EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-05470 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr12:56586400-56590390 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:56588482-56588500CGAGGGAACGAAGGAAGG+6.56
FOXB1MA0845.1chr12:56587142-56587153ATATTTACATT-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:56586584-56586596AAACAAACAAAC-6.32
IRF8MA0652.1chr12:56588077-56588091AGTTTCAGTTTCTG-6.14
IRF9MA0653.1chr12:56588077-56588092AGTTTCAGTTTCTGT-6.5
MAFGMA0659.1chr12:56590063-56590084ATCAAGCTAACTCAGCAAATT-6.51
MAFKMA0496.2chr12:56590064-56590083TCAAGCTAACTCAGCAAAT-6.02
MITFMA0620.2chr12:56588510-56588528CTAGCTCACGTGACTTCA+6
MITFMA0620.2chr12:56588510-56588528CTAGCTCACGTGACTTCA-6
Spz1MA0111.1chr12:56587246-56587257AGGGTTACAGC+6.14
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01835chr12:56589369-56590287Macrophage
mSE_02844chr12:56585499-56599816HFSCs
mSE_03007chr12:56563709-56597070TACs
mSE_06941chr12:56587641-56593004Heart
mSE_07154chr12:56587127-56590740Intestine
mSE_08439chr12:56587278-56594932Liver
mSE_09160chr12:56587696-56590824Lung
mSE_12337chr12:56589526-56590841Spleen
Enhancer Sequence
TGCGTTTGTA TGTACATGAT GGGGGTTCGG GGCACGTGCA TGGATGGTGG CTGTTCAGAA 60
GTTAGAGGGC ACACTTGTGG AGTTGGTTCT TTGCTTCCAT CTTTGTGTGG GTTCAGAGGA 120
CCACTTCTGC AGCAAGTGCT TTGCCCAATG AGCCATTTCA CTAATTACAT GCCCTGCTTC 180
TTTAAAACAA ACAAACAAAA TTTTTTTTAA TGACCTTTAA AACAATTTAA AAAAGTTACT 240
GGGCGTGGCA GCCCATGCTT GAAATCTTAA CATTCTTGCC AAGCGGTGGT GGTTCATGCC 300
TTCAATCCCA GAAGTTAGGG TGATCTTGTA ACCACCTCCC AGTGCTAGTA TTAAAGGCAT 360
GGGGCTTATA GCTCCTGTGC TGGGTCCAGT ACAAGCAGCT GTAGACATGC TTGTCCTGGC 420
TTGTGGTGTT AGGAGTGCTT TGAGAAGTGC TGCTGTCTCA GTTAGGGTCA CTGTTGCTGT 480
GACGAAACAT CCTGACCCAA AAGCAAGTTG GGAAGAAAAT GGTTCATTTG GTTTACATTT 540
CCACATCATA GGCCATCACT GAAGGAAGTC AGGACAGGAA CTCAAACAGG ACAGGAACCT 600
GGAGGCAGGA GCTGATGCAG AAGCCATGGA GGGGTGCTGC TTTCTGCCTT CCTCCTTATG 660
TCTTGCTCAG CCTGCTTTCG TACAGCACAG CAATTCTCAA CCTGTGGGTC ACAATCCCTT 720
TGGCAAACCT CTATCTCCAA AAATATTTAC ATTCTGATCC ATAACAGTAG CAAAAACTGC 780
AGTTATAAAG TAGCAATGAA AATAACTTGT TGGTTATGGG ATCAGCAGCA TAAAGAACTG 840
TATTAAAGGG TTACAGCACT AGGAAGGCTG AGAACCACTG AAACAGAACC CAGGAACTTC 900
CAGCCCAGGG ATTCACCACC CACAACAGGC TGGGTCCTCC CCCATCAACC ACTAATTAAG 960
AAAATGCCCT ACGAGCTTGC CTGGTCTTCT GGAGGTGTTT TCTCAGGTGA GGTTCTTTCC 1020
TCTCGGATGA CTTTAGCTTG GGTCAAGTTG AATAAAAGTA GCCAGCACAA CGACTAAGGC 1080
CTAGTTCTTT TAAGATGCAA TCCATTGCAT TGTCTGGAAA TGCAGGACCT CACACCAGCT 1140
TCAAAGCAGA TGACCAAGAA CCTGAATTTC ACCACTCTGT CCTGGCAATT CACATGCACA 1200
CTGTCTGAGA AGCCCAGAGA CTAAAGCCAG CACTTCCTTT GCCTTGAGAC AGGTTGCAAA 1260
CTTCCTTCAG GAAGTTCACC TCTGGAATCT GCTGTCGCCC ACAGACGTAA AAATGAAGGA 1320
TAAAGCCTGC TGTGGATGGT TGACTTCATT CCAGGCTGGC AGTTACTTTT TCTTTGAGGC 1380
CAGCTTGCCA GTATCAGATA GCTAACTAAC TGGGGCACAA GCTCCTGCCC CCCTCCCCAC 1440
ACACTCCGCC CTGGGTGGCT CTGCTGTCAG CTTCTGGCTC TGTCTGCCCT GTGCTTCACC 1500
ACAGTAGCCC CGATCTTGGT GGGCTACCTC TATTCCTAAG CAAGGGGCTC TGAGATAGGC 1560
CCTGACCGGC TTATCTGTGT GCCTCTATGC ATCCTGGAGA ATAATTCTTC ACAATGCAAA 1620
TGAATGAATG AGACCGAGAG TCCCACTTCT CAGGAGGGAA ACACACACAG AATAGCAAGT 1680
TTCAGTTTCT GTAATGTTCC CTTACGTAAG TAAAATGTGG AAACAACCTG GATGGTTTTG 1740
TCCAGGGATG AGAGGTCGGG GAATGCATTT TGGGTGGGTC AGAACAAAGT TCTAGAAATC 1800
TGACCTTTCT TGTCTAGCAA AACTCTACAC TAGGAAGGTT AGTGAAGACG TGGGGCTTGG 1860
GACAGGAATA CTGTACCTTC CTGTTCGGGT CTGGTTCTCA CTTAATCACT TCCAGGAGAG 1920
GAGGAGTTTG AATTCACGCC TCTCCTCCTG TCCTCCAGCC ATGCCAGGAC GTAGATTGCT 1980
CACACTGGAG TTTGTTTCCT CCTCTATAGA AAAACTCTTC CTGATGGAAA AAACCAGTCC 2040
ACCTGCCCTG TCAAGGCAAC GTGTCCTGCA GCCACGGGAG GCCGAGGGAA CGAAGGAAGG 2100
AGCCGAGGAC CTAGCTCACG TGACTTCAGT TCCCTCAGGC TGTTCTCTCC CTCTCCCCCT 2160
AGGCTCCTTG ACTTCTCTCT CCCAGTCCTG ACAGACCTTC GACTTCCAGG AGAAAATCAG 2220
GCATATGAAG GACGGCTTTG TCTCGTCTGA AATGGTCTTG TTCTTTACTT AGAAAAATTG 2280
AAGACTTTCT AGAAATTACA TCTGTTCTAA AATTTTCTCC AGCCAAAACC AAGCAGTATG 2340
AGGGAAACAG CAAACAAGGA GCCAGGGTGA ACTTTAGTCT TCGCTCCCTC AGGGTTTGGG 2400
CAGGTCATGA AACCTAGGCT AGTGTATGAT GTCTTCAAGA CCGCCAACAT GGGCTCCTGT 2460
GACCCAGAAG AGGACCCTCC TTCTGCAACC ATGGAGGGTG ACACTCCTAG TCAAGAGCCG 2520
CTCTGTGAGG CCACATCCTC TTGTTCTCCA ACCTTCCACA AGAACCACAA AGTGTGCCTG 2580
TCTAGGTGCA TCCTGGCTTT ATGTGACATG CTCTTGCTCA AGTAGTCCTA GTTGGCCTCA 2640
CTCATGGCAA CCCTCCTGCC TCAGCCTCTC AAGTGCTGGG ATTATAGGTA TGTGCTGGCA 2700
AACCTGACTT TAAAAGCTAT GCAGGAAGCA TTAAGACCAT CTTTCTAACA TCAAAGCCAA 2760
ATTTCTCCCC TTTGCTCTTT AGGCTATGAG GGGGTCTCTC TCTGACCCTC ACATTTCCCA 2820
CGCAGGAGAA TGAGCCTAAG TCAGCATCGA TGTGAGCAGC ACCGAACACC TGTGTTCAGA 2880
TACTCTGGGG CATAGAGCCT GGGTACCTGA TAGAGAACAC AGAGAGACAA CCACAGTGGA 2940
CTGGGGTTGC AGGAATGGGA CATGGCTGGC TTTACCCAGT TTGCAGTAGT GCTTTTTATA 3000
TAGGAAAGAC ACACTGGGTG TTGGCTCCCT TTTGGTATAA GATGAAGATG AACATCATAT 3060
TTACTTGACA TCCAATGTGG ATCCAGAACA GAATAATGAA GCATAGAAAA GATACTTTCT 3120
TAGCCATAAG CTAAAGCACA TCAAATGTAT TATTGTACAT TCATTGAATG TCATCATCTC 3180
ATTCCTTCCT ACCAAAGCAA GACTCTGTCC CCGGGACAAA GCCACTACCT ACCAAGCATC 3240
AATACGCAAT CTTCACAACT TTCTGACTTA TTGTGAAATC TGCTTTGGCA GTAGAATTAG 3300
AACCCTGAGC TGAAGATTCT TCAAGCTTGC TCCCCGAGAC CACAGTGATG AGATACATGG 3360
CCTTCTGGTT AACAGTCTGA CAAAGAAGGT TCCCGATAAG TGAACCCGCT TCCTCTCGGG 3420
GTGTCCCCGC ACAAGCTGTT CTCTGGATTT CTTGCTTCCC CTGTGAAACA CAGGATGTTG 3480
TACAATAGCT GTATTTTTTT TTTCAGCATT AGATGCCTGG CACTGTCATG TGTTTTAGCC 3540
TTATGCAATG TCTACAGCAG CCTAGTCAAT GAATAAGTCT CAGCGGTGAC TATCTCCTAG 3600
GAGGTATGTC AGGACAGTAC CATTTCCAAG CCCATGTCCT CTCTTGAGGA TTTTCCCAGC 3660
TACATCAAGC TAACTCAGCA AATTCCTCTT GTTCCAACTA AGTTCTACAG AGACTGGGTT 3720
CCGGAACAGC TTAAATCAAG GAGAAAATGG TACCAGAGCC TTCAGTGACA GGCCAGGTGG 3780
CTTGCTGGTG GTACCCCAGC TAAAGGCTGG CATTTCCTGT CACCTTGCAA CAGGCTCCCT 3840
CCCACACAGG GGCTGGAGGC TGCTGTGAAG CTCGGCTCTC ACGTGAGAAG CTACTCTGTG 3900
AACTTCCTTA GCTGGCTGAA AACATTCACG CCACCCCCTC CAGCCCCCGA TCTTCAGGAA 3960
CAAGCCACTC AGAATAGCAA ACGAGCGGGA 3990