EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-12329 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr19:3852410-3854240 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
Mrpl21ENSMUSG00000024829
Cpt1aENSMUSG00000024900
GalENSMUSG00000024907
Ppp6r3ENSMUSG00000024908
Lrp5ENSMUSG00000024913
1810055G02RikENSMUSG00000035372
Suv420h1ENSMUSG00000045098
AC133523.1ENSMUSG00000093259
ChkaENSMUSG00000024843
Tcirg1ENSMUSG00000001750
Ndufs8ENSMUSG00000059734
Aldh3b1ENSMUSG00000024885
Unc93b1ENSMUSG00000036908
1700055N04RikENSMUSG00000037263
Aldh3b2ENSMUSG00000075296
Acy3ENSMUSG00000024866
Nudt8ENSMUSG00000024869
Gm16312ENSMUSG00000086107
Doc2gENSMUSG00000024871
Ndufv1ENSMUSG00000037916
Gstp1ENSMUSG00000060803
Gstp2ENSMUSG00000038155
BC021614ENSMUSG00000058216
Cdk2ap2ENSMUSG00000024856
Pitpnm1ENSMUSG00000024851
AipENSMUSG00000024847
Tmem134ENSMUSG00000024845
Cabp4ENSMUSG00000024842
Coro1bENSMUSG00000024835
PtprcapENSMUSG00000045826
Rps6kb2ENSMUSG00000024830
Carns1ENSMUSG00000075289
Tbc1d10cENSMUSG00000040247
Ppp1caENSMUSG00000040385
Rad9ENSMUSG00000024824
Clcf1ENSMUSG00000040663
Pold4ENSMUSG00000024854
Ssh3ENSMUSG00000034616
Adrbk1ENSMUSG00000024858
Kdm2aENSMUSG00000054611
A930001C03RikENSMUSG00000087132
RhodENSMUSG00000041845
2010003K11RikENSMUSG00000042041
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr19:3853051-3853063AAACAAACAAAC-6.32
KLF5MA0599.1chr19:3852473-3852483GGGGCGGGGC-6.02
Nr5a2MA0505.1chr19:3853666-3853681CCTGGCCTTGAACCA-6.05
Nr5a2MA0505.1chr19:3852976-3852991GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
Nr5a2MA0505.1chr19:3853522-3853537GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
Enhancer Sequence
CAGGTCAGTG GCTGCGGCAC CGCGCGGTGG TGGTGGGGGC GGTGGGGGGT GAGGCTGGAG 60
GGCGGGGCGG GGCGGCGGCT TGGGTAGAGG TGATCGCCGC GCCGGTGTCC GGAGCACAAA 120
CCCCGCAGCG CGGAAGGCCG CCTGCGGGCG AGCTTTGAGA AAATGTGTGC TGGGTTGCCG 180
TCCCTTGCGG AAGAACAATA CTATGTAGTT ATACAAGCAC ATTCTGTACC AAAGCTCAAA 240
ATAGATGTGT CTAGGAAGCC GTTTCTCTGC GAGGGCCTTG AATGAAAAAA GGGATGTTGT 300
TCCCAGCACT CGGGAAGCAG AAGCAGGCGG ATTTCTGAGT TCGAGGCCAG CCTGGTCTAC 360
AAAGTGAGTT CCAAAACAGC CAGCTCTACA GAGAGAAACC CTGTCTCGAA AAACGAAAAA 420
AAAAAAAAAA AAAAAAGGAA AGAAAAGAAA AGAAAGAAAA GAAAAAGGGA TGTTGTGGCT 480
GGGCTTTAGA AAAAGAGGGA GGAGCCGGGC GTGGTGGCGC AAGCCTTTAA TCCCAGCACT 540
CCGCAGGCAG AGGCAGGCGG ATTTCTGAGT TCAAGGCCAG CCTGGTCTAC AGAGTGAGTT 600
CCAGGACAGC CAGGGCTACA CAGAGAAACC CTGTCTCGAA AAAACAAACA AACAAAAAAA 660
AAAAAAAAAA AAAAAAGAAA AGAAAAAGAA AAAGAGGGAG GAAAAATCCC CGGGGAACTT 720
TTCCTTGTAG TACTTCTAGT CTGTAGTTTG ATCACAACCC CCTCCCGCTC CAGAAATTCA 780
CCTTTGGCAC TCAGTGAGCA GAAGCAGGCG GATCTCTTTA TTATTGAGGC CAGTTTGGCC 840
TACATAGTAA GTTTCAGACC AGCCAGAGCT ACATAGCAAG ACACTGTCTC CAAAAGAGGT 900
AGAAGGAAAT TGATGTGTGT TATTGGAAGG TAGCAATCAC TCCTGTCTTT CTGAGGCTCG 960
TGTCGTGTAC CCGTGTTACT GGCCAGCGTC TGGAGGTGTG GCTCCACAAA TCATTGTGAA 1020
GTAAAATGAA TTCCTCCTCC TCAATCTCAA GCCGGGCATG GTGGCGCACA CCTTTAATCC 1080
AGCACTTGGG AGGCAGAGGC AGGCGAATTT CTGAGTTCAA GGCCAGCCTG GTCTACAAAG 1140
TGAGCTCCAG GACAGCCAGG GCTATACAGA GAAACCCTGT CTCGAAAAAC CAAAAAAAAA 1200
AAAAAAAAAG AATCTCCTGT GGGCAGAGTG ATCATGAACA TCCTTAGGTA TTGGAGCCTG 1260
GCCTTGAACC AATGAGGATC CTATAAGCAA GCATATTCAC ACACACACAC ACCATGCAGG 1320
TCGGGTTGTC TTGGAACTCA CTATGTAGAC AAGCTAGCTG GTCTCAGACT CACAGAAATC 1380
CACTGCCTCC CCTAGTGCTG GGATTAAAAG CATCTGCTGC CATGCCTGGC GTTCCCCACT 1440
TCTTTTACGT TTAAATATAT TTCACCTTAG ATTAGAAAAT AGTTTTTTAT GTATTTAGAC 1500
TTACTAGAGA AATGTAACTG TACCCTTGCC ATTTTTGCAC AAGTGCTTAG CATTCAGTAT 1560
TGAATACGGG TTGGGTTTTT TTGACCTTTA AAAACCCATT TGGTCATTTT CTACCAGTTT 1620
CTGTTTGATT GGTTGACCCA GTTGAGTGCC AAGTGTCTAG AAACTGGCTG GCTGGCTGCC 1680
ACAAATAATC CTCAAATCCA GTTGTAGTCA TTTGACTCCT TTTCTGTGCC CAGTCTCTCA 1740
CCAGAGTCAT GAATGCAGCA AAGTTAACTC TTAGATGGAC TGCACTTCCT CTTTGCCTTT 1800
CAATGTTCAG GTGCCTCATG GATCTGAGAC 1830