sequence
TATAAATCCT TTTCATATTT CTTTTATTAG CATTAGATTT GTTTTGCTGT GCGTGTGTGT 60
GCACACGCAT GAACGCACGC AGGTCCACAT GGAGGTTAAG TTGATGTTAG GTATCTCCCC 120
AAACACTTGC ACTTGATTTT GGAGACACCC CCAGCACTGG GAGGGTTTTT ACACAGGTAG 180
CACTAGCCTT GTCAAGAGTA CACATTCAGG GTTATAACCT GAAATCACCA GTAATGAGGG 240
TTTTTTTTTT TTCACATATG GCTGGGAAGA CTCGAGGACA GGTGTAAGTA TTCTGCTCTC 300
ACCAAATAGA TAAGGAGCCA TGAATCACAG GGGCAGTGCC TTAGTGGAGC TTGCAGCAAA 360
ACATGAAGTG GCTCAGCACC CGGATGTTCC TGGCTTCCAC TAACCAAACA ACAGCTCAAA 420
GCAGCTTGTA CTTGACCAGT TCCTACTTAA TCAACAGACT CCCGGGCAGC CTAACAGCAA 480
GTGACTGCAG CAATGAGCCC GGGACTGGTG GGAAGGGGGC CGGGCAGAGC CGGGCAGAAA 540
CAAGGCTGGA AGCAAAGCAG CGGCTGGTGC TAAGGGGCTA GGTGCACTAA GGTGTAAAGC 600
ACTAAGACTC CGAGAGCCAG TAGAGAAATA CAAAAATAAT CAGTGGTGAG TGGCAATGAT 660
GATAAAACAC ACCAATTCTG CACCATGCTC TGTCTGCATT CAGAATGGGC ACCCAGATAG 720
ATCCGAACTT ATTTCCTATC TCTATAAAGG GAAGAGGGGC TCTCCTCACA CTCAGGCCAC 780
AGCCATGGTC TCAGTTTTAA TTGCCCTGAG GACCCCTCTA CCCATCTTCT CTTCCCTGAG 840
CGGATATGTA GGTCACCAAC CAGCAAGTGG ATCAAATCTC CTAGGTAGAG ACCTTCGACC 900
TTGGGAACGT TTAGAGCAGA TACAGGTGCT GCAAGATGGA GCGGACATTG AAGAACGCCA 960
CCGATGCTAA GGAAAGAGCC CCTGCCCACA TGCAGTTCTC ATGTGCATTT TGTGCAGTCA 1020
GCAATTCTGT TTTCTCCACA GCCTTCAAAA TGTCAGCTTC TCATGTCAAG CAGTATGAGT 1080
ACGTCAGGCG AAGCGGAGGC TTTCTTATGG TTTCAGGCTG GTAGTATTTC AGAACCACAT 1140
GATTGCAGGG CTGAGCTCAG CAGGGCTGTA CTGGAGAGCA GATTGCATAT CCCTCATGCT 1200
GCCCACATTT CAGAGACTGA TAAAATATTG TCCCTGGGGA TTATAAGAGG AAGAAAAAAA 1260
AATGACAGCA CATCCCCCTC TAAGGAACAA GCCCGTGGGT GATCGTACTA AATGCCAGGG 1320
AACCCACTGG AGCACCAAAA TGGTCAGATG GAATTGGAAG AAAGCCTAAG AGGCCATTCA 1380
TTCTCTACGT CCAGTGAGAC TCTGAGTCCT AAAACACACT GTGCACATAC GCACACAAAC 1440
ACACACATAC CTGAAGTCTC CTCGGCTTCT CAATCACAAC GCAAACCCCA AGTCCCTTAG 1500
TGGGTTTCAG GGGCCTCCAT TAACTGGCCA CCAAGCAAGT AATTGCCAGG TGAGAAAAAT 1560
CAACTTGGGC CCCAGAAGGC CAAGTGCAGT GTACACTCGG GAAACAGGCA AAGGAGACAG 1620
ATTAGTATGG GAGAAATCAG ATACTCACTC CTCCCTGTCC ACCAATAATC CATACCAAAA 1680
GGGGTTCGGG TACAACAAGG GCAAATGCAG CTGAGATGTG GAAAGCGCGC ATCTAACAAA 1740
AGCACAAAGG GTTCGTTAAA AAGCCGTCTC CCTCCCTCCC CCCAGCCACC AAATGCTCTG 1800
CAAGAAAAGC CACAGCCCAG CCCGTGCTTG CTCGCTCGCT CGCTCGGCAC ATCTGGTTTC 1860
AGTTACCTGT GCCCAAACTG CAGCTCTCAG AGAAACAGAG CTCGAGCTGA CTCCATGGTT 1920
TAAGATCTGT CAGAACAGCT TATATGGAGA TGGAGGGACA GAGTGTGGAA GCCTTGAGCA 1980
ACAATATTTC TGGTCATCAC GTGACCCCTC ACAGATGACA TTTTGGAGTC AGATGGCACT 2040
GCTAAACTTG GTCACTGGAA AAGTAAAAGC CACCTAGGGA GACCATGATC ACTTCATAGA 2100
TAAACCCAGT TACCCACTCG GGTCAACCAC TAGTCAGCAT GAACATCTCA CAAATTCATG 2160
CCACTTCACG AGATGGCCAC ATGCTTTCCC TGCCACGGTG CACCATAGCC CCTCAGACCA 2220
CACTCAAACA TGTTAAAAGT CAGAAACCCT CCCATGCCAG ACTCCAAATC CTACTCTTGC 2280
CAGATAGACC AAAAAGCTGT CACACCTGAC ACGGCTCCCA GACTTTCCTC TGTCTATTCA 2340
CTGTTCCTAA AACAGTTGCA CATAGAAATG TGGTATCTTT TTAAAGTTAC TTTAGTGCCA 2400
AGTGTGGTGG TGCACACTCA CAATCACAAT GAAAGCAGAG ATCATGACTT CAAGATGACT 2460
GTGAGCTGCA CAGCACACCC AGATCAAACT GAACCCACAA GACAATAATC TACCTAGTAA 2520
TCTCAGTGAC TTCGTTACAT TAATTAATTA CGCTCTGTAA AAAGCTACCC TTTGCCGGGT 2580
GTGGTGGCGC ACGCCTTTAA TCCCAGAACT GCACTCGAGA GGCAGAGGCA GGCGGATTTC 2640
TGATGTTGGA GCCCACAGCT GACTCTGGCT GTGTCCAACA AAATGTGACA AATCATTGAC 2700
CTGAGCGCTT TTTCTTTAGC CACAACTCAT 2730