EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM082-07700 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Intestine_crypt_progenitor 
Coordinate
chr3:60302180-60305100 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
TCTTTCCTCC TGAAAATGGC ATCCCTTTTG TGCTAAGGGC TGTGTGCATT CATGAGCCTG 60
CAGAAGATAA CGACAACTCA CAGTGTAGGA GAAACCTAAG TGCTCTCCTG GCACTGAAAA 120
GGAACCAGTA GATTCTAAAT GGGGCAGCGA TTAGCTTTTT ATTGCTATAA TGATTTTTTA 180
CTGTTTCCAC AACTTGAAAT GTGACTATTG CTAGTTGAAG GTAACATACT TTAATATTTT 240
TAACATATGA TTAGATAGTT TGTTTTTTTT TTTCTCCTAG TGGTTCAAAC TTTTCAATAA 300
TAACAGGTTA GGCTTACTGA TGGCAACATT GTTTCAGGCC TTACTTTATT TTGGCTCACG 360
TCTAAGGTTT AGATTGGCTT GGATGCCTTG TCATGGCTTT CTTTTTCTCT TTATCTCTGT 420
AAAATAACAT TTTCCTTTGA TTTGCTCTTT CCTAGACTAT TGTATTGTTT CTAACATTCA 480
GGTGCCTTTC TTGTATTCCT TTTTTGTTCT ATTTGATGGA GCAGAAAATT TGAGTTTGTT 540
TCGATTTTTC TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT GATAGTTTCC 600
CCTCTTGTAC TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC 660
AAATTTTCTA GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC CAAAAAACCC 720
AAAACCAAAA AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA CTGTAAATTA 780
ATCCTTCAAA CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG 840
GTGCAAAGGT AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA 900
CTGAAAACAA GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC 960
AAGGCCCATC CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT 1020
TACCCTTCCT TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA 1080
AGATCTTTCT AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT 1140
CATAGTTTGC TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC 1200
CTTTTAAAGA AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC 1260
TTCTTGCACG TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC 1320
TGTGCCTATG ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT 1380
TACCTTCCAT CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT 1440
TAACTGGCTA ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA 1500
CAGACACTTG CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT 1560
CTTTACGCAG GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT 1620
TAGCAACTTC TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC 1680
CTCCTTTTCT CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG 1740
CTCTTTTCTA CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA 1800
CCTCCATCCT ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG 1860
AATGAATGCT GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC 1920
TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT 1980
TGGGAACTTT TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG 2040
GAAGGGATCA GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT 2100
ACTAGTACCT CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC 2160
TAGGAGAGTG TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC 2220
ACTCACCTCA ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC 2280
TGACGAAGTT ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC 2340
TTTATCTCTT CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG 2400
CTAATGAACT AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT 2460
GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC 2520
TTGCTTTCTG TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT 2580
TATTTGCCGA TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT 2640
CGCAGAACTC CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC 2700
TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG 2760
GCAGCTAACT CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC 2820
GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG 2880
GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2920