EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-14148 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr6:86427880-86430650 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr6:86427953-86427965ATGTAAACAGGA+6.02
Foxo1MA0480.1chr6:86427954-86427965TGTAAACAGGA-6.62
HNF4GMA0484.1chr6:86428335-86428350TGGACTTTGAACTAT-6.26
Hnf4aMA0114.3chr6:86428333-86428349GTTGGACTTTGAACTA-6.61
MyogMA0500.1chr6:86430233-86430244GACAGCTGCAG+6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr6:86429577-86429588AGGCACTCAAG+6.14
Tcf12MA0521.1chr6:86430233-86430244GACAGCTGCAG+6.14
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04601chr6:86430282-86430902E14.5_Brain
mSE_05131chr6:86427730-86430954E14.5_Heart
mSE_05692chr6:86428055-86431189E14.5_Limb
mSE_06804chr6:86426868-86432155Heart
mSE_07594chr6:86427202-86428292Intestine
mSE_07594chr6:86429543-86431037Intestine
mSE_08230chr6:86427892-86431832Kidney
mSE_08730chr6:86427785-86429373Liver
mSE_08730chr6:86430044-86431223Liver
mSE_09131chr6:86427067-86431486Lung
mSE_11195chr6:86426823-86428540Placenta
mSE_11195chr6:86428601-86431050Placenta
mSE_12694chr6:86430060-86431049Testis
Enhancer Sequence
GTGTAAAGAG AGGATTCTGG GCCCTTCCCT TAACTGTCTC GCTGGCCACC TTAAGTTAGT 60
TGATGATATC CTTATGTAAA CAGGATTCTC CTGCACAGAG GACTTCCTGG GAATTATACT 120
CAGTGTGCAG GAAACAAAGT GTGGTACCTG CCCCCACCAC CACCACAGTA ACATGTAGTC 180
TGAGAACCCG AGCACATCTG CAGGGTAGCT AGTGCTTTAA ACTAATGTCT GGGCAGCACT 240
CATGAGAAAC CATCACACCT ATACTTGCCT AAACTGTCAG CTGCCTCTCT CTAATCCACT 300
GCTGGAGTTC CAACGGCCAT GACTTCCCGC TTCCCACTGG CACTGCTTTA GTTCAGCAGC 360
TCCATCCTTT TTCTGGACTC TTGGCATAGT TGATAACTTG TCTTCCTGTA TCCACTCTCC 420
CCTTACTGTA ACTCTACTCC ATAAGTTTGG GGTGTTGGAC TTTGAACTAT CCTGTAACAA 480
GGTGCTTGTT TCAAATTCAC CATGCTCCTT TGTTTAAACC CCTCTCAGAG TAGAGCTCGG 540
GCACAGTGCT TTTCTAGCCT GCAAGAAGCC CCAACACCCA GGAGCTGGAG GCAGAAGGAT 600
CAGAAGTTTG AGGTCATCCT ATGCTACATA GTGAGTTTGA GGCTGGTCTG AGTGACAGGA 660
AATGTCTCAG AAACAAAACT GAATCTTTCA AAGGCTCCTC CAGGTTTTAC TGATAACTGT 720
ACCTGTTACT TTTACTTTAA ATTTCTTCAT GATACACATA AGATCCTGGT TCCTATGGAA 780
TGGAATGCAG CTCACGGGTA GGGTGCTTGC AGTGTGTAGT CAATGGCCAA GATGTGAACT 840
CCAGCACCAC AAGAGACCAA AACAGCCCCT GAGCCGGCTT TATTCTGTCC ATTCTCCAGC 900
CATCCTCCCC TTTCCCCAAC GTGCTCCCTT ACTCTCAGCA CTCAGGAGGT GGAGCCAGGC 960
AGACCTCTGG GAGTTTGAGG CCAGTCTGGT GTACATATTG AGTTCTCTAA CAGCCAGAGC 1020
TACATAATGA GAACCCTGTC TACACACATG CAGACAGAGA GTGTGTGTGT GAGAGCCTCA 1080
GCTCAGCCAC CTTTGCACTT CCTACAGTGC TCCAAGGCTA GGTATGTTTT CGTTTGCTGG 1140
GGTTGTGATT TGTGACTGGG TAAATGAGTA GGTGAGCCCT GTCTGCTGCT GCACTCCACT 1200
GACAAGCCCG AAGTTGATCA GGCTTGGTCC CAACACCTCC AGGCTCACTG CTTATCTTGC 1260
ATAGTGAATA ACCCAGCACT ACGTTTTGCC AGGTGGGAGA CATGCAGGCC CCTCATAGTC 1320
CTGCCTCATC TTCCCCAGTG CTGGAATTAC TAGCATTGGA CACCATACCA AAGGGCTAGA 1380
AGGGTTAGGG ATGGAGTTGA GGGTTAATAC GTTAATACCT GCTGTTGAAT GGTATTTTGC 1440
AAACTTGACA AGAGTCTCTG TGTCTCAAGG CCACCTTCTG GCATCTTCCA ATCTTTCAGT 1500
GTCACAAGCC AGGATGTCCT GTCAGGAAAC CTGAGTAACA CCAGCCTCTC TCTCTGTGGG 1560
TGAGCTTTGT GGGGGTGAGC GGGGGTCACT TCCTTGGAAG CTCCTTGCTG CTTCTGACAG 1620
GCTTTGCTGA GCCCTGCAAG TGTGCTGGAG AGTGACCAGC CTCCAGGGCC TTCTGCTCTT 1680
TGTCCTCAGC AATCTAAAGG CACTCAAGGG AAGGAAGGTG CATCCTCTCT GGGGAGGAAT 1740
GGATTGTTCT AATGTCTGCG ATCTGGCCAC ACTTGGCATC TGTGAAAGCA ACTTGCTTTC 1800
AGAGCACATG GAGCGCACCT GGCAGAGGTC TCAGATCACA TGCATGAGCT GAGGAATTGT 1860
AGCTAAAGAA AGCTAAAAGC TGGATGCTAT GGCTGTCAGG GTCAGATTAA TGAGTTATTG 1920
AGGTTGTGTG AATTAGTTTA TACTTCAGCT ATCTGTGATC TTTGCAATAT AAAAGCTAAT 1980
TCCCCAAAAA CACTTAAGAA AGAGCAATAA AGAGAGGCAG AGGCAGGCAA ATTTCTGTGA 2040
GTTCTAGGCC AGCCCTGTCC ACATAGTGCC AGGAGGAATT ACATAGTGAC ATCCTGTCTT 2100
AGAAAGAAAT GGGGGTTGGG AGGAAAGCAA TGATCATAAA TTGTATGTTG TCACACACAG 2160
TGTGGTGACC TTAAAATGGC TAATACCATG AAAATATCTA CAACTTGGTG ATGTGATTGG 2220
TTTACTGAAA ATGTATTTTT TTTTAAGCAA AGTATTCCAG ACAATGATAG CCAATTGACA 2280
ACCCCCTAAC AACCCTCACA GATGTCAGGG CAGGAATTTG GTCTCATGTT TCTGCCCCCA 2340
ACTCCTGGCC TCAGACAGCT GCAGATACAT ATTCCATGTA GCTCCAGTCT CTGAAATACC 2400
AAATGGAAAT TTACTGGGGC TCTCAACTAA GCCAGACTCT CACACAAACT GTACTGCCCC 2460
ATGGGACTCT CCACAGGGCC AGATATTTTA TGAGAACGGG CATTCCCAGT TGATTGGGTC 2520
AACAAAACGA AACCAAGGAA CTGTGTCTTA AAACTAATGT ATCCTGTTTA ATTGTACACA 2580
AGGGACACTC CACTCCAAAG CAAGAGCCAG GCAAATCTCA GGTTTGTAGA CTCGGTGAGA 2640
ATATTGGAGG CTTTTGTGGA GCTTTGTTTT CTTTAGAGAG GGATGACCAG CTGGCAGGGG 2700
GCTGGACGCT GCCTTGCAGG AGGAGGGCAC CAGCAGAGGA GACAGGAAAA CACAGTCAGC 2760
AAAACTGCGG 2770