EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM084-01391 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
IPSC 
Coordinate
chr10:79486300-79487400 
Target genes
Number: 34             
NameEnsembl ID
Cdc34ENSMUSG00000020307
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
PalmENSMUSG00000035863
Ptbp1ENSMUSG00000006498
BC005764ENSMUSG00000035835
Med16ENSMUSG00000013833
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Dazap1ENSMUSG00000069565
Rps15ENSMUSG00000063457
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Adamtsl5ENSMUSG00000043822
Uqcr11ENSMUSG00000020163
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr10:79486944-79486956GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr10:79486948-79486960GTTTGTTTGTTT+6.32
Nr5a2MA0505.1chr10:79486861-79486876GCAGGCCTTGAACTC-6.33
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03444chr10:79486330-79488004Bone_Marrow
mSE_10175chr10:79486736-79488511Embryonic_stem_cells
mSE_11976chr10:79485496-79488883Spleen
Enhancer Sequence
ACCTTGTCTA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAGCCAGT AGAGTTTTCA GATATTGTTT 60
ACAGTTGTTT GCTTAGTGGG TGGGTGGGGA TGGAAATGCC ACAGCGTTAT CGGGAGGTCA 120
GAGAACAGCT GGTGGAGGTG AGTTCTCTCC TTCCACCATG CGGGCGCAGG GATTGGATTG 180
AGGTCCTTCG GCTTGGGGAC AAGTGCCTCT ACCCACCCAG ACAGTGGTTC TCAGGCTTCC 240
TATTCCTAAT GCAGCCTGCG ACCCTATAAT AAATACAGCA CATGTTGTGC TGGCCCACAG 300
CCATGAATTT GATGTGTTGC TGCTTCATAA CTAATTTTGC TACTGTTATG AATCATGATA 360
TCTGATATGC TGCTCCCCGA CCTAAAGGGG TCGTGACCCA CAGGTTGAGA ACCGCTGTGC 420
TGGCAGCAGC AGCTCCTAGC TTTGCTGTGA GGACTATCTG TCTGTCTGTC TGCCTGTCTG 480
TCTGTCTATT TGTATTTTGG GTTTTTCGGG GCAACATCTC TGTGTAGTCC TGGTTGTCCT 540
GGAACTTGCT CTGTAGACCT GGCAGGCCTT GAACTCCCAG AGATCCACCT GCCTCTGCCT 600
TCCTAGTGCT GGGATTAAAG GTGTGCACCA CTGCCTGGCT TGAGGTTTGT TTGTTTGTTT 660
TGAGAATCCA GGCTTAATGT GAGCTCTTCC TCTGAGACCC TGGAGTATCC CCTACAGTCC 720
CTATTCTTCA TGTCTAGGTT CTGACTTTCA GACTGTGGGG TGTGGGCTCT CCCCACCCAG 780
ACCAGTTACT TTGTGACTCA GTGCTTCCTG TCACCCCAGG GTGCTAGGCT TCCTGCCTGG 840
GCGGCTCTCT GTTTTCATCT GTAAGACAGG AAGTGAAACT TACCGAGACC AGGCATGGGG 900
AGAGGGGAGA TGTGTTTCAG TTTGTGTTTT TTGTTCAGCT CTGAGTCGTG CCTCAGTTTC 960
CCCGTGGGGT CCTACTGCAG ATGCTGCCAG TGTGTGCTGT CAATGGTCCC CTGCTGGCTT 1020
GCTGGGAATG TGGGGTCCTT GCTGGTGAGG AGGGAGGGTG TGCAGAGCCA GGGTGAGGCA 1080
CAAGCTGGAT CCTCTCTCCT 1100