EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-01405 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr1:174437600-174441260 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr1:174440263-174440274GTTTTATTGGT-6.32
LHX2MA0700.1chr1:174439355-174439365GTTAATTAGT-6.02
MYBMA0100.3chr1:174441182-174441192ACCAACTGTC+6.02
RREB1MA0073.1chr1:174440684-174440704TGGGGGGGTGGGGGTGGGGG-6.06
RREB1MA0073.1chr1:174440682-174440702GGTGGGGGGGTGGGGGTGGG-6.17
RREB1MA0073.1chr1:174440664-174440684GGGGTGTTTGTGTGTGGGGG-6.63
RREB1MA0073.1chr1:174440674-174440694TGTGTGGGGGTGGGGGGGTG-6.6
RREB1MA0073.1chr1:174440678-174440698TGGGGGTGGGGGGGTGGGGG-6.95
RUNX1MA0002.2chr1:174440128-174440139AAACCACAGAC-6.62
ZNF263MA0528.1chr1:174440595-174440616GGAGGAGCACGGGAGGAAGAG+6.37
ZNF263MA0528.1chr1:174437895-174437916GGGGAAGGGGGGGGCGGGGGA+6.64
ZNF263MA0528.1chr1:174440755-174440776GGAGCAGGGAGGAGGGGGAGG+7.61
ZNF263MA0528.1chr1:174440580-174440601GGAGGAGGCGGAGCGGGAGGA+8
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04996chr1:174437907-174439352E14.5_Heart
mSE_07368chr1:174439912-174441383Intestine
mSE_09022chr1:174439874-174441302Lung
mSE_11234chr1:174437091-174439450Placenta
Enhancer Sequence
GCCAAGCTCT GTCTTTATTT TCCCCACAAT TCTCTGTCAT CTGGTTTAGG GGAGGACAGG 60
TTGGGTTTGA GAAGGAAGGA TTCAGAGCTG TCATGGGGTA GGAGCCTTAA TGCAGATTGT 120
GTGATGTGTG TCTGCAAGAT GGGAGAACTT TACTCCTCAG CGACTTGGGC AGGTGGCCTG 180
CTGTTCCTGG CCCGACAAGT ACAGGCCTCA TCTAACAGGA GATCTTTCAG GGAGATGGGG 240
CAAGATGGCC CCCATGTTGA AGCAGGCCGT TCCAACTTGG GTTGCTGAAG GTGTGGGGGA 300
AGGGGGGGGC GGGGGAGGTC ATAGTGGCTG GCTGGAACCA AGAGCTGGAA AATGAGCAAA 360
AGTGAGTTGG TGGCTGTGGA GATGGACGCT TTGCCCCTTG GTCCTACTCA CCTGTGGGCT 420
GCATTCCAGG GAGAGCCTTG CAGCACAGAC TTTGGCCTGG GACAAGATAA TCCACTTGGG 480
GTTACTGTCC TCAGCCCAAC TCATGAATGA ATGCTTGCAG CTTGTAGGTC TTCTGTCATC 540
TCAAGGCTTC CTGTGCTGTC TCTGTGTCTT CCCATGGAGG ACTTGAGGGA CTCTGGGTCA 600
CCTAGTGCCC CACCCCTGCC CAGTCCAACC AGCCAGTCTC AGGACCATGA TCTCCATTGT 660
CCCTATCTCT GACAATACTG TGCTTGAGAT TGATGATAAC AGCAGTTTGT AACCAAAGGC 720
CTCTAGTCTC CCCTCCTTCC ATGCCTCACT GTGGCAGTCT CTTCCTGGAA ACACCTACTG 780
TGTGCCAGGC GCCATGCTGT AATTTATAGC CATCTGCCCC ATGGCTTTCA GTCTAATCCT 840
GGCACCATGC TATGGAGGAG ATAGCATTTT CTTGCTTGCT GCACTCCCAG GGGCTGTGGC 900
ACAGATAAGA CAGGCTGCAG CCTCTGTATA AATCTCCAGG GGGTTAGCTG TCAGTCCTTT 960
ATCTCTCATT CAGGAAGGCT TTGTGGACTG CCAGTGTGGG AGAGTGATGT CATTGCAGAC 1020
AAAACACTGA ATCCACGGAA ATTTTTTTTT TTAAACATCC TTTCCTGATT TAACTATTTC 1080
CAGTTACAAC TGTTGTCAAC ACACTGCCAT CTTCTGAGAT GTGTGTGATG TGCCTCAGGA 1140
CTGCCTGGTC CCAGAAGATT CTTAGAGAAG TCGAGGAGGC CAATACACCT TGTCATTGCC 1200
CACATTCTAG TCACTGGCTC TCACAAAGGG CAAGAAACAT AGCCAAGGCC ACCTAGAAAT 1260
CACAGGAAGG CGCCCCAAGT CGGTCTGGAT GAAGGTCTAG TCCAGCCTTT GCTGTTATAG 1320
CCACAAGTCG GGATGTGGAG GGACTGGAGA GATGTAATGG GATGCTGTTC CTCGTTTTGT 1380
AACACTATAG AGAATGCTTT CTCCTAAGGC TCCTTGGATG ATCGTGTAAG CCCAGAGTGG 1440
AAAGGGCAGC CATAGTGAAT GCTCATAAGG GCCCAGGAAG TGCAAGTGAG GGGATAAAAA 1500
GATAGGCTTT GTGTGCACCT GGGAGACTGC TGCTGTCCAC TAGGGCTACA GACCTCTACT 1560
ACTGCACAGC TGAATATGAT CAAAGAAGCT CCCGCTGGCC CGATCCCTCT CTCTAGAGCA 1620
ACATTTCAAA GGCAGACAAT CAGTGGGGTC CAAGACATGC TCATTTTCCT TCCAGCTGTG 1680
ATCTCCAGCT GCCCAACTTA GAGAGGGATC GAAAAGTTTC TTAGTCCATT TCAGTAGGTG 1740
TTCAACTCTG GCCTGGTTAA TTAGTTAGTT AGTTAGTTTT TGTCAGCTTG ACACAAACTG 1800
AAGTTATCTG GAAAGAAGAA TTTCTATTGA GAAAACACCT CCCTCAGATT GGCCTGGAGG 1860
CAAGTCTGTC TATAGGGCAT TTTCTTGATT AGTAATTGAT GTGGGAGGGT CCAGCCCACA 1920
GTGGGAGGTG GCATCCCTAG GCAAACGGTC CTGGGTGATG TAAGGAAGCA GGCTGAGCAA 1980
GCCATGAAGA GCAAACAGTA GGCAGTGTTC CCCTCGCAGC TTTTGCTTCA GATGCTGCCT 2040
CCAGGTCCCC ACCTTGAGTG CCCGCCTTGA CTCCCCTCCG TGGACTGGGA CTTAGGATGC 2100
GTAAAGCAAA GAAATCCTTT TCTCACCAAG TTGCTTTTGG TCCTGATGTC TTCATTGAAG 2160
CAATAGAGAA AACTAAGACA AAACCATTTG GGGGCCTGGC ATCTTAAGGT CTTATATTGT 2220
TATTTTCTGT CTCTTGCTAT TTAGCTCTTT GTCCCTGATG AAGTCAGTTT CACTCCTGAT 2280
TTGACTCTTC TAACTTTTCA ACCCCTAGAA CTCAGTTGGG TCCCCATGCC AAGAGAAACA 2340
GCTCCATTGT ACAATGTCCC CTTTGCTTGT CATCGACCAG ATCCCATTCT CTGTATGTAT 2400
TTTGTAACTG ATACTGGAGC ATTCTAGATA CCTAAAACAA TCTCCTTCGA GACCTCGCCA 2460
TGGTTTGTTC GCTCTTTTAT CTTCTCAAAG CTTTGTCCAA ATATCACCTT TCCTGACCAC 2520
CCTACTTCAA ACCACAGACC ACCTCAGCCT GCATCCTAGC CTGCATCTCC TTCCCGGGTG 2580
CCATTTATGA CTGTCCCAGA GGCAATGTTT TACTTATTCA TGTTCAGTCT CCACCCATAG 2640
AATCTACACT GCACAGAGGC AGGGTTTTAT TGGTTTTGTT CCTGGAGAGT GGTGCTACAG 2700
GTGCTGGACA AATATTTGTT GAATGGATGA ACGAACGATT GTGGAACCAC CAACTTGCTC 2760
TCAAATCCCC TGGCCTAGTA AGATAGGGTC CAGCCAGACT AGGGCCACAG CAACGCAGCC 2820
TGTCATCGGG TCTGAGATGG GACCAAGCTC AGTTGACCAA GTCTCCCGCT CTTTCCTTGC 2880
GTTAATTTTC GCAAAGCAAA ACCCCAAGCC ATAAATTAGA CAGAGGGTAG TGTACAACGT 2940
GTACCCTGGG AGAAGAGAAA GCTGCATTGT GATTTGAGAT GGAGGAGGCG GAGCGGGAGG 3000
AGCACGGGAG GAAGAGGGCA GAGTCGACTT TGGTTCACTT ACTTTGCCCT CCGCTGTGAA 3060
GCTGGGGGTG TTTGTGTGTG GGGGTGGGGG GGTGGGGGTG GGGGTTGAGG AAGTGGCCTA 3120
TGGTGGCCAA TAGAAGGGAG AATTAGAGAA GGGCAGGAGC AGGGAGGAGG GGGAGGGGCA 3180
CAGAAGCTCC GCCCAGTTTA GCTTACCTGC GAGAAAAGCG GAGCTCTGTG CGGTCCCTGT 3240
GTGTGTGTTT ACCCAGGTGT TTGAGGAATG ATCAGACCTA GGCTCAGGGA CCCCTGGTGG 3300
GAGAGATGAG TCTGTGAAGA GACTGCCTGT GAGTGTCTGT CTGCCCAGGG TGGAGGATAA 3360
TGGGAGGGTA GAGGTGTAGG TTCTGTGTGC ATGGGCCCCC GTGTGTTTGT CCACGGAGAA 3420
CAATAGACGT CATTCCTGCT CCTATTGATG TCTGAGAACC TGGCAAAGGG CCTGAGGCAC 3480
AGTGGAATCG GGAGAGGGCT GGGTAACAGG ACTCCATCGG AGAGACAATA AAGGGCCTGG 3540
GATAAAATTT GTTGGAGAAA AGGCTGGACG AATGAATTAG GAACCAACTG TCTCTTTTCG 3600
AAGAAGTAGA TTTTAGTCCC AGTGGGCAAG GAGGTGGATT ATACAGAAAA ATGCCCTGAA 3660