EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-15794 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr3:88244870-88251910 
Target genes
Number: 34             
NameEnsembl ID
Apoa1bpENSMUSG00000028070
1700113A16RikENSMUSG00000086082
RhbgENSMUSG00000001417
1700021C14RikENSMUSG00000010538
Cct3ENSMUSG00000001416
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Smg5ENSMUSG00000001415
Paqr6ENSMUSG00000041423
BglapENSMUSG00000074489
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
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Rxfp4ENSMUSG00000049741
2810403A07RikENSMUSG00000028060
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5830417I10RikENSMUSG00000078684
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Msto1ENSMUSG00000068922
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Rusc1ENSMUSG00000041263
GbaENSMUSG00000028048
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
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EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:88250473-88250491GGAAAGAAGGAAGGAAGG+9.47
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FOXP1MA0481.2chr3:88247333-88247345AAGTAAACAGAC+6.52
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Foxd3MA0041.1chr3:88246335-88246347AAACAAACAAAC-6.32
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KLF5MA0599.1chr3:88244965-88244975GGGGCGGGGC-6.02
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KLF5MA0599.1chr3:88244985-88244995GGGGCGGGGC-6.02
LMX1BMA0703.2chr3:88245317-88245328GATTTAATTAA+6.02
Nr5a2MA0505.1chr3:88251633-88251648AAGTTCAAGGCCAGC+8.42
ZNF263MA0528.1chr3:88246302-88246323GGGGGAGACAGGGAAGGAGAG+6.17
ZNF263MA0528.1chr3:88247496-88247517GGGGGAGGGGAAGAGGTGGGG+6.22
ZNF263MA0528.1chr3:88247489-88247510GGGGGTGGGGGGAGGGGAAGA+6.74
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01438chr3:88250596-88336770Th_Cells
mSE_07949chr3:88246266-88247323Intestine
mSE_07949chr3:88250041-88253855Intestine
Enhancer Sequence
GCCCTCTTTC CTCAGATGGT GAGAACACTC AGACCCAGAG CTCCTAGGCT CTCTGTGAGG 60
TTGAAAATGC CTAATTCATG AAAAATACCC AGCGCGGGGC GGGGCGGGGC GGGGCGGGGC 120
GGGGCGGAAC CAGCATGCCC TTTGGACTGG GTCAGCTGTT TTCTCTGCCC TGTTCTTCGG 180
TGCCTGCATC GATGCCAGCA CGAAGCAAGA GGAATGCTCC TTCAGGCAAG CACCCCGCTT 240
TACTATGTCT GTGATCCCTG GCGAGGCAGT GGGTGACAAG ACGGAGGTGT GACAGAAACG 300
GGCGGTGTTG CTGTTTTGCA TGAACTTGCT GCGTGACTTG GGGGAGTTCC TTCTCCATTC 360
TGAGCCCTCT TTCTTTCACT CATACCCGAG GGTGTTAGAC CGGCTGTTCC TTCAAGGCCC 420
TGGCAACTAG TGAGAGTCTT TGCTCAAGAT TTAATTAATT GTCCTTCTTT CCCAAGAGCA 480
TCTCCTGAGG CCAGTCCCAA CGGTCACTTA CAAGCTGTGT AGTGAGGTTA CACAAATTAC 540
TTCATCTCAG AGCCACAAAT TTCTGTAAAG TGAGGGGACA TCTATAATCC CATTTTTGTG 600
CCAGCAACAA ACGCATGCGC CTATTTTTTT TTTTTGCCTC CTCCTATGGA GATTTTTAAA 660
AAATATTTTT AACTATTTCA CTTATTACTT TGTCTCTGTG TATATGTGTG AGTGAGGGCA 720
GGCACCTGTG GAGGCCAGAG GTATACCATC CCCTGGCATG CCTGACAGGG ATGCTGGGAA 780
CCAACTTCAG GTCCTTTGCA AAAATCAGTA AGCACTCTTA AACACTCCAG CCTCTCAAAC 840
ACTTAAAAAT TCCAGTCATG GCCTTGGTGT ATAGCCCAGG CCAGCCTTGA ACTCTCAGTC 900
GGCCTGAGTC TCCTGAGTAC TGGAATTCCA GGGGTGAGCC ACCACATTTT ATGTGGGTAA 960
GCACAGAGCC AAGGACCACC AGATTCATGG GTAAAACTGC AAACAAGACA AGCTGAACCA 1020
CTCAGAAAGA AAAGAAACAC AGACCTAAGA GGAAGCCAGG CATGGTGGCA CACGCCTTTA 1080
ATCCCAAGAC TGGGAAGACA GATTGTGAGT TTGAGGCCAG CCTGGTCTAC AGAACAAGTT 1140
CCAGGACAGC CAGGGCTATA TAATAGAGAC CTGACTCTAC ACTCCTCTTC TCCCACACTT 1200
TTCTTTTTGT TTGTTTGTTT TATTGTTTTT TCGAGACAGG GTTTCCCACA CTTTTTTTTT 1260
AACTTTATCT TTATGTATAT GGGTGTTTTT CCTATATATA TTTGTCTGTG TACTGTGTGC 1320
ATGCCTGATG CCTAGGAAGG CCAGAGAGGG TATTGGATCC CCCAAAACTG AGACATCTTT 1380
CCAGGCCCCG ATTTATTTAT TTATTTATAA CTAGAGAGGA AAAAGAGGTG AGGGGGGAGA 1440
CAGGGAAGGA GAGGAAAAAG CAAGCAAACA AACAAACAAA AAACACCAAA GAGGAAACAA 1500
GAACAATTCA ATTCAAAGAG AAGAAAATGT CAGAGAAAAT CTCCTCTCCC TGTCTTCCTG 1560
AGAGAGAGAG GGAGCTATCT TGTTCCTGAA CTAAGAGGAG CCCTTACATG AAGAGAACAG 1620
GCAGATACCA CACATCCCAC GGGAGGCGTA GCCGACCTCA GTAAAGCAGC CAGCTCACCT 1680
TCAAATACGA CCGACTCTGA CCAAGTCTCT AATCTAACAA GTGCGCATTT ACAAGAACAC 1740
TGACCCGGCA TGGTGACTCA AGCCTGTAAA CCCAGCACCT AGGAAGCACA AGCAAGAGGA 1800
TCGGGAATTC AAGGTCGTCC TTAGCTAAGA TGGGAGTCCA GAACAGTGTA GGCTACCTGA 1860
GACTCTGTGA CATAAACACA CGCACGCACG CACACACATA CACACACACA CACACACAGA 1920
CAAGCACACA CAGACAACAC ACATACAAAC ACACATACAT GCACAGACAC ACACAGACAC 1980
ACATAGACAA GCACACACTG ACACACACAC ACAGACACAC AAACATACAC ACAGGCACAC 2040
ACACAGGCAC ACGCCCTCTC TAGGTAAACT ACACTGCAGA ACAGCACCGG ACAGTGTAGG 2100
ACATTGCACA ACTCTGTAGG ACAAGGAAGT AAAGTGAACA ACAAAGAGTG CTGGAGCAAG 2160
GGCGGGGCTC ACGGATTGAG AATGTTTGCT GCTGTCCTGC AGAACCAGAG CGTGGCTCCC 2220
AACACCAATG CTGCATGGCT CACTGTAACT CCAGCTCCCG GGGACTGAGG ATACCCTCTT 2280
CTGGCCTCTG CAGGCTCCTT CACACACGTG GCATACCCAG AAACATGTAC ATATACATAC 2340
ACATAAACAA AAATAAAGAG CCTGGCTATA GAAATACATC TATAACGAAA ATAAAATGTA 2400
AATTACAAGA CACTTAATAG AACACTCTAT CACACTCTGT AGATATTATT TGGATCTTGA 2460
CTGAAGTAAA CAGACCATAT TTTTAAAATT TGGGAACTGG GTAGCTAGAT GGTGTCAGCA 2520
CACACTTTAA TCCCAGTGCT TGGGAGACAG AGACAGGCAG ATCTCTGGTC TATAGTGTGA 2580
GTCCAGGACA GCCGGGGCTA CACAGAGAAA CCTTGTCTGG GGGGTGGGGG GAGGGGAAGA 2640
GGTGGGGAGA CTGGGGAAGT GTATGGGAAG GCTGGGGAAA TGTGTGGGGA GGCTGGGGAA 2700
ATGTGTGGGG AGGCTGGGGT GTATGGGGAG ACTTGGGAAG TGTGTGGGGA GGCTGGGGAA 2760
GTGTGTGGGG AGGCTGGGGA AGTGTGTGGG GAAGCTGGGG AAGTGTATAC ACATAAAGAC 2820
CTGTGTTTGG GTCCCCAGCA GCCCCATAAA AGCCAAGTGC ATGTGTGCCT GCACCCCCAG 2880
TGCTGGGGCG TGGAAAGGAG AGGCTCTTTA GGGCTTGCTG GCCAGCTGGT CTAGTCAATC 2940
AATAAACTCT AGGTTCAGTG AGAGATGTTC TCAAAAAGCA AGATGCAAAG CTGGGCATTG 3000
TGGACCCAGC ACATGGGAGG GAGAGGCAGG CAGATCTCTG TGAAATTAAG GTCAACCTGA 3060
TCTACATAAT GACTTCCAGG CCAGCCAGGG CAATGGAATA AAAAGAAAGA GAGTAAAAGA 3120
TGGGGATACA CATGAGGAAG AAACAGAGCA TCAACCTCTG GCCTATAACA TGCATGTACA 3180
CATGCATGCA CATGCATGTA CACACACATA CACACATGTA CACACATGCA TGTAATACAC 3240
ATATGCATGC ACATGGACAC ATACATGCAT ACACATGTAC ACATGTATAT ATACATGCAC 3300
ACATATTCAC ACACACATAT ATACATGTAC ACATATATAC ATACATATAT ACATGTACAC 3360
ATATATACAT ACATATATAC ATGTACACAT ATATACATGC ATGTATACAT ACAAATATTG 3420
TATATGTACA CACAGCAAAA AAAACCCTTT ATGACAGTGG TTCTTCTTCT TCTTTTTTTT 3480
TAGATTTATT TATTATTATA TGTAAGTATA CTGTAGCTGT AATTTAGATA CACCAGAAGA 3540
GGGTGTCAGA TCTCATGATA GATGGTTGTA AGCCACCATG TGGTTGCTGG GATTTGAACT 3600
CAGGACCTTT GGAAGAGCAG TCAGTGCTCT TAACCACTGA GCCATCTCTC CAGCCTTATA 3660
ACAGTGGTTC TTAACCTCCC TAATGCTGAC TCTTTAATAC ATGTTCCTCA TGTTGTGGTG 3720
ACCCTCAACC ATAAAATTAT TCATTGCTAC TTAATAACTG TAGTTTTGCT ACTGTTATGA 3780
ATCATAAAGA CCTGTGTTTC CCAATCACCT TAGGTGGGCC CTGTGAAAGG GTCATTTGAC 3840
CCCTCCCCCA CACCGGGGTT GAGACCCCTA GAAGTACTGC TTTACAGTAT CTTAGATGTT 3900
CTGAGCTGTG AGCGGGAACA CATGTCTGTT CTCACAGCAC TTGAAAGAGA GAGGCAAGAG 3960
AATTACAATT TTGAAGCCAG GCTAAGTTAC ACAGCAAAGC CTCTTTCAAA AGAATAAATT 4020
AAAATAGGAC AGCTGGCTCA GCAGTGAAGA GTACTTAGCT GATCTTGCAA AGGATCTGAG 4080
TTCAGTACCC AGCACCCACA CAGTGGCTCA CAGTATCTAC AACTCCTGTT CCAGGGGACC 4140
CAATGCCTAT TTCTGACCTC CTCAAGCCCC AAGCACACAC ATGCTACACA TACATACTAC 4200
ATGCAGGCAA AGCACTCATA CATGTGAAAT AAAAGGAAGT CAGTCTTTTT CAAGAGTAAG 4260
TTCCAGAATG GGGAGGCTTG CGTTCTGACT CAATCACTCC TGCATCCCAC AGTCTACTGT 4320
AGCATCACAC AGTAGCACGT GCAAAATAAA TATTTGTCGA ATGAAAAACA GGGACAAAAA 4380
AAAAAAAAGA AAAAGAAAAA CAGGGACAAA CAGTTCAAGC AGACTTTTCT GTTCTGAAGT 4440
GTTGGGGATG GAGCCCAGGG CCTTGTGGAG GCTAGGTTAG TGCTCTACCA CCAAGCTCTA 4500
CCTGTATATG GGAGACCTGA AGGAGAAAGG CTCCCACAGG CTCCTCTGTT TGAATGTTTG 4560
GCTCACCCTG CCCCACACTA CTGAACTGGT TAGGATTAGG AGGTGTGACT AGATGGAGGA 4620
GGTGTGTCAC TTGAGGTGGC CTTTGAGGTT TCAAAAGCCC ACACCAGGCC CAGGTCTCTT 4680
TACCTCCTGC CTATAGATGA GATATAAAGC TCTCAACCAC TGTACCAGCC CTGCGCCTGC 4740
CTGCTGCCAT GCTTCCAACC ATGAACTCAC TCTCTGAAGC TGTAGCCGGC CCCTAATTAA 4800
ATGCTTTCTT TTATAAGAGC TGCCTTGGCC ACGGTGTCTC CTCACGGCCA TAGAACAGTG 4860
ACTAAGACAC AGAGCATGAG AAAAGCTCTC CAAAGCCAAG AAAATAAACG AAATGTCCAG 4920
GCTAATGTGG TCCACTGGGC ACCCAATTCA GCACCAAGGA CTGGCCAGGT GGCTCGGCAG 4980
GTAGGGGTGC TTGCTGCTGA CAGCTGGCCC TCTCTCCCTA ATGGGAAGGG AAGTGACTCC 5040
TGTAGGCTGC TCTCTGAGCC CCTCACACAA AACAATCAAA GAACTATGTA ATTTAAACAT 5100
TAAAAGAGTC CAGTGAGGGA AAACAAGTTA TATCCAAAAG GTTAGGTCTC CAGACAGCTT 5160
GGGAAATCTC CAAAACAGGT AACATAGTCA GCCTTGCAAA GTTTGCAGGA GATGGTTTCA 5220
GCCCCTTAAC TACATACCCT AGTCAAACCA TCAACAGTAA GAGTGAAATA AAGGAGGCTT 5280
CTGCTTTCAA CGTCTCCAAA ATTTTACCTG CCTATGTCTT TATTTTCTCA GGCCTCTATA 5340
GAGGACAGCC TCTACTAAAA TGAGGTAGTT TAAGGTGAAG CAGAGTGCTG GGAACAGCTC 5400
TGTTAGTAGA ATGCCTGCCC ACATGCAGGA AGCTCACGGT GCAACCCTCA ACGCCATAGG 5460
CACTAGGCAC GATGGTACGT GCTTAGTGCT TACACTTCTG GTACTCATGA CGGAGGCAGG 5520
AGGATCAGAA ACTGAGGTTA CCTTCAACTC CATCGAGTTC AGGGCCACCA TGAGCTACAG 5580
GAGTCCTGAC TCAAAAGAGA GAAGGAAAGA AGGAAGGAAG GAAGATAAAA AAGGAAAGAA 5640
AGATGAAGCC ACGGAATGTG TGCCAGAAAC AGAAGCTACG TCATTGGAGA GTGGCCAAGG 5700
GACACTCCAA GAAGAGGAGG AAGGGAAACT GTGGCCAGGC AGATGGACGC AGAGGTCAGC 5760
CATCTGGGCT GCAGCCTATC TGAGGCTTTC TTAGAAAGTG AAACTGCTTA AGGAGCCAAT 5820
GGTCTAACTC CAGGAGATTA GGGAAGAAGT TGAAATGAAT ATAAGAACTT AGAAAAAGCA 5880
AGCAAAAAAC CGACCAGGAT AACAACTCAC CCCAGGTAAA CAGAAGGTCT ATAAAAAGGG 5940
AAGGTTATCA TGGCTTACTA CCTCGCTCAG CTGTGAGTGA GTCATCTATA GTAATCCTGC 6000
CTAAATTAGA GTGACAGGGG CTGGGGAGAT GGCTCTAGAG GCAATTGGAC GATGGTAGAA 6060
GGGAGCCAAC TCCCCAAAAT TGTCCGCTCA CCTTTACCCA TGCACCCACA CACATCACAG 6120
ACAATAAACA AATAAAAACT ATAGCTGAAA AATTCCTAGG GGTGGAGACT GTGGCTTGGT 6180
GTTAGAGCAC TTGCCGGGGC AGATGTGAGG TCCTGGGTTT GATTCCCAGA ACTCAGAAAA 6240
AAAAAAAAAA AAAGCCACCT TTTAATGCTC ACATGAGTTA GAAATAGAAC ATGGGGGAAG 6300
GGAAGGCTGA TTTGTAGAAT TTGCTAATTT CCGAGATGCA CACTGCCTTT GAAACCGACT 6360
TCAAGCTACC TATGTTGTGG CAGTGAGCAT GAGTTTGGAG AGAGATATGC CAGCGAGAGC 6420
CAGGGAGAAG CAGCACACAC CTGTGATCCC ACCCTCGGGA CAGAGGCAGG AGGTGAGTTT 6480
GAGGCCAGCC TTGGATGGGA ATGGGGCTTC AGCACCCGTC CTGTAGGTGT CTCTGATCCA 6540
GAGGTTGCCT TGAATGTGCA CTGAATTCCC TACCCCTGCA TCCTCCTGAC CACTGGGATT 6600
ACAGACGGAC GCCATTGTGC TCAGCCTATT TGATTCATTT CAATTACGTG TACAGATAAT 6660
TCAGATTACA AAATAATAAT AATAAAAGGT GCAGGTGAAA AGCTGGACAT GGTGGCACAT 6720
GCCTGAAATC CAAGCATTTG GGAGGTGGAG GCCAGGTAGC CAGAAGTTCA AGGCCAGCCT 6780
GAGTTACATG AGGTCCTGCC TGAAAATAAC TGAAATGGTG GTGAAGCTGC CCAAAACTAT 6840
GCTTGTGGCG CCTGGCCCAT GTGCTCTTAA TTCTTTGGTG ATAAAGCCAG GGGTTTGGTG 6900
CTCAGCACTG GGAAAGAGTT GGCCCTGGCA ATCGTTCTGG ATGTAGGGTG TTATCAGACA 6960
TTTGTGGCAT ATGAGCAGCT GGGTGGGGTG TGTGGACCTT TGCCCTGCCA TGATGGTGCT 7020
GGGAGGAGTG GGTGGTACTT 7040