EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-15642 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr3:63700600-63704540 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:63703915-63703932GGCATTAATTAACAAGC+6.05
Alx4MA0853.1chr3:63703915-63703932GGCATTAATTAACAAGC+6.62
FOXA1MA0148.4chr3:63701818-63701834GTTTATTTACATAGCA-6.55
FOXB1MA0845.1chr3:63701820-63701831TTATTTACATA-6.02
Foxd3MA0041.1chr3:63701473-63701485GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:63702523-63702535AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:63702527-63702539AAACAAACAAAC-6.32
Lhx3MA0135.1chr3:63700618-63700631AAATTAATTAACA+6.19
NRF1MA0506.1chr3:63702639-63702650CGCGCAGGCGC-6.14
RFX5MA0510.2chr3:63702623-63702639TGTTGCCATGGTATCC+6.13
ZNF263MA0528.1chr3:63703771-63703792CCCCCTCCCCCCTTCTCCCTT-6.15
ZNF263MA0528.1chr3:63701277-63701298TCTCCTTCCCAGCCTTCCTCC-6.27
ZNF263MA0528.1chr3:63703768-63703789CTTCCCCCTCCCCCCTTCTCC-6.97
ZNF263MA0528.1chr3:63703761-63703782CCTCCCCCTTCCCCCTCCCCC-8.18
Enhancer Sequence
AGGCATCTAA TTAGGGCCAA ATTAATTAAC AATTCTCTTA AGAACACCAA AGGCTTCAGT 60
TTAGGTGCAG CTAGTGGTAG CATGCTTGTA TATCATAAGT GAGAAGTTGA GTCTGGTTTC 120
CAGCACTAGG GGACAAAAGA AAAAAAAGGA AAAAACAAAC AAAAAAACCC ACCAAAGATA 180
GTATTGCCAC CCTGAAAACC AGAGGCTGCA TTAGATTTAT TCCAGAACCC AGAACTCTTA 240
AGTCACTGAA GCCAAGAAAC TGAATTTATT CATCTTGCCT TACATATAAA CTCTCCATAA 300
ATATTTGTTG ACTGAATGAA TAAATTAAAT ACAAAACACT AAGAATTTTC ACAAAAGCTA 360
GGGCATATAG CCTGATAGAA GGTGCTTTCC TAGCATGCAA AAGTGGGGCC TTGGGTTCAA 420
TCCCTAGCAA CGCGCACACA CACATACACA CACACACACA CACAGTGCTT TATATTAAGG 480
AATCCTAACA CAAATCACCT TTATCACCTC TGTTTTTATA ACTCTATCTC TTATAATTAT 540
ACAAGAGACT AATTTTTTCA AAACAAATTT ACTTGAAGTC AATGAAGTGG AAACTATGTG 600
AAACAGAAGC AAGGATAATT CGTTTTATTA CAAGCCACTA TAAATCTCAC TCTGCCTCCC 660
AACCTCCCCT CCCTTTGTCT CCTTCCCAGC CTTCCTCCAG GCACTCCCAA TCTCATTATT 720
CCATGATCTG CTAAAACCAC AGTTTACCTC CTGGAACCAG TAGAACACAC ATCACTGAGA 780
ATTAGGGAAT TGGAGACAGT TACAAGCCAC CAAACAGGGT CATAAAGGAC TTGAACCTGA 840
AAATAAAGTT TTTCTAATTT TCAAGAGAAA AAAGTTTGTT TGTTTTGTTG TTTTTTAACA 900
TTATAGCTAC ACAAGTTGCA CAAGGTTGAC ACTGATGGGA AAAAGGATGG GTGAGAAAAC 960
TTAACTTGGA TGTTATTTAC AGACTATGTG AAAAATAGTA TGTTGGTGTC TTTGACTACA 1020
GCTTGCTGTT GGCACTAGAG GAAATCATCT TTAACTTCCT GGTACAAATA AACACTCGTC 1080
TTACTGGAAT GCATAGTGTT CAAAACCAGG ATGCAGAATC CTTAAGCTAC TTCACTCAAG 1140
TTATTTTAAG CCCTACTTGG TCCCAAGAAA AGCAACTCCA TTTTAAACTT TTATTAACAG 1200
TGATCTGAAT TCTAATCAGT TTATTTACAT AGCAAGTAGC TCTCGATCGC GCTGCGAAAT 1260
AGGGATGCAG TCTAAGAAAA CATAGTAACA ACAAGTTATA GCACCCACTA GAAACCGCTG 1320
GAGATTTGTA CTCTTACCAA ATGCTCCCCT GGGTGCAAAC AAATGAAACT TAAAAGACGG 1380
GAAGAGGTTT TTCAAGACAC AATTTTAAGT CGTCAACAGA CGGCTTAAGA AAGACTAGTC 1440
TGCAATAATG CGTCTTAAAA CATTCATTTT CTGAACAAGA TCATAATGCC AGCAGTAAGC 1500
AACCCACATC TTAAAAAGCA ACGTCTCTGT TGACAGAGAG AACCTTTGCT TCCCTTCACC 1560
GGCATTTAAC ACACTAGTTC ATTTGGAGAG CATCAGGTTC TGTACGTTAT AAACAGGTTG 1620
TATGCAGAGT ACACAGGAGC TACGATGTCG TCTGCACACT GTGGAAACCC AAGCTTAATA 1680
CAATTGTTTA AAAAAGCCGC ACCAGGAAAT AAAGTCTTAT TCATATCTTC CTTTTCACAG 1740
GATAAAAGGA GGTAACTTGA ATGCTCCAAT GAGCAGTTTC TCAGCATTAT TTTTCTACCA 1800
TGATCAAAAT GATGACAGAA GAGAGAAAAA AGTTATATAT TTTTTATTTC ATACCTCTGG 1860
CTATCACTTC AATGCTAAAC TCTTAAAAAA CAAAAATGAG ATCGTAAGTT GATTCCAAGC 1920
TACAAACAAA CAAACAAACA AAAAGTCTAG AGAAAGACTT GGGCTCCACA GTGAAGCAAA 1980
GCAAAACAGC TCTGCTCTTC AAGTGGCGTC TCCGACCCGG TACTGTTGCC ATGGTATCCC 2040
GCGCAGGCGC AGAGAACACC TTCACAGCCC GGGCGTCGCT TCGGTAACCC ATGATTTGTC 2100
GCTAGGAAAG GGCAGTTGGA GTAAATCCTT CTCGCACCTA ATGCCCGGAG CTTTTTGAAC 2160
AGTAAGACTC GCACCGGCAA CTAAGGGCGC GCTTCTGGGA CCGCAGAACT GCTTTCCAGG 2220
CGGCCAGAGC CAGGGGAGGT CTTGTGGGAT CATTCCGCCG CGATGCGGGA CCCTCCCGGT 2280
GGCTGGACCT CTGCCACCAA CCAGGGCAGG GAAGGTCTTG CTCAGGCACA AAAGCCCACG 2340
CGCTCCATTA GGAGCTCACG AGCTACTGTG GTCCAGTTCC TGGGCCGAGG CACCCTGGCA 2400
CACACCACAA CCCGGTGCTC GCGGCTGAGA TTGCCCAGAA AGAATTCGAG CACCTGCTCG 2460
CGCAACGCTG GAGAGGCAGT CCGGTGCTCC TCTTCCTGCT CCCGGCCCTC TCCCTGTCCC 2520
CCACCCCCAC CCCCTCCAAA GCACTGACCT GCTCAGCTCT GAGTATCCCG CTGATGAAGG 2580
ATCCTCGGAG TTTTTGTAAC CGGCTCAACC TCCCAAATGC TGGAGTGATC TGCTAGTGTC 2640
CCGGTGTGAC TCCAACCCCA ATTCCTCCAA AACAGCCCCC CAGCCCAAGA TGGGCACCAC 2700
TACACACCAG CCAACAGAAC CAACAGAGGA GCTCCAAGTA AAGACCAGCG CTGCCGCCAC 2760
AACCTGCTTT CTCATTCAAA TCCTCATGCT CACATTGGAG CACCCTCCCT CTTAACCCTC 2820
AGCTCAGGGC AAATCCGGAA CTGGAGCGCG CGCGAGTGGA CTGGAGCGCC ATCGAGGAAC 2880
AGGAGCCAAG AACTGGACGT GGACCCCTTA TGAAGATGCT ACTGCTAGGC ATAGGCCAGA 2940
ACCCCTGGGA ATAAAGATCT TCTTCTGTCC TCCCTCGCAG CAAATTTCAA AGAATTCCAA 3000
GACCAGGGAC ACCTCTGATA GATTTTCAGT TTAGGTGGCT AGCGGGTTAA AGACGCTGCT 3060
GGAACAAAGT TGGAGAGTTC AGGGGAAGCG AACTGTGCAA TGTTCTTACA AGAGTTTGAA 3120
CCGCTTCAAA AATAAAACAC CAAACGACTA ATCCTTTCTT TCCTCCCCCT TCCCCCTCCC 3180
CCCTTCTCCC TTTCCAATAA ATATAGCATC TGTTATTTTC AACTATCCAT TTTGAGTAAA 3240
ATCAAATTGA GGAACAGGGA GTGCAGGTTA TAGGATGCTT TGTTATCCCT CAGTCTCTTC 3300
CAAATATCAC TCGTTGGCAT TAATTAACAA GCCAGTTAAT TGTCAGTTCA CCCGCTAGCG 3360
GGCTGGAAAA GCTAATGTGC TGTTAAAGAG CACACAGGCG GCAGCGGAAC GTTTGCACCC 3420
AGCAAGTGTT CAAAAGCTGA GTAAAGATGA GATCTGAGCG CACTAACAGT AGAAAGGGAA 3480
TAGCGTGCTG CGGAGTGATC CGGCTTCAAG ATTCCAGGAC TTGGCTTTTA TCAGTCTTGA 3540
TTCAACCTGT CCTATTGTTA GTTCAAAGCC TAACTGGGAG GAACTGAGGA CAAGACCCTC 3600
CGTGTACCAT TCAAAGTAAA ACTTCCCTCC AGTAAGAAAG TCAGGAGCTC TGGCATGGCA 3660
ACATGGAATT AGCAGGGGTT GTCTGGGCCT GGTGACAACA TAAACAAAAG TCTTTTTTTC 3720
TTCCATGAGT GAATTTGTTC AGGAAGTAAT AAAGGAGAGT CTGAGGCTGG AGAGATCACT 3780
AGTCCTCTTT GACTGACAGT GGGGGAGTGG GAGGAGGGAT GCTCAGTGAC CTCTCAGCAC 3840
AAGATATAGT ATTTCACCTT TTCATCCGTC TTAGCCTAGC CGATACCATA GAAACAACCC 3900
ATTTGTATTA TTCAGTTCAA CAGAGGCAAT TACAATGTGA 3940