EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-14570 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr6:144401310-144404220 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr6:144402572-144402583GAGCCATAAAA+6.14
IRF1MA0050.2chr6:144403140-144403161AGAAAGAAAGAGAAAGGAAGG-6.36
Lhx3MA0135.1chr6:144403782-144403795TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr6:144403779-144403792AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr6:144403778-144403791AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr6:144403780-144403790ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:144403784-144403794ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:144403780-144403790ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr6:144403784-144403794ATTAATTAAT-6.02
TEAD1MA0090.2chr6:144403632-144403642CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr6:144403632-144403642CACATTCCAT+6.02
ZNF263MA0528.1chr6:144403152-144403173AAAGGAAGGGGGAGGGGAGAG+6.46
Enhancer Sequence
CCTCTTTCCC CACCACACAC ACACTGGCAG CCGCTCCCAA GTTACCAAAT GCCAAGTCAA 60
CCCGCAAGCT GGCTGCATGG AGCTAGATAC TGCTGGCATG TTCCTAGCTT TGCAGAGACA 120
CTCTGTGTAT GTGTGTCTCT CTCTGTCTGA CTGTCTGTCT ATAGCTCTCT CTTTCTCTCT 180
CTCTCTCTCT CCCTCTCTCA TTCTTTCACC CCCCTCCACA CCTCCACACA CACACACATA 240
CACATGACAA CCATGCTTAT TTACACAAAC ACACAACATC AACCATAGTT ATTTCTCCTT 300
CCATTTGGGG ACACTCTTCC CATGTCCTAG CCTTCTGTCT AGCTGCAGTG TGTGCCTTAA 360
TGCATGCTGA CCATATCAGC CTTCACTCTG GCCTTTCCTT ACTTGGTGGC ACTCTGACAA 420
TTAGTGGTTC ACTTATGAAC TGCTCTGAAG TGCTGTAATT AGCTTAGCCA CAGCACAGCA 480
GAGATCCAGT CTGTCCAGTG TCCTCCCCAC CTCCACCCAC ATTGTAGAGT TTCCAGGTTC 540
TCAGTGTTGC ATCTGGACAG TGTTGCTGAT GTGAGGTGAA GCCAGGAGGC CTGACCCTCT 600
GGGCCTTGCC TGGCTCACGT TGTGTACATG TGCTGTCTCC ACTGGGCATC AGGCTCTGCT 660
CAGTTTGTGT GGAGGGGCAG CAACTCCACC TAACAAATGT AACTTTAACA ACAGTAAAAC 720
AACCTAATAG CTTAGCATGC CAGGGGGCTA ATGTGGCGGG CCATTTACTG CTGCACTAAA 780
TAGCCCTGCT TTGGTTCTCC ATGCCAAGTG TCGAACTGAG AATTGCAAGG CGGGAGTGGC 840
TCCTAATTCT TTAGATAAAG GGGGTCATTG CTCATAGGGC TGGGGGCCTA GAAGGATAGG 900
AAGTTGAGCG AGACATTCTC TCGAGACACC TTTGTCAGTG GGGCTACCTG TGGTCCAGGC 960
TAGCACACTC AACAAAACAC AAGGGCTCAA TTCTGGGCAC GCAGACACCA AGCTGTGACT 1020
TGTGGCATTG TTCTGCTGAG TTCCCTGGAA AGAGCCTAGG AGGGGGGCAG AATCCCATGG 1080
CTGACCTGTG ATTTGTTATT TGTGAATCAT CCTGACACCC TCGGAACAAG GTCTGACATC 1140
TCCTGGGCTG TAAAATGAGT TACCCCTGAA ATACCCATGT CGGCTATTCT GTCTCATAAG 1200
CCCCGAACAA GTTACCGTGG ACAGTCACGA CCTGGCTAAT AGGCTGGGCA GAAAGAGACG 1260
GTGAGCCATA AAAAGATGGA AAAAAACCTT GTTAACAGTG TTACATTTTC TAATATCATC 1320
ATCTTTTTAT TTAGATTTCT GACAGTTATA AATTGCCTCT GAATGGTCCT TACACCGCTC 1380
TAGAGCAAAA ATCATCGACA TACCTGTTCC ATGGTAACAG AAGAGAGCAA TGAGCTAAAT 1440
CTTCGAATAA GACCTCCGAA ATGGGACATC TTTATTTCCC GAGCATTAGC CCTAAAACAA 1500
CTGACTTCAC TAATTCCCTC CATCACTCAG ATTGGCCTTG AATTACTTCC CAATGGGCCT 1560
CCCATGCGCC TCTCAATGAG AAGGGTAATG GGGGATCTGT TAATTAACTA GAAGCAAAGT 1620
TGCACGGTGG GGATCAAACA CTGGGTACGT CCTAAAACTC CCACAGAGAA GATGAAATGC 1680
AGTGCAAACT TTAAAGACTT CCCGTCATTA GCAGAGACCT TGCTGCTCCT GGCCCAGACC 1740
CCTCCTGTTC CAGAGAACAA TGAGGACAAT GGAGACAGAG AAGAAATGGT ACAGCCAGGA 1800
ACAAAGGAGC TGGCTATTTA CTGGCAAAAA AGAAAGAAAG AGAAAGGAAG GGGGAGGGGA 1860
GAGAAACGGA GAACTTTCTT TTGTTGGTGG TTCCTGTCTA CTTTAATTAA TTTATGACTG 1920
CCGGGGAATT GAGAGCACCT CCTGCTCATG TGCCCCAAGC AGGGGTTAAT ATAGAAAACA 1980
TCTAGGGTTT ACTCCCAGGG AAGGGTAACA GGACACAGAC AGGGATGCGG AGGAAGGGCA 2040
GAGAATGGGA TGGAGAGAAT AGAATAGAGA CAAATAATAG GCAAGATATT TCACTTTGAG 2100
CAGCAGAGTT CAAACAGAAA CAAAGCCACC AGGTCCCAGG GTTTCCTGGG CCCTTTAGAT 2160
CAGGTCTCCA TCAAGCCCCA TGTCCCAACA CGGAGCTCCC ATCTTGACAC CGACAGAGGC 2220
CTCCTGGTGA GGTCCATAGA AACATAAAGA ATCATATTCA GAGTAAAAGG GCTGGGCATG 2280
TATCTCAGTG GGTACAATGC TCATCTAATA AACACAAGGC CCCACATTCC ATGCCAGCAC 2340
AGCAGAAACC AGCCACGGTG GACCACATCT GTAACCACTC AGGACATGGA GGAAGGAAAA 2400
GAAGTTCACT GGCATCTCAC CTACATGATG AATGTGGGGT CAGTCGTACC ACAGAAAAGC 2460
CTGACTCAAA ATTAATTAAT TAATAATACA CAATAATAAG AAATAGCAAA ACCACCTAGC 2520
CATAATACCG ACTTCTGTTT GTCTCTCCCA TTTTCTTGAC AAGAGAATTC ATAAAATGCT 2580
ATATATAGTA GGACTCAGGA GACTGGCTCA ATGGGTAATA TACTTACCAT GTAATTGTGA 2640
GAAAGAGAGT TTGGATCCCC AGAACTCATA TAAAAAGCTG TGTGGCCATG CCAGCCTTCA 2700
TAGAATACCA ATGCACTGGA GGAAGAGTCA GGGAGCTAGC TGGTGAGCCC GCTTGCCAAA 2760
ACAGAGAACT CTAGGCTCAG GGAGAGAGCC TACCTCAAAG TTTAAGATAG AGAGCAATGA 2820
AAACACCCAG AGTCAACCTC AGCCTCAACT TGAATACACA CGCATGTGCT TATGCGCCTG 2880
GGCACAAGTA AAACACATGC ATAGCACACA 2910