EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM084-00611 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
IPSC 
Coordinate
chr1:135993900-135997810 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr1:135994647-135994664GTGTTTGTTTATTTGTG-6.51
Nr5a2MA0505.1chr1:135994842-135994857ACTGGCCTTGAACTC-7.4
TCF3MA0522.2chr1:135996587-135996597AACACCTGCT+6.02
TP53MA0106.3chr1:135997691-135997709AACAAGCCCGGGCTTGAT+6.14
TP53MA0106.3chr1:135997691-135997709AACAAGCCCGGGCTTGAT-6.28
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01169chr1:135945308-136008057Th_Cells
mSE_02680chr1:135989644-136013255HFSCs
mSE_03412chr1:135994137-135996732Bone_Marrow
mSE_04347chr1:135994484-135996722Cortex
mSE_04817chr1:135994315-135997432E14.5_Heart
mSE_06037chr1:135992860-135996988E14.5_Liver
mSE_06619chr1:135992060-135997265Heart
mSE_07309chr1:135988354-135997070Intestine
mSE_08945chr1:135988492-135997234Lung
mSE_09588chr1:135994199-135999076MEF
mSE_11210chr1:135993564-135997433Placenta
mSE_11929chr1:135993665-135996950Spleen
Enhancer Sequence
CAGGGTCAAT CCATGGGTAA TATTTGGGGC AGACATGGTA TAGGGAAAGG GCTGGCCATG 60
TCAGAATTGG CTCCTTTTCC CTCTTCAATG ATGTCTTATC CCTGCCCTCC TGGAATCAAG 120
GAAGTTCATG ACAAGATTGC TAGAACTCAA GTTAGTAGAG CCCAGTATAA ACACAGCCTG 180
TTACACAAAC ACTTCAGGTA CTCAGAGGCC TGGAATTCAT AAACATACCT GGATCCAAGT 240
ACATTCTGAA CTGACTCTAG AAGCGGGAGT CAGTGAGTCC TGTATCCTTG CCCACTGGTA 300
CCTACTGGAT AATACTGTCC TACCCTGCCA TGGGGAACAG ACAGTCAGCC CACCCACCCC 360
AGCTCTCCAG CATGAAGCCA GAAGTCAAGT GCCTCTGGAA CTCCCTGGCT GTGCCACCAT 420
CTTGCTGGGC CCCGGTCTCC CTCACTGTAA ACTGGGATTG TTGGCTGACC ATGAGTTAAG 480
ATACCCAGAT AGCTTGATAA TTTTCTTTGT ACCTTGTGCT CCCAACGCCC TCCATCCTCT 540
GCCACTTGCG TTCGCTTGGC TGGCCTTGTG TACATCCTAT TAAAGGCCTT TTGTTATGTT 600
TTTTTCCTCA CTCCCCAAAC AACTAGTAGT ACACACTAGG CAGGTACTGG AGAAATCTGC 660
AGTGGCCACA GAGTAGTAGA GAGGACCCGC AGGCCAACAA CTGATAAAAA TCAAGATCTC 720
GGGGGAGGAG GGCAGGTTTT GAAGTTTGTG TTTGTTTATT TGTGACTCAG GCTAGCCTAG 780
GCTGGTCAGG AATTCACACT TAACCCAGTA ACTCCTTGTG GGTTTGAACC TTGCGCAGTA 840
CTTCTACCTC CGCTTCCTGA ACGCGGAGGC TGCAGGCTCC AAACACCACA AGCTGCTCCC 900
ACTGTCCTTC CTTCCTTGAG GCAGTCAGAC CATGCTGCCC AGACTGGCCT TGAACTCTCA 960
ATCCTCCTGC CTCAGCTTTC AAGTGCTGCC ACACACCAGG TTATATGAAC CTTTTGAGTA 1020
CCCAAGAAGC AGCTTTTGAA TTTCAGCTCA GAGTGCCATG CTATAGGGCT AGGTCAGGCT 1080
TTCCTTTCTG ACAGAGAGGC TGTATACTTT CCAGCCGGAA TATAAGGGAG CAGATGCCCG 1140
AGACTGCTGT CGCTTGAGGT CTAGGTCCTG CTGGCCCTTT CTGAACCCTC CTGGCTCCTC 1200
CTCCCAGCCA CTGGAGAACT GCCACATTGA GAGGCAGAAC CTGGGAGGCG TCGGAGCCCA 1260
TTCATTTTTA ATAGTCCAGC TGCCATGGTC TCCCAGAAGT TCCGCTGCAC ACAAGCACTC 1320
TCAGTTGCCA GGCCTGGGTC TTGTCAATGT TTAATGGAAG CAAGGATCTT ATCTGGAGTT 1380
CCAAGTCGTT TAGATTACTC CTGTGTAAGG ACCTGTAGTG TGGGATGGTG AAGACAGATG 1440
GAAGACTCCT CAGAGTGACC CTGCTGCTCC CCGGGGCAGG AAGGGGTTCT TAGAGTTAAA 1500
AACAGTGTGT GGGTGGCCCA GGAAACAACG CAAACGGGAC AGAAAGCCCT ATCTCACTTT 1560
GGTCAGGGTC TGACCACACT GTCAACAGCT CTGCCTTGGA GTCGATTCCA GGTGCCCAGT 1620
GCACACCCTG CCAGGGGCCT CCTGGGAAAT CCAAGACACA AGGTAATGGA TGAAGTCTGG 1680
AGGGACTTAA AAATAGATGT CCATTGAGCC TGTTCTGGTG TCCCTCAGCA ACCAAATCTG 1740
CCTGTATTTG GGAGAAGAGA CACCATCTGG CTTGCCTCTA GTATCAAAGT GTTGCATGGA 1800
ATGACTACAA GTCCACACTA ACCTGCCAGA CTGAGCTGGG CCGCTCTGTG CTCCCGGTCC 1860
TGACTCCAGA GCAACTAGGG GAGGGACTAG TGCAGCTCCC CAAGGCCCCG AGGAATGCCT 1920
TACGCAGAGA GTCAAGTTCT ATTTGGGGAA TGGAACATCA CGGTTCTAAA CACAAGCCGG 1980
ATGTTATTTA CAAAACTTGT CTAATGGCCC AGCCTCCATA CCGGTAGCTC ATTGGCTGCT 2040
CGTCTAATGG CTCAGCCTCC ATACTGGCAG CTCATTGGCT TCCAGCTCAG GTTTCTCTAG 2100
CGGCTTTCTC CGGACTTTCT CCCGTCCTAC CAGTTTCCTC CGCTTACAGA TCAACATTCC 2160
AGCCGAAGTG TCTCACTGAC CACTGACTGT CACTCACCGA TGAGACCTGT GGAGGGAAGC 2220
TGGCAGGAGC AGTTCCTAAC TGGGAGACTG AGGCTTGGGA AGGGGAGACC GGCAGGAAAG 2280
AAAGTCAGAA TGATATCACC CTGCCCTGCT GTCTGCCATT CTTATGAGGG TTAAAATGAA 2340
AGACGGCCGA GGGCCTCTCC CAGTTCACCC GTGAAGCTCG AGTCTAAGTG ATGGGTCAGG 2400
TGATTTAAGC TTTTTCACTC CAATTCAGAC GGTGGAGAAG TCTGGCTGAA TGGATCAAAA 2460
CTGGCCAGCA CACTGGACAG ACCATTCCTA ACACCTGGCC TTTTGCTATG TTGTGTTTGG 2520
GGAGGTTGGA CTAGAGACTG GAAAATCCCA ACAGACATTC CTAAGTCCCG GGAAAGTCTG 2580
ACGCTGAGGT GTCAGGACTG TGGGCACATG CTCTTCTTGA ATATCCCTGG GTCTCTTAGG 2640
CCACTCTGTC CCCTTTGCTC ATCATCTTGT CTCATGCCTG TTCACCCAAC ACCTGCTCCA 2700
TCACCACCTC TCCCACACAG CGCAGGCCCG TGGGCTGCAT GTGGTATGTA TAATAGTAGT 2760
CCTTGCCCCA GTGACCCGTG AATATTCAGT GAGCTAACTC ATGTGGAATG CTTGGACCAG 2820
CATGGAGTAA AACCTCAATA AATATTAACT GCTACAAATG CCTGTTGCTG TATGGTTTCT 2880
CATCCTCCAT CCAGGGTAAA GGAACTTTAA AGGAACCCTG TCACGCGAGC CCTTCTAGGC 2940
CCTAGCATGA TCCCAGACCT GAACACGGAC AGCTGTGCCC CGTGGGTTTT CTCTAAAGGT 3000
CACAAAGACT CATCGAGAAA TGTCCAGGCT TAGGCGCTGA CCTAGGAAAC TAAAGACGAG 3060
GCTTTATTCC ATCAGCAAAC AGGTGGGCTT CCTGAGAACG CAAGGACACC TGTGAACGGC 3120
TCATGAGCAA CACAGTGGCC TGGCTAGCCA CCAAATACTA CCATGATGGT GCTGACCACT 3180
GGGTCCTTAG GATCTAGAGC AGAGGAGGTT TGGCAGGGCA GCTCAGGTAA ACCTCCTGGT 3240
GAGAGAGAGC TGCAGAGTCG TGGCTACTTT AAATTGGGGG GGGGGGCATT GCTGGATGAA 3300
GAGAGAGCCT CACCTAGGCT CCACACATTC TGTGAGTGAG TAGCTCAGCA CTCAGGCCCG 3360
TGGCAGAGGG TGTAGAGTGG CGCAAGCCTC TTACATAGAA GATACTAGAT AGCACCTTAT 3420
AGGTAGACTA ACTCCAGGTT CCACCCTATC TGGGGCCTCT GTGAGTCCTT GTGGGCTGGG 3480
GACAAGATCA TTGTGGGAGA TTATCACCTT CCTCCTTAAA TAGTACCTGC TCTACCCCGC 3540
TAATGAGCCC TCATCCAGAA GGGCTTGGGG ACAGAGATCC ATGACTTTTA CCAGGCACTT 3600
CCTAAGGATG AAGATGAGAC ATAGGCAGAG GCCACAGGAG AGGATGAGGA AACCAAATAG 3660
TGGGGAAGAG GGAGACGTTA CCCTGAGTAG CAAGAACAGA AGAGGCTCCC ATTCCTACCC 3720
CAGGCAGCCT CCCATCCTCC TGCCAGCTCC CTTAGGGTAG ATCGGAGAAT ATCTAGACAA 3780
GAGTTGCAAG GAACAAGCCC GGGCTTGATC CCAGAGTGTG AGGATCTGGT TCACTTAGAG 3840
GAATGTTGCT ATTCTTAGAA TCTAAATCCC AGGATGGTGA CACTAACTTC CCCCTAGGAA 3900
GGCCCTGTGA 3910