EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM085-14322 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Kidney 
Coordinate
chr18:65742860-65745710 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr18:65744993-65745011CTTTCCTTCCCTCCCACC-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr18:65745169-65745182TTTAAGTGGATTT-6.39
RREB1MA0073.1chr18:65743859-65743879CCCCCCCCCACCCCCAAACT+7.01
RREB1MA0073.1chr18:65744425-65744445CCCCCCCCCACCCCCCAAGA+7.31
ZNF263MA0528.1chr18:65743115-65743136CCTCTCCCTTCCCCTTGCTCC-6.03
ZNF263MA0528.1chr18:65744419-65744440TCTCCCCCCCCCCCCACCCCC-6.97
ZNF740MA0753.2chr18:65743857-65743870CCCCCCCCCCCAC+6.92
ZNF740MA0753.2chr18:65744423-65744436CCCCCCCCCCCAC+6.92
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02775chr18:65731419-65747323HFSCs
mSE_02983chr18:65724740-65761065TACs
mSE_04047chr18:65738267-65743866Cortex
mSE_04047chr18:65744441-65745333Cortex
mSE_04410chr18:65736777-65745099E14.5_Brain
mSE_05090chr18:65738575-65745485E14.5_Heart
mSE_05535chr18:65738232-65745756E14.5_Limb
mSE_09821chr18:65739228-65745683MEF
mSE_10021chr18:65740595-65749350Embryonic_stem_cells
mSE_10853chr18:65738028-65745272Olfactory_bulb
mSE_12791chr18:65738667-65744423Testis
Enhancer Sequence
CGAGATCTGA ATACCTTCAT TAAATTGCAT GTGCCTGGGT GATTTGGAGG AGCCAGGCCT 60
GGAAAAGCAT GTTTAGAGGG TGGGAGGCGG CTGGGCCTTG TGGAGAAGGC ACTGTTTTTG 120
CATAGATGCA GTCCACATTT CGTGTTTTCA CCACAGTCGT GAGAAAAGGA AGGGCTTCAC 180
CAAATCGAAG CAGGCCAGCC AGCTTTTTAG GGTGTGAGGA GCCTGGAGGT AGAGTCGGCT 240
TTTGTTCATC GTTCACCTCT CCCTTCCCCT TGCTCCCGTG TTGACCTGAA AGGTTTCTCA 300
GGCAAGTGGT GGAATGTCTT TTTATTGATT TCGGGGGCTG TCGACGGAGT GTTCACCATT 360
GGATTATTTG TGGCATACAT TTTAATGTGG GGCTACTAGA AGGACTAAGA GAAACCCAGG 420
TCTCTCTGGT TTCCTCTGTA CAAGAATGGT TGTCAGCTTA TAGCTGTACT GTAGTGGGTG 480
GTGGGAAATG TCTAATGCTT TGCTGCAGTC AGAATTGGGT TGGTTAAAAA AGAAAGAAAG 540
AAAGAAAAAA AAAGAGTAAC CTAGAGCTGG GGAAGAGAGG AGAGGAGAAT GCAAAGGAGG 600
GCAGCAAATT AGTGAAGAAC AAAGGCGGTG GCAGCTTCCA GGAGAACACT AAAACGTTTT 660
GCCTTGGGGT TCCTTGTGCA AAGAACTCCA ACTTCCCCAA ACAGGAAACC AGCCACACCA 720
GTCTGGTCCA GTCTGATCTC AGCAACAGAG CTGGTTCTGC CTTTCTGCTG GTTTTGGTAA 780
AAAAGCACAG TCAAGAGGAG CCCATGGGAG ACCTGATTGC AAATACATTT TCTCCCTTTG 840
AAGTGCGTAT CGGGTTCCTC TCTGGGCTCA GTTGAATAGA CTTATTCAGA AATGCGGAGG 900
ATCTTAGCCT TGGTGGAGTT GTGTGCTGGC AGTCGGTGGG CAGTCTGTCT GCAGTAAAGG 960
GTGTTAAGTA TGCAGGGGTT TTATTGTTGG GATGGTTCCC CCCCCCCCAC CCCCAAACTG 1020
GGCTGCAGAG AGTCGCCTGT GTGCTAGCAT TGGCAAAAAA GGCGGGTGGG GGGGACGACG 1080
ACTAGAGTGC ATGGTTAGCT TGGAATATTT TATAAAGTAT TTAATAGAGA TAAATGCGAT 1140
CTCAGACGGA TATGCCAGCA GAGAGCTTCC AGAACGGGAC AGGTTCTTTG CAAATCAGAC 1200
TGCTACAATT GGTTTTCAGT TCTACCTCAT TTTCGACTGC CAGGGGTGTT CTGCAGATGA 1260
CTGTGGGAGA AATAATGCTT GCGGACCATA CTCGAATCTG TACTCCAAGG GGTGTTGGTC 1320
CCTGAGTTTC TGGTGCCAAC TAAAACTCAG AAGGCTAATG TGATAAACCT TAATTAGCTT 1380
AAGACAATAA GCTGGTCTGT CATTTAGTCC TTCATTCCGG TCTTTCCAGG GGCAGGGGGT 1440
TTTATTTAAC TTTCACAGCT AGCCTCTTGC AGTGACCATT TCTCGAGAAT GTGTTTCGAA 1500
AGCCCTTTTT AGGTACTGTG TGTCGTGGAA TGTTCTGGTC TTGTTGGATT TAGCTTTGTT 1560
CTCCCCCCCC CCCCACCCCC CAAGAAGTCT CTCCCGAAAA TAGCATTTGT TTTACATTTA 1620
GGCCAGTCTT TCCAGCTGCA AATGCCGTTG GAGGCCGGGG AGCTGGTTCT CCCAGGCAGC 1680
AATCATGAGC TCATCTTGGA TTGGAGTTGG CCTCAGGTGT TGATCTCATG CTGGGCTGTA 1740
ACAAGGTAGC AGGCCTGCCT CTCCAGGGAG AGGGACCCAG AAACACAGAG TGTTCTGGAG 1800
AAGAAGCGAG GGCATGCTCC TTCCTGGTAG AGCCAGGAAG GAACACCATG GCTTTCATGT 1860
TAGAGCCACA GCTGGCGCCT GTTCGCTCTT TCCTGAGGCA GTCTCTGAGG AGGACCTTCG 1920
GGCCTTCCCT GTCTGCAGCA GGAATGTGCG GGTTTGGCCA GAGCACACTG GAAAGAAAGT 1980
GTAACTGGGT GGTGAACACT TGCTTGTTTT CATCCTTTGC CTGAAATTGA CTCATATTTT 2040
CCATGTTAAG GAACACTCAA TCCAAGGTTT CTTTCTTTTA CAGCTCGGTC TAACCTGGTT 2100
CAGGGCTTCA TTCTGTGTTC ATAGTATCTC TCACTTTCCT TCCCTCCCAC CCTCTCCTCT 2160
TTTCTCTTAA ACACCCCTAC CCACCTTGGA GTCAGGCCGT CCTCAAACGT CATCCTTCTA 2220
CCTGGCTCTG AGTGCCAAGG TTGCAGGCAT GTGCCACCAT GCCAGCCCAG CTCATTTTTA 2280
AGGACAGACT TGGAAGGAGG TAGATCACAT TTAAGTGGAT TTTTTTTTCT CCCTCTTACA 2340
CTTGCTAGGT TGAGTTACCA TGTTAAGACT TGGTCCCTGC TGCCCTTTCT TTGAAATCCT 2400
TTTGTCAGCC TCTGTGTTGC GTGGATTTTG AGTAACCTCG CCCATGTCAT TGGTTAGAGC 2460
TGAGCCTTAA CTACTGCTGC AGAAGTTACC ATTGGTTAGA GCTGAGCCTT AACTACTGCT 2520
GCAGAAGTTA CCCTAGTGTG GAATTTCTAA AAGGTACAAG GGGCTGAACA GAGAGCTGAA 2580
GGACAGTTGG GGAAACTCCT TCCTCAGCTG CCTCTCCCCA CCCCACCCCG ATCTCCCCCT 2640
CACTTCTCAG ACTGTCAGAA CTAAGAGAGC AGTCCTCACA GGCACAGCAG CCCCGAAGTC 2700
CATATGTTGG TGTTAAGTAT GTTTTAGAGA TCACTAGTCT CAAGGCATGG TTAAAGGGTT 2760
TCAAATGTTT AATTTACACC CAGGGACATA TGGTGGACAG TTGCTTAGGT TCTGACATGT 2820
GTATAGAGCC ACATATAAGT TGATAGAATC 2850