EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-15747 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr8:28213820-28219200 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:28216556-28216573GCTAGTTAATTAATGGG-6.07
Alx4MA0853.1chr8:28216556-28216573GCTAGTTAATTAATGGG-7.2
GSCMA0648.1chr8:28216571-28216581GGGGATTAGC-6.02
MNTMA0825.1chr8:28216828-28216838ACCACGTGCC+6.02
MYCMA0147.3chr8:28216827-28216839GACCACGTGCCC+6.02
NR2F1MA0017.2chr8:28214709-28214722AAGAGGTCAAGGG+6.14
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr8:28217250-28217261CTTGAGTGGCT-6.62
RARA(var.2)MA0730.1chr8:28218106-28218123TGACCCCAAGTTGACCC-6.61
RARAMA0729.1chr8:28218532-28218550AAGGTCAAGAGTTGAATT+6.01
RESTMA0138.2chr8:28216214-28216235ATCACCACCACGGCCAGCTTT+6.11
RREB1MA0073.1chr8:28217357-28217377GGGGTGGGGTTGGGGGGGGA-6.16
RREB1MA0073.1chr8:28218287-28218307GGGGTGGGGGTGGGGGGTTG-6.29
RREB1MA0073.1chr8:28218291-28218311TGGGGGTGGGGGGTTGGTGG-6.95
Rarb(var.2)MA0858.1chr8:28218106-28218123TGACCCCAAGTTGACCC-6.46
RarbMA0857.1chr8:28218531-28218547GAAGGTCAAGAGTTGA+6
SOX10MA0442.2chr8:28214028-28214039TCCTTTGTTTT-6.32
SP1MA0079.4chr8:28214981-28214996TGTGGGCGGGGCCAA-6.57
SP4MA0685.1chr8:28214979-28214996TCTGTGGGCGGGGCCAA-6.22
SPI1MA0080.4chr8:28218874-28218888AGAAAGGGGAAGTG+6.22
SPIBMA0081.2chr8:28218876-28218888AAAGGGGAAGTG+6.07
Sox3MA0514.1chr8:28214029-28214039CCTTTGTTTT+6.02
XBP1MA0844.1chr8:28215580-28215594ATAGCCACGTCAGC+6.06
ZNF263MA0528.1chr8:28218169-28218190TCCTCACCCACTCCCTGCTTC-6.32
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05628chr8:28214513-28215595E14.5_Limb
mSE_05628chr8:28217425-28218244E14.5_Limb
mSE_09663chr8:28214043-28219306MEF
Enhancer Sequence
GTACGCCAGG GCTAACTGTG GTAGCCAGAC ATCGTAGAAC ACTTGTAATC CCAGCCCTGG 60
GGAGGGAGGC AGAGGCAGAG ATGCTGTTGC AAGTTTGAGG ATGGCTTAGA ACTCATCATG 120
TGGACCAGGC TAGCCTGGGC TACATAGCTT TACAGAAGAC CCTCTAAAAA CAAACCAATA 180
AAAGGCTCAG GATCAAATCC TGTTCTTTTC CTTTGTTTTT GAGCACTTCC ACAAGCCTTG 240
CCTGACACAC TGTGTGGAGA ATGGAGCTAG GAATTCTCTG AAAAGTTGCT ACAGGGATAA 300
ATGAGTTAGT TCATTGATAC AGTACTTCTG AGCATAGGCT TTCCCAGTGA AGGCAGTGTT 360
CTTCCTTTGT AAAGACTTCT GTACATGTAA GGTATTTGCT ATGTGTAGTT GTCCAGATTT 420
CTCATCATGT GTCTTTCTTT TGTATGTCGA GGGACATATA TGAAGACCAG AGGACATTTT 480
ACTGGGGTCC ACCACATAGG TTTTGAGGCT AAGATGCAAG CTTAGTGGCG AGTACCTTCC 540
CCTGCAGAAC CGTTTTGCAG GCCCCAGTTG TTCTGAGACC CTAAAACTCC GTGTCTAGTC 600
CAAGGTCCTC TGGAGTACTG AGACTACAGA TGCAATCACC TGTGTGTCAG TCACTAAGCC 660
CAGCTCTCGT CGTTTGTAGT GCTGGTGATG TATTGGTTAG CGCCCCACAC ACGTTAAACA 720
AGTAGTGTGC CATAGAGCCA CCCCCACCCT CTCGTGGAGG GCTCCTTCCT TGTATGTGTC 780
TCCGTCTGGA TCCTCCACCA AGCACATATA ACGAGGAATG GGTTGGTAGA TAAATCTTCA 840
GGGCTCTATG AAGATGCCTC CATGCGGCCA CTGGACAGAC ATGCCCCAGA AGAGGTCAAG 900
GGAGAAAAGA GAGAGAGAGA GAGACTGAGT ATGCAGAAGG GTGTGAGACT CCACGTGGAT 960
GTGGACCCAC GGAGGCTTGT GTGAGGCTGG AGCAGAGGGC CCAAGGAGGG GAGCTCGCTC 1020
TGCTCGGTGT GATTTGTCAT TGCCTAATGA GATTAATGAG CCCTGAGGGC TGGTATGCAG 1080
AGGGTGCCGG GGCACTCATT AGAAGCAGAT GCTCATGGGA ACGAACAGGG CAACTCTCTA 1140
GCCAGGTGGT TTCTATTAAT CTGTGGGCGG GGCCAAGGGT GAGGCCTGGG GCTCTGTCTC 1200
TCCATTCCGT TCTTGTTCCC ACTAACACTG GGGAGGGATG ACAAGGAGAA GCTGTCCTGG 1260
CCTCCAGTAC AGCTGAAGCC CTGGGAGATG GCTAACAAAG TCAGGGACAG CCCCCTCTTG 1320
TTTGCCTCTG TCAGCATAAG TGCCGGGCAC AGTGTATGTG CTCAATAAAT ACCTGTAGAA 1380
GGTTTCAGGA GCAGAAGCCC TGGAGATGGT GGGAAGGTGA GAGGCTGGGA CCATAATGGG 1440
TTTCCTTGAC CACAAGATTC TTTTTTTTTC TTCCCCGAGC AACCTCTATA CCGGCAGGGG 1500
TGTCCTGGCC AGTTTTGCAG CCAGCCTGCG CTTTCAAGTT GAACTCTGGA AACCTTGTAG 1560
GGCTCAGGGC AAGTTGCTGT GTGGCCAGCA AGCCTATAAT TTGGTTTTCA GACCTACAAG 1620
CAGGGAGGTC TGTGGGGGCT AAGAGGAGTG AATTCTGTGC AACCCTACTC TGTCTGGATG 1680
GCGTGTGAGC GCATACATAC ATACATAGTC ATACACACTT AGTCACACAC ACATAGTCAC 1740
ACATACATAG TCACACACAC ATAGCCACGT CAGCTCACAC TTTTGACACC TCCAACATGA 1800
TGTAATTTAT ATCGCCCATT GAAAGTGCAT GATCCAGTGA GCCCTGATAT ATTTCAGAAA 1860
ATTGTGTAAC CGTCGCTGTC ATCTAATTTT AGAACATTTT CATCATCCAC AAAAGAAAAC 1920
TTGAATCATT AACTGTCGGT CTCCGTTCCT CTGCCAGACC TAAGCAACCG CTAATATCCT 1980
TCCCATCTTT ATGGAGTTGC TTGTTCTGGA CATGTATAAA TAGACATACA ATATGTGATC 2040
TTTTATAACT AGATCCTTTC AGCCCATGTT AACATTTTCC AGGTTCATCC TTGCTTTATC 2100
AGCACTGGTT TCCCTTTGTG GGCAAATAAT AAGTAGCTCA CTCACTGAAC ATAGTGTTCT 2160
TTAAATCTTT TACTTATTTA TACATTGATG GATACTTGAT ATTTTTGTCT TTTAGGCTAT 2220
ATGATGGAGT TCTTTCGGGA ACTTTTACCT GGTGGGCCTT TTGTTTTGTT TTGCTTTGGC 2280
TTCTGCTTGT TTTTGGGTTT TTGGAGACAG GTTCTGGTTA GATAGCGGTG GCCTGGCCTC 2340
AAAACTCACA ATCCTCCTGC TTCAGTCTCC GAAGTGCCAG GATGGAAGGT TGGAATCACC 2400
ACCACGGCCA GCTTTGATCT CTCCCTGCTG CGCGCCCACA CTCAGGTTGT GGAAAGCTCA 2460
CAGGGCATGA CTGCCCTAGA AGTCTCCATC TACCTTTGCT GTCAGGGGTC CCTCCCTTCA 2520
TGCTGACACT CATAGTGGGA GAAGGGTGTG CCTGGAGTCA GGGCAGCTAG CATATGATCA 2580
AGATTGGACA AAAGGCAATG GGGATAGGGA CACTCTGTTG GTGCAGCACC TCTTCCCCAG 2640
GTCCAGAGCT CTGAGGAAAT AGACGGGGAG TCATGCAATC CATATTCTAG AAACAGCTCT 2700
GTGTCCTTCG ACTGGTTACT TTGGCTTGTG ACCTCAGCTA GTTAATTAAT GGGGGATTAG 2760
CTTAGATAAT CTGGAGCTAG GGTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTTAACC 2820
ATGGTCTTGC TATGTAGACT AGGCTATCTG AAACTCATAA AGGTCCACTT GTCTGTGCCT 2880
CCTGAGTGCT GGGAGAGTGT TTTTCATTGT GGGGTGGAAC TCAGGGCTTA CACATGAGGT 2940
AAGAGCTCTC TCCCACTAAG CCCCAACCTC AGCTCTGTGG AGCAAGGGTT CTTCCACGGC 3000
CCTTCAAGAC CACGTGCCCA GTGTTAAGTG TAGAACATTC TTCTAGGGTG GGAGTCGAGG 3060
CCTTCATCAG CTTTCCCCAA CAGTATTAAA CAGGAAGGGT TCAGAACAGC CAATTGAAAA 3120
GAGCCTTGGA TTTCTAAAAC ATACAGTTCC TGGGGTAGCA TTTCCTCCTG TCCCTGGGGA 3180
GGTACAGCCC TGAGCCACTT CCCTTATTCG GGGACCAGGA GACTTGGCTT GTCCCTAGGC 3240
CCACTGGGCT GTCAGGGTTC AGCCCAAGAA GCAGTCCCCC TGCATTTGCC CCCAAAACCT 3300
GGTGTCCCAG GGCTGGCCCA CCCCCTAGGG AACTAACTAC AAGAGACCAT CTTGGTCACC 3360
TCTGAGCCCG ACTTGAAGAA AGGGGAAGAC CCACTGCCTG TCTCCATGGA AGCTGCCCTA 3420
TAGAGAGGGC CTTGAGTGGC TCAGCTGCAG GAAACAGGGC AGGGAGAGGG GCTGGGGCCC 3480
CAGGGCTGCC TTGCTCCCAT CTGCAGAGCA TCAGTGGGAC AGGCGGGTGG GGTTCACGGG 3540
GTGGGGTTGG GGGGGGAGGA GGAAATGAGA ATAAACACAA GTGAGCAGAG AGGGAAGGGG 3600
CGGGGGGCTG CCCCTTTGGC AGCCCATGAA GGGAAGTGAC ACACAATGAG GAATGTGTTT 3660
CCCTCTACCC GCCCCTGCAA GGGGGTGGAG GCAGATCCCT GAGAATGGCC AGACCCCAGC 3720
AGAGGCCAGG GGGCACAGGC TGGATCAACA GAAGAGGGTG GAATGGAAGG GTGGAGCCTG 3780
ACAGTCAAGG GGGGTGCGCG GTGATACACA GGAAGGGCAG TCCTGGGCAG GGGGACTTAC 3840
TCTGTCCTCT TGACTGGGCA TTCAGGCAAT CTAGGACCAG GCCAGGGCCT TCCACATTCT 3900
CAGCTTATGC CTAGCACCGA GGCACCACCC CACAGCTGGG GCTTTCTCTA GGACGATGAG 3960
CCCTGATGTT AGCGTCCCCT TCTTCGTCCC CTTCTTCCTT ACCGGAACTC ACCTTCATCC 4020
GAGTCTTCTG TGTGAGAGGG AGCTGAGGTA CAAACAGCCT AAGTAGAACT TCATCTCTGC 4080
CTCTTGTCTC TCAGTGTTTC TTTCCCCAAC AGGGACTGCA CAAACAGGCC TCCTGGTGGG 4140
ACAGGACAGC CCCTCCCCAT CCCCAGACAC CCATTTCCTT TTACCCAGCA GGGACATAGC 4200
TGAGTTAACT CTCTCCTGTC CATAATTCAG AGCTGTCTCC AAGGCCTTCA GCCTTGGCTG 4260
GAATGGCTGA GCTTTGGAAA CCACGTTGAC CCCAAGTTGA CCCCCAGATA TCTTTGTCAG 4320
ATTCTGCCGT CTTCCCCTCC AGGAATGGCT CCTCACCCAC TCCCTGCTTC CCGGCTCCCA 4380
GGCTCTCTTA AGTAGGAGCA GAAAAGATGA GCCTTACTTA GTGCTATAGG CAGCCTCAGT 4440
TTCAGTCTGT GTTAGTTTAG AAAAGATGGG GTGGGGGTGG GGGGTTGGTG GAGCGTTGGG 4500
TAGGTGGAGC TTTGGGTAGG TGTGTCATGA TCTGTAGCCC TCTGTAGCCA TGCACAGCAT 4560
AGAGGATAAT GCAGAAGATG AGTAGACTGG TACCCAGTTT GGCCCTTAGT GTGGAGGCTT 4620
GCATGGTAGG TATGGGCTGA TGCATTAGAT AGGCATGTCC TCCTGGTTGG GGGTGGGGAG 4680
GCACTGCAGC AGCTGGGGAG GGGAGGAGAG GGAAGGTCAA GAGTTGAATT CCTGCATCAT 4740
GTTTGAGCCC CTGAACTGGG AGTCAGAGAC TGCTGTGAGA CTCATCTGTG GTACGTTTCT 4800
TCATATGGAG TGGGGATGAC TCTCAGGAGC CATCATCCAT CCTGCTGTGA CCTGCTCAGC 4860
CTGAAGGCAG CTTCCTTGCC ACCTCGTGGC ATCAGTGGGG GTGTGGGTGT GGGGCACGAG 4920
ACTGAAGACA TTGCATAGGT TTTATGAGCC CTGGGCCTCA TCTGGACCCA TGATTGGCTT 4980
AGCTTGGAGC TGTACAGGGG CACAGTGCAT TGCTCACCCA TCAGCCTTAC TGCCCTTTTC 5040
CTCCCAGGCG AGAGAGAAAG GGGAAGTGGG GCAGAACAAA CACTGTTGGA ATAGAATAAC 5100
TGGAAAACTT CCTCTGATTG ACTTGGTATA CCTGTTTCAA AGGCTCCTCA GAGCTGCCCT 5160
CTATGATCTC GAGTGGCTCT GTTGAACGAC CATGGGAAAC CAAGTCTTCT ATTTCTTAAT 5220
GCAAAGCTTT CTCTAACCCA CTGTCCCTGT TTCCCCATCC AAAGCCCTTC CTATCCCATC 5280
TCTTGCCTCC TGTATCATCT CAGATATGTT GCTATAAAAC ACAGCTCTTG TCCCAAAGGA 5340
GTAAGACGTA GATGGTTCTG AGCCACAGAT GGGTGACCAT 5380