EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-00713 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr1:93993600-93998600 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:93998543-93998561CCTGCCCTCCTTTCTTCC-7.13
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:93998547-93998565CCCTCCTTTCTTCCTTCC-8.03
Foxd3MA0041.1chr1:93996971-93996983GAATGTTTGTTC+6.14
Foxd3MA0041.1chr1:93997774-93997786GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxq1MA0040.1chr1:93997916-93997927AATAAACAATA-6.62
HNF4GMA0484.1chr1:93996506-93996521AGGGTTCAAAGTTCA+7.64
Hnf4aMA0114.3chr1:93996507-93996523GGGTTCAAAGTTCAAG+6.93
NFAT5MA0606.1chr1:93994292-93994302AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:93994292-93994302AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:93994292-93994302AATGGAAAAT-6.02
Nr5a2MA0505.1chr1:93996514-93996529AAGTTCAAGGCTAGC+6.14
RXRBMA0855.1chr1:93996507-93996521GGGTTCAAAGTTCA+6.91
RXRGMA0856.1chr1:93996507-93996521GGGTTCAAAGTTCA+6.96
RxraMA0512.2chr1:93996507-93996521GGGTTCAAAGTTCA+6.84
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02655chr1:93982944-94040567HFSCs
mSE_03244chr1:93972239-94013222TACs
Enhancer Sequence
TTTTAAAAGC TGACATCCCA AAGAGAGATT AGAGGCTACT ACAACTCAGC AACAGAATGA 60
AGATCCTAAA AGAAGTCGAC TTACTGCAGT CCACAGAGAG GCAGCATCAC CCTCAGCTGA 120
GCTGCAGCAG GAAGGCATCT CTGCCTCACC ACAGCAACAG AGGCAAGAAA GATGCTGAGC 180
AAATGAAATG TGATCACCAT GAACTTACCC TATATGGAAC TTGCTACAGT GTGTTTTTGA 240
AACAGGGTTT CATGTAGCCA GGACAGCCTG AAATGTGGGC CATGAACTCC TGATCCTGCT 300
GCCTCCACCT CCTATGTGCT GGGATCACAG GTGGGCTGCA CGGCCTGCAG ATGAACTATC 360
CCATTGCCAA AAAACCAGAG GAAATCTAGT CTCTGCCCCT GTAGAATGTC CTAGAACTCC 420
TTCCTGGCCA CACCACAAGA CTAGAACATG CATCTAAAAC GAGAAAGGAA GAAGAAAAAC 480
TACCCCCTCT ACATTTAATG CTCCTTTGTC CTAGAAACAC TGAAGAAGTC ACAGAAATCT 540
GCTCAGAAAC TATACAAGTT TAGAATAATG AGATGATCAC ACACACACAC AGAGAGAGAG 600
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAT CCATTTATAA TAAATTTACA TATACTAATC TTAAAAAAGA 660
AAATAAACTT AATTTAAAAG AAAGATACAC AGAATGGAAA ATGGCTTGAT TAGTAAATAA 720
AGCACCTGCT TTCAAGGCAT GAGAACCTAA GTTTAGACTG CCGAACGAGC TACACACCTG 780
TACTCCAGCA CTGGCGAGGA GGTAGAAGAA CAGACTCTGT GGAGCTCAGT GCCCAGCCAG 840
CCTAGCCAAA TTGGAGCTTC AGGTTCAGTG AGAGACTATC GCAAAAATAA TCAGAAAGGA 900
ATTGAAGAAG ACCTCCAAAT GCACTTATGC ACACACCTGC ACACACGTGC ACATACCCAC 960
AAGAACACAC ACAACACTCA CATACTAAAT TTTAAGTTTC TTAAAAAAGG ATCATCTTTA 1020
ACAGAAAAGG TAGCTACAAT TTACAAATTA TTAAATTCAA TATAAGATCT TTATAGGAAA 1080
AAAAAGTATA AAAACCAACT AAAAGACATA GAAGTACAAA GTCCTGAACC CAATCTGAAG 1140
GACCAGGGCA TATGTGGGTG GTAAATATAA AAGACCTGAT TATGAGGTAA AGCGGTTTGC 1200
CTCCAAGCAT GGCAACCTGA ATTCAAGCCC CAAAATCCAC ACGTGACTGA GGGTTTCCTC 1260
TTATGGACAC ATGTAACTGT GGCACACCAC ACACTTACAC ACATAAACAA GCAAGCAAGC 1320
AAACCCATTA ATACAAAAAG TTACAAGAGA CCTGACAACA AACTAGGCAA GTAAATATAC 1380
TGTGAACAGG TCAGTTCTCA ACCAAATAAA TCCATATATA TTGAATATAT GTATAACAAA 1440
CAAAGTTTTC ATTTTGACTT TGAAAGGAAC TTGCTCTCAG AGATGTCACC ACTATGGAGG 1500
AGCTGGTGTG GTGACAGGGT GGTAACAGGA AAGTTCCCCT AAGAGGCTGG AGCCCATGCC 1560
AAGGAGCCTA TGAACAAGAG AAGTGCCCCT GGGACCAGGA CAGGAACACT GTGAATGAGC 1620
AAAGCTGGAC ACCAACAGCA TGACCCTGAC ACATGACAGT GCAGCTGCTC AGGGGAAGGA 1680
CAAAAGCTCC GACATCAAGG GAACATGGGA AGGGGGATGA AGACCATCCC TGCTCCAAAG 1740
ACTCACTCCA ACGAAGACAG AACTTCCAAC GCTACTGGAG AATCAAGGGC TAGCAATCTA 1800
TAGCCTAGGT AGAAGCTTCA CTGCTGTTTT GTTTCTTAAT AAAATATAAA AGATAAACCA 1860
CCAAAGGAAA AATGTTAAGT TTTGGCTCAG CCACAGTACA ATTTAAGAAG CATTTTTGTA 1920
TATAATCTTT CTTGTACTAA ATAATGTCTT TAAAACCATG CTTGACAGTA ATCAGAGAAA 1980
AATCCACTTT TTAAATTAAA ACCTAAGAAT ATACTAATAG TTTTTAATAA ATTTGTTATT 2040
TCTTTTCCAA ATATGAGCTA TTATTTCCTG TATTATTACT CTTACATGGT TCCATGCTCA 2100
GTTAAATCCT CACGTGGGGA AGAGAAGCCT TCCCAAAAAG CTGACCATGG GGACAGCCAG 2160
TGCCAATGAC ACAGGGACCC CACAAACCAA GGCACATCTA TTTTCATTGC TGAAGGACAT 2220
TTCTTTCTGT GTATAACAAG AGGAGGGGGA GATCTCTGAG ATTTCCAACA GAGTTTTAGA 2280
CAGACAAGGG ATTCTGAGTC CCATCAATTA CAAATTAAGG TTCTCAATTT GAAAAGCTTT 2340
ATACAATATG ATTGGCAGAA TAAATAATCT AGACAGCAAG AAAACTGAAA GGAAAGAGCT 2400
GCTCAGAAGT GGGTGCCCAC CCCACTTTAT CATGTATGTC CCACAGGATG TCTGCATGTC 2460
CCGGGGTAAC TCTCAAACAG AAACCTATAC TACTAACAAA GGACTCAGCT GCACAGGCTC 2520
CCTGGGCCTT GTGCAATGGA ACACAAGGAT CACCAACACA AGGACCTGGG AGTTTTGTGA 2580
GAAAGCCAAG AACCAAGGCA GGGAACGGAC TTGCAAGTCA TCCTGGCCTG CCATGACTGG 2640
CCCAGGCTGG CCAGGCCAAG TGTGAGCTTC CAGGGCCAGC TGCGGGGCCA AGGACTGCCT 2700
TCCTGGCCAA CAAGACAAGC CACAACAGCT GTGACACTGA CGACGGGCAC ACTAAAATAG 2760
AAGGGTGTTT GTTTGCATCT CCTGTGATAA AGACCTGTGT GGGGGTGGAG CACTGAGAAG 2820
ACCAGAGCAG ACTGGAGTGA GATTTTAATA AAGTTAAATA AAGCCTTGTG CAGTATTATA 2880
TGCCTACAAT CCCAACTACT GTCAGGAGGG TTCAAAGTTC AAGGCTAGCC TGCACAACAG 2940
CATGAAACCT GTCTAAAAAT ACAAAGAAAG ATGGTCAGCT CATCACCTAA AGAGAGACTA 3000
GGGAGCTGGG TGGCTCTGGA AACAGGCACA TACTCCCCTC CCTGAACTGG GGCTGTGCGG 3060
GTGCCAGTAT GTAATACCTC ATGGGAGAAC CCACAGCCAG CCTGCTGCCA GGGCCTAGAG 3120
TACAAAAACA GCTTTAGAAG ACAGCATACA ATTAACACAG CAACAATCAT CTTCCTAATT 3180
TAGGGTAATC TCTGCTTCGT AGCCCTTTTT GGCAGTGGGT GTACTAGAGC TATCTGTGTG 3240
GGTGCTTTTC ATCTGGTTAC TCGACGTCCC CAGTTGGAAG ATATCAAGGA AGATCTTAAA 3300
TGTCCACTAG CACCTTCTAG AGAAAGGGTG AGACTCAAAA GAGTTAGTAG GCCTTGCCCT 3360
CCCAGAAGAA GGAATGTTTG TTCGCAAGAG TTCATGACTA CTGATCAGGC TTTTGTCTGC 3420
AGCCTGGCAG CAGATCAGGG TAGGACACTG CTGTTGGGGC AAAAGCCTGG CTGGGGGTGG 3480
GAGGGATTGG AACTTCAGCT CTCTGAAAGA AGTGGGGACA CAGAGACAGG TCTGGCCCCT 3540
GGTGGCTGGG AACCTGGGTG CAGTATAAGA GTGTCAACAG TTCAGGTGAC CCTGTGCACT 3600
GCCTGTCGAG GAGCACCAAG TGCTGTCTTT GGTCTGGCCC ACAGGCATTG AGGTCCAGGT 3660
TCATCCAGTC CTGGCTCCAA AGAAAGCAGA GTTCTCTGGC ACAGTGCTCT GGGTGAGAAC 3720
ACAACCTCTG GCCAGCATTT GTTGTTTGCT GGACATGTGA CGCAAAGGCT TTTGAGAGCT 3780
TCTGAGAGAG AATAGCAACC CCATAAACAC AGACGTCCTT GAGGCAGGGG CCAAGAGAAT 3840
CCAAGAATCT GATGGACTGG GGGCAGTGAC CCAGATGCAC TACAAGAGCC TTGTACCACA 3900
GCGGACAGGC ATAGAGCCTG GAAACAGAGA CCTACCAAAA CTTTATTTAA AATCACCTAT 3960
CTTTATTCCA GAAAAGCAAA TCAAAGTCTA TCTGGGGATT CAAACAAAGT AATGAGTGAA 4020
GTCAGGTCCA GTGACCAGTG ATCACAGGCA CAGCCATTGG ACCAAAGAAA GAAAATTTTA 4080
TTTCTCTCTC TGTTTTTTCT CCTTTTAGAG GAGGAAGGCA GAATAGAAGA CAGCCAGTGA 4140
GGCCATCTTT CACAAAAACC TTTAACTGTT TTTTGTTTGT TTGTTTTAAA AAAAAAAAAA 4200
AAAGCCTACA AGGGACCAAA CCCCACATGG GAAAGGTACC CAACAGCACC CCACAGGCAA 4260
GTTCATTCCA GCTCTCTGGC AGGCACGAAG TCAGTAACTT TAAATTATCA CATCACAATA 4320
AACAATAAGC CCCATTAGAT GTATGTAGCC TTACTTTAAA GAACATGCAA CCAAACATCC 4380
CTACAGTAAT ATACCAGGAA TAGCTACTAG CCTGGGGGTT GAAGGAACCC AGAGCCTCCA 4440
ACCCCACCCC CAACAGAGGC CTATGAAGGG ACTGAGATCT ATGGAATTTG GATTCCTTGA 4500
AATAGCAGAG GCCAGCTGAC TTTTGAACTT TAGGGTCCCA GGATTTCGAT ATAGTAGCTG 4560
TCCTTAGAAT GATGGAGATT CCCTTTCCAG AAGTTTGGCT AAGACCTGAT CCTTTCCCAA 4620
TGTTAGTGAA GAATTTTAAG CATCTTGCAG AAAACTCACT TTTAGAAATA AAGTGCCCAA 4680
CCCAAAGATT AATAAACATG GCACAGTCGA GCCCAAGGAG TGAAGACACA AGGCGGGACT 4740
CCAGAGAAGC AGGAAGGCCA GACCCTGGCT ACCCCGAGGA ACTGAGGAGC AGGGAGAACT 4800
CAGGCCTTCT GGTGTCTTGT AGCTGCTGCC CAGGTTGTTC TATTTGTCTT CTCTCTGGAT 4860
CCACTCAAGG CCCACACTGA GATACTGGCC TATGCTCCAT GAACACTCTA AGTGGTTGGC 4920
TTGAAGACCC CAGAGGCAGC AAACCTGCCC TCCTTTCTTC CTTCCTGGTG GAAACCAAGG 4980
CAATGGGCAT TTACTAATAA 5000