EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM085-14728 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Kidney 
Coordinate
chr19:5723940-5725910 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
Banf1ENSMUSG00000024844
Drap1ENSMUSG00000024914
FibpENSMUSG00000024911
Efemp2ENSMUSG00000024909
Mus81ENSMUSG00000024906
Cfl1ENSMUSG00000056201
Ovol1ENSMUSG00000024922
Gm962ENSMUSG00000049562
Rnaseh2cENSMUSG00000024925
Kat5ENSMUSG00000024926
RelaENSMUSG00000024927
Sipa1ENSMUSG00000056917
Pcnxl3ENSMUSG00000054874
Ehbp1l1ENSMUSG00000024937
Gm16538ENSMUSG00000089766
Fam89bENSMUSG00000024939
Sssca1ENSMUSG00000079478
Ltbp3ENSMUSG00000024940
Scyl1ENSMUSG00000024941
Malat1ENSMUSG00000092341
Neat1ENSMUSG00000092274
Frmd8ENSMUSG00000024816
Slc25a45ENSMUSG00000024818
Tigd3ENSMUSG00000044390
Dpf2ENSMUSG00000024826
Cdc42ep2ENSMUSG00000045664
Pola2ENSMUSG00000024833
Syvn1ENSMUSG00000024807
Mrpl49ENSMUSG00000007338
FauENSMUSG00000038274
Znhit2ENSMUSG00000075227
Tm7sf2ENSMUSG00000024799
Arl2ENSMUSG00000024944
Mir192ENSMUSG00000065523
Ehd1ENSMUSG00000024772
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr19:5724924-5724939AGAGGCCAGAGTTCA+6.1
KLF4MA0039.3chr19:5724693-5724704GGAGGGTGTGG-6.32
Klf1MA0493.1chr19:5724695-5724706AGGGTGTGGCC-6.32
SP2MA0516.2chr19:5725503-5725520AAGGGGGAGGGGCTGAA-6.16
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03451chr19:5723829-5729012Bone_Marrow
mSE_06186chr19:5722062-5729978E14.5_Liver
mSE_12449chr19:5723855-5728813Spleen
Enhancer Sequence
AGAGGCAGGA GTGGAGGAGG TGGCTTTGTG TGCAGAGAAG GCTCCAGGTG GAGGAACTAG 60
CCAAGTGCGA GGACCTAAGG GAAGGGGAGA GGCAGAGGTG GACTGACAGT AAATGGGAGG 120
AGTGAGGCCA GAGCAGCACA GGGTCAGCTT GCCATTAGAC ACCACCCACC CACAGAGGTA 180
GGCAGGCTGT GGACAGCCCT TTGCTGCACT CAGTGGCTCT GAGCAGGGTC TGGCAGGGTT 240
CTACTTCCTC AAACCCAGGG CCACTGGCCA CCACTCTAAA GGGATGATGG CAGTGGGCCC 300
CCAGGAAAGT CTGAGGACAC TGCCAGGCAG TGACAGCTAA TCTGAACATC TAACATGCTG 360
CAAAGACTCA GGGGAGGCAA ACGTGTGTGG CAGAGACGTA CAAGGAGAGA GCTGCACAGG 420
GCTGAGCCCT GACAAGGTGC TGACCTCTGC CCAGGGAGGT AGGGTTGGTC AAGGAAAGGA 480
TCAGGCAAAG GCGGTGTGAG AGCATTCCCT GTCTCTTTCC AGCCCCACAA CTGGATGCTT 540
AGGTCTGCTA CCACTCTAGA GGCTGAGTCA GGACAAGTGG CTTACTGTTG TTAACCCTTG 600
AGGTTTCTGA GACACAGAGA TGCCGGCTAG ATAAGGTCAC ACAGCTGAGT CTAGAGTCCT 660
CTGACCCAGA AGTAAGCAAC CATCCCCAGG CTTCAAACCA CAGGCAATGG CCCAGCCAAG 720
CTGTCCCAGA AAAGGGAAAT AGCGGGTGCC TTGGGAGGGT GTGGCCTGGT TGGGTAGCCT 780
GACTCAGGCC GCCACGCCTT CTTGGGAAGC CATGACCTAG GCAGGGGCCA GCTTCCTGTC 840
CTGGCCTCCT GGCTAAGAAA CCCAGCGGGG CCTTACCCAT TTACTTGTGA CTCAGCCCAC 900
TGACACCGTC TGTATAGTCT GTCTGCTCAC CAGAACCATG CCCAGTGTCC CTCTGGCCTC 960
ACCCAGCGTG CTGGGGCAGG AGCCAGAGGC CAGAGTTCAA GTGCTAGCTC TGCTGTGTTA 1020
GCCTAACTAG TTCTTACGCT CCCTTACCCT TTACGGTATA AAGGGCCTCC GGGTACACTC 1080
AGCATGTTCA AGGCTGATGA TTAATGGTGC TACCCCCAAA GACCCCAGCC TCTGCTCCTT 1140
CGCCTCCTTA GACCCCATGG TTCCGGCCTA CCCCAGCTCT TCCCCCTTGG GAGTCTATAT 1200
TTAGCCCTGC CTGGCCTGTG AGGCCCCCAC AGCTGTGCCC TAATCCAGCC AAGGGAAGCT 1260
GACACCGGTG AGCACATATA TTTAGGGTGT GACGCAGGGG CCTGGGCAGC TGCCCGGTGG 1320
GGACATGTGA GCCAGATGCC CCCAGGGGCC CTTGACAGTC CAATACAAGA CCTGTCCTCT 1380
CTTGCAAGTC GTCCCCTCAC CCAACTCTCT TTCCCTCCAC GGACCCTCTC CTGAACCCAC 1440
CAGCTCCTAG GACTTCAGGC CCCTTTAAGC CTCTCCCCGC CTCCCTGTTA TCCATCCAAG 1500
CTCAGTTTCC CCTTTTAAGG ACATTGTGGA GACAGCACCA GCTTCTGGGG CCCACTCTGG 1560
CTGAAGGGGG AGGGGCTGAA AAAGAGAAGG CCACATTTTC ACCCTGAACT GGACTAGGAA 1620
CCATGAAGTC TTTTCCACCC AAAGCCCCCT GGAGCCCTAA AATCTTGTTC CGTTTTCCAC 1680
TGCTACCCTA GACCGCTGTC CTTGGCTTGA GGGCTTCTCC CCGAGTCCTG ACCACAGCCG 1740
ATTTAATGTG GGCCCAGGCT GATTCTCCCA AAGCCACCGA GTCTTGACCC CCACAAGGTT 1800
CTCCACAACA GGAGTCCCCC CAACCTGCCA GGCACTTCAG TGTCTGGAAT ACCTAGGATG 1860
GGAACCCCTT TAGCCTTTAG ACTTGAGAGG ATTTTTTTTC CAGGTTCAAA CGAGTCAAAC 1920
TAAGTTGAGT CCCACATCAG TCTTAGGGGA CTCCCTCAGG CCCCGCTTCT 1970