EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM082-00557 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Intestine_crypt_progenitor 
Coordinate
chr1:169319360-169323880 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSMA0476.1chr1:169320684-169320695GATGAGTCACA-6.14
Foxd3MA0041.1chr1:169321693-169321705AAACAAACAAAC-6.32
Foxq1MA0040.1chr1:169322681-169322692AATAAACAATT-6.02
JUNDMA0491.1chr1:169320684-169320695GATGAGTCACA-6.14
MyogMA0500.1chr1:169323504-169323515AACAGCTGCAG+6.02
Nr5a2MA0505.1chr1:169322350-169322365GCTGGCCTTGAATTA-6.2
POU2F2MA0507.1chr1:169320878-169320891TTCATTTGCATTT+6.59
POU4F3MA0791.1chr1:169320926-169320942TTTATTATTTATGCAT-6.09
RFX1MA0509.2chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA-6.95
RFX1MA0509.2chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA+6.97
RFX2MA0600.2chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA+6.64
RFX2MA0600.2chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA-6.72
RFX3MA0798.1chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA+6.32
RFX3MA0798.1chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA-6.78
RFX4MA0799.1chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA+6.15
RFX4MA0799.1chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA-6.69
RFX5MA0510.2chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA+6.27
RFX5MA0510.2chr1:169319921-169319937GGTTATCATGGTAACA-6.55
Stat4MA0518.1chr1:169322781-169322795CTTCCGGGAAACTG+6.15
Tcf12MA0521.1chr1:169323504-169323515AACAGCTGCAG+6.62
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_06175chr1:169316761-169325096E14.5_Liver
mSE_07512chr1:169319522-169320911Intestine
Enhancer Sequence
TCCTAGAGGT GTGCCCTCCA GGACACAGGA CTCTCTAGAC GCATCTCACA TCTTGCTTCT 60
AGTGGTTTGG AGGCAGCCGC CTCAGATGAG AAAGGAGAGG TATCAAGGAA TACAGTTGGG 120
GGGGGGGGGA AGACACCAAA GCACTTGTCA GATGAAGTAG ATTTGATAAA CTCAGTTCAG 180
GAGAAAGCAT TTGACCCAGA GGACTGCTTA CGTCCAGTCC CACCTCCCAC TCCCTCAGAT 240
TCCTTCCTTC CCTTTTTTTT TTCCCCCAGA GACAGGGTTT CTCTGTGTAG CCCTGGCTGT 300
CCTGGGACTC ACTCTGTAGA CCAGGCTGGC CTCGAACTCA GAAATCCGCC TGCCTCTGCC 360
TCCCAGGTGC TGGGATTAAA AGGCGTGCGC CACCCGGTGC CCTTTTCAGT TTTGTTACAG 420
ATACCACACC ACACCCCCTG TGCAGGGCTC CAGTGGATAT CAAGATGGAG AAGGGAGTTC 480
CGAACCTTTA GAATGCAGTC AGGGTGGGAA GGTAGAGGAC ACACCTGGAG GAGGGGGGAA 540
GACTGGGCTG GAAGCCACAG AGGTTATCAT GGTAACATGT GACAGAGAAC ACAGGTAAGA 600
ATGCAGCAGG TTAGAAGCGT ACGGGCAGGC AGGTCAATGT TCACATGGCC GAGAAAGGAG 660
GCCAGTGTGA CTGAAGAGTA GTTACAGAGC CCAGAAGAAG AGGAGGAAAG GCCTATTCTT 720
TGTAATCTTT ACCTAGTAGG GATTAAACCC AGTTCTAAGC AAGTGGTATT AGCTCATTTA 780
AATCCTCGCA GTACCTCTAT CAGGGATTAC TGGTTCTGCA GGTGAGGGAA TTAAGTACTA 840
GAGGGATTCA GTAACATCCT TGAAAGCACA CAGAGCAAGG CCTGGATTCC CACACTCCCT 900
GGCAGCGTGT TTCCAGATTC TGTACTTTAG GCCTCGACCG CCCCGTCTTC GAACCAAGCT 960
GAAGAGCAAG TTTGCCAACA TCTGACCCTC TCCCAAGCAT AAAACATAGT AGCAAGAAAG 1020
TAGAGCTAAT AATTAGCTCC AAGCCTGGGC CTGATTACAG ACTGTGATGT TTCTAATTGG 1080
AAAGGGGAAA AAACCATCTT GGAAAAGTTC CAGAGAAGAA CATATTCATT TTAGTGTACG 1140
GCTGTATGAG GATGAAGAAC ACTTCCTCCA GTCTCCTGGC ACCCAGCGTG GCAGGGCAGT 1200
CCTGAAGCTG GCTCTTCATT ACTGCATCAT GATTCCCACA AACCTCTACA CGAGCTGACA 1260
TTACACAGGA GCGTAAAGTC ACAGGACAGC CAAGCTATGA CTTCCAGGAG AGGAAAAAGT 1320
CTTGGATGAG TCACATTAAT ACTACTTGGA TTTTCCATCA TAAGAAATAA AGGCAGCTTA 1380
GAGTTATTAT AATTCTTAGC AGATGCTAGA TCCCTGGGAA GATACCAGTT GTTAAGTGAG 1440
GGAGCCACCT AGGCTGCTGG CTTCCATCTG GCTCGACCCT CCCATGCCTC TTGGGTCTTA 1500
GAAGCATGCT TTGGCACATT CATTTGCATT TTTCTATCTT TTTTTAAAAA ACTGCCACTC 1560
TTTATTTTTA TTATTTATGC ATATATATGT GTGTCTGAAA AGGCCAGAAA TGTATGAATG 1620
TATGCCGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATGTGTGTGT 1680
ATACGTCTGT TTGCAAAGGC CAGGAGAAGG TGTCAGATCT CCTGGAGCTA GGGTTACAGT 1740
CAGTTGTAAG CCCACTGGAT ACCGCAACAG AACTCTGGTC CTCTGGAAAA GCAGCAAGTG 1800
CTTATAACTG CTGAGCCATA GCCACAGACT CCATTTGTAT TTCCTAAGCT GGAGAAAAAT 1860
CCAGGTGTTG TGTATGGCTC ATGCTTAGCG TCTCAGGATG CGGGACACTG AGGCAGGTGG 1920
ATTGAGAATC TGAGGCTTGA GAAGACACTG TTTCAAAGGA ATAACAAAAA AGGCGGGCCA 1980
GGGCACCAAA GTTTTAGAAT TTACATTCTG GATGACGAGT AGATCAGTCT AGAAAGAACT 2040
CGAAGTGGGA CAAGGGGCCC TGTGAAACCC TCAATGCATT TGGAAAACAA CATGATTTTC 2100
CCGCTCCACT TGCTGCATTT CTTGCCACAG ACAGGCACGT GGACTCTGTG ACAGAGCTAA 2160
TCTTACACAG GGAAACCTGA CAATAACACC AAGGTTTTTT TTATTCCAGA GGACAGTGGA 2220
CTCGGAAGCA GGATCAATAA ACTGAGCTGC AAGGGCTGGG GAGATAGCTC AGTCAGAAAA 2280
ACTGCTTGCC AAGTAAGCAT GAGTAGCTGC TTTAAGCTCT CTGAATCCAT GTTAAACAAA 2340
CAAACCAACC AACCAACCAA CTAACCAACC AACCAAGACC CAGCGCTCAG CAAGCTCAGA 2400
TAGGAGGACC CTGGGCAAGT TCAGGCCAGC AGGCTGGCTG AATCAGTAAG ATTCAGTGAG 2460
ATTCTCAAAA CTAAGATGGA GAATGACTAA GGAAGACATC TTCATATGTA TGGACATGCA 2520
CATGTGCTTA TAGTCATTCA TGTGTATATA TACATCACAT ACAACATACA CACATTTTAG 2580
TTGCAAAAAT AACAGCGGCA TATTCTAAAG AGATATAAAC ATAGAGAATG ACTAAATTGT 2640
AGGTTTAGAT TTTTAAAATA AAAAAAAATT CGAATTTAAA TCATAGGTTT AAAATGAGCT 2700
AAGTGTTCAG TCAGTGTTAG ATTACTTTTG ACAGGTTCAT TTGACACCCA CTCATTCTTG 2760
ACTGGTCCAG GGGCTTTTCA GCATCTCTTT GGATAAACAC ACCTTTTGTA AGTGTGTGTG 2820
TGAGTGTGTG AGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTCT CTGTGCTGTC TACTTATAAA 2880
GGAGTTCCTT TTCAGATTGT TTCCTCCGGA ACTCTACACA AGCAGGAGGG AATCTAAGTG 2940
AGGGAAACTC TGCCCTTGTC CTTTAAACAA GGACTCAATA AATGGCCCAG GCTGGCCTTG 3000
AATTACCATT CTCCTGCCCC AGGCTCTCTG GTGCTAGGAT TCCAGTTGCA GGCCTCTGCA 3060
TCCAGCAAGA TTTTGTTCCT TAGTCTAAGG AAGCCCCAGT AGTTCAGTTT CTATGGCTGG 3120
CCACACTATC CCTGTCATTT TATATATAGT AACACTGGTT AAAGGAAAAA AAAAAAAAGA 3180
ATCACTTGAC AGAGTTTTCT ATTTCTGTAA CATTGTGTCA GGAAGAAGCT GAGCAGAATG 3240
TACTTCCCAG GGTGAAAGCA CATGTTTGGA TTTCAGATGT TAGTTTTATT TAACTCCTTA 3300
GATAAATTTA GCTCCTGTGA GAATAAACAA TTCTGGATCC CCTGACTCAA GACAGTATAC 3360
TCTCATTATG GACACACTGA AAGAAAACAC ACCGGGTAAC CCTGACTAAT AACCTTGGCT 3420
GCTTCCGGGA AACTGCAGTC TGCAGGTGCC CTACAGATTC CCGCAGGGAA GCCCTGGTTT 3480
CTGCTACTAC CTTAAAATCT GCAGCAGACC CTGCAAGGCC ACACCTAAGC CACCAGTACA 3540
GGCAACAGAG CAGAGAGCTG GTTGCTCTCT GGGGCACCTC CTTTCCCTAG TTAAGGGATT 3600
CAAGTCCCAA CCCGCAGCGC AGCGTTGCTT TCCTACCCAT CCGACCATCT GTCTCTGCTT 3660
TTCCTCTACT TCCTTTTCCG CACTGACTTG TACCCTAGGC TACTTGCAGA CTGGTGCCTC 3720
CCAAGCAAAG AATTAACAGA AACCACAACC TCGGGAGTGA CTCAGTGTCT CTTACTCCCT 3780
TCCACCACCC TGCAGGTGCC CCACCCTGTG GTTCTGGGTC TCCCTGTAGC GACACAAGAT 3840
AAGTAAAGGG ACACTTGCGG ACATGTGAGT ATGGGATGAA TTAATATCCC ACTCACTCTT 3900
CCCAAGAAGT CTCTTGCTAT GAGGACAGAA GTAAGAAAAT GACCCATATT CAGGTATCAA 3960
TGCAAATATT TCTACGAGGC GAGAGGAAAA CAAATGCAAT TCCCTCTGAG ACCCTCTCGA 4020
AGGATCCTAG CAACAAGACA TCCATAGCAG GCGCGGCGCT TGCACGCCAC TTATGAAACC 4080
TGTGCTAGAT CAGGTACGAA TGGCCAGTTC CCACTGCAGA GTTCCGGGCT CCTTTCTCTG 4140
TATTAACAGC TGCAGTGAGT AAGGTCAGGT GGTCTCTTGA AGGCCGAAAG AGGGAGCCCC 4200
AGGTCTTTAC ACAATTGGAA TTAAGGAGGG GGAGGAAAAT AAGGAATTGA GGATGAGCTG 4260
ACCTTGAGAA CCTCCCTGAG TTAGAGATAG CGAGGTAGGG GCCTCCCCGA GAAGCTCCTA 4320
AGCTACACCA TCGGGGGGAG CATGCAGGGA GGGCGGAGGG CAGAGTGGGT AGAAATGCAG 4380
AGCTCAAATC GACCGATAAA GAAGGGAGGT TGGAGACCCC AATTCCGTTC CAAGTGACTG 4440
AGATACCGGT TGTGCATGTG CAGGCATTCA GGTGTCCCAG TGAAGCTAAA GCTCCTGCAG 4500
CTCGCAGCTG CCAGCACTTA 4520