EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-00248 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr1:52349400-52352900 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA+6.11
RFX1MA0509.2chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA-6.11
RFX2MA0600.2chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA+6.39
RFX2MA0600.2chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA-6.39
RFX3MA0798.1chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA+6.57
RFX3MA0798.1chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA-6.57
RFX4MA0799.1chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA+6.11
RFX4MA0799.1chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA-6.11
RFX5MA0510.2chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA+6.07
RFX5MA0510.2chr1:52350331-52350347TGTTTCCATGGAAACA-6.07
RREB1MA0073.1chr1:52350814-52350834CATGGGGTGGTGGTGGGGGG-6.11
RREB1MA0073.1chr1:52350817-52350837GGGGTGGTGGTGGGGGGGGG-7.47
TP63MA0525.2chr1:52352865-52352883GACATATTGGGACATGCA+6.07
ZNF263MA0528.1chr1:52349809-52349830AAAGGACGAAGAGAGGGAAGA+6.42
ZNF740MA0753.2chr1:52350826-52350839GTGGGGGGGGGGT-6.32
Enhancer Sequence
ATCAACTCTG AAAAGTATTG AAGATGCTCT ACTTTTGCAG GATTGACTAT TAAGTCGAAA 60
TTTAGTTCTT TATGTAAAAA GAAACAGGTA CACCCACATT ATTAGTATGC AATTTTTCTT 120
TTACTTTTAG CAAATGGTGA AATTATATGT ATACCAGTGA ATTGTTTTAA GATAAATTTA 180
TTTGTGATTT AGTTCAGTAG ATGTTTATGT CACACACTTG CTTTATATAT TTATATATGC 240
ATGGTTGTGT AAAAAAGATT GAGCAAGAAG AGATTGTGAG TTGAAAAATA CTCATATTAA 300
GAAGTCTTGT TCTAGAGTAG AGGGAGTAAA GGGTCAAGCA ACGTGGGATG TTTCCAAGAG 360
GCATATGAGA AAACAGACAA GGAAGGGAAG AGGAAATGAA AGGAGAAAGA AAGGACGAAG 420
AGAGGGAAGA GGAAGAAAGA TCATTGGTAG ACAGGGAAAG CTGGCAAAGT GTCAATCAAA 480
ATCTCCTCAG GACAGAGGAA AATCTCCTCA GGACAGAGGG AAAATCTCCT CAGGGTTGTC 540
TGTGGGAAGC TGCGTCACAT GGTGTGTTTG TGTAGAATGG AAGATGGTTT CCCCTGGTTG 600
CAGCCTCACA AGCCTCTCTC CACAGCCCAA TGATGTGTAG AATGAAAGAA GATTATCAAT 660
GCAAACTCAT GGATTCCTTT TGCTTTTTTG TTTTTGTTTT TAGATTCCAG GAGAGGGTGT 720
GTAGCAATGT GAGTAACTAT CTATTAGAAT ACTTGAAATG GGCCAGTGAA CCAAGCAGGA 780
ACTGAGGGAC AGGTTGAGAC AGGGAAGAAA TCCTTTAAAG ACTGGCCAAC CTAGTCCTCT 840
GTTGTGACAA GGAAGAGTGG GGCCCAAGAG GTCTTTACCA TGTGCCTAGC ACTCAGACTC 900
ATGTCCTGTG CTTGATTCTT CCTCCAGAGA GTGTTTCCAT GGAAACACTG GAATTTATGT 960
AGATGGTCTT AATCTAACTC CTCAGTGACT TTGTACATGT GGAAAGCAGC CAGATCTCAT 1020
GGGTGGATCA TTAAACTAGA ATTCTTTTCT AAGCACGCCA GTACCTTAAA GTGTGACCTT 1080
GACTTAAGAC AGGCCATCCA CCTGTTGAAA GAAATGACCC CAGGGATATG GGCCTGCTGC 1140
CTCCATTAAA GGCCGGCTCT TCAAAAACAT GCAGAGCTAA TCAATCCCTT CTGGTTTCTT 1200
CATGCCGAAA GGGACTGTTA GGAGAATTAT AAAGATAATA TCTACAAAGG ACTTTGAGCT 1260
CATTCAATAA AAAAATGTGT TTATATGGCC TGAGGCGCTC TGGTAGACAG ACTTTATGTA 1320
TTAATCGTTG TGTCTAGAGG TACACACAGG TGTGGATTCA GAGGCCCAGA GCTAAAATAT 1380
TTAACTCAGT CCTGTCCTTC AACACCTTTG GAGACATGGG GTGGTGGTGG GGGGGGGGTT 1440
CACCATAGTG CAAGACCTTG AGCTGTGTCT GAGTTTATGT GAACCATGTG TACAGGAGCC 1500
CTCCAAGGCC AGAAAAGGTG TAAAGCTAAT TTGAATGACT GACATGATTC ATCTTTCAGT 1560
GGAATGACAG TCAGTCAATG TGAGTTTGAG GGGTATTTCT TGCTACCCCA AAGTACTGTG 1620
TCATTCATGT GAAGGGCTCT ACATTTCATG TTGTATTGTA AGATATAATT TGGGTTCTAA 1680
CAGCTTCTTC TTGACACCAG TATTTAACCA AGACAAAGTC ATCAAAATGA TATAAATGTG 1740
ATAATCACAT CTATTTCTTG GAAAAAATTT TTAAAGAAAA TGTGATTAAA GCACTATAAT 1800
AGTGTGCGTG GATATCGAAA ATGTGATCAA ATCTCCACAA TGGGGATGTT CATGGATGCT 1860
GAAGGAGGAA AGATCACACC CACATTTCTT ATACGATTCA AACATGAGGT CGATATATAA 1920
AAGGGATTTC TAATTGAGGA AAGGATAAAA ATGGTGGATA TTGCAAAGTG TTAACTTTCA 1980
ATAGAGGTGA CAGTGAACAA AGCTGTGGAA GAGAAAAGAA CCAAGTATCA GGAAGCCGTA 2040
AAAATAATGA TTGGAGTCGG ACAATAACAG ATCAAGAAAC TGGAACCTGA TGAAAAAACC 2100
CACAGGGAGC TATAAAAGAG GCATTTGAAA CAGGAAGTGA TGTGGGAAGG GAAGATAATT 2160
TTAGCCTGCT TACAGGAGGT AGCAGCTGTG GGTGTGAAGA GAACAGATTA ATTTTAAATG 2220
TGTCCCAGAA GTAAGATTTT TTTTTTTTTA GAGTGTGGGA ACAATGATGA GGGGAACCCA 2280
GTTGAGAGCT GTACCAAGCA GGAGTCCAAA CAGAGTATTG TTTCCATTTT TGGACACTGG 2340
GCACACAGAA ACTTTGATTA ACTAGGTCAT TCAAGACACC AGGGCCAAGG AACAATATGC 2400
TAATGGTGAG TCTATAGATA GAGTAAGGGT ATCTATAGAT ATAGAGATAT TGGCAGCTCT 2460
GCTTAGATAT CTGCAGGTCT ACTATAAGGA AGAAAAGGAT AACACCTGCC TGAACATGTT 2520
CAGAAGAAAG CAACAGACCA AGACAAGTTA GAGTAAATGT TGCTCAACAG TTATGCATGC 2580
CTGGTATCAA AATAGGCGTG GGTAAAGCCA TATTCTGCAC ACATTTGAGT GGATAATGTT 2640
TAATAACTGG GCTTATTTGA CACTCTTGTA CAAATCCCTC TCCAATTAGA GGGGCATGTG 2700
ACTTGTTGAT ATGAACTTGA GTCTTTACAC ATATGATGCT ACATTCTCCA TCTCTTATTT 2760
GAAGGCTACT TATCATCAGT TAACACTACC TACCAAGAGG AAAAGTAACC AGATATACTT 2820
GTGACCACCA TTTGTCATAA TAAATTAACT GGTATGTTAA ACATCATCTA AGAGTTTTGA 2880
TTTTTCTTAA TTAGTTATTT ATTTTGGGAT CATTAGCAAG AGCCTCTGAA GGCCTTTCTT 2940
CTTGTTAATT ACCCTGTGAC ATAAATTAAA GTCCAAAGGA CCAAGAGATA ACTCAGTGGT 3000
TAAGAGCACT TACTGCTCTT GCAGAGGACC CAAGTTTGGT TCTTAGTACC CACGTTGGAC 3060
AGTTCACAAT TGCCTGTAAC TCATTCCATG GGATCTGACA GCATTTGCTG GACTCTGTGG 3120
GCCCAAACAC TGACATATAC ACCCCCTTAC ATATTCCTAA TTAAAAATAA GTTAATGTCT 3180
AAGTGGAGAC TAATGAGTAT TCAAACTGAG GAGCATGGGG AGGGTTTGAC AATAGATCTA 3240
TAAGACAAAT AGTTTACCAA TAGCGAACAG CATAGTCCCA TCTCTTAGAT AAAGAGATCT 3300
CTTAGGTTAT AAAATTATAC ATATAAAATT AGGTCCAAAG GTCTGTGAAG TGGCTCAATG 3360
TGTAAAGGTG CTTGCTGCTG GGCCTGAGAA CCCAAGATCT ATTCCCAGTA CCCACATGGT 3420
AGAAGAAGAG AACCAATCAC TGAAAATTGC TCTCTGACCT CCATAGACAT ATTGGGACAT 3480
GCACAACTCA ACACTCACAT 3500