EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-15817 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr3:88751000-88753780 
Target genes
Number: 41             
NameEnsembl ID
RhbgENSMUSG00000001417
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Smg5ENSMUSG00000001415
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
Rusc1ENSMUSG00000041263
FdpsENSMUSG00000059743
PklrENSMUSG00000041237
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
GbaENSMUSG00000028048
Mtx1ENSMUSG00000064068
Muc1ENSMUSG00000042784
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Dpm3ENSMUSG00000042737
Slc50a1ENSMUSG00000027953
Efna1ENSMUSG00000027954
Gm15417ENSMUSG00000074466
Zbtb7bENSMUSG00000028042
Flad1ENSMUSG00000042642
Cks1bENSMUSG00000028044
Shc1ENSMUSG00000042626
Pygo2ENSMUSG00000047824
Pbxip1ENSMUSG00000042613
PmvkENSMUSG00000027952
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr3:88752801-88752812ACAGATAAGAA-6.14
Gata1MA0035.3chr3:88752801-88752812ACAGATAAGAA-6.62
RREB1MA0073.1chr3:88752113-88752133CCCCACCCCAACCCCACTGT+6.07
Enhancer Sequence
TGGAGAGACT CTGTCTCAAA ACAACAACTA CATAAGTAGA AAATACAATC ACATTGATGA 60
ACCAAATAAT TGCACAGAGC ACTATTTCTG GGGCAGGGAA CTGGGCTGGC AGTAATGGGG 120
ATCAAATCCA AGGCCTTGTT ATATTAAGTC GGCACTCAAT TGTGTGGACT GAGAAAGACT 180
GTATGGAAAT TAGTGAAGAC TAGTTGTTTC CATTAATTTC ATTAGGGAAA AGGACAGCTT 240
TGGCTGGAAA CTATGACTCA GTTATCAAAG TGCTTGTCAT TAAAATGTAA TCCTAGACAT 300
ATAAAAAGCC AGGCATGGCG GTAGATACTT TATAATTCCA AGACTGGGTA ATGTGGAGAC 360
AGTCAGGCCA GTAACTAATC AAATCCAGCT CACCTGAGTT CTAGGCAGGC AGCTACTTCA 420
GAAAACAACA ACAACAACAA CAACAACAAC AACAACTACT GACCTGGTAT AAAGGCACAC 480
ACCTTTAAAT CCAGCACTGG AGGCAGACAC AGGGGAATCT AAGTTCAGCC TGGTCTACAG 540
AGTTCCAGGG ATACCAGGGC TACACAGAGA AACCCAAAAC AAACAAAACA GGAATAACTA 600
GTAGACTAGC TCCTCAATAG TGGCATTTAA AGTTGACCTC TGGCACCCCA AGAGTGTGCA 660
TGCACATGTG CACAGCACAA TCAAACATAT TTATGCTACA TTTTTTGCTC CTACTCGCCC 720
AGGTTTGGGT TCCTGGAGAA ACACTGGGAC TACAGAAGGA AAATTAATGT GCCTCACCCC 780
ATCTCCTGCA CCCATGCAGG GGCTCACAAT CTTAGGTGAC CCAACACCCT CTTCTGGCCT 840
CTGGGGGCAA CACACACACA CACAGGATGC ACAGACATAC ATGTATACAA AACACCCATA 900
TATACACACA CACATACAAA TAAAGAATTT TTACTACGAA GGCAGTGTGA TATAGGGGAA 960
AAGTTAGGAA ACTAAAGTCT AAAGATCAAG TTACAGATTT CTTTGAACTT CAAGCTTTGC 1020
TTGGAAAAGG AAGAGTCTCC CTGTTGTAAG GGTTCAACAG GAACAGTACA GAAGTCCGTC 1080
AGTGCTCTTC AGACTAACTT TCTCTCACCT GCCCCCCACC CCAACCCCAC TGTTGTTCTG 1140
AGACTGTCTC ACGGAACTCA GGCTAGTCAA GACTTTGCTG CATAGCTGTG GATGACCTCC 1200
AAGTTTCCAT CCTCCTGCCT CCACTTTGTG GAGTGTTGAG ATTATAGCTT CAAGCTTTCT 1260
AGTCCTAGTA TTTAAGTATG TGACACTGAT TTTAACATTT CCATGTCCTT TGAGATAGAC 1320
CCTGTAAATC AGTCGGACAG TCTGCACACA TGCAAGCACA CACCTATACA AAGTTGCACA 1380
CAGGAAGCTA CTGAAGAAAG ATTCCTGCAA CCCTGGGTAG ACTGCATGGG CTTGGTTAGC 1440
AAAAGTAACT TCACAGCTAG TCAATTAAGG CTGATTGTCT CTTTAACTCA AAGAAGGAAA 1500
CACAAAGATA ATCAATCCCC AATGCATACA GCCAATAGGG AAAGGTTGGG TTATCTGAAA 1560
ACCAGGTATG GGTTCATGCC TATAATCCAA CCTCTAAAGA GGCTAAGACA GGATGACTGT 1620
CAGAGTTTCA GGCAAGCTTG GGCTAAAGAG TGAGACTGTC AAAACAAACA AATAAACAAC 1680
CACTCAAAAG ACAATTTAAC CCCTATTCCA AAAAAAGACT GAATATTAAT TGAATGGGTT 1740
CTGGAGATGA ATGGAACGCA GTAATGTTTA AATTTCCCCT GAATCACAAA GGTAAGAATT 1800
CACAGATAAG AAAGGAAACT TAAGGTGCCA TTCCTCTAAA ATTTTGCTTT GCTTTTTGTG 1860
GGAGACTAAA AATGAGTAGA TCAAACGTTG GGGTTTTAAC ATCACATGCC CTGAATTCAC 1920
TCATCCAATG TCAACACGGA AACAAATACT AGCAGCCAAT GAATGCCATA GGTCTGGTTT 1980
AACTAGCAAT TTAGATGAAT AGAACACAAA CTACCAATTA CACCTACAAA TCTTATCAAC 2040
ATCAACAGCA CTGTAAATGA TAACAATAAT ACTCCGCATT TTCCCCGTAC CCAGGAGCTA 2100
ATTCTGCTTT ACATATATGA TCTCATTATT TCATACTCCA ACCCTGAAGG TATATTTTGG 2160
GGTTAGCTAA TTTTTACTAC CAGCATCTCA TAAATAACTT GGAAAAATTT GAAGGCCTAA 2220
AAGATCAAAT CCAGAAATAA AATCTCAGTG CATAGTTTCA TCCCCTCACA CACTCAACCT 2280
GCGGGTGGCG ACCCGAGGAG AGGTCTAACA ACCCTTCACA GGGATCCCAT ATCAGATATC 2340
CTGTATATCA GATGTTTACA TTAAGATTCA TAACAGCAAA ATTACAGTTA CGAAGTAGCA 2400
ACAAAACTAA TTTTATGGTA GGGAGTCACC ATGTGGAACT GTACTAAAGG GTCGTAGCAT 2460
TAGGAAGGCT GCGCGGACCA CTGCTCTAAC ATCAGGCTGC CAGTTGCAAA CCGAGTTCGC 2520
ACAATCTTTG AGAAGTGCAC AAGGATCACA CAAGCATCAC AGAGGATAGG TACCCTCTGG 2580
GACTTTAACA AGGTTAAACT ACATTAACAT ATTAACAGCC GTTCTGTCCG TTCATCCTCC 2640
GGTCCCAGGT CCGCAGCCCC GGGTCTGAAG GATGCCCTCT TGGAGGATCA CCGACACTGC 2700
TGCCCTCATT CCCTATCTCG GGGCAGTTCA AATACACGCT CCTTTCCCTC CTTCATCATT 2760
GCATCCCCTG TGTGGCTCAG 2780