EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM085-06753 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Kidney 
Coordinate
chr12:88157000-88160520 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:88159117-88159135GAAAGAAAGGAGGGAAAG+6.33
Foxd3MA0041.1chr12:88157006-88157018AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157010-88157022AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157014-88157026AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157018-88157030AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157022-88157034AAACAAACAAAC-6.32
MEF2CMA0497.1chr12:88159328-88159343GAGCTAAAAATAACA+6.4
Nr2f6MA0677.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.51
Nr5a2MA0505.1chr12:88159712-88159727GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
PKNOX2MA0783.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.02
PLAG1MA0163.1chr12:88159384-88159398CCCCCCAGGGCCCC-7.03
RXRBMA0855.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.04
RXRGMA0856.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.39
RxraMA0512.2chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.24
SOX10MA0442.2chr12:88157843-88157854AAAACAAAGAC+6.14
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.04
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.18
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.07
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.44
ZNF263MA0528.1chr12:88159110-88159131GAAGAAGGAAAGAAAGGAGGG+6.75
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00507chr12:88151708-88178129pro-B_Cells
mSE_01277chr12:88127683-88178050Th_Cells
mSE_03860chr12:88156238-88159616Cerebellum
mSE_04026chr12:88156887-88158603Cortex
mSE_04392chr12:88155275-88159353E14.5_Brain
mSE_04811chr12:88156930-88160639E14.5_Heart
mSE_05545chr12:88157021-88158215E14.5_Limb
mSE_06635chr12:88156946-88159646Heart
mSE_08022chr12:88156119-88159455Kidney
mSE_10068chr12:88155514-88159197Embryonic_stem_cells
mSE_10703chr12:88155356-88160063Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
ATCTCAAAAC AAACAAACAA ACAAACAAAC AAACAAAAAA CCTGAAGAAA GAAAGAGGTT 60
TATTTTATGA GAGTAAGGTC ACAGCAGCAG CAAAAGGCAG GGTTCGGCTT CTCATCTGCA 120
AAGTGCCCCT TAGAGATGAC TACTGTCAGA GAACACCCCC AACCCAGTTT GCAATCCTTC 180
TTAGAGCCAG AGCTGTGGGG GGTAGGGATG CCACGCCTAG CTGGCTGGGG ATGCTGCATC 240
TCTGTCTGCC ACTGAAGGAC CTAACTGCTA ATCAGCAGCA CTGGTATCCA GGCAACCAGC 300
CTCCCTGGCT TCAGATAAGC AGAAACAGCT GGAGCTGCTG AGGCTGGGAG CCGCAGGGGA 360
GGAAAGGAGC CAGCCTATCC TCGCAGGTTA TTTTGAGCCT GTTACACGCA CTATCCAGAC 420
ATCAGCTTGA GCTAGGGCCG TTCCCCTGGT GTGTCCTTGC CACAGCCTTT GGGGAAGGGT 480
TTCTAGGGCT CAGCCCAGCA GGGAGCTTGG CACACTCGAG GATGGGGTGG GCTGAAGAAC 540
TCCTGGTTTT TCCCTTTCTT GAGCAAGAGA GGGAGGAAAA TTGGTACTAT ATCTAGAGGT 600
AAAAGCTTAA GTCCATCTGG TAAACCACAG TACTTGAACT CAGCCTTTTG GGGCCTCCTG 660
ACCTTAAGGG AAGTCAGGCC AGGCTTGAGT GCATTTTCAT TTATCCTGTA CAACCTCTTA 720
GGAGCACTCC AGGAGGGCAG TGGCCATTGA GCAAAGGGCT AGGTCAGACA AGCTAGGTCT 780
GGATCTGTCA GGCTCTGTTC TTTTAGGTTT GGCCTTTCCT CTCTGACTCG GGTTCCGTTG 840
CACAAAACAA AGACAAACCC CACCTGCAGA GTGGATGCTG GAAACTGAGG AAGTGGCATG 900
TGGCCTAGCC AGCAGGGTGC CTGGCACAAG GGATGCTGAG GTGGCTCTCC CCTGCCAAGT 960
TGCTGGGCCT GCCCTGCCAG CCTGAACCTC TCTCCCACAC AGGAGCATAT CCGTCCCTCC 1020
ACCCCTCTCT CACCCCGGGC TATTTCTGTC TCCCTCTCTA AAGGTCAATG CCTTTCCCGG 1080
GATATGGCAG CTGTCACCTT TTTTTCCTTC TAAGTGACCT TGGCTCCATG CCCAGGGGCA 1140
AGAGGTTGTC CGGATGATGT TCCCCACCCC GTCCTCTACC ACATCTGGCC TGGGCATGCC 1200
CACACTACAG TACACAGGGC CCTCAGGTCA TTTCTGGGTC TGGTGTGTGT GTGTGTCCAG 1260
CTCTGGACTG ACACACTGGC CACACCAGCA GCCAGAATCC TCCTATTGTC CCCTCAAGTG 1320
TGGGACAACT GGGGTGTGTG CTGACGGCTT GTTCCAGTGC TCAGCCGGCT TGAAGGAGAG 1380
CACAGGACGA GGCAGCCTGG CTCCCTGAGA AAGTCCTCAC GAGAATATCA AAGCAGTGCT 1440
GCCCTCCACC AGCTTGGCAT CTGTGCCCTT GAGATCTAAG TCTTTGACTG GGAACAGGAG 1500
GTAATTGCCC CTCACTTTTA ACATTAGAGC AGATCTTTTG GAGTGGTATA GGAAGAAAAG 1560
CAGCAGATGA TAGCTCCTTA TCATCCCAGA GTAGAACCTT CCAGATCTAA GTCAGCCCTC 1620
TGAGAAGGAA ATGGCTTCTT CCAAGTGACC TACAAAGACC TCTGGAGACT CAGGGCCCCT 1680
TAGTACCCTT GGCGCTGTTG CCATGTGACT GACCGTAGGT AGACCTGTCT GATTCTTATT 1740
CAACAGTGTT CCAGCATCAG GAAAGTTCCC TATTTCTGTG TTGCTCTCAA CTTCATAGAG 1800
GAAAGGGCAG ACTCCAAGCT GATTATGTTC AATCTTGTGG TTCCTGCTGT TCAAGAGAGC 1860
TACGGTGTGT TCTGAGGTGC TGGAAGGACA ATGGGGGAAT CCTGGCTAAA CAGTGAAGGG 1920
CCTGCGCTGG ACAGCACAAC TGAATGGGAG CCAAGGTTTC CCAGAGCCGG GCGTCTCCAT 1980
TTCACCAACT AAAAATCAGA AGGGAAGGAG AGGACCCTGG TGTGGTGTAT AGCCCGCAAA 2040
TCTACTGTTC TGAGGGCTGA GGCAGGAGGA TCCTGAAAGT CTGTCTCCAA AAAAGAAAAG 2100
AAAGGTAAAA GAAGAAGGAA AGAAAGGAGG GAAAGCCAAC CCTTGATCAA TGGATGGTAG 2160
AGAGGGGGAG GGAGGACCCA CCCCAGCTGG TCTCTTGTCT CTCCCATCTT TCCCCCATAT 2220
GACACCCTCA GGTCCCCTGC TCTCTCCCCT GATACTGACT TGCCAGAGGG AATCAGGACT 2280
CCAAAGCAAG ATAAGCAGAA GGGAAGGGGG CTCAGGAGAC ACATTCCAGA GCTAAAAATA 2340
ACAGGGTCAG CTGGCAGGCT GGCAGCCTCA GCCTTCCTCG GGGTCCCCCC AGGGCCCCAG 2400
CCAGTCTCCT CCTCTCTCCC AGCTCTCTGC TGGGCCCCAA TCTGGGAAGC CTGGACTGCA 2460
TCTGCTGAGA CAAGGCCAGC ATCTCCTCCC GACTCTATCT CAGCTAGAGA AGGTAGAGGA 2520
GCCACCCTGG CAAGGCTCCC TCCTCCACCT CATCTAACAC TCTCCCCAGC TCATCATCTT 2580
AACCTTTGAC CTACATTCTC TTAATGTTAT CACAAAATGC AAAATTTTTG GTCCACTAGG 2640
CAAAGGCTGT TTGGGTCATT AAAGAAGAGT TCTCCTTTGA AACATACCCT ACACTCACAC 2700
CTGCAGGAAT GGGAGTTCAA GGCCAGCCTG TGCTACACAT ACCTGTCAAA CTTAAGGCCT 2760
GAGATCATGT CTCACTACAA CAGGAGCAAG AGCTCCACAC AGGCAACAGA AAGCATGCCT 2820
AACTGGTTGA CGTGCCTGTT AACTCCTGTG ACACTGTGTC TCCCACATCT GTGTACAGCG 2880
CCATTCACTC AGACTCTGAC AGGTCTGTCC TCGTAGGCTC TATGGTGAGT TGGGGGTTTT 2940
CTTTGACAGT GTGGGCACTG TATTATCTAT CATGCATGCT GGGACCCTTC ACCTTGAAAC 3000
CTGAAGTCTG TGACTCTCCC CTCCCTACCC CAGCCCACAA ACGGTCCTTG AGAACCAATC 3060
CCCCCCCCAC GGTCTAAATT CCCCACCACT CACTTCCTCC CACTTGTTCT CTACTTCCAG 3120
AGACCTTCCT GTAGCCACCT CACTCCTACC CAAGCCAGAG TATTGCCACA TCCTGTCAGT 3180
CCCCTAGACA AACTTCACAA TGGTTATACA AACTCCATCC TGAGCTGAAA AGCCCTTCAG 3240
TGACTGGACC GGCCTTGCCC AGTCCCCTGA TAGCAGCCTG CCAAACCTCT TCCTCTTGCC 3300
TCAAGACCTC CGCACTTGAG GTTCCCTGTT GTGGTTTGAA TGGGAAAGTC CCCACAGGCT 3360
CATCTGTTCG AAGACTTGGT CATCAGGGAC TGGTACTATG ATGAGATATG GCCCTGTTGT 3420
TGGAAATGTG TCACTAGAGG GTGGGTTCTG CAATCTCAGA TGCTCAAACC ACGCCCAGTG 3480
TGGTACTCTC TTCCTACTTC CTACGGATCC AGATGTAGAA 3520