EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM084-10377 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
IPSC 
Coordinate
chr3:60302420-60305100 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
TAACATATGA TTAGATAGTT TGTTTTTTTT TTTCTCCTAG TGGTTCAAAC TTTTCAATAA 60
TAACAGGTTA GGCTTACTGA TGGCAACATT GTTTCAGGCC TTACTTTATT TTGGCTCACG 120
TCTAAGGTTT AGATTGGCTT GGATGCCTTG TCATGGCTTT CTTTTTCTCT TTATCTCTGT 180
AAAATAACAT TTTCCTTTGA TTTGCTCTTT CCTAGACTAT TGTATTGTTT CTAACATTCA 240
GGTGCCTTTC TTGTATTCCT TTTTTGTTCT ATTTGATGGA GCAGAAAATT TGAGTTTGTT 300
TCGATTTTTC TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT GATAGTTTCC 360
CCTCTTGTAC TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC 420
AAATTTTCTA GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC CAAAAAACCC 480
AAAACCAAAA AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA CTGTAAATTA 540
ATCCTTCAAA CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG 600
GTGCAAAGGT AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA 660
CTGAAAACAA GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC 720
AAGGCCCATC CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT 780
TACCCTTCCT TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA 840
AGATCTTTCT AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT 900
CATAGTTTGC TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC 960
CTTTTAAAGA AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC 1020
TTCTTGCACG TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC 1080
TGTGCCTATG ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT 1140
TACCTTCCAT CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT 1200
TAACTGGCTA ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA 1260
CAGACACTTG CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT 1320
CTTTACGCAG GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT 1380
TAGCAACTTC TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC 1440
CTCCTTTTCT CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG 1500
CTCTTTTCTA CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA 1560
CCTCCATCCT ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG 1620
AATGAATGCT GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC 1680
TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT 1740
TGGGAACTTT TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG 1800
GAAGGGATCA GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT 1860
ACTAGTACCT CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC 1920
TAGGAGAGTG TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC 1980
ACTCACCTCA ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC 2040
TGACGAAGTT ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC 2100
TTTATCTCTT CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG 2160
CTAATGAACT AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT 2220
GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC 2280
TTGCTTTCTG TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT 2340
TATTTGCCGA TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT 2400
CGCAGAACTC CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC 2460
TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG 2520
GCAGCTAACT CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC 2580
GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG 2640
GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2680