EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-24796 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr9:40572200-40576800 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:40572550-40572562GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr9:40573249-40573270AAAAAAAAAAAGAAAGAAAGA-6.25
Nr5a2MA0505.1chr9:40572961-40572976GCTGGCCTTGGATTT-6.13
RFX2MA0600.2chr9:40574172-40574188AGTTCCCATGGTAACC+6.21
RFX2MA0600.2chr9:40574172-40574188AGTTCCCATGGTAACC-6.36
RFX3MA0798.1chr9:40574172-40574188AGTTCCCATGGTAACC-6.14
RFX3MA0798.1chr9:40574172-40574188AGTTCCCATGGTAACC+6.35
RFX4MA0799.1chr9:40574172-40574188AGTTCCCATGGTAACC+6.07
RFX5MA0510.2chr9:40574172-40574188AGTTCCCATGGTAACC-6.44
RFX5MA0510.2chr9:40574172-40574188AGTTCCCATGGTAACC+6.6
ZNF263MA0528.1chr9:40576485-40576506CTCCCCTTCTCCTTCTTCTTC-6.22
ZNF263MA0528.1chr9:40576482-40576503TTCCTCCCCTTCTCCTTCTTC-6.24
ZNF263MA0528.1chr9:40576476-40576497TTCCTCTTCCTCCCCTTCTCC-6.34
ZNF263MA0528.1chr9:40576471-40576492ACTTCTTCCTCTTCCTCCCCT-6.61
ZNF263MA0528.1chr9:40576479-40576500CTCTTCCTCCCCTTCTCCTTC-6.76
ZNF263MA0528.1chr9:40573481-40573502TTATCTTCCCTCCCCTCCTCC-7.23
ZNF263MA0528.1chr9:40573484-40573505TCTTCCCTCCCCTCCTCCACT-7.29
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10044chr9:40573263-40575825Embryonic_stem_cells
mSE_10044chr9:40575929-40577010Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TACAGCTGTG AGGAGGTCAA CATATCACTG CCTCCTTGGA GCACCCCATG AAAGGCATCC 60
AATAATTTGA AAGGAAAGGA CTGGAGGAAG TAGTGTACTT CCTCCTGTAA GCAGTCCCCC 120
TGGACTGCTG ACACAGAATG CACAAAAGCC CTGGGTTCAA CCCACAGCGT CAAATAGACT 180
GAGCACGGCA GTGCACACAT GCAGTCCCAG CACTTGGATG GAGATGGAGG ATCAAAATTC 240
AAGGTCTTCT CTCTACATAG AGAGAAGGAG TGGTACACAG TCTTTGTGAC GTGAGTGAGA 300
CCTGAGTTAG CCTTACCAGA AACCATAGCA ATTTCAGCAC ATGGTGTTTC GTTTGTTTGT 360
TTTCTCTGTT AAAGGCAAGA AATTTCACCT TTGACTGAAG GAAGACTTTT TATGTCTTCT 420
CCTCAGCATT TCCAAATTCT CACCATTTCT ACTGTTGAAT CTGCCAGTCA GGTTTCAGAA 480
CATAAGTGCT ACACTATCTA GACAGCCATG TAAGAGCAGC CTGGTGCTAA GTGACTGAGT 540
CACCTACAGC ACGGACAGGC TGGATGAAGG CTCAGGAAGG ATGGAATAGA ACTGCGAAGG 600
CTTCCCCACA CTACCCAGAA GAAGGCTTCC CCACACTACC CAGAACGGTG CTATTTAACC 660
ATATGTATTG TTTCTCTCTG GAATTTTCAT GGAATCCGAG ATAAGAGGAC TGCTATATAA 720
AGCTGGAACC ACCCACCAAG ACTTGATAGA GGAGGGTCAA GGCTGGCCTT GGATTTGAGA 780
CTCTTTCCTC AAGCGCTAGA ATAACAGGCG TAGAGCATAA TGGCCAGCTT TGATCGAAAT 840
CTCTTCTTTT CTTCCCTTCC CTTCCCTTCC CTTCGTAGCA GTTAAGAGCT CTGGCTACTC 900
TTCCAGAGGG TTCTGACTTC AAGCCCCAGC AACCACATGG TGGCTCACAA ACATCTATAA 960
TGCAATCTGA TGCCCTCTTC TGGCCTGCAG CTATGCAGGT AGGTGCACAT GCAGACAGAA 1020
TGCTCATACA TGAGTAAATC AAATTAAAAA AAAAAAAAAA GAAAGAAAGA AACAAAAATA 1080
AAGATGCCTG TAGGAGCTTC AGGACTTGAG CATGGATGAT CTCCCAGCCG TACAAGGGCA 1140
TTTAAAATTG TTCCTGTATT AGCCATAGAG TTTTAGAAAG ACTTTAAGAG TGCTGGGGAC 1200
ACGTTGCATT TTAAGGCATT GATTTAAGAG GGCTTCAACT AAACTAACAA TAAGCATAAT 1260
CTCATACTAT ATAATAAAGG CTTATCTTCC CTCCCCTCCT CCACTCACTC GTTCTCCGAT 1320
TGACTCATGC TTTAGCAAGC ACACACACAC ACAGGCACAG AGAAAAATCT ACAAATATTT 1380
TTCAAATCTC ACTGTATATC CTAAATTGAC TGTAAATTCC CATCCTTACC ACCTGGAAAA 1440
CCTGGATGCT GAGGTTGCGG GCATTTGCCA CCTCATCCCG TTTACAATAA GTTTAAACTA 1500
CGGGCGTGAG TTGGGAATCT CAACCTAGAG ATAGGAAGTA AATAGTAGGT AAAGTTGCCA 1560
GGACTTTATA ACTTCCGGGA GTGGGGGGTG GAGCGAGTCT GAGGGTGACT GGAAAGGAGG 1620
AACAGGAAAG GCTGAAATAG ACGTGCTGCG TGAAGTGGGC TAACCAGTGA CGCAAATCAC 1680
AACTTTAGCT CTGCATTTCA AGTTGAGAAG TGTTTTTATC TCCTTTGTCT AGGATGCTCG 1740
GAGTAGGCAG GGAACATCTG GGGGTGGCTC GGCAGTCCCG GGAACACGTG TATTTATTTC 1800
AGTCTTGGTA GAGTAGAATG ACCAAAGAAT TCAATCACTT TTCTTCGTTT ATCCTAAGGC 1860
TGACTAAATT TCAAAAAAAG GAGACTGGCC ATCCCCTCCC AAAGCCACCC AGCAACATAC 1920
AACAGAGTTT TCTCTAGGTT CTCAGATTAA GTAATTAGAA CAGAAAGCAT CCAGTTCCCA 1980
TGGTAACCTC TTACTTGTCA CCCTGTCCTT TTCCGTTTGG CTTTGAGCAA GAAAACTCTT 2040
GATGGAAAGC AAGCAGAAGC CAGGCTGCTG GGTTGGCTCA GAGGGTAAAG GTGCTTGCAG 2100
CCAAGCCCGG CATCTGGGAG TTCAATTTGT GAGACCCACC CGCTGGAGGA GAATTGAGTC 2160
CCACAAGTTA TCCTCTGACC TCCACACACT TGCCATGGCC TGTACCAACA TGCCAAGAAT 2220
TAAACAAAAG GGAAACAGAC AAGCAATTTT ACCGTTGCTT CCCAGGCCAC TGCACTACAG 2280
AGGAGTTGCC AGACAGCTGA GGGGCTCTGC CTGTTCCATA TAAGACATAA CAAGTTGACT 2340
TGTCCTCGGG GAGGTTCATA AAGCTCAGCC TCACAACTGC TGTAATTCAT CTTTGTCCTT 2400
GTGTTTATTG GGCTGAAATC CATTGTTATA TCACACCATG TACTGTTTAC TCTCGTCACT 2460
AACCTTTTCT ACAATTAAGA CGAAATCATC CCGCCCAACC AGATGTGTCA GTAGGTAAAG 2520
GCACTTGCAG CCAAGCCTAA CTACCTGAGT TCGATCCCAG GGACCAACTT GGTAGACAGA 2580
ATTCACTCCT ACAAATAGTT CTCTGACCTC TCTACATGCG GTTTGTACGC CTACACTTCA 2640
TGTGTGTGTG CATACCTACG CACAGACACA CAGACACAAT AAATAAACAT GTCTAGGTGT 2700
GGTAGTGCAT GCTTTTTAAT CTCAGCATAT GTGAGGCTGA GGCAGGAGGA TCACGAGTAG 2760
GAGGCTAACA GTATCACTCA CACTTCTTCG CCTCAGCAAC AAAAGTCACT GATGCTCACA 2820
GAGAAACAAA TCTAGTTGTC CCAAGGAAAC ATCTACTGCT CTTAGTCATA CTTCTCATGT 2880
GCACTGGTTG TAACATCTTC CTGCTCTTGC TTGTTGGTTT GTGTTTTTAT TTTGAGACAG 2940
GTTTTTTTCA TAACCTGGAA CTTGCTCTAT CCTGGGTTGG CCCAGAACAA GATCCTTTTG 3000
TCTTGGCCTC CTGAAGTCTG TGATTATAGG TGTTTGTTAC CACACCTGGT TTCTCACCAT 3060
GTTCAGTCTT TTAATGAATG AAATAAAAAT TCCTGGCAGC CTGCTCACCT TTCCTGCACT 3120
GAGTCATGGT TTTACCCCTT CTCCAAAAGC TATCCATTAA TATTTCACAA CACCCAACCC 3180
TTTGTGTTGT TACAGTTTCC AGCATGGAGC CAAGAACACA GCATGTGGGG TCGATCTTGT 3240
TTTGTCCTAA GACAAGGTAG TCCAGGTTGG TGTCAAACTC ATGACACCTG AAACTCATGT 3300
ACCTCATCTC CCAAGTGCTG GGACTATGGA CTATGGCTCA GAGAATGAGT TTAGTAAAGG 3360
CATACTGAAT GCAGAGTTGG TAAATAGCCA GCCAAACACT GCAACAACTG GACATAAAAT 3420
CAAATAGCTG CACGGAGTTC CCTGGACACA TCCAACATTA TAGAAAGTAC ATCCATCAGC 3480
CTGTCTGCCC AGTTCCAAGG TCCTTCACAA TTGTTCCTCA AAGGAAAACG GTTAAGAGAC 3540
AGTAGTTATC GGGCTGGAGG GATGGCTCAG TGGTTAAGAA CACTGACTGC TCTTCCCAAG 3600
GTCCTGAGTT CAATTCCCAG CAACCACATG GTAGCTCACA ACCATCTGTA ATGAGATCCC 3660
ATGCCCTCTT CTGCTGTGTC TGAAGACAGC TACAGTAGTG TATTCATATA CATAAAATAA 3720
ATATTTTTTA AAGAGAGAGA GAGAGAGCAG TATAACTCGG TGAAAGATGT GCAAGGTCCT 3780
GAGTTCAATC CTCTGTCCCC AAAAGGAATA GAACAATGGA ACAAAAAAAT ACTACAGATG 3840
AGACCAAAGT GAAGACATCT TTCTTGCTAA GTTCTGAGTA AACCCAAGGA TAAGTATTCT 3900
GGGTCTATAC TCCTCCCCTT GCAAACCTCG CTCAATTGTA ATTGAAATCA AAAGGACTTT 3960
GCATGTCTGA TGGGAAGCAG CCATTCCTGG GTTATGGAGT TTATGCTGAA CTGGGCGGCG 4020
GTGCTGCTCT TAGAGGACTG GGTTTTGGTA GGCTTGATCA GCATGGCTTT GTGACTAACA 4080
GGAATGACAT CCAGCCGCCA GAGTAAAGGA CTGCAGGCTG ATGGGCAGGC AGGATATACT 4140
GACTAGTCAG GAATTGTTTT CTTTTCTTAG GGAAATCTAA AATGTGCTTT CACTAACTGG 4200
GAAAAGCAAA CCCTGCAAGC TCACACATTT TATGGGGAAA AAAAAATCAC ATTTATTTCC 4260
CCCAAGTAAC AACTTCTTCC TCTTCCTCCC CTTCTCCTTC TTCTTCTTTT TTTTTTTTTT 4320
TTGGTTTTTT GAGACAAGGT TTCTCTGGCT GTCCTGGAAC AACTCACTTT GTAGACCAGG 4380
CTGGCCTCGA ACTCAGAAAT CCACCTGCCT CTGCCTCCTG AGTGCTAGGA TTAAAGGTCT 4440
GCGCCACCAC GCCCGGCTCT TCTTTTTTTT TAGATGTATT TATTTTTATG GTTTGCTTGC 4500
GTCTATGTCT GTGTGAAGGT GTCAGATCTC TGGAACTGTA GTTACAGACA GTTGTGAGCA 4560
GTGAGCTCGA CTGGGTGAAA ACTGAACCCA TGTCCTTTAC 4600