EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-15075 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr7:80750500-80753640 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr7:80751889-80751903GCTGCGTGGGCGGA-6
EGR2MA0472.2chr7:80751891-80751902TGCGTGGGCGG-6.32
EGR3MA0732.1chr7:80751889-80751904GCTGCGTGGGCGGAA-6.13
FOXA1MA0148.4chr7:80753347-80753363CAATGTTTACTTAGTA-6.13
FOXC1MA0032.2chr7:80753349-80753360ATGTTTACTTA-6.02
FOXD2MA0847.2chr7:80753349-80753362ATGTTTACTTAGT-6.32
Foxa2MA0047.2chr7:80753350-80753362TGTTTACTTAGT+6.44
ZIC1MA0696.1chr7:80751806-80751820CTCAGCAGGGGGGC-6.18
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00389chr7:80728813-80754010pro-B_Cells
mSE_01523chr7:80662346-80773459Th_Cells
mSE_02681chr7:80731224-80764627HFSCs
mSE_03000chr7:80728755-80771487TACs
mSE_03459chr7:80752445-80752863Bone_Marrow
mSE_03982chr7:80751273-80752089Cerebellum
mSE_03982chr7:80753028-80753344Cerebellum
mSE_04060chr7:80751282-80753626Cortex
mSE_04416chr7:80751110-80753688E14.5_Brain
mSE_04807chr7:80751431-80753544E14.5_Heart
mSE_05509chr7:80751081-80753496E14.5_Limb
mSE_06583chr7:80751249-80753369E14.5_Liver
mSE_06612chr7:80751246-80753522Heart
mSE_07229chr7:80751242-80753696Intestine
mSE_08080chr7:80751435-80753991Kidney
mSE_08614chr7:80751335-80753561Liver
mSE_09049chr7:80751325-80753714Lung
mSE_09494chr7:80751426-80754236MEF
mSE_10229chr7:80750482-80751256Embryonic_stem_cells
mSE_10229chr7:80751258-80752906Embryonic_stem_cells
mSE_10773chr7:80751274-80753605Olfactory_bulb
mSE_11288chr7:80751310-80752907Placenta
mSE_11971chr7:80751381-80752954Spleen
mSE_11971chr7:80752979-80753451Spleen
mSE_12651chr7:80751315-80752082Testis
mSE_12651chr7:80752108-80752838Testis
mSE_12880chr7:80750510-80751237Thymus
mSE_12880chr7:80751301-80754308Thymus
Enhancer Sequence
GAGTACAGCT AACAGATTAT CGGCTACCAA TAACCAGATT AACTTGGCCT GCTTATAAAG 60
TCCTGTCTTG TCAGGACCTG GTGTTTGTAA GACTGTTTAT GCAATACTGA AGCAGTTTTT 120
TCCCCTCTCC ACTTTGTGAA CAGGATGGAG GGTGACAGAA GATTGCTTGT ATGTAACGAT 180
AGTTTTTTCA GTGCCTGCTA CCAAGGTTTT CTAGGTTTGG GCCTTCTGCT CCAAGGTAAA 240
AATTGCTCTG AGCATTAATA CCCAATACAA AGGTGGCAAT TCTGAGTCAG ACTTTCCCAC 300
GGCTCCCAGA GACTGTTGCA TGTACATTCC CAGCTCACCT GCAGCACGCA GGAGTGCAGG 360
CTAGAACAAG CTAGCCTCAC CTAGGCTCCT TCTGGATATT TTAGTGCAGG CTCCACCAGC 420
AGCAGCATTT TAGGCGGTAA CAATTTCCTT TTGTCTTACT TTCTAAATCT GTAAAACATT 480
CCTAGCTTGC TTGCAGTTTG CAGAGGGAGT GCAGGACTGA AGGAGGTAGC CTGACACCAG 540
CTCCTAAAAC TGGTCTTAGC ATAGCACTTG GCAGAGTTGA GTTTCAGGAG CTGTAATTGG 600
TATTATTTAG CAAGGCACAA AAGTTCTGAG ATACACAGCA AAGTTCATAT CCCTAAAGAA 660
ACTTTCACTC CAATACGGAT TTTCTTTTTT TTGGTTTTTT CGAGACAGGG TTTCTCTGTG 720
TAGCCCTGGC TGTCCTGGAA CTCACTTTGT AGACCAGGCT GGCCTCGAAC TCAGAAATCC 780
GCCTGCCTCT GCCTCCCGAG TGCTGGGATT AAAGGCGTGC GCCACCACGC CCGGCCTCCA 840
ATACAGATTT TCATAGCACC ATCTGACCCT ATCTGGGCAG AAACTAAATT TTAAATAGAA 900
AAATGGGCAG GTATTTTAAA CGAGGGAATT GTATCACTTC CCCAAGTGAA CATGTTCCTA 960
GAGTTAACCA TCCCTGCACA GTTTAAATCT CCTTCTGAGC TACATTAACA TGAAACAAAT 1020
TCAACAAATT TTATCCAAAG AACGTGGGGG ATTGCACCAG TTTTGAGGCC TCCATTCCTA 1080
TCCTGGAAAC CATAGCTCAT GTCTTGAGGC ACGCCCCAGG CTTTTCTCCC ATCTAGAACA 1140
CTTGTGGGAA GGGAGCTTTG TGCAGTTGTG ATAGTAAACA TTCCACACTC TAGAGACCGA 1200
CATACAACTC TCTCTGCTGA GCTCAGGCTG GGCCACTGGC TTTGTTCTCC GCACACATAA 1260
ATATAAGTTT TGGAGGCCAT CTTGGAAACA GGAGAACTCT GGGCGCCTCA GCAGGGGGGC 1320
TGACCGTAAC TAAGCAACGG AGGCGCACCC AGTGCCGCGC AGCCGCAGAG CGCCGCGCAC 1380
GAACGCCCCG CTGCGTGGGC GGAACTGATG GGGGAGGGCG GCGGCGGAAA ATTACCTTAG 1440
GTTCTTCTTA AAGGCACAGA GGCCTTACCT GCTAAAGGTC CAATCGCCAG CCGATCTAGG 1500
GTGCATGTTT TACAAAGCCT ATTTGTAATG CAGTCGACCT TATATTTCTC TGTGAATACG 1560
AATTTTATTT ATCTTCTCAG AGAAATAGAA TCCAATCCCA AATTAACTTC CCCGTGTAAA 1620
CTTCAGTCAC TAAGTAAGCA AATAGTGGAA TAAACAGGCT TCTTCAAAAT CAAGTTAACG 1680
GGCATGGGGA GGGGAGAGCA AATCAAACAA AACAGCCACC AAATTAACCC TAAAATGTCG 1740
AATGGCGAAG AAAGAGAGCT AATGAAGTCA GGAAGGGGAT GAAGTGAGCA CCCAGGAATA 1800
AAGTCACGAC TGTGTAGCAG CTTTAAAAAT GTACAGATTC TGAAGCAAGG AAAATTTATT 1860
CTTGACAGAT GGATTGGCAG ATTATAGTAT ATACTAAAAA TTAACAGAAA AACAAGATGT 1920
CTGTTAAGTA AAGCGGGATC AGAAAACTCT CCGCATAGGT CACTTTTTTA CAGCAAATAA 1980
AACCATAAGA CTTTTTGCTC TTCTTTTTAG AAAAAGAAAT GCAGTTTTTA AAAGTGTTTG 2040
GTGGCACACG GGTGCTGATG GCGGTGCAGT TATACCACAG TACGCTTGTG GAGGTCGGAG 2100
GACCTTGCAG GGAGTTTGTT CTCCCATGTA TGTTCGGAGG ATTGAATTCA GGTCTTCAGA 2160
CTTAGCAATA ATCACTTTTA CCCTCCGAGC CTTATCTCCA GCCTCCACCT CGCTTCTTAT 2220
CAAAGACATT TCCTTCGATC TAGCAGTTTC TATGATTTAC AAGTTAAGGA ATAATTCATA 2280
ATGGTCCTAC TTATGTGAAA GAATAAACGC AGGGTCTGGT TCAATGGAAA TCTGCAGGGG 2340
ATAATGTGCT GCTCTGCAAG TCTCTACAAT TAATCTCCTT ACTAAAAGCC TTCCTTGAAA 2400
ACAACAACAA AACAAAACAA AACAAAACAA ACAACGGAAG AAAAAGAAGA AGAAAAGAAA 2460
AGAAAAGTAG GAAAGAAAAG AAAAGGAAAA GGAAAAAAAC GTGTCCTCTC TGAAATAAAG 2520
CCATTCCCAC ATTCCGAATC TCCATTTCCA ACGACAGAAG ATCTTTTGCA CTCCTCAGAT 2580
GGTTTGCTTG TTATAAATGA TTTCTCTTCC AAACTGCCAT TAGGTGTACC CTAATAAACA 2640
GCACCATACA TCCTCGGAAG CACCTGGGGC TCTCACCACA AATGGGGGGA TGTTCCAGTC 2700
CTATCACGGC CCTAACAAAC CAATTGTCAA TCCCAGAATC GACCATTTCT TCCCATGCTT 2760
CTCAGCCATT TTAAACCTAA TTTTCACATC TACTTTAAAT CCCTACAAAT CTTCCCCCTT 2820
GTCCCTACTG TAAAGTCTTT ACAATGTCAA TGTTTACTTA GTAATTTGTA AAGGGTACCG 2880
TGTTCCTTTC AGAATATGGA ACCGTGTGAT CTTGATACTA AGAAAATGTT TTGCAATGGT 2940
TTAGTGTGCA GCTTGTTAAG TTTCAATTTG GCTATTAAAG AAAGGACCAC ACTAACTTTC 3000
TAGAAGCACA GGGAGATAAG TCCTTTAGAT TAACAAAACA AAACAAAACA AAAAACCAAA 3060
ACTGTGTGGT GCAGAAGAGG TGCCACCACC ACCTTGAGGG GAAAGATTTA ATGTCTAAGA 3120
ACTGTGTCTT GGAAATAAAA 3140