EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM084-02384 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
IPSC 
Coordinate
chr11:55220780-55223420 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:55220915-55220933TCCTCCTTCCTTCCTTTA-6.2
Nr5a2MA0505.1chr11:55221281-55221296GCTGACCTTGAACTT-9.03
RARA(var.2)MA0730.1chr11:55223022-55223039AGGTCAAGAAGAGGCCA+6.29
RELAMA0107.1chr11:55221932-55221942GGAAATTCCC-6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr11:55223022-55223039AGGTCAAGAAGAGGCCA+6.34
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_06706chr11:55218423-55221503Heart
mSE_06706chr11:55222954-55226439Heart
mSE_09187chr11:55217792-55221108Lung
mSE_09431chr11:55217797-55221262MEF
mSE_09431chr11:55221707-55222754MEF
mSE_09431chr11:55222964-55231758MEF
mSE_11217chr11:55217645-55221617Placenta
mSE_11217chr11:55221688-55222781Placenta
mSE_11217chr11:55222882-55234360Placenta
Enhancer Sequence
GCTGGAAAAG AGAGCAAGGT TCAGGGAGTT AGTCAAGGCC AAGGCCACCC TCTTCTCGGA 60
AGTGTCTCTG GCTGGGAACA CAAGCCTGGA GTGAAGGCTT TGATGCCTCT GGCTGGAGCT 120
CACAGTGCCG CTCCATCCTC CTTCCTTCCT TTAAAAAAAA AAATCTGTTA TCACAATGAT 180
TTTATTTGTG TGTGTGAGTT TTATGTGGGG GATGGAGTGA GCACCCACAG CACAAAGAAT 240
GTGTGGAAGC TGAAGGAGCT TGTGGAAGCC GGTTCTCTCC TGCGGTGTGG GTCCTCAGAT 300
CGTCAGGATT GGCTGCCAAC CCATCTTGCT GGCCCCATCT TTATTTCTTT TTTTTTAAAA 360
AAAAGTACAG AATGCTTCAT GTGGCACTAT GGCCGTGCCA GTCTTCTCGG TATCATACAA 420
GTTTCAATCA GTCTATTGCT GAAGCAAGCT TGCGTTTTAT TATTTCCTTT CATTTTGACA 480
AGGTTTCGCT ACAGAGCCCA GGCTGACCTT GAACTTGCCA ATTATGTTTT AGCTTTCTAA 540
GAACTGGGAT CACAGGCTTG AGCCATCACA CTTGACTTTT ATAGATCTTC CACCAAACCA 600
TCTTGCCTAT TCCTCATTTT ACTGACAGAA ACATTTCTGC TAGTCAAGCC TCAATACGTC 660
CCCAACACAA CAGAAGCAGA TTGTGGTGGT TTGAATATGC TTGGCCCATG AAGTGGCACT 720
ATTAGGAGGT ATGGCTTTGT TGAGTAGGTG TGGTCATGTT GGAGGAAGTG TGTCATTGTG 780
GGCATGGGCT TTAAGACCCT TGTACTAGGT GCCTGGAAGC TAGTCTTCTC CTAGCAGCCT 840
TCAGATGAAG ATGTAGAACT CTCAGCTTCC CCTGCACCAT GCCTCCCTGG AAGGCACCAT 900
GCTCCCGCCT TAATGATAAT GGACTGAATC TCTGAACCTG TCAACCACCC TCAATGAAAC 960
GTTGTCCTTA TAAGAGTTGC CTTGGTCATG GTGTCTGTTC ACAGCTGTAA AACCCTAACG 1020
AAGACACAGA TGAACTCCCT TTAATTCACA GATGGAGAAA ATGAGACCCA GACAGAATGA 1080
ATACCCTCTG TGACTTCTAA TAAATGCCAA TCCTCCCTGC CTCTCACATG TGACCTCATT 1140
TTATTGCAAT TAGGAAATTC CCTCCTGATA TTTCAGGCTC CGAGAAGAGC AGGTCTGGTA 1200
ACAAGACATT TTCAGGCCCC TGATTGACTG TAACCCCTTC CAAAGTTAAA GGTAACCTCA 1260
CCAATCTTCA GCCAAGATCC AAAATCTGCC TGGCTGATGA GTTTGACCAG AAGCTGCCAT 1320
CTACCTGCTA GTGAACAGAG CAGGGAATGG CAGTTTGAAA TGTAGCTAAC CAGGAGTGCT 1380
GGCACAGGTA ACCCCAGCCA TTGGGAGGCT GAAGCAGAGG TAGGGGGTAG TTAGAGGCAA 1440
GCCAGAATAT ATAGTGAGAC CATGGAGGGG GGCGGGAGGC CAGGACCTCA TTTGGTGGGA 1500
TTGGCTCTCT TTGAATGTTT CCAGTTTCTT TCTTCTTGCT CCACATTCCC AAGATGGAGT 1560
AAAGGTCGTT TCTGGTTCAT CCCAATGGTA ACCCCTCCCT CTCCCTGCCC AGCTCCAGTC 1620
TTACTCCAAG ATCCTACTGT GCTGCCCTAT GTATCCCTGG TCTCCAACAG CCTCCAAAGC 1680
CACGATCTCT GTCTGCATCT TTTCTACCCC CAGAATTCAG CCAGAGTCAG TTACTTACCA 1740
TCTAACTTCC CAGACTCAGA CGCCAACCTG TTCCTTTCTC TGGACCTAGG TCCTTCTGCC 1800
AGCTTCATTC CCACCAACAG TCCCTCATCC CTGTTGCTGA CTCCCTCCCT GAAGAGGACA 1860
GGTCCTGCTA AACGCACCGG AACTAGTGTG CAAGCTCGGA GCTTTACAGA GAGCTGCTTC 1920
CCTCATTTCA ATTCTCCTAA CCTTGTTGGC TTAAAAAAAA AAAGACAACT TATTTTTAAC 1980
TTTTTTAAAG ATTTATTAAT TATTATATCT AAGTATACTG TAGCTGTCTT CAGATGCACC 2040
AAAAGAGGGT GTCAGATCTC ATTATGGATG GTTGTGAGCC ACCATGTGGT TGCTGGGATT 2100
TGAACTCAGG GCCTTCAAAA GAGCAATCTG TGCTCTTAAG CCCTGAGCCA TCTCTTCAGC 2160
CCAAGATTTA TTTATTTTAT GTATATAAGT GTTTTGCCTG CATGTATGTC TGTACACTAT 2220
ATACATGCCT GGTACCCATA AGAGGTCAAG AAGAGGCCAT CAGATCCCCT GGTTGTAAGC 2280
CACCATTTGG GTTCTGGGGA TTGAACTTGA GTCTTCTGCA CATGCTCTTA ACCACTGCAC 2340
AGGCTCCTTT TTTAAAGACA GGATCTCATG TAGCCCAGGC TGCCCTCAAA CTCACTACCT 2400
ACCCAAAGAT GAACTTAAAC TCTGGATATT CCTACCTCTA CCTCCCAAAC GCTGGGATTG 2460
TAGGTTTGTT CCCTAAAGCT GGGTTTATGC GATGCCGGGG ATTGAACCCA GGACTTTGTA 2520
CACGAGTGCT AATTAAGCAC TCCACCCACT GAGCGACATC CCTGCTGTCT CCTTGAGCTC 2580
CCAGAGCAGG TTGAGAAGCT GGAGAAAGCG GGATGAGTTA GAACTCTGAC AGCATCTTCG 2640