EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-21155 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr6:125533200-125536800 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr6:125535050-125535068CCAGCCTCCCTGCCTTCC-6.09
GLI2MA0734.2chr6:125535154-125535169AGGCCACCCACCTAG+6.2
NR2F1MA0017.2chr6:125533500-125533513CTCATGACCTTTG-6.3
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:125533496-125533511TGAACTCATGACCTT-6.09
Nr5a2MA0505.1chr6:125534279-125534294GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RFX1MA0509.2chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC+6.63
RFX1MA0509.2chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC-6.65
RFX2MA0600.2chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC-6.73
RFX2MA0600.2chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC+6.86
RFX3MA0798.1chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC-6.87
RFX3MA0798.1chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC+7.05
RFX4MA0799.1chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC-6.56
RFX4MA0799.1chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC+6.66
RFX5MA0510.2chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC-6.57
RFX5MA0510.2chr6:125536233-125536249TGTTGCCATGGTGACC+6.82
RarbMA0857.1chr6:125533496-125533512TGAACTCATGACCTTT-7.08
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03273chr6:125522372-125548826TACs
mSE_10502chr6:125533437-125534339Embryonic_stem_cells
mSE_10502chr6:125534380-125536145Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
GGAGCCCTGA TCAGGAGAAG GTGAAACGCC TACCATTCTC AGATCTGAGG GTACTGGGGT 60
TTCTGAACCC ACTCGACCTT CCTAGTCTTT GGTGGTAACA TAGTTCTACT TACCCCACAA 120
GTCTCTGAAG ATCTATTTTG TGAAAGATGC ACAGGGTTTT GTTTTTGTTT TGTTTTGTTT 180
TTAAAGATTT ATTTATTATT ATATCTAAGT ACACTGTAGC TGTCTTCAGA CACACCAGAA 240
GAGGGCGTCA GATCTTATTA AGGATGATTG TGAGCCACCA TGTGGTTGCT GGGATTTGAA 300
CTCATGACCT TTGGGAGAGC AGTCAGTGCT CCACCCGCTG AGCCATCTCT TCAGCCCAGA 360
TGCACAGGTT TTGCAACAAC TTTATTTACA CAGGTTAGAA GAGGGTCTCA GCGGTAGAAG 420
AAGGACAGGG TTTGTATTTC ATGGGAACCT TCTGTTGAAG CAGAGATGCT GTGTGAAGCA 480
TTGTGGCTGG GCTTCTCTAG GTCAGCAGCC TCTGACTGGG AGGGCCGACA GAGGCCAAGG 540
ATGACTGGCT CAGGCCTCCG GCTTGACTCT TCTGGCCTCT TGATCTGGAT TCACAAATTT 600
TCTTGACTTC GCACATGCTC ACAGGAAGGT AGGGCGCATA GAGATAATCC TTAGCGCCTC 660
AGCTCAGCAT CGCTGGAACA AAATACCAAA GGAAGTCAAT TTGATAAGCA GCACAGTTAT 720
TTTTGTTCAT GGTTTCAGGG TTTTATGGTC ATTTGGTGCC ACCAGCATGG GCCTGTAAAA 780
GTACAGTGCA CCACAGTGGG AGTGTGTGGC TAAGGAGGGT GTTTGCTTTG TGGTGGCCAG 840
GAAGCAAGAG AAGGAGCCTG GGGTGCTATC TCCCCTTTGT AGGCACATCC CCAATGACCT 900
AACTTTCTCT TGCCAGCCCC CACTACCTAA AGGTTCTCCT ACCTCCCAGA AGGCTGGGAC 960
TCTAGGCTGG GGGCAACACT TTGTTTAGTC TCCTCTTACC CTGTTTGTTT TTGTTTGTTT 1020
TTCAAGACAG GGTTTCTCTG TGTAGCCCTG CCTGTCCTGA AACTTGCCCT GTAGACCAGG 1080
CTGGCCTTGA ACTCACAGAG ATCCTCCTGC CTCCGCCTCC GCCTCCGCCT CCGCCTCCGC 1140
CTCCGCCTCC GCCTCCGCCT CCGCCTCCGC CTCCGCCCCC GCCCCCGCCT CCGCCTCTGC 1200
AGTGCTGGGA TTAAAGCTGC TGCCTGGCTT GCCTCTAAGT CTTTACTCAG CACCCAGACC 1260
CAGCTCAGAG TATGCCTGGC TTTGGAATGC TTTCCCTGAC ACCTCAGCTG CAGGTTTCTT 1320
CCAGTTACAA TAGGCAGCAT AACTGAGAAG GCCACCCCAG GTAGGGATGA AGCCTTCAGC 1380
CTGCATGTAA ACCAGCCTAT GCCACACCCT AGGCCCTGGA GGCAAGTTAT GCTAGTATTT 1440
ATTACGGCTA GGATTGACCC AGTGTTTACA TCTCTGTCCT TGGAACACAT GTATGGAAAC 1500
TCAGGAGACG GGTACAGAAA GGGGTAGTAG CAGTTCAAGA GCGGTGTGCC CAGCAGTTGA 1560
TGAGAGAGGA GGAACTTTGG GGAAGCCTTC CTGGAGAGGT GGCTCCTGGA CCGGGCCCAG 1620
AGGGCTTCAG AGAGGACATG CAGACAGGGG GAGAGGTTAG GCTTCTCCTC CCTTCAGGTT 1680
TTGAGAATTT ACCCAGTGTA TTTTCTTTTG CATTCATTGT GCTAAACACA GTGCCTCGAT 1740
ATAGTAGACA TGCCAATGGA AGGAAACATG AAGGTGTTTT CAGGAAGGCA TCAGCAATGC 1800
CTGGGTTGGG GATGGGAAGA GAGGGGAAGG CTGAAATCCA GTCCTGGGGC CCAGCCTCCC 1860
TGCCTTCCTA TTGAGTTAAA ATGTTGCCCT TTAAATTGGA ATGGGGTATA GTTTGCTTTT 1920
TATATCCAGC CCCGTCTGTG TGCTGCAGAT CTAGAGGCCA CCCACCTAGT GTATGTATAG 1980
TATTTTAACA TCTATATAAT GAATGGTGTC TGCTGGGAGG CTGGGAGCAC AGGTATTAAA 2040
TCCACCTTGG ACTTCACTCT GTCATCTCAG GCCTTTACTT GTCCTGGCTG GGCTGCCTGA 2100
GTTAGAACAG AGAAGCCTGG AAGTGGCTAA GACTGTGAGG TAAATATGCC CCTGGGTACT 2160
GCTGTGGGGT CAGAGAAGGT GGCACTGGGC AGCTGTTGAA AAGCCTGCCT AGCAACCAGA 2220
CTGTGGACCA GGTTGAGGAC GGGGGTGACC AGAGGAAGCC TGGAAGAGAA GATGAGGGCC 2280
CAGACTTCTT TTTGTTTCTG TGGAGGGAGA AACTATAGCC GAAGGATTTG TTCTAAGAAG 2340
GCAGCTTCTA CAGAAACCTC ACTCCCTTCC TGCAGTGAAA TAACCCGAAA GCACCCATCT 2400
TGCTGTGGCT TTCTACAAAC CAGTTAATAC CTCCAGGGAC CTCCCAAGAA ATATGCTAGA 2460
GTCTTGTTCC CACTTTCCCT TTGGAAAGGG CTGACCTGGG CCAATGGGGG ATGGGCCAGG 2520
CAGCCCTTGC CCTGGCAGGA CTCCTGGCAG GGAGGATAGA TGCTACTGTG TCCTGCATGG 2580
GGAAAATTTC TTGCTCCTCC TTACCATGCC AAGAGCCGGT CACACAATGA CTCAGAGCGA 2640
TTGCTCTTGT CTGAGAGCCC TGGGCTGGGG GTGGAGCAGC AGTAGATTTT CATGGGCTTG 2700
TGATTTTCAG GTGTTTTGTT TTCTTCTTTC TAGTTCCGAA CTGTGGGTGG GAAATCAGGT 2760
AGGCAGGAAC CTGAGCAGCT GGACACCCTC AGCTGTCCTC AGCAAGAGTC AGGGCTCTGT 2820
TCCCTGAGTG GCGGTTTTTA TGGGCAGATA GCATTGCAGA AAGGCAACAG CCTCAGGGCC 2880
TCAGCCTCCT TCCTTGCCCT TCAACTTAAG TCCTTGCTAC TTTGTCTGGG AGGATCATAG 2940
CCTTCCCAAA TTAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAATCAA TGAAAGCTGC CCCAGCTTAC 3000
CAGGGAGCAG CCAAGATACC AGAGCTCTGA TAATGTTGCC ATGGTGACCA TTATCCCACT 3060
ATGGCCCAGG GAGCTAGAGA TGGGAAAGGG GACAAGAGTG TCCTGATCTA GAGACCTGCT 3120
TGCCTTGGGA GGCAGAGGGA CAGTAGAAGG GTAGACGATG ACGTTGCCAT GACTTCTTGG 3180
GACGAACCAT TGACCTGTGT GGTTCTATTC ACTGCTCACT GCGGCTCACT GCAGACTTAC 3240
AGTAGGAGCT CTGACCCTCC TCCCCATTTC ACACAGAGGA AGGGGTGGGA GGTAACAAGC 3300
TGAAGTTCAC ACAATGGCAC ATGCATGAGC TGAGCCTAAA CTTGGGGCCT GTGAAGTTAG 3360
AGTGAGGCCA GGGCAGGCCA ACCAGGCCCT GCCACTCTTT CTGATCACTG GCTCGGGAAC 3420
TCCGTTTCTG TTTGGGCAGA ATATTCAAGG TGGCTAATGG AAGGACTCTG GAGCTGAGAC 3480
CTAACTGGCC TGAGCATCCC CCAAGGCATT CATGATGACC TATGTGGTGA CAGGCATCGT 3540
GGCATCTCTA CAGTAACCCA TGAAGTAGCA TTAAGGCTAT TATCCCTATT CATTCCAGGG 3600