EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM088-00115 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Large_intestine_epithelial 
Coordinate
chr1:36068820-36072920 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:36071761-36071773GAATGTTTTTTT+6.52
HNF4GMA0484.1chr1:36071550-36071565TGAACTTTGAACTTT-7.73
Hnf4aMA0114.3chr1:36071548-36071564TTTGAACTTTGAACTT-6.49
LMX1BMA0703.2chr1:36072083-36072094GTTTTAATTAA+6.14
Nr5a2MA0505.1chr1:36070257-36070272GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
Nr5a2MA0505.1chr1:36071337-36071352GCTGGCCTTGAACTC-8.25
PKNOX1MA0782.1chr1:36071104-36071116TGACACCTGCCA-6.02
PKNOX2MA0783.1chr1:36071104-36071116TGACACCTGCCA-6.27
POU1F1MA0784.1chr1:36070722-36070736CTCATTTGCATAAG-6.63
POU2F2MA0507.1chr1:36070722-36070735CTCATTTGCATAA+6.44
POU3F1MA0786.1chr1:36070723-36070735TCATTTGCATAA-6.52
POU3F2MA0787.1chr1:36070723-36070735TCATTTGCATAA-6.52
Pou2f3MA0627.1chr1:36070721-36070737CCTCATTTGCATAAGG-6.16
RXRBMA0855.1chr1:36071550-36071564TGAACTTTGAACTT-6.32
RXRGMA0856.1chr1:36071550-36071564TGAACTTTGAACTT-6.54
RxraMA0512.2chr1:36071550-36071564TGAACTTTGAACTT-6.4
ZNF263MA0528.1chr1:36069005-36069026AGGGGAGGAGAATGGGGAGAG+6.32
ZNF263MA0528.1chr1:36069008-36069029GGAGGAGAATGGGGAGAGAAG+6.63
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10290chr1:36068696-36069962Embryonic_stem_cells
mSE_10290chr1:36070039-36073050Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
GGTGCCTCTG TGAGCCAATG CTGAGGCATC CCTTCCCCCT GAGGGACCAG CCACAGGACG 60
GTATAGTATA GAAGTTTATT CAGGGTATGG GGAGGGGAGT TGACTAGGTA GCAGAGACAG 120
CGAAAGGCAG AAAGACAGAG AGAGGGTAGA GAAGTAGAGG CTGGTCAAGA GCATGTGTAG 180
AGAGGAGGGG AGGAGAATGG GGAGAGAAGG GACAGGGGGG GAAAGGGGAA GAGAGCAAGA 240
GAAGAGAGGA GGGGCAAGTG AGTCAGGCAC ACCTGGCTGT TGCCAGGTAA CGGTGAAGAA 300
ATGCCAACAG TATCTATTAC ATAAAAGTAG AAGTAAAACT ATGTAGGGAG ATACCAGACT 360
AGAGGGAGGG AACGGGGAGG AAAAGGCCGA GTGGGCAGTA TAGACAAATA TGGTTCAGCA 420
TGCATTGTGA ACTAAAAATA ACAATAATGT AGAGTAAGCT CTCTGCTCCC CTCAAACCCC 480
AAGTCATTGA AAAGGGGGGC CCTTGGAATG AGGGACATAC CAGCTGAAGA GAGAAGAGCC 540
TACCCACACC AAGAAGGTGA ATACAGGTAC AGTGAGAGAG GCAGCAGCCA CCAACCCTGT 600
CCCGAAGCTC CCGGGAAGCC CCAGGGATAC TGATAAGACC CTCTCACATA GCGTCTCACT 660
AAGTGCTCTA GCACTTGCCC AACGCCCATA TGACCCTGGC TTCAATCCCC CGAACTTAAA 720
GGGGGGAAGG GCTTAAAAAT GGCTCCTCCT AGGATTACAA CACATGAGCA TCAGATGCAC 780
ACTGATATTC ATATTTTAAC CCTTTGTGGG TAACATTGTG ACCTGAAGCG ACCCCTCCCT 840
CCATACATAA ATGTATATTA AGGATTCCAC GGGGCTAGCT AACTCATTAG GAAGAGTTAG 900
AATATTGTTA ACTCCAGAAC CAAATTATCT TGTGCAGTCT TTAGCTGTTC ATTGCCCTCT 960
GGGATGTTTG CCGGGACATA TTTGTGACTC TGGCGTGAGA CCTTTTGGCA TGTATTACCT 1020
AACAGACCTG GCTTTCATCA ATCCCAAAGC TAATATAACA TCTGATACTT GTAGATTTCC 1080
CCCCACTTTG CTGTAACTTA CCAACTGGTG TCCATTCCAA ACTACTTGAA AGTTTATATA 1140
TATAAACTTT ATATATATAA GTTATATATA AAACTTTATA TATATAAGTT ATATAACAAA 1200
TATATATATA TATATATATA TATATTTGTT CTATGACTAT ACAAACTACA TTAGCCATAT 1260
CATAATGCAA AATGCATTTA GTCCAACTTC AAAAGTCCCT ATAGTCTATA ACAGTCTTTA 1320
ACTTGTTTAA AGTCCACCTC ATGAAAAGGA ATCTAAGGAA CTTGGAACAG TAGTTCCACG 1380
CATAGCGGTG CACAGCTTTA ACCCCAGCAC TCTGGAGACA GAGGCAAGCA GATTTCTGAG 1440
TTCAAGGCCA GCCTGGTCTA CAGAGCACGT CCCAAGACAG CCAAATTTTG GCATAAAGGT 1500
AGGTGAAAAT ATACTTGAAC AAGGGGGCCG TGTTCCAGCC CTAGCCAGCA ACAGAACTTG 1560
GCAGCTTCAG CCACATAGGT TCTGGCTTTA AAGTCTCCCT CCAAGACTAA GGAAAGCCAC 1620
TGGGGCTGGT GTGTGGCCAG CAGAGTGCTG TCTAGGCCCT GAATGGCAGT GTGATTGCCC 1680
CCCAATTGCA ACCGTTGGTC CTGAGAGAGG AAGCAAGGTG GACCACTGGG GAGCAAAGAG 1740
ACCCTCAGGT GGCAGTGAGC CTAGCGAGAA CAAACTCTTA GAAGACAACT TCAGTCAAAT 1800
AGCTCATTTA ATGAGGGAAC AAAGACTACA TAAAGCATTG GGTGTGGGTA TGAGCTTTCA 1860
GGTGAGCATA AATCTCTGGC CTGGCCAGAG CACTGAGCAA GCCTCATTTG CATAAGGAGG 1920
AATTCCAGGC GTGGCCAGGC GTGACCTTTT AAGGGGAGAG GAAGTTTAAC CTGGCTAATG 1980
AGTATCGTGG CCTCCTGGTG AGGAAAAGGT GGGTGCTCGA GGCTATTTTA TTTGTACCAG 2040
GACACTCAGG CCAAGGGCCG GGGAGAGCAA TTTTACTCCT GCAGATCTCA GGACAAGATT 2100
TCCTGGGTTT GGACGTGCCT CAACCCCGCT CTTGTTCCGG GCCGGCTCCC CAGGGTTCCA 2160
GGCCTCTCCA GCCCCCCAGC AGGGCGTCCC AGTGTGAAAG TCAAGAGAGG CCATTGTGTG 2220
AACTGTGAAG GTGAAACCTG GCTTGCCTCG GAGACCTCAA ACTGTGGGAG ATGGCAGAGC 2280
CATGTGACAC CTGCCAAGGA GAGCTGCTAA TGGGGGTGGA ACCAGCCCAA GAGAGAGAAG 2340
TGTGTTGCAG TCAACAAAGC TGAAAGGAGT TGGAGATCAG AAAGGCATTT TGACTTCAGC 2400
CATGGAGATG CTGAGTTTGG AGTTTTTTGG TGTTGCTTTT TTTTTTTTTT CCTTTTTTTT 2460
CGAGACAGGG TTTCTTTATA TAGCCCTGGC TGTCCTGGAA CTCACTTTGT ACACCAGGCT 2520
GGCCTTGAAC TCAGAAATCC GCTTGCCTCT GCCTCCCGAA TGACCACACC CGGCTAAACC 2580
CGGTGTTGCT TTAGTGCAGT AGTTCCTCAC TATGTTCCCT TTTGAGATGG TAATGTAGGT 2640
CCCTTGCCAG CGTATGTGGG AAGTATATGA TCCGATTTTT TTTTACAGGG GATTAGAGTT 2700
AAGAGAGTGC ATGAGTCTCA AAAGAGACTT TGAACTTTGA ACTTTAAACA AGTCTAAGAC 2760
TGTTATAGAC TATGGAGACT TTTGAAGTTG AACTAAATGC ATTATGATAT GGCTACAATG 2820
CTCTGGGGGT CACAGAGTGG AATATGATGA TTTGAAGAAG AAAAAAAAAT GGTCCCCATA 2880
GGCCTATGGG AGTGGCCTTT TAAATCTAAT TGTGGCCCTA ATTAAATGTT TTTCATTATA 2940
AGAATGTTTT TTTCATGGTC ATGGTGTCTC CTCACAGCAA TAAAACCCTA AGACACCTAC 3000
CTTTCTTTTA AAAGGTTGTA TGACTACCTG GTGTCATTGC GACCTTAGGA CCACCTTGTA 3060
GTCATGTCTT TCAGGAGGTC CTTGTGACTA ACTTGTTATG TTTATGTTCG GTCCCCATAA 3120
GCCCACCTAT TTTCCCCCAT TTGGAAACTC CTTATCCTCA AGCTATAAAA ACCTTGTTTT 3180
CCCCATGCCT TCCTCTCAAA CCCTGACTAG GGGAAGGCAG CCCATGTACA TGAACTTGAA 3240
AAGTTTGCTT TAATCAATTG CTTGTTTTAA TTAATTTGCT CATGGCGATT TGGGTCAGTG 3300
GTCTTTTACC TCAAATCTTT GGGATTAACA ATCCCAAGCT TTGAGGTCTG TTGTTGACGT 3360
ATCTGTAATC CCAGCATTGG GGGGGAAAGA GTCAGGTGGA TCCCTGGATT TGAGCGTCAG 3420
CAGACCAGGC CAAACCAGTG GGTTACAGGT TCAAGGAGAG GCCAGCCCTG TCTGAAAAAA 3480
ACGAAAATGT AATTGAGAAA GACAGCCAGT GCGGGACCAT AATAGCCCAG GGTTACAGAA 3540
AGAGAGTTAA AGGAGCTCCA ACCCCAGACA CCCCAATCAT GAGGACAGCA GAGTTGGCTA 3600
CCTCCCAGCT CCCAACCTGG CACTGTGAAG TCAGCTCCCA CACCATCAAC CCTAGTTGAC 3660
AGTTATCAGG CGTCACTCCT TGTTCAACCT TCTAGCCTTT TGCCCTAGAC CTACAGCTTC 3720
TGAGTCTGTA GATGAAGCAT CTTTCAACAC CCCTGCCCTG GCCAGTGGCG CACAAGCTCA 3780
CAAGTCTTGC CCCAGAGACC CTGGCCACCT CCCCAGGGCA TAAATATCCC CCCCCCCCTA 3840
AACTAAACCA GTTCTGCCAA GCTGTTCCCA GATATGTTTA TTCCCTGTGC ACTTATCGCC 3900
GTCCAAGATC CTGCCTGCAC CCACCCCCAG CTAAGCTTCC GCTACCCCGA GAGGGAAGGA 3960
AACACCCGGC AGCAACCCAA CATCAATCTC TGGCCTCCAT GTGGACTTGC ACACACATGA 4020
AGACACACTC ATGTTCCTCC CCCTTAGAAA TTTCATGAAA CTGTTACCAT CTTAGAGCAT 4080
GCAATTTGGG GCAATCTAAA 4100