EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM085-25076 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Kidney 
Coordinate
chr6:124745100-124746440 
Target genes
Number: 39             
NameEnsembl ID
Clstn3ENSMUSG00000008153
C1rlENSMUSG00000038527
C1raENSMUSG00000055172
C1rbENSMUSG00000092005
C1sENSMUSG00000038521
Gm5077ENSMUSG00000079343
Lpcat3ENSMUSG00000004270
Emg1ENSMUSG00000004268
Phb2ENSMUSG00000004264
snoU89ENSMUSG00000088835
Gm15884ENSMUSG00000087327
Ptpn6ENSMUSG00000004266
Grcc10ENSMUSG00000072772
Atn1ENSMUSG00000004263
Eno2ENSMUSG00000004267
Lrrc23ENSMUSG00000030125
Spsb2ENSMUSG00000038451
Tpi1ENSMUSG00000023456
Usp5ENSMUSG00000038429
Cdca3ENSMUSG00000023505
Leprel2ENSMUSG00000023191
Gpr162ENSMUSG00000038390
Cd4ENSMUSG00000023274
Lag3ENSMUSG00000030124
A230083G16RikENSMUSG00000055818
PtmsENSMUSG00000030122
Mlf2ENSMUSG00000030120
Cops7aENSMUSG00000030127
Zfp384ENSMUSG00000038346
Ing4ENSMUSG00000030330
AcrbpENSMUSG00000072770
Chd4ENSMUSG00000063870
GapdhENSMUSG00000057666
Mrpl51ENSMUSG00000030335
Vamp1ENSMUSG00000030337
LtbrENSMUSG00000030339
Scnn1aENSMUSG00000030340
Tnfrsf1aENSMUSG00000030341
Cd9ENSMUSG00000030342
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr6:124746088-124746106TCTTTCTTCCTTTCTTTC-6.22
GFI1MA0038.2chr6:124745351-124745363TGCTGTGATTGG-6.02
Klf1MA0493.1chr6:124746412-124746423AGCCACACCCT+6.02
LEF1MA0768.1chr6:124745932-124745947AATGATCAAAGGAAA+6.06
ZNF263MA0528.1chr6:124745139-124745160CCCTTCCCCCGCCTCTCCCCC-6.06
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10555chr6:124745597-124747178Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TTCCCTTTCA TCCCATTATC CCCACTTTTG TCCTTTTATC CCTTCCCCCG CCTCTCCCCC 60
AACACAAGAT AGGAAAGAAA GCAGGACATG CCATGCAGGA GCCGAAGTGA ATAAGCAAGC 120
CCACCATTTT GTTCAGCTAT GATGGGTATA CCCAGGAGAT GCACAGACCA AGGGCCTTCA 180
TCCCAGGATT GCTTCTTGCT ACTAATGTGC CTTCTCTATT TGTCCTTTCT ATCTTCCTTA 240
TATATGTAGC ATGCTGTGAT TGGGCATAGG GAGGCCCTCA CTGCCTATTT CCTGCTGTAA 300
TTACTCCCTG GGTGATAGCC CACTCTGTTG GACAAGTTTC CTGCAGATCA ACAAGAAGAT 360
GAACTTTTTT TTTTAAAGAT TTATTTACTA TTATATGTAA GTACACTGAA GCTGTCTTCA 420
GATGCACCAG AAGAGGGCGT CAGATCTCAT TACAGATGGT TGTGAGGCAC CATGTGGTTG 480
CTGGGATTTG AACTCAGGAC CTTCGGAAGA GCAGTCAGTG CTCTTACCCA CTGAGCCATC 540
TCTCCGGCAC CCAAAGATGA ACTTTTAAGC GATAATGCTG TTTAGGGGAA TGATTTTATG 600
GAATTCCTGA TTTTATTTAA GTAGTTCTAG GGAGTTAGTT TGAGTTAAAT AACGTTGGAA 660
AGTTAGGGTG TTGGTAGAAA GTTTAAAGTT AGTTGAAAGT CAGAGTCAAG AATAGAGTGT 720
GCCCCTTCCT CAGTGTTGCA AGGGCTGCAC AGGTTTTTGA AAGAGTACAG TGAGCTTTCA 780
TGCATTACAA GCATTTATTG TACTAGCAAT GAAAACAGGC TCGGGACAAG TTAATGATCA 840
AAGGAAACAT TCATTCTAGG TTGGACTTGA GTTCCAAAAG AGCACATGGG ATCTGAACTG 900
AAGACCATGA AACAAGCACT CTTAACTGCA GAACCATCTG CCAAGCCACC CCCACAACGT 960
GTGCGTGTGC GCTGCCAGCC TTTCTTTTTC TTTCTTCCTT TCTTTCTTTG TTTCTTTCCT 1020
TGTTTGAGAC AATGTTTCTC TGTGTAGCCC TGGTCACACT GGAACTTGCT CTGACCAGCC 1080
TGGCTTCCAA CTCTGACATT TGCTCACCTC TGTAGCCCAA GTGCTGGGAT CAAAGCCTAT 1140
ATTACTCTGC TGCAAGTGAT CTATTTCGGG TTGTTTTCGT TTTGTTTTCA TTAAATTCCT 1200
CTGTTATTCC ATCATATATC TGCATACATA TTTTTAGTGG TTGTAGGCAG ATGTGTACTA 1260
AGGGTGTGTC TGTATGCCAG TCAGAGGGAT TAAAGATGTG TGCTAAGGGC TGAGCCACAC 1320
CCTAACTAGA AACAGGTTCA 1340