EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-15795 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr3:88252060-88253600 
Target genes
Number: 37             
NameEnsembl ID
Apoa1bpENSMUSG00000028070
Iqgap3ENSMUSG00000028068
Mef2dENSMUSG00000001419
RhbgENSMUSG00000001417
1700021C14RikENSMUSG00000010538
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Tmem79ENSMUSG00000001420
Smg5ENSMUSG00000001415
Paqr6ENSMUSG00000041423
BglapENSMUSG00000074489
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
Rxfp4ENSMUSG00000049741
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
GbaENSMUSG00000028048
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:88252683-88252704GTCTAGTTTTACTTTTTTTCT+6.07
RarbMA0857.1chr3:88252586-88252602GGACCTTTGGACCTTT-6.09
SOX10MA0442.2chr3:88253242-88253253GTCTTTGTTTT-6.14
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01438chr3:88250596-88336770Th_Cells
mSE_07949chr3:88250041-88253855Intestine
Enhancer Sequence
TGCCTGAAGA CAGCCAGAGA AGACATTCAC TGTGGTTCCC TTGGCTGCCT CTCCAGCCCC 60
AGTGGAATCC CAGCCGGCCT AGAGGGTAGG AGCCAGGCCA ACCTCTGGAG GCTTATTTTT 120
TCCTTGCTGA TGGTGATAAG GACCTGACAG CCCCACAGAG TTCCCTGACC CTGACCTAAG 180
GCCTGTCTGG AAGCCCATCG CAGGATCTGA AATATGATTG CTCCTAATGA GGATTAATTG 240
GGGCATAGGT AGGCCCTGGG GTGGCCCCTG CCTGTCCTGC CCAGGCTGGG CTGTGCCCAC 300
AGGAAGAGTG GTAGAACCGG CTTCGTGGTC CTCAGAGAAT GAGCCACGGC TGTCTCTTCT 360
GCTGGTCTGT GGCGAACCAG TACGTCTTCT CATAGTCTCC TCGACACACT GACTGGGTTC 420
CCAGTTCTGC ATCTAACTGA TGACAGACCC TGCACACCAG AAACCTTCGC TTCCTGATAC 480
ATGGTTGGCA GGTGTCTAAA CACTGTGATG CCAGACTGTG GCTGTGGGAC CTTTGGACCT 540
TTCTTGGTCT CTGAGCAAGT CCTTCCTGTT TTCTCACTCA TAACGATAAC CTATGGCCAT 600
TAGGAAGCTA GTGCTAAGTT TGTGTCTAGT TTTACTTTTT TTCTTTTTCT TTTGTTTTAA 660
ATTATTTATT TTATGTATAT GAGTACACTG GACAGTACAG TATATGTAGC TGTCCTCAAA 720
CACATCAGAA GAGGACATCA GATTCCATTA CAGGTGGTTG TCAGCCACCA TGTGGGTATT 780
GAATTGAACT CAGGACCTCT GGAAGAGCTG TCAGTGCTCT GAACAGCTGA GCCATCTCAT 840
CAGCCTGTGT TTAGTTTTAC AATAGCATTT GAGCGCTACA GACCCTTGTC CTGCCTTTCT 900
GGTATTTTCT TTTACTTCCA TTTCCTAGCC TAGTGAATTG GTTTTGTTTG TTTGTCTTAA 960
CACAGTCTCC AGTAGCTGAG GCTATCATTA GTATGGAGCA GAGGATGGCC TCCTGTCTCT 1020
TCTTCCCATC TACCACCATC CCTGACTTAG GTGGTGCTGG GATCCAACTC AGGGCTCTGT 1080
GCATGCTAGG CAAATGCTCT ACCAACTGAG CTACATCCCC AGCCCTTGTT TATTTTTGAG 1140
GCATTAGTCC TTGAACTCCT GATCTTCCTT CCTCACCACC ATGTCTTTGT TTTATCAATG 1200
TTTTATTTTG TTTGAGACAA CAAGCTCTCT CTGTGTAGCT CAGACTGGCC TCCAGTTCCT 1260
TAGCCTCTTG CCTCCACCTC CCAAGTGCTG AGAACACGGC ATGCAGCATG ATGCTAGGTA 1320
TTTTGCTGAT TTCTAGTGTC TGCCTCCTGT AAGCTTCCTT CTAGGCAGAA TGAAGCTAGT 1380
CTCTGAGCTT TGTTTCTTCC CTACACATGA GAGACAGTCC GGTTCCGGGG GTCTGGTGAT 1440
GCTCAGATGC CTTCCTATGC AAAGCACGGA ATGTAAAGTA GGCTCTATCC GCTCCCGCCT 1500
CCCTGGGTCG CAGCCCTCCT TTTCCCTGCC TTGCTGCTCA 1540