EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-00047 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr1:16238280-16241010 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:16238297-16238309GTTTGTTTGTTT+6.32
KLF4MA0039.3chr1:16238723-16238734ACAGGGTGTGG-6.14
RREB1MA0073.1chr1:16239714-16239734AACCAAAACACACACACACA+6.14
Enhancer Sequence
GTAGGACTCT CCATCTTGTT TGTTTGTTTG TTGTTTGTTT TAATGCAGGT TCTCTCATTG 60
AGTGCCATTT TGGATAGATT CCTGGCCAGC TAGCCCAGGG AATTTGCTGT CCCCTGCATG 120
GAGATTACTG GTGGGTGCTC ATAGACAGCT TTTGCAAGGG TGCTGGGGAC TGGAACTCAG 180
CTCCTCACAA GGGCCTTAAG ACCAAGCCCT GTGTCCACTG AACTGTTCCC AATGCTTCAA 240
CAACTGCTTT TAGAGATACT CTGAACACTG GCACATGCTG ACCATCTCAG GGTTCTCTTC 300
CTACCACCTG GATGGGTTTA TCTGAAACCT CATAATTTGC TCAACCAGAA GGTGAAGGAA 360
AAAGAACTTT GTCTCTGGTC ACATAGTGTT CAGTCTTTGC TCCCAGCTGA CTTGATGCTT 420
CTATTATTTC GTATCAAGAC ACCACAGGGT GTGGTCACCC TAAAGGGGAC AGTGAAGCAA 480
GAAGGTGACG GCATTTGTAT TTACCAGCCA CCCCCCTCTT CTCTAAAATG TTTGTGTAAA 540
CACACTCAAG TGCCAGCACA GAAGACACCA AGCCACCCAA ACACCAAAGG CCCACTCATC 600
TTGTGTGGGT CCCACACACT GTGGGACTAA GGCTGCCCTT GGCAGTTTTG TGCCTGTTTC 660
CCTCCTGAAG CAACTGAAAG AGATATCACC CTGGCCCAGG ACTTTTTCGG TTCTAACAGC 720
TCGTTCATAA TTTTGTGCTT TGCACTCTTT GAGACTTTGC CTTGGCTCAT CCTACACAAA 780
CCTACAGCCG ACAGCTCCTT TAACGGGGAT GTCTATAAAG GACAGCCCCA AATCTGCTTT 840
TCCACTGCAC TTAATGTCTT TCCAATTAGA TCCAGATGTG AGAAGCCGAA GGAACAGTTC 900
TCAGGACTGG ACAAGATGAC ATAAATCTTG CAGCTGACAG AGATCCCACT GAGCTTGGTT 960
GGGGAAACTC ACAGAGAGCT TGTTTGGGGC CAGAAAAGCG GCTGGTTATA AAGACAGATG 1020
TGTACACTCT AATTCAAAAA AACATGCTCC GAGAGAGGGA GTGCACTGTG GAGCACAATG 1080
CCTACAAACC TTCTGTAGCC CAGAGCCTGG CTGGGGCTCC CCTCCTGCTC AAAGCTACAT 1140
CAAAGGAGTG ACTGAGCAGG CTGCTAGAAA ACAGACCAGA ACTGATGCTT CCTGGCTCCT 1200
TAATTGCTCT TCTCAGGGAG AAGAAGGTGG GCATTCCTAA CAGACCTTTG CTGGAGGAGA 1260
ACAAGGGCTG TTTGTGCAGC TGAGCGTTTG GCCTTTATTT TTTTAATTAT CAGGTCTTGT 1320
ATACTTTCCA GCAAGTTTCT TTTAAAAATA GTATATTCTT CCTCCTCTTC TCCAGATGCT 1380
AGGAAGTGCA GGTTCAACCC AAACTGTGTC TATTTCAAAG GGACACACAT ACAAAACCAA 1440
AACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACAAA ACAAAGCTGG AGCTAAAGGA 1500
GTTTGGTGGC GTAATGCCCG AGGACTTTGG GCTTTAGGTT TCTTTTACCC TCCCAGTAAT 1560
TTTATTTTTA AAGCTTGGAA AACAAATTGC ACCAAAGACC CAGCTTCTGC AGGATGCAGT 1620
GTGGAAAAGG GCAGAGCAGG CAGTGGATGC CAAGAGCTCG TGGGAGGATC CTGGGCAGGA 1680
GCATACAAGC ACATGATAGA CAGGTGCCAC AGTGGGCCAG CAGCTCGGAC ACTTCCTGAA 1740
GGCTTGTACT CTGGCGATCT GGGTCCACAG CAGAACAGCT GGGCACTTTT GCTCTGACAG 1800
CATCCCAGAA TGATGCACAG TGTCATCTCT AACCCCTCTT CCGGCTCAAT AACTGGCTAT 1860
GTGACAGAGG ACAGAGGGGC TGATCTGAGG CACTTCACAA GGGCCATTTG CAACACCTGG 1920
TCGGTGCCGC TTTGCTGAGC TTGAGCCTGG ACATACCAGA GTGAGAAGCT CTGTCCCCTT 1980
GGGGTCAGAC CATTCTTCCA ACATGTGTCC CAAAGAAAAC CGTGGAGAAT GTAGTAACTG 2040
TATATGCCCT GGACACCCAC CCCCACCCTT GAGCCTGTCT TGGGTGGGTG AGAGCGGTAC 2100
TCTGCCCTTC CTCGACTCCC ATCTACCACA CCAGGACTAA CGAGGGAGCA AAGAGAATTC 2160
AGGATCACAG AGTGGGAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAT 2220
TTTTATTTTC CCATCTTGAG ATAAAAGACA AGTATGTTTT TTAAATTTAT GTTTTACATC 2280
TTAGTTGGGC ATGACTTTTT CTGAGCAAAT TCTAAGGACT ATAAAGATGT CTTTCCAGAT 2340
AGACAACTTT GACTCTAAAA AAATTAATGC AAATTATAGT GCAGTTCAGT GAAATGCTAA 2400
TTTATAGCTC TGTAAAGGTA CAGTTCAAAG CTCAGAGGAG CGGGAGGAAG TCAGTGGATT 2460
GATGGCTTGC AGTAAGAAAG GGTTAGAAAT GGGAGAATGT AACCAGGGTT TTAGTTGGGA 2520
AATGAGATGA GGGGTTCATT TGTTCCACGT TACTGAGTTT TTAATTCAGA TTTGCTGTTA 2580
AAACATTTTG TACTTGTGGT TAGTAAGTGA CTCCCTCTGG TTGTCTTTAA AAGAAAACTG 2640
CCAAAGAACA GGACTAATTC TCTAAGATAG GAATCATAGG GGCAGGTCTC TGTGCTAAAA 2700
ATGTAATACC TGTCTTTAAA GTGGGATCAG 2730