EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM085-01059 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Kidney 
Coordinate
chr1:134284170-134286470 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:134286152-134286171CAGCCAGCAGAGGGAGGTC+6.3
IRF1MA0050.2chr1:134285502-134285523AAAATGAAAGCAAAAGCAAGC-6.8
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:134284846-134284857CTTGAGTGGTT-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:134286165-134286180GAGGTCGAAAGGTCA+6.92
RARAMA0729.1chr1:134286165-134286183GAGGTCGAAAGGTCACCC+6.12
RarbMA0857.1chr1:134286164-134286180GGAGGTCGAAAGGTCA+6.82
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03609chr1:134284362-134285638Bone_Marrow
mSE_03609chr1:134285724-134288828Bone_Marrow
mSE_04094chr1:134284087-134288215Cortex
mSE_06071chr1:134283900-134288225E14.5_Liver
mSE_06983chr1:134283941-134288817Heart
mSE_08541chr1:134284063-134288148Liver
mSE_09006chr1:134283971-134288852Lung
mSE_11086chr1:134284178-134287026Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
AACAGACTAA CACAAACCTA CCCTCTTGCC AATAGACTGA ATGGGGAAGT AACAGGAGCT 60
ATTCGCAGGA TGCTGAAACA CCCTCAAACA CCGGACCAGG AAAACCACCT AGGGTTCAGC 120
TCTAATTTCC CTTGGTGTCT GTTGTCTTCC CTGATCCTCA CTCAGTAGGA AGAGAGAACA 180
GAATAAGCTA TGAACAGAGG AACAGGATCT GAGCCTTGAG TCAAGAGCGC TTCCAACAAC 240
ACAGGAACAA CATGAAGGTG GAACTCTCCT ATCTTCTTTA AGGAGTGATG ATGATGCTGT 300
TCAGAAATCC CAGAGGACAG AGCACCTCTG GGAACTTTCC CTGGCCAGCA TCCTCTGGCT 360
TTTCCTCTCA GAAAAGGCTC TGTTCCTGCA CGGAGCGGTG GGATTGGAGT GGTGGAGGGT 420
GGGCAATGCC TTCAGGAAGA GCTGCACACT ACGCTCAGCC ATTCTCCCAG GCCTCAGCCA 480
CAGGCTGTAT TCTAAACAGG ATCTCTGTGT GCGGAGTTCC CCTAAGCTCC TCCCCACCCC 540
TTCTCACTAC AGCCAGTCTC CTCACTAGAG AATTCTGTTA CACTTTAGGT CAGCCAGCCA 600
GTCTCTCCTC AACAAGCAAG GACTCTGGAT AGCAGCAAAG GATGGAATCA TGAGACCAAG 660
TGAATGGAGA TGTGAGCTTG AGTGGTTAAA GGAATCCATT TTAACTATCA GGCTCCCCTT 720
ACATACTGTC TGCTGAGATC TTTCCCCCTG GAGGATTCAT GCTTATCTGA AGCTCTGGCA 780
AAGCCTCAGA AGTGTTTACA GAAGCCTCCT GTGGGGCCGG GCCCATTCGC AGGTTGCTTT 840
TCTGTTATAG TTACCATTTT AAAATGTTAC TATGTAACTA TTTTCCAGAC CCCCACCCCC 900
ACCCCCTAAC CACATAATCA CAGATTCCAA GCTACCACAG AAGAAATTTA CGGTGATAGA 960
GGGCTTGTCT AGTATGCTCA AGACGCTGGT TATGATCTCA GGACATCCAC CCCTACCCCA 1020
ACCTCCACAC AAAATAAGCC AAGAAATGCA CATCGTGCAG TATGATCATC CTTGAAGGAC 1080
CAGAGATAGC CGAAGCCCCT GACACTGCTG AGCATCACTA GCCGGGCATC ATTCAGATCT 1140
CTAGCAAAGA CCAGATTCTC CTCTTTCTCT CCTGCTATGG AGGTGCTTTA GACAGAGCTT 1200
TCCATGCCTT CGCTCCTTGC TCAACAATCA AGATGACTGT CTCCATTGAC ACACAATCAG 1260
TCCCCATGCC TGGAGCTGTC ACAAGAAAAT AGAAGTGGGA CTAAGGGACT GAAAGTTCCT 1320
ATCTCCAAGT TCAAAATGAA AGCAAAAGCA AGCCAGAGCT CCTGAACAGC ATCAACTAAA 1380
CACAGGCACG GGAAAGGCAT TCCAGATTAA AAAGCAAACG CATTTCCTCT TGGTATCATT 1440
GTCAAATTCA GAACAAGTCA GCCCCCACCC AGTTCCAGAG ACAATGATGA AATTTTTCCA 1500
CTAAACTGTC AGCCATGGGA AACTTGTCCA GCACTGGAAA ACAAGTTTAG CCACACTCCA 1560
ATATCCCTTG TTCCTTTCTT CAGAAAAGTT AAGTGACATG TCACATTTTG GTAGCCCTGA 1620
GTCACATCTG GTAGAGAGGT CTCTGTCCTG CAGTAAACAT GTTGTGATGA GACAGACAGA 1680
GATAAACAGG CAAGTGCTCT GTGAGTCTCC CCGTGCTTGC ATAAGCTTGG ATCCACACTG 1740
CCTGGGCTAT ATAGAAGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTAAGG 1800
GTCCTCAATT CTCAATTCCT CCTCAGGACG GCTCAGCGGT TAACATATTG TAGTCAAGTG 1860
CAGTGCTATC GCTCTATCTG CCCCTGTTCA AAATGAATGT CATCAAAAAA GATGACACAG 1920
GAGGGTACAG ACAAGGAGCC TTGGGCAGCT TTATAGACAC AGAAACTACA GCCCCCTTAG 1980
CACAGCCAGC AGAGGGAGGT CGAAAGGTCA CCCCCTGTTC CTCTCGGCAG CATTAAAGGG 2040
ACTTACCATC TCAGTTAAAA CAAAAAACAT GTCACTTGGG GGAGGGAGTG ACACTTCTTG 2100
GAGCCTGAGG GAATCACAAG CTTTGTGAAG AAAGCCTAGG TGTTCAACTA GTCCATCATT 2160
ACACATAAGG TGGGTGGAAA GAGGTCAGGT TTGCAAAACT TCCACAAAAA TTTAAAAGTC 2220
CCACAAGGAG TGAGTGGGCT CTCTTCCCCA AGGGACAACA CACACACACA CACACACACA 2280
CACACACATA AAGCACACAT 2300