EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-15793 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr3:88225060-88228640 
Target genes
Number: 36             
NameEnsembl ID
HdgfENSMUSG00000004897
Mrpl24ENSMUSG00000019710
Apoa1bpENSMUSG00000028070
Iqgap3ENSMUSG00000028068
Mef2dENSMUSG00000001419
1700113A16RikENSMUSG00000086082
RhbgENSMUSG00000001417
1700021C14RikENSMUSG00000010538
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Tmem79ENSMUSG00000001420
Smg5ENSMUSG00000001415
Paqr6ENSMUSG00000041423
BglapENSMUSG00000074489
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
Rxfp4ENSMUSG00000049741
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Syt11ENSMUSG00000068923
Dap3ENSMUSG00000068921
Rusc1ENSMUSG00000041263
Scamp3ENSMUSG00000028049
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:88227403-88227415AAACAAACAAAC-6.32
NR2C2MA0504.1chr3:88228063-88228078GGGGGTCAGAGGGGA+6.04
Nr5a2MA0505.1chr3:88227673-88227688ACTGGCCTTGAACTT-7.44
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_08821chr3:88224433-88230228Liver
Enhancer Sequence
CTGGGGTTTG GGCAGGCGAG AGATGTGAGG AAGGTCAGGA CAGCATTGCT TTCCCCTCCT 60
GCCTAGGCTG CCAAGTCCAC CTCTCGGGCT GTATCTTCAG GACACTCACC TCAGCGAAGC 120
CTAGCCTTCA AACAGCCTGG CTCAGTGCGT CCACGACCCA GTGCATTGTC TCTGCACTTC 180
TGTCTTTGAC AAGCCCTTCT GAAATCATTC CTCACCACAC AGCAACGCTG ACCACACCAC 240
ACATCAGCCC CTACTCGGTG TGTAGGACCA ACCATTCTGA ATTTTGTCTC TTTCCTAGGT 300
CTTGGCATCA CAGTCCTGAA TAGGGACCAT TCTCTGTCTC ACCTGCTGGG CATGCTTAGC 360
AATCCATCCA CCTGGCATGA TTCAAGGCCT GCATGGAGAG CAGGATGTCA CTGTGTGCCA 420
TGGGGGAGTT CCTGGAGGCG GGAACACTCC TGGCTCCTCT GAGGAAGCAG CCACCTTTGT 480
TGTCTGTTCA TGCTCAGAGG GGGTCACCTT CCTAACATTT GCTGCCTGCT TACCTCACTT 540
CTGTCCCCCG TGCCGGCTGC TCTGACCATC CCTGAACCCA ACCCACCCCC TGATCTATAT 600
TTTCTCCAGT CTACATTAGA AGAAAGTGTC GAGACGAGTG TAGAGGGGGA TTTCACACCA 660
CACGGCATCC TCACCCTCCT CCCCACTCTC TAGGAAAAGG AGTCTAAAAG TCAGGAACAG 720
GCCAAAGGTC TAAGTCCTCC TTGGCCATTA GATAGTCCCC AAAAAAGAGA AGAGCCACCC 780
GAGGGGTTTC CTCTCAGGAA CCTAGAGAGC TACAGGACCT GCTTGCATCT GGCTAACCCT 840
GAGTGTGCAA ACCATAAAAC AACAACAAAA ATACTTCGGG GAAGGGAGCA AATTGAGGAT 900
TCTAACGGTC AACCGTGGCC AGCCCAGTGC CATGCAGCCA CACAGCAGGG AAGGCGAGAT 960
AAGCCAAGAG CTCTACTCCA CGTGCCTTCT GTGCCAAGTG AGCCAAACAT CTCAGTGCAA 1020
TTCTCTCTGT TTAAATTAAA ACTAACTCCT CCCATGGGAG GCAGTGTAAA CACCCTAGAA 1080
ACTGCCAGTT CTCTCAGCTT TATCCCAGAA GCCAAGACTG CCTGCCTTCT CTTTCTTAGT 1140
GTTCCTGTGG AGTGACTGAG CTTATTGGCT GAGCAGGCAT GGTGTCATCG CAAGACAAAC 1200
ACACAGCAGG GCTCAAGCAG GGGCCTCCTG CTGGGCATGC ACTAACTGCA TGCTAGGCAG 1260
GGCAGAAGGG CAGAGCGATG AGGCACTCTG TTCTAAGGCC TGGTTACCTG GGCACCTTCT 1320
TAACCTGTCC CGCTGAATCA CCCACTACTA GCATCTCTGA TGAGCAATCC TGAGGCAGAG 1380
CTCACTACTC CAGTTCCCCT TTCTCCGACC CAGAAGGAAG CCAGGATTTC CCAAGGCCCG 1440
TCTGTCATCC TACAATGTCA TAGTAACAGG AGGAGCCACT AAAGGTCATG ACCCAATCAA 1500
TAAGGCACCA TATTAGAAGG CTGAGAGGGC ACTATACCCT TGGATTAGGG GAAATTTCTC 1560
CCTGAAAGTG GGATCTCAGC TTGCTCCAAT GTCCTATAGC CTCCAGATGC CCTGCTGAAA 1620
TATCAGTTTT TGTTTCATCT GCTGGAAAAC TCTCTTTTTA GAAATATGAA TGCAATCATT 1680
CCTCAGCCTT CTTTTCTCCT GGTTCAGCCA GTCCATCTTC CTTCTGGCCC TTTGTCTGAC 1740
CTTATTTGTG GTACTGGACT CCAATTCTGG ATTTTCTGTT CATGGGGCTA GGGTTGTAGC 1800
TTAGTTGACA GAGTGACTGC CTAGCATGTA CCCAGTCCTA AATTTAATTC CCACCATGGC 1860
ACGACAACAA CAATGATATG GTGACCCAGG CCTATAGTCC TAGCATTTGG GAGGTGGAAG 1920
ATCACAAGTC TCTAGTCATC TTTGACTATG GCAAGTTCAA GACCACCCAG GGTTACAAGA 1980
AATCCTGCTT TAAAAAACAA CAGAGGGGCT GGAGAGATGG CTCAGCAGTT AAGAGCACTG 2040
ACTGCTCTTC CAAAGGTCCT GAGTTCAAAT CCCAGTAACC ACATGGTGGC TCACAACCAT 2100
CTGTAATGAG ATCTGATGCC CTCTTCTGGA ATGTCTGAAG ACAGCTATAG AGTATTTACA 2160
TATAACAAAT AAATAAATCT TCAACAACAA CAACAGAGTT GGGCAGTGAT GGTGCACGCC 2220
TTTAATCCCA GCACTCGGGA GGCAGAGGCA GGCGGAATTC TGAGTTCGAG GCCAGCCTGG 2280
TCTACAGAGT GAGTTCCAGG ACAGTCAAGG CTACACAGAG AAACCCTATC TCAAAAAAAA 2340
CCAAAACAAA CAAACAAAAA ACCCCAACCA AACCAACAAC CAAAGCATTG TTTGTGAATC 2400
ACTAAGTGCC TTCTGTACAT CCCATCAGAT CGCCCAGACC AGGGAGCGTT TTATGCTTGA 2460
AGTTATCAAA TGAAATGGAA AGTAGACTAG CTCAAATATG CACGTGTTAC AACTCTCCTC 2520
ACATAAGCAA AACTCAGAAC TACTCTCTTG CTTTGCTTTG CTGCCTTTGC TGCTGTTTTG 2580
TTGTTTGTTT GGTATGAGTT TCAAGTGGCC CAAACTGGCC TTGAACTTCT GAGCCTCTTA 2640
TCTGCAATTC CTAAATGCTG GGATTATAGA TGTGAGCCAC GATAACACTT GCCGGGTTTA 2700
TTCTGAGCTG TGTGCTATGC GCATTCTACC AACTGAGCTA GATCTTTGGC CCTTGGAGTT 2760
AACAACTGTG GAAGGATTTT GCTAACAGTA AAGTATTTCC CTTACTGCAC AAGGTTCTAC 2820
TGAGCAGGGT TACTCCAAGT CCTCACCAGC CATCTGGTCC ACAGATGGCA TGGACAATAT 2880
AGTTGTCTAT ATAAGAGCAG ACCTAGGTGT GGTAGCACAG GTCTATCACA CTAGCCCAAG 2940
GGGGCTGAGG CAAGAGAAAC AGGAGTTTAA GGTCAGCCTG GTTTACACAG TAAAACCTGT 3000
CTTGGGGGTC AGAGGGGACT CAGGCCATAC TGTAAACCTG CTGATAAGAA ACAACACTCT 3060
AACATCTCTA GATAATATAT GGATTGTAAA ATGTGAGAAG CATTGCTTTA CTTATTCCAG 3120
CTTGTCAGTT TTATAAGAAC TATAACTATT CTCAGATTCC AGCATCATTA GAACCAGGTT 3180
AGGAGTCCTC TGATTCCATC CTTGGTAGTG GACACAATGA TGATTAACTG GTCCATTCCA 3240
ATCAGCCACT CCCACCACAT CGGGTCAACT CCTGACCAGA CACCAGGCTG CCATTCTCAG 3300
ACAAAACAGA TACTTCCCAG CACCCTCTTT TCTTTCTCTC TGCCACTTCA GGTTCTGCAT 3360
TCTGGGAGCT GTCACCCACA TAAACGCGAA TTAACTGTCC CGCTAGCTAT TCATTGCCCT 3420
TCACTAGGTC CTGACTATGT CGCCTCCCAA TCTAAGCCTC CTCCCTCCGG CATGGTGAGG 3480
TTCCACCTAG TCTTCATTGG TCTTCAATAG ATTTCCACGT GATCCTCCAT CACACACACC 3540
ACATGACAAT CCCCTCCACA CACTCCACGT GACACCCTCC 3580