EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-01565 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr1:193266400-193271200 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:193267821-193267839GGAAGAAAGAAAGGGAAG+6.09
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:193267817-193267835GGAAGGAAGAAAGAAAGG+7.78
HNF1AMA0046.2chr1:193268536-193268551GATTAATGATTAAAT+6.53
NFIL3MA0025.1chr1:193270218-193270229TTATGTAACCT+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:193270268-193270283TGAACTCCTGACCTT-6.04
Nr5a2MA0505.1chr1:193270260-193270275GCTGACCTTGAACTC-8.73
RARAMA0729.1chr1:193270265-193270283CCTTGAACTCCTGACCTT-6.5
RREB1MA0073.1chr1:193267950-193267970CCCCCCCACACACACACACA+6.17
RREB1MA0073.1chr1:193269745-193269765TGTGTGTGTGTGTTGGGGGT-6.17
RREB1MA0073.1chr1:193267948-193267968CCCCCCCCCACACACACACA+6.38
RREB1MA0073.1chr1:193267942-193267962CCACCACCCCCCCCCACACA+6.3
RREB1MA0073.1chr1:193269743-193269763TGTGTGTGTGTGTGTTGGGG-7.29
RUNX1MA0002.2chr1:193269157-193269168CTCTGTGGTTT+6.14
RarbMA0857.1chr1:193270268-193270284TGAACTCCTGACCTTC-6
Tcf12MA0521.1chr1:193267322-193267333AACAGCTGCTG+6.32
ZNF263MA0528.1chr1:193267818-193267839GAAGGAAGAAAGAAAGGGAAG+6.13
ZNF740MA0753.2chr1:193267946-193267959CACCCCCCCCCAC+6.09
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_08818chr1:193266977-193269424Liver
mSE_08818chr1:193269476-193271037Liver
mSE_09193chr1:193268073-193269209Lung
Enhancer Sequence
CCAGAATGGA ATGGTGCATC TGTGTTAGTC ATGTGACTCA TGATCTCAGA GGCTTCTGTC 60
CTCCATGGCA GGGATGGGCA AGACGTACAG CTTGGTCTGT GACGGTGGGA GTGTGTGGTT 120
CAAGTTCCCC GACATTGCAT TGGACCAGGG AGGAGAACAG GGCAGAGCCA AGGACCAAGG 180
TGTAATTTCC AAAGGCCATC TCCTGGATGA CAGCTTCTTC CAGCAAGTCC CCCAAGAACT 240
GCCAGATGGG GACTAAATCA TCAAAGCATG ATGGGAGAAA GAGCAGGTAT TTTAGATTCA 300
AACCATATTA CTATTATTCC TGACTGTCCT GACTGTCCCT AGTAACATAA AAACCTGCTG 360
TGCTCTGAGA TGACTCCCTG CTTTGTCAAC TTGACTACAT CTGGAATTAA CTAAAACCCA 420
AATAACTGGA CACACCTTTC AGGAAGTTTT TGTTTTGTTT TTGGTTTTGT TTTTGGTTTT 480
TGAGACAGGG TTTCTCCGTA CAGCCCTGGC TGTCCTGGAA CATGATCTGT AGACCAAGGA 540
GACCTCACTT AGAACTCAGA GATTCACCTG CCTCTGTTTC CCCAAGTGCT GAGGCTAAAG 600
ATGTGTGCTA CCAACACAGC TAAGGGATTT TTTTTTCTTT ATTAAATCAT CCAAAGTAGG 660
GAAACACATT TCTAATCTGG ATCTTTGAGG TGAGGAGATA AACCTTTCGT CCATGTCTTT 720
TGAGGTGCAA CGGTCCATCT TTACCTGGAA CCACACCTTC TGCTGGCAGC CTATATACAG 780
GACATAGATG AAGGAAGCTC TCGTCCTCTG TTTGCTTCTT CTCATCCTCC CTAGCAAATC 840
AATTCCTTCA CTGGCATTAA CCACTTCTTT AGGATTCAGA CGTATACCAA AGACCAGCTG 900
AGACATCCAG CCTTGTGGAC TGAACAGCTG CTGGATTCTT GGACTTTCCA TGCATAGGCA 960
GCCATTGTTG GATTAGCTGG ACCACACCCT ATAAGTAACT CTAATAAATT CTGTGTGTGT 1020
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TCATTCTATA AGTTCTGTTA CTCTAGAGAA CCCTGACTAA 1080
TAATATGGAA GGCTCATGTC CCTAAAGCCC TCCACTTTAT CCCCTCCATA TGCTATTCTT 1140
AAACCACGTT GAATGTCTTG GTCTGTTGAG AAGGAAAAGG CTTGGGTTCA GTTTCACTTC 1200
TAGTCAGTCA CTCAGTTATG TCTTTCAGGA AGCTTCCCAC GTCCCTCCCA AGCAAGACTG 1260
GAAAATCCTC AATGTACTAA TGTTCTCTCT TTCTCTCTCT CTCTCTCTTC TTTATTTCTA 1320
GATTTTGCTG AGTTCAAGGA GGGCTGAGGA TACGTGTTAT TAATTTCTTT ATCCTTAACA 1380
CTGAATTAGT TTAAGAACTA ACAAGCATAT TAAAACAGGA AGGAAGAAAG AAAGGGAAGA 1440
AAGCCGAATG AAGGAGGGAA AAATTCAAGC ATGATGGTGC ATGTCTATAA TCCCAGTACC 1500
CAGGAGTCTG AGGCAGAACG ATTAGGAGTT CAAAGTTAGC CACCACCACC CCCCCCCACA 1560
CACACACACA TAATGGGGAA TGAAAATCCT GGGGACATGA CAGCATACTG AGTCTAGTTT 1620
TGTAGGCCTT CCAGTGGCTC TGAACAGTGT CTCTCAAATC CATTCTCCTC TGTGTTTGAT 1680
CTTTCAGCTT CCACTCCCTG GTATTAATAT AAAAATAGGA TGCATTTATA TGTGCTAAGT 1740
CACCATGATG ACTTTTGGAG TCCTAGGCTG TCAGCAAGCT TGTAAATGTC TCTACTGACA 1800
GCAAGGCATA AAACCATCAC CAAATACAAA CACTGGTCTT TTTCCTGGTC ACAGATACAC 1860
GCTCTATTCC ATGGACAAGG TCACTCACTT CTTGTGAACA TAAGCTGTCC ACGACAGCCA 1920
AACACGTGCC CACACACACC TTCAAAGAAG AGAACAAAAA AGTTCTTAGC AATTAATTCC 1980
CTGATGAGAT CACTTATGGC CATCTCCACA AATGGAGAGG GACAAGGCCC AGAAAAATAC 2040
AGAGAAGAAC AAGAAAGCCA GATAGCCAAG CAATTAACTG TGGTGTGTAC ATGCATACAG 2100
ACTCCACAGT GAAACTCCCT AGCAATGTTT TGCTCAGATT AATGATTAAA TGGCTGTGTG 2160
TATTTTGACT AGAAGCCAAC AGCTGGGCAA GGTAAGAGGG AGACATGGTG CCACGGTCAG 2220
CCAGGAATGA GAATCAGTCA GGCTTCTGTG CAGATAACCC AAGGCCTTGC ACATGGATTC 2280
CCCCCAGGAC TTCAACTTTG TTCTTTAGAG AAAGGTGTTT TTTTTTGTTT TGTTTTTTTA 2340
AGTCCAGACT GACTTCAAAC CCATGATCCT CCTGCATCAG CTTAACAGTG CGGGGATAGC 2400
ACAACATCCA GCTAGCTTCT CAAAATATTT AGCTCACCCT CTGACCCAGA CCTGACGTTT 2460
GAACCAATGT TGGTTGTGTC TGGAGGGCAG AGTCTGGGGC TCTGAGGTCT GCTGCTGAGA 2520
GTCCTCTCCC CTCCGAGGAG CATGCCTATT CTTGACAGCC CACCCTTTCA ACAGCACGTT 2580
TATTCCTCTT GATTCATTTT GTGCTCAGAA ATGTCATTGC TGTGTGCGGA ATCACGTGGG 2640
AGTCACCTGT TAGGGAGACT AGAGGCAAAG ACAATCCAGT GCAGACTCCT ATTTAGACAA 2700
TGCCAGATGT CCATCTTGTC TCAGAGACGT CTGGGGGAGC CCAGGAAGGA AGACAGACTC 2760
TGTGGTTTAT GTAAACTGTC AGCTTGGCAA GACCTAGAGT CACCTACTTA TTTATTTATT 2820
TATTTATTTA TCTATCTATT TATTTATTTA TTTAGAGACA GGGTTTCTCT GTGTAGCCCC 2880
GACTGCCCTG AAATTGGCTA TGTACACCAA TTTGTCAGAC TCAGAGACAT CTGCCTGCCT 2940
CTGCCTTTGG CGCCCTGGGA TTAAAGCCAT GTGCCACCAT GCCCAGCAAT CTTAGTTACA 3000
TCTGCTGTTG CTGTGATGAA ACCTCAGGAC CAAAGACAAC TTACGCAAGA GAGAGTTGAT 3060
TTTGGCTTTC GGTTCCAGAG GGCAAGAGTC CGTCACGTCA CGGTGGAAAG CCATGGCAGC 3120
AAGCAGTAGG CATGTGGAGC AGGAACGGAG AGCTTACATC ATCATTCAAA AACAGGAGTC 3180
GGAGAGCCGA GTGGACATAA GTAAGGTTTT AAACCCTCAA AGCCCACCCC TAATGGCTTA 3240
CTTCCCCGAA GTGAGACCAT ACTTCCTGAA CGTCTTCAAA CAGCTCTACC AACTGGGGAC 3300
CAAGTATTCA AATACTAGAG CCTATGGCGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTG 3360
GGGGTGGGGA AGTTGGGGGG CAGATAGGGG TGACACATCT TATTTAAACC ACCAGAGTCA 3420
TCTTTGAGCC AAGTCCTCCG GGCACAGCTG TGCAGAGAGT TCTAGATTAG CTTATCTGAG 3480
GTGGGTGATG CACCTGGCGG CCGGATAAAC AAGCACCCAT CGGTCTCCTG ACTGCAGATG 3540
CAACGTGACC AGCTGCCTTC CTCACGGTGG TGGACTGCCG GTTCAAGGCA TGAACCAAAA 3600
CAAACACTTC TCTCCTCAAG CGGCTCTTGT TGGTGTTTGG TCACAACAAG GGGAAAGGTG 3660
ACTAACACAG TCTCCTTCAG TGAAATGCAC TCCACAGCAG GAAACCACAC TCCTCAGATC 3720
AAAGGAGGGG GTCCCTCTCT GAGACTTCTT CCCTTTCTGC CTATCCTTTT CCATCCACAT 3780
TTAAATTTAA AAAAAAAAAT TTTTTTTGAT GCAGGGTCTT ATGTAACCTG GGCTAAGGAC 3840
AACCTTTCTA TATAGCACAG GCTGACCTTG AACTCCTGAC CTTCCTGTCT GTAGCTCCCA 3900
GTTCCTGAGA TTACAAGTGT GTGCTGCCAC AGCTGCCCGC CCCCCCTCTA TCCTCTTTTA 3960
CTGACCACCT TCGTGTTAGG TTCAAGAGCA GAGAATACAG AACAACAACA ACAAAAACTA 4020
GAGAGCGTGA AGCACTGGGT AGTAGAGCTA ATGAATAACC AGCAAGTTCC ATAACCCGCC 4080
TTGTGCACCT GTATCTCAGG GCCTGCTTTG ACAGCAGGGC CTTGGTGGAG GAGGCTGCTG 4140
CCAGCAGCTC ATTCAGCTAA ATCAGTAATA ACGTGGGTCT CAGAGCATCT TCAGCACTGT 4200
GCTCTATAAT AACAGAGGAG AAATATATCC TAACTAAATC CAGGGTAAGG GTGTTGACTG 4260
GATGTGTGAA TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGAGAGAG AGAGAGAGAG 4320
AGAGAGAGAG AGAGAGCCAA CACCAGCTTT AGCTCACTTG GTAACTGAGG CTGGCTTCAA 4380
ACTTGAGATC CTCCTGTTTC AGTTTCCAAG TGATCGCATT ACAGATACCA TGTCTGGTTT 4440
TGACTGACTT TTGTTTGGAA AACACAAAAA GTCTTCTAGA AGACATTGCT GGATATTGCA 4500
GGAACATGTT ACATGGCCTG AGAACAGGTG AGATGAGGTA GCTATTGTCA GCTTTTTTTA 4560
AAGCATAATA AAGGAAAGAG TGAGGAGAAT GTCTTCATTT TTGAGAGATG TGTAGTCATG 4620
TATTTTAATT GACCTCTACA TATCTCTACA TTGAAATAGT CCAGAAAAAT AGATGTATAT 4680
GATAAGATGT AAGCAATAAG ACCATCATGC GAGGTGTAAG AGTGTCATCC ACGCAGTTCT 4740
TTCTATTGTA CATCTGAAAT TTTTCATAAT GAGAAAATGT CCTGAGCACA ATGCCTCACA 4800