EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM085-02660 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Kidney 
Coordinate
chr10:79302860-79304630 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
Ppap2cENSMUSG00000052151
Mier2ENSMUSG00000091854
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
GzmmENSMUSG00000054206
BsgENSMUSG00000023175
Hcn2ENSMUSG00000020331
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
9130017N09RikENSMUSG00000035852
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
CfdENSMUSG00000061780
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
Mbd3ENSMUSG00000035478
Scamp4ENSMUSG00000078441
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr10:79302979-79302989GCACGTGACC-6.02
CDX2MA0465.1chr10:79304076-79304087TTTTATGGCCT-6.02
ESR1MA0112.3chr10:79303976-79303993GAGGTCACCACGACCCC+6.19
ESR2MA0258.2chr10:79303977-79303992AGGTCACCACGACCC+6.28
Foxq1MA0040.1chr10:79303879-79303890AATAAACAATG-6.02
SP2MA0516.2chr10:79303735-79303752AAGTGGGAGGGACTTTG-6.34
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04504chr10:79303153-79304081E14.5_Brain
mSE_04845chr10:79302976-79304654E14.5_Heart
mSE_05508chr10:79302762-79304677E14.5_Limb
mSE_07352chr10:79302988-79304675Intestine
mSE_08114chr10:79302803-79304677Kidney
mSE_09089chr10:79302817-79304681Lung
mSE_09812chr10:79302961-79304656MEF
mSE_10291chr10:79302623-79304692Embryonic_stem_cells
mSE_11035chr10:79302942-79304508Olfactory_bulb
mSE_11888chr10:79303090-79304641Placenta
mSE_12235chr10:79303866-79304386Spleen
Enhancer Sequence
CTTCCACTGT GTCGCCCAGT AGGGCCTCAA ATTCCTGATG CTCCCGCCTG GCTATGGCTT 60
GGCTACCAGG AGTGACCCAC TGGGTTCCAT CTCCTGCACC ACACAAACAG AACTTGGTGG 120
CACGTGACCA TCATCTCAGC AATCAGGAAA TAGAGGCAGA AGGACCAGGT CATCTTCAGC 180
TACATGTCCA GTTTGAGCTA GCCTTGGCTA CATGAGACCA TGTTCAAAAA GGCAAAAATC 240
AATGCAGGCA GCAGGCACCC TGCATAGCCC TTCCTTGCCC TGTAGTCCTT CAAGCTTGGC 300
AATGTCTAAG GAGCCACTAG GGCATCACCA GAGACAGATG GGAGATCACA TCTAAACCTC 360
CAAACTCAGA AAATTGGGCC AAAGACATCC CTAGCAGGTT TTTCCAGCCC TCAGAGGCAG 420
TAACGTGCAC CTGAATTGCT TGAACTTGCT GGAATTTCTT CCATGGTACA GCAAGCAGAC 480
TCATGGCTGT GTGGGACGTA GACAGGAGGA GTGTAAAGGG GGACAGGGAT GTTGAGGGAT 540
ATGCTAGTGT TTGGATACTG GGTTCCAGCC CAGCCTGTAG GTGGCAGGAA CCCCTTCTTC 600
CTACCTTGAT GCTCTCTGGT GGTATAGCCC CTGCCTAGAA CCCACACAGC GAAGGGCTGG 660
AGGTGTGACC ACAAGGATCC TAAGGACCCT CCCTGCCTAG AATCCTCCAG TTAGAGCCCT 720
GTGTGTGCTC AGGGGTGGAG CCCTGCCTAG AACCCCGCAG TGAGAGGCTG GGAGCAGACT 780
CAGTCCTTAG CTCGACTCTA GCCAAGTACG CAGCTCGGGG TTTATGATAA TATATGGAAG 840
AGTGGAAGAA AATCACCCGC TGTGGAAGTC TGAGGAAGTG GGAGGGACTT TGCCGCGGAA 900
TGTCTGTGCC CACGCCTGGG CTGTAGTGGT AGTCTAACTC CTCACACCCC ATCCCCCAGG 960
CTCCTTCCAA GTCCAGACAG AGAAAGGAAT TCCTGGCTGA GTCTAATTTA AAACAAACAA 1020
ATAAACAATG TTTGCAGGGA GGAGAATGAG AGGAATGCGG GCGGGGCTCT TCCCTGCGGG 1080
AGAACCGGAG AACTGGGGCC TCGGACTGCA AGAACAGAGG TCACCACGAC CCCAGCAAAC 1140
TCCCACCCCA TCTCTGCAAA GAGCTGGAAA GCACTGTTAA GCCCACCCCG ACCGGCCTTC 1200
CAGGGTTATT CTGTTGTTTT ATGGCCTTTT TGCTCCGCTG GCTGCAAATT GGGGGAGGGG 1260
AGAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAACACGGG AGGCGGGGTA ACGACAGATT CCGGATCCCT 1320
GGTCCCGGAA ACCTTTGTTT CTTAAGGCTG GGCAGCTGCT CCTCAGAGAC AGTTAGGGCT 1380
CTGGACTTGG AGCACCGGTC AGTGTTTTTA CTTCAAGGAA AGCTCTAACC TAGAGCAAGA 1440
GCCCAAAATT TCTCAGGTAG TTTGAAAAAC AGTGAGGTGG TTTTGTGTGT GTGTGTGTGT 1500
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTCT TTCTGAGGTG GTTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1560
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTTTCTT TCTTAGTACT TGGTAAGCTG 1620
AAGCAGGAGG ATTGCGGCAA TTTTAATGAC AACTGGGCTA CATGAGACCT TGATTGTCTC 1680
CAAACATTGT TGGTGCCCAC CTGTCATGCC AGCATTCAGG AGGTGGAGGC AGGCGGATCA 1740
AATGCAAAAG ACTATCCTGG GCTATGTGAG 1770