EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-21103 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr6:124989910-124992800 
Target genes
Number: 44             
NameEnsembl ID
Lpcat3ENSMUSG00000004270
Emg1ENSMUSG00000004268
Phb2ENSMUSG00000004264
snoU89ENSMUSG00000088835
Gm15884ENSMUSG00000087327
Ptpn6ENSMUSG00000004266
Grcc10ENSMUSG00000072772
Atn1ENSMUSG00000004263
Eno2ENSMUSG00000004267
Lrrc23ENSMUSG00000030125
Spsb2ENSMUSG00000038451
Tpi1ENSMUSG00000023456
Usp5ENSMUSG00000038429
Cdca3ENSMUSG00000023505
Leprel2ENSMUSG00000023191
Gpr162ENSMUSG00000038390
Cd4ENSMUSG00000023274
Lag3ENSMUSG00000030124
A230083G16RikENSMUSG00000055818
PtmsENSMUSG00000030122
Mlf2ENSMUSG00000030120
Cops7aENSMUSG00000030127
C530028O21RikENSMUSG00000030329
Zfp384ENSMUSG00000038346
Ing4ENSMUSG00000030330
AcrbpENSMUSG00000072770
Lpar5ENSMUSG00000067714
Chd4ENSMUSG00000063870
Nop2ENSMUSG00000038279
Iffo1ENSMUSG00000038271
GapdhENSMUSG00000057666
Scarna10ENSMUSG00000089617
Ncapd2ENSMUSG00000038252
Mrpl51ENSMUSG00000030335
Mir3098ENSMUSG00000093157
Vamp1ENSMUSG00000030337
TapbplENSMUSG00000038213
Cd27ENSMUSG00000030336
LtbrENSMUSG00000030339
Scnn1aENSMUSG00000030340
Tnfrsf1aENSMUSG00000030341
Plekhg6ENSMUSG00000038167
Cd9ENSMUSG00000030342
VwfENSMUSG00000001930
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr6:124991403-124991414TTGACCTTGAA-6.14
Foxd3MA0041.1chr6:124990782-124990794AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr6:124991952-124991973TTTTTGTTTTTTTTTCATTTT+6.04
JUN(var.2)MA0489.1chr6:124991282-124991296GAAAGATGAGTCAT+6.27
KLF16MA0741.1chr6:124990062-124990073GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr6:124990063-124990073GGGGCGGGGC-6.02
NFE2MA0841.1chr6:124991286-124991297GATGAGTCATC-6.14
Nr5a2MA0505.1chr6:124991101-124991116GAGTTCAAGGCCAGT+7.4
Nr5a2MA0505.1chr6:124991402-124991417GTTGACCTTGAACTC-7.7
Enhancer Sequence
GGACAGTAAG AGCCAACTGG AGAAGGGGGT CATGGGCCAT AGAGTGGTGT AGAGGGTCCA 60
GGTTGACAGA CTTCATGGCC CCGAGGTTCT GGTAGCCTGA AGATCACAGG AAAAGGGTTC 120
CGTGGGAAGA TTTATTCGAG GGGGAAGAGG GAGGGGGCGG GGCAGTGGGC TTAGAGGCCT 180
CGCTCAAGAT CTGGACGAGG GAAGGGCTGC TCCGTGGGAT CAGGGCTGGG CTTTAAAGGG 240
TTAGGGGTAG CAGGAAAGTA GTTGCTGACT CAGTTCTTGA GGGTAGATTT TTTTTCCCCC 300
CTAAGTTGTG CAGCGTCGTT ACTTACGCAC TGCCATTTGG AGCAGCTGCA GATATTCGAC 360
CTAATTCCTT TAGTCATTTA TATCTCAAAA GTTGCTCCTC ATTAAGCTTG CTGGGTGGAA 420
TAGAGCGACC ACTGAGTTGA TCGCTGAAAT GCTTTACTTT ATGAGCAAAA TCCAGTTCTC 480
AAAAAATGAG GAATATGTCT GTCTGTCTGT CTCCTCGCCT CCCTGGTCTT CCCCCTCCCC 540
CGTCGTGTGT GTGTGTATGT GTGTATAGAG ACTGGGAAGT GAGAAATCGG CTGGGGATAT 600
ATTAGACTTT TAGGCAACTC TTAACCTGGG CATCTTAAAA TAGAGCATTG ATTTTAATAA 660
AAGAAAGTAA CTGATCAAAT AATGGTAGCA GTCCAAATCA GAAGTGCAGA CCTGGTCTTA 720
GAGAATGACA GAAAGTTTTA GATATTAAAC ATGGCACACC TTTAATCCCA GCACTTGGGA 780
GGCAGAGGCG GGCGGATTTC TAAGTTCGTG GCCAGCCAGG TCTACAGTTT GTTCCAGGAC 840
AGCCAGAGCT ACACAGAGAA GCCCTGTCTC AAAAACAAAC AAACAAAAAA AGATATTGAA 900
CATGGCAAGA TTGATTGAAT GACTTTGCGA TTGAGAGAGA AGGAAAATCC AAGGTGAATT 960
CTGCTTGGAA AATAAACTAT CTAATCAGCA GTGTAGGAGA TTCTGGAGTA ATAACAATAC 1020
ATTAGTCTTT GCCTTAGAAA TAGGCATTCA ATCTGACAGT GAGATTATTC AGGAAAAAAC 1080
TTCAGACAGT AAAAAAGACA CTGAGCTCAA GAAAGCAGCA TTTAAAGGAT AAGATGTAGT 1140
GGTTCACGCC TTTAATTCCA GCACTCGGGA GGCAGAGGCA GGCGGATTTC TGAGTTCAAG 1200
GCCAGTCTAG TCTACAAAGT GAGTTCCAGG ACAGCCAAGG CTACACAGAG AAACCCTGTC 1260
TCGGGAGAAA AAAAAATGTC GATGCTGGCA ATACCAGAAG GCCTCTGACC TAGTATTCAC 1320
TGCTAGGAGG AAGTAAGTTA CTTGAACGAG AAGGTGGTGC CGACTGCCTC GGGAAAGATG 1380
AGTCATCTGA TTTGGTAATC TGTTGTGACT AGTAATCCTA GTGAACTGCT GTCACAGACT 1440
TAAGAAGCCC CCTCTTGTTT TGTCTTTTCA GACAGTGTCT GATTTAGCCC AGGTTGACCT 1500
TGAACTCCAG GCCCTCCTTC TATCTCCACA GTGCTATTGA TTATAAGCAC CAAGCCATAT 1560
TCAGTACAAA CATTTTTTTA CATTTGAGTT CGACTTACAG AAACACAAGT TTGGGTAGCA 1620
CATACCTTTA ATCCCAGCAC TTGGAAAGAT CTCTGAGTTT GAGACCAGCC TGGTATTATA 1680
AGGTGAGATC TCGGCCCGCC ATGGCTACAT AATGAAAGCC TGTCTTTATG TTTATATAGG 1740
AGATGACACT AGACCACTTG CCTAACAAGG GGCAGCCCCT GGGATTGAAG TTCAGTCTGC 1800
CCCACCACAG GGAGCGAGAG AGTGAGGTTA AGCTCTGTAG AGAAAATTTG CTTTTGTGGA 1860
GAAGCTTAAC TAATAATACG TTTATTCAAT TATTTATTTG ACACTTTCTA AACATGAGGG 1920
GAATTTAAAA TTTGATCCAG GCATGTGTCT CCTGGAAGGT TAGGGAGACA TACCCAAAGT 1980
AACTATTAGT TATTTCGTTA TGGTTGGATA AATACTAAAA ATACTGGCTA GACTATCTCT 2040
TTTTTTTGTT TTTTTTTCAT TTTGGTTTTT TTCGAGACAG GGTTTCTCTG TGTAGGCCTG 2100
GCTGTCCTGG AACTCTTTGT AGACCAGGCT GGCCTCGAAC TCAGAAAACC GCCTGCCTCT 2160
GCCTCCCGAG TGTTGGGATG AAAGGCATGC GCCACCAAAC CCGGCTCTAG CTAGACTATC 2220
TTGACAGCCT GTCTATGTAA GGCATTTGTC CGAGTCTGGG AAAGTCCGGT TCTGAAACTG 2280
CACTTTGAAG AATGAGAAGA AGTGGAGTGG GGGAAGCAGG TACTGTGTGG GTGGGATGAG 2340
GAAGCCAGGA CTCCTGGAAA GTTGCTGACA AGTGTGAGGC GCTTAGAAGG CCAGTGTGTT 2400
ATCAGAGAGA GCAAGAAGAT GGCAAGGCTG AGTGAGCTAA GCCAGATAGG AAGTGTGGAA 2460
CACAGCCTTA AGTTACTGGA CGGTTACAGA ACGCATGATG AGTGCTAAAG TTGAGAGCAA 2520
AGAAGATGGA GGTTGAAGCT AAAAGAGAGA AAGCTGGTTT ATAGAATAAG GTCACCAAAT 2580
AAGAAGAGGT TAGGAGGCTT GCAGAGACAG GAGGCTAGCT GAAAAAGAGG TTTCCCCTTT 2640
TGAGAAAGGG TGAATGAATC CTGTCACAAA TAAATCCCTC ATTTCAGGCT GGGCATGGAG 2700
CTCAGTTGGT AGAATGACTG CCTGGCATGC AAGGGCCCTG AGGTTTGATC CCCAACACTG 2760
TATACAGCTG GCATAGGACT ATTAACACTG GACTATTAGG AGCCAACACA TGACAAGAAT 2820
CAGAATTTTA TTGTTGGTCA TCGTTGGCTA CAAAGCAAGT TTGAGGCCAG CCTGGCCTAC 2880
AGAGACCCTG 2890