EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-15800 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr3:88349170-88351950 
Target genes
Number: 39             
NameEnsembl ID
PrccENSMUSG00000004895
HdgfENSMUSG00000004897
Apoa1bpENSMUSG00000028070
Iqgap3ENSMUSG00000028068
RhbgENSMUSG00000001417
1700021C14RikENSMUSG00000010538
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Tmem79ENSMUSG00000001420
Smg5ENSMUSG00000001415
Paqr6ENSMUSG00000041423
BglapENSMUSG00000074489
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
Rxfp4ENSMUSG00000049741
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Mtx1ENSMUSG00000064068
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Slc50a1ENSMUSG00000027953
Efna1ENSMUSG00000027954
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr3:88350653-88350664GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr3:88350653-88350663GCCCCGCCCC+6.02
MAFFMA0495.3chr3:88349393-88349408CTGCTGAGGCAGCAG+6.04
RREB1MA0073.1chr3:88351497-88351517GCGGGGGGGGGGGGGTGGGG-6.24
RREB1MA0073.1chr3:88351505-88351525GGGGGGGTGGGGGGTGGGGG-6.63
RREB1MA0073.1chr3:88351512-88351532TGGGGGGTGGGGGGTGGGGG-6.63
RREB1MA0073.1chr3:88351506-88351526GGGGGGTGGGGGGTGGGGGG-6.69
RREB1MA0073.1chr3:88351513-88351533GGGGGGTGGGGGGTGGGGGG-6.69
RREB1MA0073.1chr3:88351498-88351518CGGGGGGGGGGGGGTGGGGG-6.83
RREB1MA0073.1chr3:88351499-88351519GGGGGGGGGGGGGTGGGGGG-6.92
RREB1MA0073.1chr3:88351509-88351529GGGTGGGGGGTGGGGGGTGG-7.47
RREB1MA0073.1chr3:88351502-88351522GGGGGGGGGGTGGGGGGTGG-7.62
RREB1MA0073.1chr3:88351516-88351536GGGTGGGGGGTGGGGGGGGG-8.13
SP2MA0516.2chr3:88350649-88350666ATCTGCCCCGCCCCCTC+6.47
ZNF263MA0528.1chr3:88351514-88351535GGGGGTGGGGGGTGGGGGGGG+6.25
ZNF263MA0528.1chr3:88349180-88349201GAGGGAGTGGAGAGAGGAGGG+6.35
ZNF740MA0753.2chr3:88351499-88351512GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:88351528-88351541GGGGGGGGGGCGC-6.1
ZNF740MA0753.2chr3:88351502-88351515GGGGGGGGGGTGG-6.44
ZNF740MA0753.2chr3:88351525-88351538GTGGGGGGGGGGG-6.92
Enhancer Sequence
CAGCACCACT GAGGGAGTGG AGAGAGGAGG GCTGAGCCAG GACAGAGCAG CTCTGAGCCT 60
ACCTGAGCTC GACAGTCTGT CCCACCAGAA AGAGGAACTG AGATCAGAAA AGCAAGAAAA 120
GAGTTGTCTC TTCTGGCAGA GACACTGAGG GGATTGGCCA CAGTACATAG GACATCTGTC 180
TAGGGCCGGG GAACAGAAGG GCCAGCAGTG TTCGAGACAG GGGCTGCTGA GGCAGCAGGG 240
TACCGCAGTT AAGAGCAACA GCTGTGGGCT GCTGGCAGAG GACATGTGGA AAGGTTACTG 300
AGACAGGTCA CGTGAGAAAG GATAAAAGCA CGGAAGGCCT GGAGTGCACA TTTCTGGACT 360
AGGGAGTATG GGAAGGATGC AGATGTCTGT AAGTGAATTG GAAGGATGAG GAAGAAGGGC 420
TTGGGTATTT GGTGTGTTTC CATGGAAGAC TGAGGTTAAG GTTGGCTGGT GACACTTCTG 480
TGGGTGAGAG GCAGGTGCTG GAGTGCACCT TTTTGCATGC ATGTGTGTTA CTGCCTCTCC 540
TTTGTGAGGA GAAGCATTCC CATTCATCCA TCCGCTACCC TGTCCTCAGG CAAGGTTTTA 600
ATGCTAGGCA GGTAGCTGTC CCTACTGGCT TTGAGGCCTT TTAATTTTGT TTTAAGATTT 660
ATCTATTTTA TGTAAGTGAG CATGTGGCTT CTACATGTGT TTGTATACCA CATGCATGCC 720
TGGTGGAGTG TCAGGTCACC TGGAACTGGA GTTAAAGATG AGTGTAACCA CCATGTGGGT 780
ACTTACCCAC AGAGCCACCT CTCCAGCCCC TTTAGTGACT TCTTTTTGGC AAACAACTTA 840
AGTCTCTCTC TACATCTTAG TGTCCTCCTC TGTAAAATGC CAGTGGCTAA CATTTACAGA 900
GTGTTTCCAT CACATCAGCC ATTATCCAAA AAACTTTATG TAACCCCACA ACAATGCCTG 960
AGGTAAATGC CTTTATTGTT CCCATTTTTG TTTATATTAT TATTATTAGA CTTTTAAAAA 1020
GATTTATTTA TTATTATATT ATATGTAAGT ACACTGTAGT TATCTTCAAA CACACCAGAA 1080
GAGGGTACCA TATCTCATTA CAGATGGTTG TGAGCCACCA TGTGGTTGCT GGGATTTGAA 1140
CTCAGGACCT TTGGATGGAA GAGCAGTCAG TGCTCTTAAC CACTGAGCCA TCTCTTCAGC 1200
CCATATTATT ATTATTATTA TTATTATTAT TATTTTGTTT TTTCAAGACA GGGTTTCTCT 1260
GTATAGTCCT GGCTGTCCCG GGACTCAGTC TGTAGACCAG GCTGGCCTCG AACTCAGAGA 1320
TCCACCTGCT TCTGCCTCGT CAGTGCTGGG ATTAAAGGCC TGCACTACCA CCGCCCAGCC 1380
ACCATGCCCA TTTTTATAGA CAAGGAAGGC ACCCAGCTAG TAGGTCTATC ACACTGCTCT 1440
AAACATAGAT GTGCTGCTCA CCTCTACCTT CGGGGAAGGA TCTGCCCCGC CCCCTCATTG 1500
CAGGGAGGAA AGCAGTAGCA GTGACAGCTC ACAGGTGAGC CCTCACGGAC ATGGGGATGT 1560
CAAACCTCTC TGGACAGCTC CATGTGGTAC CCCAGGGACA GTGTTCCAAG GCTACTCCAA 1620
AGCTCCCTGT TCCCTGAGTA GCTCTGAGCT CTCTCTCATG GCAGGCAGGT GACTATCCTC 1680
TGCCTAGTCC TGCTTCCTCC TGCTTATCTT CACATGTGGT GGCTTATAAT CATTACAGAA 1740
TACCCGACAC TTCTCAGAAG TGGCACTGGG ACCCCATCTG AGCTAACTGG TAAGTGGCAG 1800
AGAGGCCATG CAACCACTCA CGGTGATAGC TCACACCAGG GCTGTAAGAT GAGTGTGTGA 1860
GAGTGGCACC CAGTAGGGCC TCAACAAACG GGAGTTACTA TACCATGGCC ACAGCCCCAC 1920
CAGATTCCTT GGGAAAATGC CAGGAGTACA GGCTCCCCAG CTTGGGCCAG GGTGGGGCTG 1980
AGGTTGGGAG AGGCTGTGGG TGTGGTGCAA AGGAAAGGAG AGTGCCACCA GGCCACCTAG 2040
CCTTCAAGAA GGAGAGCTAG AGACCCACAG AGAGACCAAA CACCAGGAGC TGAGGGAAAG 2100
CAAGCAGGCA GGATGCATGT GCACTGTCAG AAACAGCCCA GCAAACCCTG TGCCTAGTAT 2160
CTGGGTCCAA AGATTGTGTG GTACAAGAGG CCATGCATGG CACAGGCTGC AGCCCAGGAG 2220
TCCTGTGGAA TCCATTAGAT GGCTGGAGAG TCAATGCATT GTCCGGGTGT ATCAACTACC 2280
TAAGTATCAA CTTCCCTATG TGTCAACTAC CTAGATCAAC AATGACTGCG GGGGGGGGGG 2340
GGTGGGGGGT GGGGGGTGGG GGGGGGGGCG CACCCCTTCC TACGCATCTG CTGGTAGAGA 2400
TGACTTTCTT CCTCTTAAAT AGGCTTGCTT CTCCCTCTAC TCTGAAAGTC CTTTCTGAAG 2460
TCCGACTTCC ATCTCTTGGG CTTCACTGAC ATTCCCAGGG ATTTGAGCAT CTATTAGAGA 2520
CTGGGCAGGG AAGAATAATT TGGCAATAGG GAGAAATTAT CCACATCTTT ATAGAGAGCA 2580
TACAACTCCA GAACATCTGT ACCTGTAACC AGACATGCCT ACTCCTCATG GCCTTTCTCT 2640
CGGAGAAGGA ATGCTGAGCT TGGGGACGGG TGGGGGGAGA ATGTCCAAGG TAGAGATAAA 2700
AATAAAAGGG AGACCCTGTG TCCTCTGGAA ATAGCCTCTC TCCCACCCTC TCTGGAGTCT 2760
CCCTTTTCGA GAACCCCAAC 2780